Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsPr106_02g0024740 | OGI:02001240 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:26092591-26118387 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MCSEQEQPVKLAMFIQLVLLLLFYRVGNVVHCSTVHEDNIDLQSLLDFKKGITEDSSRSLSSWNTSTHFCWWNGVMCTTARPFRVSTLNLSAQSLAGEITSSLANLTFLSALDLSSNRFFGRFPLLNHLQHLGFLYMNDNSLDGIIPDTLTNCSKMTQIDLSNNQLRGAIPPRIGSLTNLEYLNLGNNSLTGIIPATIGNLIKLGYLNLGMNNLTGIIPATVGNLTLLTVLRLEYNQFEGKIPDGVWQLANLTYLLLGQNRLSDVPPFRAWDPAAPAAANVAAAAAQPFHRLVDQTLPLLNRKGSLVVVVVVGGGGSAIRCATAPDNSTDISSLLDFRQAINDPTGALNSWSTAVPHCQWKGVSCSRRHVGRVTALNLTRKSLSGSISASVGNLTFLHTLDLSHNNLSGQMPHLNNLQKMQVLNLSYNSLDGIIPDTLTNCSNLQQLILRYNNFRSRIPPQIGLLTNLVYMSMSNNNLSGIIPPTLGNMTSLVILALTTNHLRGRVPDEIGKLPNISIVVLGDNMLSGIELRANLLTGTLPINMGDNLPKLKSLFLGHNMLEGHIPASLGNASTLKQVVLQTNNFTGQIPTTFGKLFGLSRLDLQANMLEAKDSEGWGFLYALRNYSVLQILELTENQLQGIIPNSIGSLSNTLGYLMLGGNELSSIVPSCIGNLSGLVQLTLDANKLTGSISPWIGNLKYLEYLHLGKNRFTGPIPYSIGRLTRLTELYLENNAFEGTIPCEISNLRQLVYLKLASNKLTGNIPNALDRCQNLVTIQMDQNFLTGTIPISLGNLKGLSVLNLSHNILSGTIPAVLGDLPLLSKLDLSYNNLQGEIPRIELFRNATSVYLEGNRGLCGGVMDLHMPSCPQVSHRIERKRNLTRLLIPIVGFLSLTVLICLIYLVKKTPRRTYLSLLSFGKQFPRVSYKDIAQATGNFSQSNLIGRGSYGSEYKAKLSPVKIQVAIKVFDLEMRWADKSFVSECEILRSIRHRNLLPILTACSTIDYSGNDFKALIYEYMPNGNLDMWLHKKNTTVASKCLRLSQRVNIAVDIANALSYLHHECERSIIHCDLKPMNILLNSNMNAYLGDFGISSLVLESKFASLGHSCPNSLIGLNGTIGYIAPEYAQCGNASTYGDVYGFGIVLLETLTGKRPTDPMFENELNIVNFVEKNFPEQIPHIIDAQLQEECKGFNQERIEQENRCLPNHDDYSVDLQALLGFKQGITSDPNGALSNWNTSTHFCRWNGVNCSQVRPWRVTGLNLTRKSLSGQISSSLGNLTFLRKLLLHDLQQREVLNLRQNSLNGIIPDGLANCSSLTALALSSNNLMGRIPPTIGNLSMLLGLDLSQNNLAGIIPQDLGKIASLQYVDLSRNQLNGGIPNEFWQSQNIRVLYLNQNNLSVRLPQILPNVSYLTELSLASNMLVSTLPCNIGDAIPNIQLLYLGNNTFEGNIPDSIGNASELTELDLLSNNFDGRVPSPLGKLSRMSYLNLERNEFEANDSEGWEFFYGLANCSLEFLSLSTNQLQGVIPNSVGNLSKSLTRVLLGGNKLCGTVPQSIGKLHNLTQLSLDENNLTGKIEEWVGKLTKLQHLNLQSYNI |
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Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsPr106_02g0024740 | OsPr106_02g0024740.01 | Chr02 | 26092591 | 26118387 | + | NAM | ||
CDS seq | atgtgttccgagcaagagcaacccgtgaaactcgccatgtttatacaactggtgttgttgctgctattttatagagttggtaacgtcgtccattgctcaactgtccacgaggacaacatcgatctgcaatcactgctagatttcaagaagggcatcacggaagattcaagcagatccttaagttcttggaacactagcactcacttctgttggtggaatggtgtcatgtgcaccactgcacggccatttcgcgtctcaacgctgaatctctccgcccaaagcttggcaggggaaatcacctcctcacttgcaaacctcacgtttcttagtgcccttgacttgtcctcaaatcgcttctttggtcggttccctctccttaaccacctacagcatctgggtttcctttacatgaatgacaactcactcgatgggattattcctgacacacttacaaattgttccaaaatgacacaaatagacctctctaacaaccagctgcggggtgcaattcctcctagaataggatcccttaccaacctagagtatctgaaccttggcaataatagtctcactggaatcatccctgcaaccattggaaaccttatcaaacttggatatttgaaccttggtatgaataatctcactggaatcatccctgcaaccgttggaaatctcaccctgttaacagttctcaggcttgaatacaatcagtttgaaggaaaaatcccagatggggtctggcaattggcaaatctgacatatcttctcctaggtcagaataggctatcagacgtaccaccgttcagggcttgggaccccgccgcccctgcagcggcgaatgtcgcagccgcagcggcgcagccgttccaccgcctcgtcgatcaaacgctgccgctgttgaatagaaagggcagcctcgtcgtcgtcgtcgtcgtcggcggcggcggatcagccatccgttgcgcaacggcccctgacaacagcacggatatatcatcgttactagatttcaggcaagccatcaatgatccaacgggagcgctaaacagttggagcacggccgttccccattgccagtggaagggcgtcagttgtagccggaggcacgtcggccgagtcacggcgctcaaccttaccaggaaaagtttatcgggttccatttctgcctctgttggaaacctgacattccttcatacacttgacctgtcccataataacttgtccgggcagatgcctcatcttaacaatctgcagaagatgcaggtccttaatctgagctacaattccttagatggaattattccagacacgctcaccaattgttccaacctacagcaattaattctaagatataataacttccgaagtcgtattcctccgcaaataggtctccttaccaaccttgtttacatgtccatgtccaataataatctctctggcattattcccccaaccctcggtaacatgacctcgctagtaatcctcgctcttacaacaaatcatcttagaggaagagttcccgatgaaattgggaaacttcccaatatcagcatcgtagtcctaggagataacatgttgtcaggaatagaattacgtgcaaatcttcttacggggactctacctataaacatgggtgataatctccctaaactcaaatctctcttcttgggccacaacatgcttgagggtcacatcccagcttccttaggcaacgcttcaacgctaaaacaagtagttctacaaaccaacaatttcactggccagattcctactacctttggaaagctttttggactgtccagactagatcttcaggcaaacatgcttgaagcaaaagacagtgaaggctggggatttctgtatgcactgagaaactacagtgttctacaaattcttgaattaactgagaatcaactacagggaattataccaaattcaatcggtagcctatcgaacactcttgggtatctcatgttgggtggaaatgaactatctagcatagttccctcatgcatagggaacctttctgggttagttcaactgacattagatgcaaacaagctaacaggttcgatcagtccatggattggaaatcttaaatacttggaatatttacatcttggaaagaacaggttcactgggcctattccatattctattggcagacttacacggctgacagagctctatctggaaaacaatgcatttgaaggcaccataccttgcgagattagtaatcttagacaactcgtctacctgaaacttgcatcaaacaagcttactgggaatatacctaatgctttggaccgatgccaaaacttagtgaccatccaaatggaccaaaactttctcacaggaaccattccaatttctcttggcaacctaaaaggcttgagcgtactaaatctttcccataacatcttatcgggcaccatcccagcagtactgggggatctacctctactcagcaagctggacctttcttacaataatctccaaggagaaataccaaggattgaattattcagaaatgctacatctgtttatcttgaaggcaataggggactatgcggaggagttatggatctccatatgccatcgtgcccccaagtttctcacagaatagaaaggaagagaaatttgaccagattgttgattccaatagttggtttcttgtcactcacagtgctgatatgccttatataccttgtgaagaagacaccaagaagaacatatctatcattgctttcttttggaaagcagttccctagggtttcttacaaggatatagcccaagctacagggaacttctcacagtcaaacttaattggaagaggaagttacggttcagaatataaagcgaaattaagtccggttaaaatacaagttgctattaaagtttttgacctagagatgagatgggcagacaaaagcttcgtatcagaatgtgagatcttaagaagcattcgacatcgaaaccttcttcctatcctaacggcgtgttcaacaatagactatagtggaaatgatttcaaagctctgatttatgaatacatgcctaatgggaacttggatatgtggttgcataaaaaaaataccactgttgcttcaaaatgtttgaggttatctcagagagtaaatatagctgttgacattgctaatgcactgtcctatttacaccacgaatgtgaaagatctattatccattgtgatttgaagccaatgaatatccttcttaacagtaatatgaatgcatatttgggagacttcggaatttcaagcctcgttcttgagtctaaatttgcctcacttggacattcctgtccgaatagcttaatcggattgaatggaaccatagggtatatagctccagagtatgcacagtgtggcaatgcatcgacctatggggatgtttacggttttggaatagtacttctagagacgctgacaggtaaaagaccaacagatcctatgtttgagaatgagctcaacattgtcaactttgtggagaagaacttcccagaacagataccacatataattgatgctcaactccaagaagaatgcaaaggcttcaatcaagaaaggattgagcaagaaaataggtgcctacctaaccatgatgattacagcgtcgatctgcaggcgctgctcgggttcaagcagggcatcaccagcgatccaaatggagccttgagcaattggaacaccagcacccacttctgtaggtggaacggtgtcaactgcagccaggtgagaccttggcgcgtcacggggctcaacctcactagaaaaagtctatcaggccagatctcatcttctcttggaaacttaacgttcctacgaaagcttcttctccatgatcttcaacaacgagaagtccttaatctgagacaaaacagtttgaacggaattattccagatggacttgcaaattgctccagcctgaccgccttagccctctctagcaacaatctaatgggcaggattcctcctaccatagggaatctttccatgctacttggtttggacctttcccagaacaatctcgctgggatcatcccgcaagacctcggaaaaattgccagtttacagtatgtcgatctttcaagaaatcaactcaacggtggcattcctaacgagttttggcagtcgcaaaacataagggtgttgtacctaaaccaaaataatctgtcagttagactcccacaaattctccctaacgtgtcttatcttacggaattatccttggcgtccaatatgttagtcagcacattgccatgtaacatcggcgacgccatacctaacatccaactcctatacttaggaaataacacgttcgaaggtaacatcccagattcaataggcaatgcttcagagctaacagaattggatctattgtcaaataattttgatggccgtgtcccaagccctttaggaaagctttcgaggatgtcctatctaaaccttgagagaaacgagtttgaagcaaacgacagcgaaggctgggaattcttctatgggttagcaaattgttctctcgagtttctttcgttatcaaccaatcagctgcagggagtcataccaaattcagttggtaacctttcaaaaagtctgacacgtgtgttgttgggtggaaacaaattatgtggaactgttccacaaagcataggaaaacttcataatttaactcaactctcactagatgaaaacaatcttactggcaaaatcgaagaatgggtcggaaaactgacaaagctacaacatttaaatctccaaagctacaacatttaa
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.833541 | 0.0 | 0.566644 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0615400 | SBH | 1.810530 | 3.247144 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g40190 | SBH | 0.669016 | 2.108611 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0615400 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0025000 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0025230 | RBH | 0.246092 | 0.000000 | 0.510617 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0025050 | SBH | 0.778974 | 0.000000 | 0.521185 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0024670 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0024590 | SBH | 5.118042 | 2.253283 | 6.222695 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0396300 | SBH | 0.6404455 | 0.2594735 | 0.4822715 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0024560 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0425300 | SBH | 0.877423 | 0.2626745 | 4.1508945 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0024750 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0024640 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0024970 | SBH | 68.361366 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0024860 | RBH | 32.739056 | 0.000000 | 2.989254 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0024410 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G024890 | SBH | 0.0 | 1.775304 | 0.840148 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0008780 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.650414 |