Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsKeNa_02g0025230 | OGI:02001240 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:24606371-24625302 | ||||||||
Gene Symbol | RLCK110, OsRLCK110, PTK5, OsPTK5 | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MQLGGPVPVMRPVKHSMLVVLQQLLLLFYGVCSIHCATAPDNSTDISSLLDFRQAINDPTGALNSWSTAVPHCQWKGVSCSRRHVGRVTALNLTGQSLSGSISGSVGNLTFLHTLDLSHNNLSGQMPHLNNLQKMQVLNLSYNSLDGIIPDTLTNCSNLQKLSLRNNFLSLIPPQIGLLTNLVYMSMSNNNFSGIIPPTLGNMTSLVILLLTTNHLGGSIPDEIGKLPNISIVVLGDNMLSGSIPASLSNSSITGIELRANLLTGTLPINMGDNLPKLKSLFLGHNMLEGHIPASLGNASMLKQVVLQTNNFIGQIPTTFGKLFGLSRLDLQVNMLEAKDSEGWGFLYALRNCSVLEILELTENQLQGIIPNSIGSLSNTLRYLVLGGNELSGIVPSCIGNLSGLIQLSLDVNKLTGSISPWIGNLKYLEYLNLGKNRFTGPIPYSIGSLTRLTELYLEKNAFEGHIPPSLGNPPLLLKLDLAYNNLQGTIPWEISNLRQLVYLKLTSNKLTGNIPNALDRCQNLVTIQMDQNFLTGTIPISLGNLKGLSVLNLSHNILSGTIPAVLGDLPLLSKLDLSYNNLQGEIPRIELFRNATSVYLEGNRGLCGGVMDLHMPSCPQVSHRKERKSNLTRLLIPIVGFLSLTVLICLIYLVKKTPRRTYLSLLSFGKQFPRVSYKDIAQATGNFSQSNLIGRGSYGSVYKAKLSPVKIQVAIKVFDLEMRWADKSFVSECEILRSIRHRNLLPILTACSTIDYSGNDFKALIYEYMPNGNLDMWLHKKNTAVASKCLSLSQRVNIAVDIANALSYLHHECERSIIHCDLKPMNILLDSDMNAYLGDFGISSLVLESKFASLGHSCPNSLIGLKGTIGYIAPECGNASTYGDVYGFGIVLLETLTGKRPTDPMFENELNIVNFMEKNFPEQIPHIIDAQLQEECKGFNQERIEQENRFYKCLLSVALSCTHPIPRERMDIREIAIKLQAIRTSYAEATKRDNMLRRRDARCLPSHNDYSVDLQALLDFKQGIIDPNGALSDWNTSIHFCRWTGVNCSHARPLRVTGLNLTSKGLSGQISSSLGNLTFLQILSLADNNLNGPIPLLSNLQHLEVLSLQQNRLHGIIPDALTNCSSLTFLSLSSNNLTGVIPPSIGNLSRLEALYLFRNNLTGIIPQTLGKVATLEAVDLSENQLNGPVPDELWQLQNIIQLILSQNNLSGGLSQSLPNISSLQELSLASNMLGNTLPSNIGDALPYLRYLYFGINMFEGNIPDSIGNFSKIEQLDLSSNNFNGHVPSSLGKLSKMSYLNLEHNKLEANDSESWKFFHALANCTSLNGFSLSNNQLQGVIPNSIGNFSVNLQYVLMGGNKLSGTVPPSIGKFHDLVQLSLDQNNLTGNIEEWIGNFTKLQHGPIPLEFAELQQLTKLHLSSNRLTGKIPESLGQCHELENIQMDQNLLTGNIPISFSNLKSLTMLNLSHNNLSGTIPTALGELKLLNQLDLSYNNLNGEVPTNGVFENTTAVSIIGNWGICGGPSNLQMPPCPTTYPRKGMLYYLVRILIPLLGFMSVILLLYLTQVKNKTSKGTYLLLLSFGKQFPKVSYHDLAQATGDFSKSNLIGSGSYGSVYKGKLVQVRVQVAIKVFDLEMRFADKSFISECEVLRSIRHRNLLPILTACSTIDNLENDFKALVYEFMPNGNLDKWLHKKSSYEAPNSLGLGQRISIAANIADALSYLHHDSRTSIVHCDLKPSNILLDADMNAYLGDFGISNVIHNSTSTSACHSGVDSSLNSSIGLRGTIGYIAPEYAQSGQTSICGDVYSFGIVLLEIVLGKRPTDPMFDNGLNIVIDVNVEEECKGFIEATTVEENEVYHCLLSLLQVALSCTRLYPRERMNMREVANSFGNRSRISKSRNFVAIRLQPPKLAMYIQLVLLLLCYGVGNDVVHCSTVHEKSVDLQSLLDFKKGITEDPGGVLLSWNASTNFCRWNGVICTTSRPWHVSGLNLSDKSLEGKITSSLANLTSLTILDLSYNRLFGQFPLLNPLQQLDTIYMNDNSLDGIIPDTLTKCSKLVNIDLSDNQFQGAIPPKIGSLINLQAVYLQQNYLSGTIPATVGNITQLSVLNLKSNQLEGNIPDGVWQLSNLTGLALGQNKLSGGIPSALNLPLLTRLGLEENMLGQVLPPKIGYALPSFQLISMYSNKFEGQIPTSIGNASGLQLMDFSANNFTGQIPSSIGRLSKLSRLNLERNQLEASDNQGWEFLYLLRNSTSLTVFSLAQNHLQGSLPHSVANLSSNLKILLLGKNKLTGIVPPSIGNLCNLSKLGLEQNNFSGEIGKWIGKLKNLQGLNLGGSTFFGPIPPSIVNLTLLTELFLDNNKFEVPLKIEKRSYLVRLLIPIFGFMSLTMLIYIITLGKKTPRRTYLFLFSFGKQFPKVSYSDLARATGNFSESNLIGRGSYGSVYKGKLTQAKIEVAIKVFNLEMRRADRSFVSECEVLRTIRHRNLLPILTACSTIDNRGKDFRALIYEFMHNGNLDKWLHHGRAGVVRKLLSMDQRVSIAVNIADALVYLHHDCGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFGIASLVLDSSLTSDGNSGCNSSIVVKGTMGYIAPEYAQSVRASTSGDVYSFGVVLMEMLIGKRPTDSMFENELTITNFVERKFPDHILHIIDVHLQEECNGFIHATRKTENATNLKRLITNE |
||||||||||
Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsKeNa_02g0025230 | OsKeNa_02g0025230.01 | Chr02 | 24606371 | 24625302 | + | NAM | ||
CDS seq | atgcagctagggggccctgtgcctgtcatgcgacctgtgaaacacagcatgcttgtggtgctacagcagctgctgctactattctacggagtttgcagcatccattgcgcaacggcccctgacaacagcacggatatatcgtcgttgctagatttcaggcaagccatcaatgatccaacgggagcgctaaacagttggagcacggccgttccccattgccagtggaagggcgtcagttgtagccggaggcacgtcggccgagtcacggcgctcaaccttaccgggcaaagtttatcgggttccatttctggctctgttggaaacctgacattccttcatacacttgacctgtcccataataacttgtccgggcagatgcctcatcttaacaatctgcagaagatgcaggtccttaatctgagctacaattccttagatggaattattccagacacgctcaccaattgttccaacctacagaaattaagtctaagaaataacttcctaagtcttattcctccgcaaattggtctccttaccaaccttgtttatatgtccatgtccaataataatttctctggaatcattcccccaaccctcggtaacatgacttcgctggtgatactgcttcttacaacaaatcatcttgggggaagcattccagatgaaattgggaaacttcccaatatcagcatcgtggtcctaggagataacatgttatcaggtagtataccagcaagcctttctaattcttctattacaggaatagaattacgtgcaaatcttcttacggggactctacctataaacatgggtgataatctccctaaacttaaatctctcttcttgggccataacatgcttgagggtcacatcccagcttccttgggcaacgcttcaatgctaaaacaagtagttctacaaaccaacaatttcattggccagattcctactacttttggaaagctttttggactgtccagactagatcttcaggtaaacatgcttgaagcaaaagacagtgaaggctggggatttctgtatgcactgagaaactgcagtgttctagaaattcttgaattaactgagaatcaactacagggaattataccaaattcaatcggtagcctatcgaacactcttcggtatctcgtgttgggtggaaatgaactatctggcatagttccctcgtgcatagggaacctttctgggttaattcaactgtcattagatgtaaacaagctcacaggttcgatcagcccatggattggaaatcttaaatacttggaatatttaaatcttggaaagaacagattcactgggcctattccatattctattggcagtcttacacggctgacagagctctatctggaaaaaaatgcatttgaaggtcacataccaccctccttgggaaaccctccactactcttaaagctggatcttgcctacaacaatcttcaaggcaccataccttgggagattagtaatcttagacaactcgtctacctgaaacttacatcaaacaagcttactgggaatatacctaatgctttggaccgatgccaaaacttagtgaccatccaaatggaccaaaactttctcacaggaaccattccaatttctctcggcaacctaaaaggcttgagcgtactaaatctttcccataacatcttatcgggcaccatcccagcagtactgggggatctacctctactcagcaagctggacctttcttacaataatctccaaggagaaataccaaggattgaattattcagaaatgctacatctgtttatcttgaaggcaataggggactatgtggaggagttatggatctccatatgccatcgtgcccccaagtttctcacagaaaagaaaggaagagcaatttgaccagattgttgattccaatagttggtttcttgtcactcacagtgctgatatgccttatataccttgtgaagaagacaccaagaagaacatatctatcgttgctttcttttggaaagcagttccctagggtttcttacaaggatatagcccaagctacaggaaacttctcacagtcaaacttaattggaagaggaagttacggttcagtatataaagcgaaattaagtccggttaaaatacaagttgctattaaagtttttgacctagagatgagatgggcagacaaaagcttcgtatcagaatgtgagatcttaagaagcattcgacatcgaaaccttcttcctatcctaacggcgtgttcaacaatagactatagtggaaatgatttcaaagctctgatttatgaatacatgcctaatgggaacttggatatgtggttgcataaaaaaaataccgctgttgcttcaaaatgtttgagcttatctcagagagtaaatatagctgttgacattgctaatgcactctcctatttacaccacgaatgtgaaagatctattatccattgtgatttgaagccaatgaatatccttcttgacagtgatatgaatgcatatttgggagacttcggaatttcaagcctcgttcttgagtctaaatttgcctcacttggacattcctgtccgaatagcttaatcggattgaagggaaccatagggtatatagctccagagtgtggcaatgcatcgacctatggggatgtttacggttttggaatagtacttctagagacgctgacaggtaaaagaccaacagatcctatgtttgagaatgagctcaacattgtcaactttatggagaagaacttcccagagcagataccacatataattgatgctcaactccaagaagaatgcaaaggcttcaatcaagaaaggatcgagcaagaaaataggttctataaatgcttgttgtctgttgctctttcgtgcactcatccgatcccaagagaacgaatggacattagagaaatagctattaagctgcaagcaatcagaacatcctatgctgaagcgaccaagcgagacaatatgcttcgaagaagggacgccaggtgcttacctagccacaatgattacagcgtagatctgcaggcgctgcttgattttaagcagggcatcatcgatccaaacggtgccttgagcgattggaacaccagcatccacttctgtaggtggaccggtgtcaactgcagccatgcgagacctttgcgcgtcacggggctcaacctcactagcaaaggcctgtcaggccagatctcatcttctcttggaaacttaactttcctccaaatactttctctcgccgataataacttgaatggtcccatacctcttcttagtaatctacaacacctggaggtcctttctctgcaacaaaaccgtttgcacggaattattccagatgcacttacaaattgttccagcttaaccttcttaagcctctctagcaacaatctaacgggtgtgattcctcctagcataggtaatctttccaggttagaagctttgtaccttttccggaacaacctcaccgggattatcccacaaaccctcggaaaagttgctactttagaagctgttgatctttcagaaaatcaactcaacggacccgttcctgacgagctttggcaactgcaaaacataatccagttgatcctatcccaaaataatctatcaggtggactttcacaaagtctacctaacatatcttctctccaggaattatccttggcgtccaatatgttaggcaacacattgccatctaacatcggcgacgccctaccttacctccgatatctatatttcggaatcaacatgttcgaaggtaacatcccagattcaataggcaatttttcaaagatagaacaattagacctgtcgtcaaataatttcaatggccatgtcccaagctctttaggaaagctttcgaagatgtcctatctaaaccttgagcataacaagcttgaagcaaatgacagcgaaagctggaaattcttccatgcgttggcaaattgtacttctctcaatgggttttcattatctaataatcagctacagggagtcataccaaattcgataggtaacttttctgtaaatcttcaatatgtattgatgggtggaaataagctatcaggaactgttcctccaagcataggtaaatttcatgatttagttcaactctcactggaccaaaacaatcttacgggcaacattgaagaatggattggaaacttcacaaagctacaacatgggccaatacctctggagtttgctgagctgcaacagcttacaaagttacatctttcatcaaacaggttaactgggaaaattcctgaaagcttgggccaatgccatgagctagaaaatatccagatggaccaaaaccttctaacaggaaacattccaatatcatttagtaacctcaaaagcttgaccatgcttaatctttcccataacaacttatctggcaccatacctacagctttaggtgagctaaaacttctcaaccagctggacctatcttacaacaatctcaatggagaagtaccaacaaatggagtattcgaaaacaccacggcggtgtcaatcattggaaactggggtatctgtggaggaccatcaaatctacagatgccaccatgccctactacttaccccagaaaaggaatgctatactacttggtcagaatactaattccattattgggcttcatgtcagttatactgttgctctacttaacacaagttaaaaacaagacgtcaaagggaacatatttgttgttactttcattcggcaagcaattccccaaagtctcctaccatgatctggctcaagctacaggagacttctccaagtcaaacttaattgggagtggcagttacggttcagtgtataaaggaaagttagttcaagttagagtgcaagtggctattaaagtatttgaccttgagatgagatttgcagacaaaagctttatatcagaatgtgaggttttgaggagtattcgacatagaaatctcctccctatcctaacagcatgttc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Protein seq | MQLGGPVPVMRPVKHSMLVVLQQLLLLFYGVCSIHCATAPDNSTDISSLLDFRQAINDPTGALNSWSTAVPHCQWKGVSCSRRHVGRVTALNLTGQSLSGSISGSVGNLTFLHTLDLSHNNLSGQMPHLNNLQKMQVLNLSYNSLDGIIPDTLTNCSNLQKLSLRNNFLSLIPPQIGLLTNLVYMSMSNNNFSGIIPPTLGNMTSLVILLLTTNHLGGSIPDEIGKLPNISIVVLGDNMLSGSIPASLSNSSITGIELRANLLTGTLPINMGDNLPKLKSLFLGHNMLEGHIPASLGNASMLKQVVLQTNNFIGQIPTTFGKLFGLSRLDLQVNMLEAKDSEGWGFLYALRNCSVLEILELTENQLQGIIPNSIGSLSNTLRYLVLGGNELSGIVPSCIGNLSGLIQLSLDVNKLTGSISPWIGNLKYLEYLNLGKNRFTGPIPYSIGSLTRLTELYLEKNAFEGHIPPSLGNPPLLLKLDLAYNNLQGTIPWEISNLRQLVYLKLTSNKLTGNIPNALDRCQNLVTIQMDQNFLTGTIPISLGNLKGLSVLNLSHNILSGTIPAVLGDLPLLSKLDLSYNNLQGEIPRIELFRNATSVYLEGNRGLCGGVMDLHMPSCPQVSHRKERKSNLTRLLIPIVGFLSLTVLICLIYLVKKTPRRTYLSLLSFGKQFPRVSYKDIAQATGNFSQSNLIGRGSYGSVYKAKLSPVKIQVAIKVFDLEMRWADKSFVSECEILRSIRHRNLLPILTACSTIDYSGNDFKALIYEYMPNGNLDMWLHKKNTAVASKCLSLSQRVNIAVDIANALSYLHHECERSIIHCDLKPMNILLDSDMNAYLGDFGISSLVLESKFASLGHSCPNSLIGLKGTIGYIAPECGNASTYGDVYGFGIVLLETLTGKRPTDPMFENELNIVNFMEKNFPEQIPHIIDAQLQEECKGFNQERIEQENRFYKCLLSVALSCTHPIPRERMDIREIAIKLQAIRTSYAEATKRDNMLRRRDARCLPSHNDYSVDLQALLDFKQGIIDPNGALSDWNTSIHFCRWTGVNCSHARPLRVTGLNLTSKGLSGQISSSLGNLTFLQILSLADNNLNGPIPLLSNLQHLEVLSLQQNRLHGIIPDALTNCSSLTFLSLSSNNLTGVIPPSIGNLSRLEALYLFRNNLTGIIPQTLGKVATLEAVDLSENQLNGPVPDELWQLQNIIQLILSQNNLSGGLSQSLPNISSLQELSLASNMLGNTLPSNIGDALPYLRYLYFGINMFEGNIPDSIGNFSKIEQLDLSSNNFNGHVPSSLGKLSKMSYLNLEHNKLEANDSESWKFFHALANCTSLNGFSLSNNQLQGVIPNSIGNFSVNLQYVLMGGNKLSGTVPPSIGKFHDLVQLSLDQNNLTGNIEEWIGNFTKLQHGPIPLEFAELQQLTKLHLSSNRLTGKIPESLGQCHELENIQMDQNLLTGNIPISFSNLKSLTMLNLSHNNLSGTIPTALGELKLLNQLDLSYNNLNGEVPTNGVFENTTAVSIIGNWGICGGPSNLQMPPCPTTYPRKGMLYYLVRILIPLLGFMSVILLLYLTQVKNKTSKGTYLLLLSFGKQFPKVSYHDLAQATGDFSKSNLIGSGSYGSVYKGKLVQVRVQVAIKVFDLEMRFADKSFISECEVLRSIRHRNLLPILTACSTIDNLENDFKALVYEFMPNGNLDKWLHKKSSYEAPNSLGLGQRISIAANIADALSYLHHDSRTSIVHCDLKPSNILLDADMNAYLGDFGISNVIHNSTSTSACHSGVDSSLNSSIGLRGTIGYIAPEYAQSGQTSICGDVYSFGIVLLEIVLGKRPTDPMFDNGLNIVIDVNVEEECKGFIEATTVEENEVYHCLLSLLQVALSCTRLYPRERMNMREVANSFGNRSRISKSRNFVAIRLQPPKLAMYIQLVLLLLCYGVGNDVVHCSTVHEKSVDLQSLLDFKKGITEDPGGVLLSWNASTNFCRWNGVICTTSRPWHVSGLNLSDKSLEGKITSSLANLTSLTILDLSYNRLFGQFPLLNPLQQLDTIYMNDNSLDGIIPDTLTKCSKLVNIDLSDNQFQGAIPPKIGSLINLQAVYLQQNYLSGTIPATVGNITQLSVLNLKSNQLEGNIPDGVWQLSNLTGLALGQNKLSGGIPSALNLPLLTRLGLEENMLGQVLPPKIGYALPSFQLISMYSNKFEGQIPTSIGNASGLQLMDFSANNFTGQIPSSIGRLSKLSRLNLERNQLEASDNQGWEFLYLLRNSTSLTVFSLAQNHLQGSLPHSVANLSSNLKILLLGKNKLTGIVPPSIGNLCNLSKLGLEQNNFSGEIGKWIGKLKNLQGLNLGGSTFFGPIPPSIVNLTLLTELFLDNNKFEVPLKIEKRSYLVRLLIPIFGFMSLTMLIYIITLGKKTPRRTYLFLFSFGKQFPKVSYSDLARATGNFSESNLIGRGSYGSVYKGKLTQAKIEVAIKVFNLEMRRADRSFVSECEVLRTIRHRNLLPILTACSTIDNRGKDFRALIYEFMHNGNLDKWLHHGRAGVVRKLLSMDQRVSIAVNIADALVYLHHDCGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFGIASLVLDSSLTSDGNSGCNSSIVVKGTMGYIAPEYAQSVRASTSGDVYSFGVVLMEMLIGKRPTDSMFENELTITNFVERKFPDHILHIIDVHLQEECNGFIHATRKTENATNLKRLITNE
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
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Homologues
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g40180 | RBH | 1.164243 | 0.429848 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0614966 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0025070 | RBH | 2.266135 | 0.000000 | 2.324937 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0025040 | RBH | 0.095130 | 0.000000 | 0.117828 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0025060 | SBH | 8.845984 | 0.000000 | 17.735216 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0024670 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0024740 | RBH | 0.833541 | 0.0 | 0.566644 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0396700 | RBH | 2.187931 | 0.0432085 | 0 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0024420 | RBH | 0.025480 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0425600 | RBH | 3.2197335 | 0.0065365 | 0 |
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KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0024640 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0024950 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0024860 | RBH | 32.739056 | 0.000000 | 2.989254 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0024410 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
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