Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsAzu_02g0025070 | OGI:02001240 | 16/16 | Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:24746710-24768959 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGT6] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsAzu_02g0025070 | OsAzu_02g0025070.01 | Chr02 | 24746710 | 24768959 | + | NAM | ||
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ATGGGGCCTGAGCCAATCACATACAACTCATACTCATTTCCAGAGAGTAACAACGTTTTGTTCAGCTCCAATGATCCAACTAGAGGGGGCCCTGTGCCTGTCATGCGACCTGTGAAACACAGCATGCTTGTGGTGCTACAGCAGCTGCTGCTACTATTCTACGGAGTTTGCAGCATCCATTGCGCAACGGCCCCTGACAACAGCACGGATATATCGTCGTTGCTAGATTTCAGGCAAGCCATCAATGATCCAACGGGAGCGCTAAACAGTTGGAGCACGGCCGTTCCCCATTGCCAGTGGAAGGGCGTCAGTTGTAGCCGGAGGCACGTCGGCCGAGTCACGGCGCTCAACCTTACCGGGCAAAGTTTATCGGGTTCCATTTCTGGCTCTGTTGGAAACCTGACATTCCTTCATACACTTGACCTGTCCCATAATAACTTGTCCGGGCAGATGCCTCATCTTAACAATCTGCAGAAGATGCAGGTCCTTAATCTGAGCTACAATTCCTTAGATGGAATTATTCCAGACACGCTCACCAATTGTTCCAACCTACAGAAATTAAGTCTAAGAAATAACTTCCTAAGTCTTATTCCTCCGCAAATTGGTCTCCTTACCAACCTTGTTTATATGTCCATGTCCAATAATAATTTCTCTGGAATCATTCCCCCAACCCTCGGTAACATGACTTCGCTGGTGATACTGCTTCTTACAACAAATCATCTTGGGGGAAGCATTCCAGATGAAATTGGGAAACTTCCCAATATCAGCATCGTGGTCCTAGGAGATAACATGTTATCAGGTAGTATACCAGCAAGCCTTTCTAATTCTTCTATTACAGGAATAGAATTACGTGCAAATCTTCTTACGGGGACTCTACCTATAAACATGGGTGATAATCTCCCTAAACTTAAATCTCTCTTCTTGGGCCATAACATGCTTGAGGGTCACATCCCAGCTTCCTTGGGCAACGCTTCAATGCTAAAACAAGGAACCATAGGGTATATAGCTCCAGAGTGTGGCAATGCATCGACCTATGGGGATGTTTACGGTTTTGGAATAGTACTTCTAGAGACGCTGACAGGTAAAAGACCAACAGATCCTATGTTTGAGAATGAGCTCAACATTGTCAACTTTATGGAGAAGAACTTCCCAGAGCAGATACCACATATAATTGATGCTCAACTCCAAGAAGAATGCAAAGGCTTCAATCAAGAAAGGATCGAGCAAGAAAATAGGTTCTATAAATGCTTGTTGTCTGTTGCTCTTTCGTGCACTCATCCGATCCCAAGAGAACGAATGGACATTAGAGAAATAGCTATTAAGCTGCAAGCAATCAGAACATCCTATGCTGAAGCGACCAAGCGAGACAATATGCTTCGAAGAAGGGACGCCAGGTGCTTACCTAGCCACAATGATTACAGCGTAGATCTGCAGGCGCTGCTTGATTTTAAGCAGGGCATCATCGATCCAAACGGTGCCTTGAGCGATTGGAACACCAGCATCCACTTCTGTAGGTGGACCGGTGTCAACTGCAGCCATGCGAGACCTTTGCGCGTCACGGGGCTCAACCTCACTAGCAAAGGCCTGTCAGGCCAGATCTCATCTTCTCTTGGAAACTTAACTTTCCTCCAAATACTTTCTCTCGCCGATAATAACTTGAATGGTCCCATACCTCTTCTTAGTAATCTACAACACCTGGAGGTCCTTTCTCTGCAACAAAACCGTTTGCACGGAATTATTCCAGATGCACTTACAAATTGTTCCAGCTTAACCTTCTTAAGCCTCTCTAGCAACAATCTAACGGGTGTGATTCCTCCTAGCATAGGTAATCTTTCCAGGTTAGAAGCTTTGTACCTTTTCCGGAACAACCTCACCGGGATTATCCCACAAACCCTCGGAAAAGTTGCTACTTTAGAAGCTGTTGATCTTTCAGAAAATCAACTCAACGGACCCGTTCCTGACGAGCTTTGGCAACTGCAAAACATAATCCAGTTGATCCTATCCCAAAATAATCTATCAGGTGGACTTTCACAAAGTCTACCTAACATATCTTCTCTCCAGGAATTATCCTTGGCGTCCAATATGTTAGGCAACACATTGCCATCTAACATCGGCGACGCCCTACCTTACCTCCGATATCTATATTTCGGAATCAACATGTTCGAAGGTAACATCCCAGATTCAATAGGCAATTTTTCAAAGATAGAACAATTAGACCTGTCGTCAAATAATTTCAATGGCCATGTCCCAAGCTCTTTAGGAAAGCTTTCGAAGATGTCCTATCTAAACCTTGAGCATAACAAGCTTGAAGCAAATGACAGCGAAAGCTGGAAATTCTTCCATGCGTTGGCAAATTGTACTTCTCTCAATGGGTTTTCATTATCTAATAATCAGCTACAGGGAGTCATACCAAATTCGATAGGTAACTTTTCTGTAAATCTTCAATATGTATTGATGGGTGGAAATAAGCTATCAGGAACTGTTCCTCCAAGCATAGGTAAATTTCATGATTTAGTTCAACTCTCACTGGACCAAAACAATCTTACGGGCAACATTGAAGAATGGATTGGAAACTTCACAAAGCTACAACGTTTAAATTTGGAAATGAACAATTTCTTTGCTGAGCTGCAACAGCTTACAAAGTTACATCTTTCATCAAACAGGTTAACTGGGAAAATTCCTGAAAGCTTGGGCCAATGCCATGAGCTAGAAAATATCCAGATGGACCAAAACCTTCTAACAGGAAACATTCCAATATCATTTAGTAACCTCAAAAGCTTGACCATGCTTAATCTTTCCCATAACAACTTATCTGGCACCATACCTACAGCTTTAGGTGAGCTAAAACTTCTCAACCAGCTGGACCTATCTTACAACAATCTCAATGGAGAAGTACCAACAAATGGAGTATTCGAAAACACCACGGCGGTGTCAATCATTGGAAACTGGGGTATCTGTGGAGGACCATCAAATCTACAGATGCCACCATGCCCTACTACTTACCCCAGAAAAGGAATGCTATACTACTTGGTCAGAATACTAATTCCATTATTGGGCTTCATGTCAGTTATACTGTTGCTCTACTTAACACAAGTTAAAAACAAGACGTCAAAGGGAACATATTTGTTGTTACTTTCATTCGGCAAGCAATTCCCCAAAGTCTCCTACCATGATCTGGCTCAAGCTACAGGAGACTTCTCCAAGTCAAACTTAATTGGGAGTGGCAGTTACGGTTCAGTGTATAAAGGAAAGTTAGTTCAAGTTAGAGTGCAAGTGGCTATTAAAGTATTTGACCTTGAGATGAGATTTGCAGACAAAAGCTTTATATCAGAATGTGAGGTTTTGAGGAGTATTCGACATAGAAATCTCCTCCCTATCCTAACAGCATGTTCAACAATAGATAATCTAGAGAATGATTTCAAAGCTCTAGTTTATGAATTCATGCCAAATGGGAATTTGGACAAATGGTTACATAAGAAATCATCTTATGAAGCTCCAAATAGTTTGGGCCTAGGGCAAAGAATAAGCATAGCTGCTAATATAGCTGATGCTTTAAGCTATTTGCACCATGACAGCAGAACATCCATTGTCCATTGTGATTTGAAGCCTAGCAATATCCTCCTAGATGCTGATATGAATGCTTATTTGGGTGACTTTGGGATTTCGAACGTTATCCATAATTCTACATCAACATCGGCTTGCCATTCAGGTGTAGATTCAAGTTTGAACAGTTCAATCGGATTGAGGGGAACTATTGGATATATTGCTCCAGAGTATGCTCAAAGTGGGCAAACATCAATTTGTGGGGATGTTTACAGTTTCGGAATAGTACTTCTAGAGATAGTGCTTGGAAAAAGACCTACGGATCCCATGTTTGACAATGGACTGAACATTGTAATTGATGTTAATGTCGAAGAAGAGTGCAAGGGATTCATTGAAGCAACCACAGTAGAAGAAAATGAGGTTTATCACTGCCTGCTGTCCCTCCTGCAAGTTGCTCTTTCTTGTACACGCCTATACCCAAGGGAACGGATGAACATGAGAGAAGTAGCTAACAGCTTCGGGAACCGAAGCCGCATTAGCAAATCCAGAAATTTCGTCGCCATTAGATTGCAACCCCCTAAACTCGCCATGTATATACAACTGGTGTTGCTGCTGCTATGTTATGGAGTTGGCAACGACGTCGTCCATTGCTCAACTGTGCACGAGAAGAGCGTTGATCTACAATCACTGCTAGATTTCAAGAAGGGGATCACTGAAGATCCAGGAGGAGTCTTGCTCTCTTGGAACGCCAGCACCAACTTCTGTCGGTGGAATGGTGTCATCTGCACCACTTCACGACCATGGCACGTCTCAGGACTGAATCTCTCCGACAAAAGCTTGGAAGGCAAAATCACCTCCTCTCTTGCAAACCTCACATCTCTTACTATACTCGACTTGTCCTACAATCGCCTCTTTGGCCAGTTTCCTCTCCTTAACCCTCTTCAGCAACTGGATACCATTTACATGAATGACAACTCACTAGATGGGATTATTCCTGATACTCTTACAAAGTGCTCCAAATTAGTCAATATAGACCTCTCTGATAACCAGTTTCAGGGTGCAATTCCTCCTAAAATAGGCTCACTTATCAATCTTCAAGCTGTGTACCTTCAGCAGAATTATCTCAGTGGAACCATCCCTGCAACTGTTGGAAACATCACCCAGTTAAGCGTTCTCAACCTTAAATCCAATCAGTTAGAAGGGAATATCCCAGATGGGGTCTGGCAATTGTCAAATCTAACAGGGCTTGCCCTAGGTCAGAATAAGCTATCAGGTGGAATTCCATCGGCCCTAAACCTGCCTCTTCTTACGAGACTTGGTTTGGAGGAAAATATGTTGGGCCAAGTTTTGCCACCAAAGATTGGCTATGCCCTCCCAAGTTTCCAACTGATAAGCATGTATTCTAACAAGTTTGAAGGTCAGATTCCAACTTCTATAGGCAATGCTTCAGGTCTGCAATTAATGGATTTCTCAGCAAATAATTTTACTGGTCAAATCCCTAGTTCTATTGGAAGGCTTTCAAAGCTGTCGCGACTAAACCTTGAGCGAAACCAGCTTGAAGCAAGTGACAATCAAGGCTGGGAATTCTTATATTTGTTAAGAAATTCCACATCTCTGACGGTGTTCTCCCTTGCTCAAAATCATCTGCAGGGATCTCTACCACATTCCGTGGCTAATCTGTCTAGCAATCTCAAGATTTTACTGTTGGGTAAAAACAAACTAACAGGGATAGTCCCCCCAAGTATAGGGAACTTATGTAACTTAAGTAAACTCGGGCTAGAGCAAAATAATTTTAGTGGGGAAATTGGAAAATGGATTGGGAAGCTGAAAAATCTGCAAGGTTTAAATCTTGGAGGGAGCACCTTCTTCGGGCCAATTCCGCCCTCCATTGTAAATCTTACTCTGTTGACAGAGCTCTTTCTAGATAATAATAAATTCGAAGTTCCTCTGAAAATAGAAAAGAGGAGTTATTTGGTGAGATTGTTGATTCCAATATTTGGCTTCATGTCCCTCACCATGTTAATTTACATTATAACCCTTGGAAAGAAGACACCAAGAAGAACCTACTTGTTTCTGTTTTCTTTTGGTAAGCAATTCCCTAAAGTTTCTTACAGTGATCTAGCTCGAGCTACAGGAAACTTCTCAGAGTCGAACCTAATTGGAAGAGGAAGCTATGGCTCTGTATATAAAGGGAAGTTAACTCAAGCCAAAATTGAAGTGGCTATTAAGGTTTTTAATCTAGAGATGAGGCGTGCAGACAGAAGTTTTGTATCAGAATGTGAGGTTTTGAGAACCATTCGACACCGGAACCTTCTTCCTATACTAACTGCATGCTCCACGATAGACAATAGAGGTAAAGACTTTAGAGCTCTAATTTATGAGTTTATGCATAACGGTAATTTGGACAAATGGTTGCATCATGGACGTGCTGGTGTAGTTCGCAAACTTTTGTCCATGGATCAAAGAGTAAGCATAGCTGTCAACATAGCTGATGCTTTGGTCTATTTACACCATGACTGTGGAAGGCCTATTGTCCATTGTGATGTGAAGCCCACGAATATCCTTCTAGATGAGGATATGAGTGCCCATTTGGGGGACTTCGGCATTGCAAGTCTTGTTCTTGATTCTTCATTGACATCAGATGGGAATTCTGGTTGTAACAGTTCAATTGTTGTGAAGGGAACCATGGGATACATAGCTCCAGAGTACGCTCAAAGTGTCCGTGCATCAACCAGTGGTGATGTTTATAGTTTTGGGGTAGTACTTATGGAGATGCTAATAGGCAAAAGACCAACAGACTCTATGTTCGAGAATGAGCTGACCATTACCAACTTCGTAGAGAGGAAGTTTCCAGATCATATATTACATATAATTGATGTTCATCTCCAGGAAGAATGCAATGGATTCATCCATGCAACAAGGAAGACAGAAAATGCAACCAATCTGAAGCGGCTAATCACGAACGAGTAA
