Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_02g0025230 OGI:02001240 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:24606371-24625302
Gene Symbol RLCK110, OsRLCK110, PTK5, OsPTK5
DNA seq

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Protein seq

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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_02g0025230 OsKeNa_02g0025230.01 Chr02 24606371 24625302 + NAM
CDS seq

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Protein seq

MQLGGPVPVMRPVKHSMLVVLQQLLLLFYGVCSIHCATAPDNSTDISSLLDFRQAINDPTGALNSWSTAVPHCQWKGVSCSRRHVGRVTALNLTGQSLSGSISGSVGNLTFLHTLDLSHNNLSGQMPHLNNLQKMQVLNLSYNSLDGIIPDTLTNCSNLQKLSLRNNFLSLIPPQIGLLTNLVYMSMSNNNFSGIIPPTLGNMTSLVILLLTTNHLGGSIPDEIGKLPNISIVVLGDNMLSGSIPASLSNSSITGIELRANLLTGTLPINMGDNLPKLKSLFLGHNMLEGHIPASLGNASMLKQVVLQTNNFIGQIPTTFGKLFGLSRLDLQVNMLEAKDSEGWGFLYALRNCSVLEILELTENQLQGIIPNSIGSLSNTLRYLVLGGNELSGIVPSCIGNLSGLIQLSLDVNKLTGSISPWIGNLKYLEYLNLGKNRFTGPIPYSIGSLTRLTELYLEKNAFEGHIPPSLGNPPLLLKLDLAYNNLQGTIPWEISNLRQLVYLKLTSNKLTGNIPNALDRCQNLVTIQMDQNFLTGTIPISLGNLKGLSVLNLSHNILSGTIPAVLGDLPLLSKLDLSYNNLQGEIPRIELFRNATSVYLEGNRGLCGGVMDLHMPSCPQVSHRKERKSNLTRLLIPIVGFLSLTVLICLIYLVKKTPRRTYLSLLSFGKQFPRVSYKDIAQATGNFSQSNLIGRGSYGSVYKAKLSPVKIQVAIKVFDLEMRWADKSFVSECEILRSIRHRNLLPILTACSTIDYSGNDFKALIYEYMPNGNLDMWLHKKNTAVASKCLSLSQRVNIAVDIANALSYLHHECERSIIHCDLKPMNILLDSDMNAYLGDFGISSLVLESKFASLGHSCPNSLIGLKGTIGYIAPECGNASTYGDVYGFGIVLLETLTGKRPTDPMFENELNIVNFMEKNFPEQIPHIIDAQLQEECKGFNQERIEQENRFYKCLLSVALSCTHPIPRERMDIREIAIKLQAIRTSYAEATKRDNMLRRRDARCLPSHNDYSVDLQALLDFKQGIIDPNGALSDWNTSIHFCRWTGVNCSHARPLRVTGLNLTSKGLSGQISSSLGNLTFLQILSLADNNLNGPIPLLSNLQHLEVLSLQQNRLHGIIPDALTNCSSLTFLSLSSNNLTGVIPPSIGNLSRLEALYLFRNNLTGIIPQTLGKVATLEAVDLSENQLNGPVPDELWQLQNIIQLILSQNNLSGGLSQSLPNISSLQELSLASNMLGNTLPSNIGDALPYLRYLYFGINMFEGNIPDSIGNFSKIEQLDLSSNNFNGHVPSSLGKLSKMSYLNLEHNKLEANDSESWKFFHALANCTSLNGFSLSNNQLQGVIPNSIGNFSVNLQYVLMGGNKLSGTVPPSIGKFHDLVQLSLDQNNLTGNIEEWIGNFTKLQHGPIPLEFAELQQLTKLHLSSNRLTGKIPESLGQCHELENIQMDQNLLTGNIPISFSNLKSLTMLNLSHNNLSGTIPTALGELKLLNQLDLSYNNLNGEVPTNGVFENTTAVSIIGNWGICGGPSNLQMPPCPTTYPRKGMLYYLVRILIPLLGFMSVILLLYLTQVKNKTSKGTYLLLLSFGKQFPKVSYHDLAQATGDFSKSNLIGSGSYGSVYKGKLVQVRVQVAIKVFDLEMRFADKSFISECEVLRSIRHRNLLPILTACSTIDNLENDFKALVYEFMPNGNLDKWLHKKSSYEAPNSLGLGQRISIAANIADALSYLHHDSRTSIVHCDLKPSNILLDADMNAYLGDFGISNVIHNSTSTSACHSGVDSSLNSSIGLRGTIGYIAPEYAQSGQTSICGDVYSFGIVLLEIVLGKRPTDPMFDNGLNIVIDVNVEEECKGFIEATTVEENEVYHCLLSLLQVALSCTRLYPRERMNMREVANSFGNRSRISKSRNFVAIRLQPPKLAMYIQLVLLLLCYGVGNDVVHCSTVHEKSVDLQSLLDFKKGITEDPGGVLLSWNASTNFCRWNGVICTTSRPWHVSGLNLSDKSLEGKITSSLANLTSLTILDLSYNRLFGQFPLLNPLQQLDTIYMNDNSLDGIIPDTLTKCSKLVNIDLSDNQFQGAIPPKIGSLINLQAVYLQQNYLSGTIPATVGNITQLSVLNLKSNQLEGNIPDGVWQLSNLTGLALGQNKLSGGIPSALNLPLLTRLGLEENMLGQVLPPKIGYALPSFQLISMYSNKFEGQIPTSIGNASGLQLMDFSANNFTGQIPSSIGRLSKLSRLNLERNQLEASDNQGWEFLYLLRNSTSLTVFSLAQNHLQGSLPHSVANLSSNLKILLLGKNKLTGIVPPSIGNLCNLSKLGLEQNNFSGEIGKWIGKLKNLQGLNLGGSTFFGPIPPSIVNLTLLTELFLDNNKFEVPLKIEKRSYLVRLLIPIFGFMSLTMLIYIITLGKKTPRRTYLFLFSFGKQFPKVSYSDLARATGNFSESNLIGRGSYGSVYKGKLTQAKIEVAIKVFNLEMRRADRSFVSECEVLRTIRHRNLLPILTACSTIDNRGKDFRALIYEFMHNGNLDKWLHHGRAGVVRKLLSMDQRVSIAVNIADALVYLHHDCGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFGIASLVLDSSLTSDGNSGCNSSIVVKGTMGYIAPEYAQSVRASTSGDVYSFGVVLMEMLIGKRPTDSMFENELTITNFVERKFPDHILHIIDVHLQEECNGFIHATRKTENATNLKRLITNE

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.246092 0.000000 0.510617

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0615400 SBH 1.810530 3.247144 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g40180 RBH 1.164243 0.429848 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0614966 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0025070 RBH 2.266135 0.000000 2.324937
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0025040 RBH 0.095130 0.000000 0.117828
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0025060 SBH 8.845984 0.000000 17.735216
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0024670 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0024740 RBH 0.833541 0.0 0.566644
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0396700 RBH 2.187931 0.0432085 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0024420 RBH 0.025480 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0425600 RBH 3.2197335 0.0065365 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0024730 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0024640 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0024950 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0024860 RBH 32.739056 0.000000 2.989254
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0024410 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G024890 RBH 0.0 1.775304 0.840148
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0024720 SBH 0.000000 0.0 4.170712
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