Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsAzu_04g0013150 | OGI:04011900 | 16/16 | Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:19295915-19319556 | ||||||||
| Gene Symbol | SDRLK-27, SDRLK-28 | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64477] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsAzu_04g0013150 | OsAzu_04g0013150.01 | Chr04 | 19295915 | 19319556 | + | NAM | ||
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| Protein seq | MPLALTLLGLLLLSLHISASCAAMDTMTPAQALFGNGKLISSNGKFALGFFQTGSKSSHNTLNWYLGIWYNKIPKLTPVWVANGDNPVTDPNNSELTISGDGGLVILDRSNRSIVWSTRINITTNDTVAMLLNSGNLVLQNFLNSSDALWQSFDYPTHTFLPGAKLGWSKISGLNSRLVSRKNSIDLAPGKYSVELDPSGANQYIFTLLNSSTPYLTSGVWNGQYFPSIPEMAGPFIVNFTFVDNDQEKYFTYSLLDETVVFHHFLDVSGRTKTFVWLEGSQDWVMTYAQPKVQCDVFAVCGPFTICNDNELGFCKCMKGFSIKSPKDWELDDRTDGCMRNTPLDCASNKTASSLTDKFHSMPCVRLPQNGYSIEAATNADKCALVCLSNCSCTAYSYGNGGCLVWHAELFDVKQQQCDGITDTNGGTLYIRLASREEQSQKKNRRGLIIAIALGLSFAALTIAVKKLAGAHQGEKQFRAEVSSIGLIQHINLIKLIGFCCDNDSKLLVYEHMPNRSLDVHLFPTDIKILNWDTRHQIAIGVARGLSYLHDSCRDCIIHCDVKPQNILLSESFTPKIADFGMAKFLGRDFSRVLTTMRGTIGYLAPEWISGVPITPKVDVYSYGMVLLEIVSGRRNSNGGCITGGDKDVYFPVKVAHKLLEGDVESLIDPNLHGDANLTEVERVCKVACWCIQDNDSTATDTVSPGHALVGSDRLVSNNGKFALGFFKPGNESYTNHNSYLGIWFNKVPKLTPLWTANGNNPVVDPTSPELAISGDGNLAILDHATKSIIWSTHANITAKDTIAILLNNGNLVLRSSSNSSIIFWQSFDYPTDTLFPSAKIGWDKVTGLNRRLVSRKNSIDQAPGIYSLELGPNGDGHLLWNSTIAYWSSGQWNGRYFGLTPEMTGALMPNFTFFHNDQEAYFIYTWDNETAIMHAGIDVFGRGLVATWLEESQDWLIYYRQPEVHCDVYAICGPFTICDDNKDPFCDCMKGFSVRSPKDWELDNRTGGCIRNTPLSCGSRTDRTGLTDKFYPVQSIRLPHSAENVKVATSADECSQACLSNCSCTAYSYGKSGCSVWHDELYNVKQLSDSSSDGNGEVLYIRLAAKELQSLERKKSGKITGVTIGASTGDNRLLVYEYMPNSSLDVCLFKANDIVLDWTTRYQIAIGVARGLAYLHTSCRDCIIHCDIKPENILLDASYVPKIADFGMAKILGREFSRAMTTMRGTFGYLAPEWISGTVVTSKVDVYSYGMVFFEIISGRRNSSHENFRDGDYSFFFPMQAARKLLNGDVGNTVSPSQALAGSNRLVSNNSKFALGFLKPGNESYNNHNSYLGIWFNKVPKLTLLWTANGDNPVVDPTSPELTISGDGNLAILDHATKSIIWSTRANITTNDTIAVLLNNGNLVLRSSSNSSKIFWQSFDYPTDTLFAGAKIGWDKVTGLNRRIVSRKNSIDQAPGMYSLEVGLNGDGHLLWNSTVPYKSSGDWNGRYFGLAPEMIGVALPNFTFVYNDQEAYFTYTLRDDTAIVHTGIDVFGRGFAGTWLEGSQDWLIHYRQPIVHCDVFAICGPFTICDDKKDPNNNPFCDCMKGFSVKSPKDWELDDRTGGCMRNTPLSCGSSKDRSDLTDKFYPMQSIRLPNNAENVQAATSGDQCSQVCLSNCSCTAYSYGEDGCSIWHDELYNVKQLLDAASDGNGVVLYVRLAAKELQISERKKSGTLIGVAIGASTGTLFLITLLLILWRIKGKWIIAHPLEKSEDSIGIIAFRHIDLRRATKNFSEKLGGGSFGSVFKGNLSDSTIAVKRLDGARQGEKQFRAEVNSIGIIQHINLVKLVGFCCEGDNRLLVYEYMPNCSLDVCLFKANDIVLDWTTRYQIAIGVARGLAYLHTSCRDCIIHCDIKPENILLDASYVPKIADFGMAKILGREFSRAMTTMRGTIGYLAPEWISGTVVTSKVDVYSYGMVLFEIISGRRNSSHENFRDGDYSFFFPMQAARKLLDGDLAMVFHQLCQVQQHIHTGQ
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.031411 | 0.866329 | 0.576742 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g34390 | RBH | 0.068536 | 0.0 | 0.052151 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0420900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0020690 | SBH | 0.000000 | 23.696850 | 5.517277 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0013950 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.220761 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0013720 | RBH | 0.000000 | 1.222291 | 0.000000 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0013320 | RBH | 0.019342 | 0.033247 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0013620 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 3.549162 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0328500 | SBH | 2.370298 | 0 | 0.023448 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0012540 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.216144 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0327400 | SBH | 0.717196 | 2.293277 | 3.4411705 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0013190 | RBH | 0.039733 | 0.116363 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0012800 | SBH | 0.035199 | 2.476301 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0012810 | SBH | 0.000000 | 10.048559 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0013410 | RBH | 0.169686 | 0.172605 | 0.267748 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0013540 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G012670 | SBH | 0.284199 | 0.643363 | 0.235737 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0012660 | SBH | 0.428041 | 1.303368 | 1.550173 |