More
|
|||||||
| Protein seq | MGPEPITYNSYSFPESNNVLFSSNDPTRGGPVPVMRPVKHSMLVVLQQLLLLFYGVCSIHCATAPDNSTDISSLLDFRQAINDPTGALNSWSTAVPHCQWKGVSCSRRHVGRVTALNLTGQSLSGSISGSVGNLTFLHTLDLSHNNLSGQMPHLNNLQKMQVLNLSYNSLDGIIPDTLTNCSNLQKLSLRNNFLSLIPPQIGLLTNLVYMSMSNNNFSGIIPPTLGNMTSLVILLLTTNHLGGSIPDEIGKLPNISIVVLGDNMLSGSIPASLSNSSITGIELRANLLTGTLPINMGDNLPKLKSLFLGHNMLEGHIPASLGNASMLKQGTIGYIAPECGNASTYGDVYGFGIVLLETLTGKRPTDPMFENELNIVNFMEKNFPEQIPHIIDAQLQEECKGFNQERIEQENRFYKCLLSVALSCTHPIPRERMDIREIAIKLQAIRTSYAEATKRDNMLRRRDARCLPSHNDYSVDLQALLDFKQGIIDPNGALSDWNTSIHFCRWTGVNCSHARPLRVTGLNLTSKGLSGQISSSLGNLTFLQILSLADNNLNGPIPLLSNLQHLEVLSLQQNRLHGIIPDALTNCSSLTFLSLSSNNLTGVIPPSIGNLSRLEALYLFRNNLTGIIPQTLGKVATLEAVDLSENQLNGPVPDELWQLQNIIQLILSQNNLSGGLSQSLPNISSLQELSLASNMLGNTLPSNIGDALPYLRYLYFGINMFEGNIPDSIGNFSKIEQLDLSSNNFNGHVPSSLGKLSKMSYLNLEHNKLEANDSESWKFFHALANCTSLNGFSLSNNQLQGVIPNSIGNFSVNLQYVLMGGNKLSGTVPPSIGKFHDLVQLSLDQNNLTGNIEEWIGNFTKLQRLNLEMNNFFAELQQLTKLHLSSNRLTGKIPESLGQCHELENIQMDQNLLTGNIPISFSNLKSLTMLNLSHNNLSGTIPTALGELKLLNQLDLSYNNLNGEVPTNGVFENTTAVSIIGNWGICGGPSNLQMPPCPTTYPRKGMLYYLVRILIPLLGFMSVILLLYLTQVKNKTSKGTYLLLLSFGKQFPKVSYHDLAQATGDFSKSNLIGSGSYGSVYKGKLVQVRVQVAIKVFDLEMRFADKSFISECEVLRSIRHRNLLPILTACSTIDNLENDFKALVYEFMPNGNLDKWLHKKSSYEAPNSLGLGQRISIAANIADALSYLHHDSRTSIVHCDLKPSNILLDADMNAYLGDFGISNVIHNSTSTSACHSGVDSSLNSSIGLRGTIGYIAPEYAQSGQTSICGDVYSFGIVLLEIVLGKRPTDPMFDNGLNIVIDVNVEEECKGFIEATTVEENEVYHCLLSLLQVALSCTRLYPRERMNMREVANSFGNRSRISKSRNFVAIRLQPPKLAMYIQLVLLLLCYGVGNDVVHCSTVHEKSVDLQSLLDFKKGITEDPGGVLLSWNASTNFCRWNGVICTTSRPWHVSGLNLSDKSLEGKITSSLANLTSLTILDLSYNRLFGQFPLLNPLQQLDTIYMNDNSLDGIIPDTLTKCSKLVNIDLSDNQFQGAIPPKIGSLINLQAVYLQQNYLSGTIPATVGNITQLSVLNLKSNQLEGNIPDGVWQLSNLTGLALGQNKLSGGIPSALNLPLLTRLGLEENMLGQVLPPKIGYALPSFQLISMYSNKFEGQIPTSIGNASGLQLMDFSANNFTGQIPSSIGRLSKLSRLNLERNQLEASDNQGWEFLYLLRNSTSLTVFSLAQNHLQGSLPHSVANLSSNLKILLLGKNKLTGIVPPSIGNLCNLSKLGLEQNNFSGEIGKWIGKLKNLQGLNLGGSTFFGPIPPSIVNLTLLTELFLDNNKFEVPLKIEKRSYLVRLLIPIFGFMSLTMLIYIITLGKKTPRRTYLFLFSFGKQFPKVSYSDLARATGNFSESNLIGRGSYGSVYKGKLTQAKIEVAIKVFNLEMRRADRSFVSECEVLRTIRHRNLLPILTACSTIDNRGKDFRALIYEFMHNGNLDKWLHHGRAGVVRKLLSMDQRVSIAVNIADALVYLHHDCGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFGIASLVLDSSLTSDGNSGCNSSIVVKGTMGYIAPEYAQSVRASTSGDVYSFGVVLMEMLIGKRPTDSMFENELTITNFVERKFPDHILHIIDVHLQEECNGFIHATRKTENATNLKRLITNE
