Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLaMu_04g0000150 OGI:04000640 | 10/16 LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:245736-252890
Gene Symbol YK28, SDRLK-21, SDRLK-22
DNA seq

tacggtcaacaaaaaacacatttctcactgtgcatcgacaaccgttgcttacaaaagtctgtcattaaagaaaaaaaaatgtaaatacaagagtagcattatacagtacattttagcaattagaggattttgaattgtttttacatctcagctacattagaagatcttgttatagctgcaagtagtcttggcatagggggcatatcaaactcctgtagaccttcaagaaccaggaccacttcacccattgtcggccgatcgaactcattatcttgaatgcaccaacaagcaactttgcaaaccctttcagcctcttctaaattgaagtcgccactcaaacgtggatccaccaaactctgcacatctccctcatgaagcttgctgatggcttgcacagggaagtaagcagcatgatgactgttgctactgtgtacattaggtaaacttctcattCctgatatgatctctagcaacaccataccatagctgtaaacatcaacttttggtgtaattgcgacaccactaatccactccggggcaagatatccaactgttcctctaaatgtagtcagaactctgctaaaatcccttcctacaaatactgccatcccaaaatctgcaattttaggagtaaatgattcgccgagaagtatgttttgtggcttaatatcacagtgtatgatgcattcatggcaactctgatgcaagtaggaaagtcctctagcaactcctatggctatttgatacctcgtgctccacgtcagtatagtagcattgctctgaaacagatgggtatcaagagaaccgtttaacatgtgttcataaacaagtagcctcttgtcaccttggcagcagaaaccaatcaacttgactaggttgatatgttggatcaatccgattgagctcacctcagccctgaactgcttctcgccttgacgggcaccatcaagccttttcactgctacaacagtcaagtccctcaacactcccttaaacacggagccgaaacctccttctcccaacttctctgagaaatttttagtagcatggtctaaatcactatatctgaaggctataattccactaccaccttggcttctgtgtaatggcacaccacaccacttgaatctattcctccaaaccattaccaacaccatgagcattattagtaacacaagactaataatgcttatggttgtaacaactccaacaattggttttcttttGtttttgctcaaactttgcaaatctttggctgcaaggcggaggtaaagaacatcatcgaaatgattttcaatgccatcattctgatttacactaaacaaatccccatgccagacagagcatatgttgttctgataggagtaagcagtgcatgagcaggaactgagacaggcttgtgcacatttgctctgagtggtggcatcttgtatgctttcagagtcatagggcaatttaacatgagctatagggtggaacatgtctgctgaacttgtcctgttaccgctaatagtgcaatctaatggagtatttctggagcatcctcctgtccgatcaccaaggtcccaatcctgagacgactttcgagtaaaactctccatacattcacatactggatttgaattgccgttgcagatggtaaaaggtccacatgtagcaaatgggttgcagggatcagcaggctgggcatatatgatttgccaagactggttagcttctgaccatacattgagcatgatctgaccagacatgtccagtgagaggaacgaagaagacgattcgttggataaagtgtacatgtagtactcctcttggctgttatcaacatatgtagggatgatcaaacctctcgtccgtggatccattgctagcagggatctgagctctggtataagagttggtgatgttagaccataccaatacactttaggagggttgcggagcatgaggatcacccccttggtaccattagtgtctagttcaacactgtatgagccaagacctggatctatcaagctcttctttgagatgcattgacggttcaggccagtgatcttgttccaaccaaacttggcaccagggagcacaacatctgttggggagtcaaagctttcccacaacactacatttgctgtgctttctatcacaaggtttccggtgttcaatagaacgacactcgtgttcgtgctgctggtttcttgtgtcctatgactatcgataataacgcgagtggaccagattatggattcagtggcatggttaaagatgacaagattgccatctgatgagaatttgagctgtgttagattgagctcagggatagtgagtggcctctccctgttggcaacccatacagtagtaaaaactgggatcttattgaaccatatgccaaggtaccagccaggggaattggtgctagtatcagatgacttactggtgcctgcgtctggctggaagaagccgagggtgaacttgccgttgttcgagatgagcttgtcaccgacggcgagcgcttggccagccaggagagtatcattatttagatttgcagcagagcatggagcaagaggaagcagggagaagaggagaagaacaaggccaagaaatgcatagctctggggacgcatggagacgagaattgctggtagcttcctctgcagttggagctgggacaaggaataagaggagagcgagtgatctgatggggaatatctacacggcaacgacgctgagcatgcatgctggtcaaattcagattaagacagcactgggtgggggtggccacttttattggccattatctcctgttgcttaaacaagtacaacatgtgttgcatggttggtggagtttgcgatatacgtatataaaaaaacactacacttggggaggtagtaaactagtaccttttcaacatcaaataaatttgattggagagactatacggttttcttcatatatgtattgtcgtttcaaaggatgtaggctagcagcccatcgcgtacatgccttagaagatatacaagaaatttgaacagcaacatcagaagttcagaacgataccatcatcagctcagctgtatgtatatatatggagagatcatatgcagaacttgaaatggacgatgggacagccaagggataagagcaaacgaatgacaatgcaaaaacagcaacatagatcatggccagcataagaaagatcaggttggatgtaaagatcggattttaatccTttttattaaaacgaaaaaggtgcaaatcataaccgggacaagagcgtcagtgcttaatgcaacgacataattgtgaccttccaaggccacactattttccaaccaaattgggtcaaaaagggcatcaatttagggcgataaagcccattcaaatgtcactactacacaaaatctacaaatgtgccgttttttccaaccggcatcatggaggcgacactgatcaaaaggctcatcggtgccgaattgagaaccggtactgattagttgcacgattccaaaaaatcggtcgaaagcattgtttgaccgtggtcttgcctacgtggcacgccacatggacgatgacatggcgtttttttttccttcccccttttctttttcctcctattcttttatcttcttcctccactagagccacctcgagctcccccgcgtcgaagaggtcaaagaagagagaaatgaaagaggaagaagagagaaacaaagaaacaaagaaataataataataccacggtcatctacatgtcatgccacgtaggtaagaccacggtcaaatgagactttcaattgggatgatacaataaaccaagtttagggtcttcgatacacactttgcaagttcatagatctagatgaaatttgcttacaagtttaaggaccgctagtgcaatttactAaaaaaaatagtaaggaccttttataccaagctaagttagactcctcgatggtgtcctcgatggtgtgccgagcttcgcggttgatcgtcggcgtgtacgttgacaatctcatcagcaccggctgcagcagcaaaaaaaaaaatcgacatgttcaaagctcaaatgaagcaggtattcctcatgagtgaccttgttggcctcttatcttactatatatatccgggcatcgagatcacccaggatgcgaacggaattacactgtgcatacaaaatgttaatagtacatggcatcatcctaagggaagttcgaaaatattgtagtactacattagtctggcactttattggataactacgtggtggcatatttcaataggcaattttacaaatgctatatctctaattcaagcactaagtaatggcatatatcatacatgaacttccttcaatttgaggatacatttcagtgcttccatcaaataaacatagacatatttctttttctccagtacggtggagaatatacacatgtttctagtactggcatattttccaaaagtatctgctcatcagaatataataggtaatcattacaaacagaacGgggggaaaacatacaccataccataaaattcaacaatatttgcaagcttgacttcctctattaatttctcctgccacacgttagcatcataaattattccgaaatatagtgaaatacaagtatttatgaactattatattgaacccacgtcagagcattttgttaaagctgcaagtaatcttggcactgggggcatttcaagctcttgcataccctcaaggacccgaaccacttcactcattgtcggtcgatcatgctcatcatcttggatgcaccaacatgcaaccttgcaaaccctttcagcctcttccaaactaaaatcatcacataattgtggatccaccaaattccgcacatctccctcgtgtagcttgttgatggcttgcacagggaaatacgaaacatggtaattatcactagtgtattcattaggtgaattccttcgtccagatataatttccagtagtaccataccaaagctataaaca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Function G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64477]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLaMu_04g0000150 OsLaMu_04g0000150.01 Chr04 245736 252890 - NAM
CDS seq

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 4.059380 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0103700 RBH 0.0 0.0 0.387844
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g01310 RBH 1.272589 0.685590 0.305400
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0103700 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0000150 RBH 0.211760 2.395765 3.749433
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0000160 RBH 0.096671 2.853943 1.208340
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0000150 RBH 0.808031 5.019080 3.806088
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0000170 RBH 0.069744 0.323755 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0000140 RBH 0.605598 3.359040 4.364083
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0003700 RBH 0.8073645 24.093412 1.8771285
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0000160 RBH 0.381690 0.585906 0.808173
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0004300 RBH 1.511669 18.5250015 2.9534285
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0000150 RBH 0.390810 0.135176 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0000170 RBH 0.035487 3.797025 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0000170 RBH 0.766307 8.266186 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0000140 RBH 1.239633 0.798403 0.959144
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0006850 SBH 0.053359 0.568915 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G000180 RBH 0.673993 2.495537 0.991814
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0000120 RBH 0.342205 15.181497 3.611933
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