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|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsAzu_02g0025070 | OsAzu_02g0025070.03 | Chr02 | 24749697 | 24753320 | + | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGTGGAGGAGTTATGGATCTCCATATGCCATCGTGCCCCCAAGTTTCTCACAGAAAAGAAAGGAAGAGCAATTTGACCAGATTGTTGATTCCAATAGTTGGTTTCTTGTCACTCACAGTGCTGATATGCCTTATATACCTTGTGAAGAAGACACCAAGAAGAACATATCTATCGTTGCTTTCTTTTGGAAAGCAGTT |
|||||||
| Protein seq | MWRSYGSPYAIVPPSFSQKRKEEQFDQIVDSNSWFLVTHSADMPYIPCEEDTKKNISIVAFFWKAV |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| A3 | Chr02 | 24752653 | 24752773 | + | OsAzu_02g0025070.03 | OsAzu_02g0025070.02,OsAzu_02g0025070.03,OsAzu_02g0025070.01 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 2.266135 | 0.000000 | 2.324937 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0615400 | SBH | 1.810530 | 3.247144 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g40130 | SBH | 0.573867 | 1.093673 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0615400 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0025000 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0025230 | RBH | 0.246092 | 0.000000 | 0.510617 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0025060 | SBH | 8.845984 | 0.000000 | 17.735216 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0024680 | SBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0024600 | RBH | 1.744725 | 5.268727 | 0.000000 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0396300 | SBH | 0.6404455 | 0.2594735 | 0.4822715 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0024560 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0425300 | SBH | 0.877423 | 0.2626745 | 4.1508945 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0024760 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0024650 | SBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0024970 | RBH | 68.361366 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0024860 | SBH | 32.739056 | 0.000000 | 2.989254 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0024420 | SBH | 4.755641 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G025050 | RBH | 3.565824 | 0.0 | 3.907463 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0024870 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
