Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsCMeo_02g0025050 | OGI:02001240 | 16/16 | CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:24479620-24509255 | ||||||||
| Gene Symbol | OsGIRL1, OsGIRL1-1, OsGIRL1-2, OsGIRL1-3, LP2, OsLP2 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MARAGKQAAAGRVRLLRRAHARGGKQFRREVAAAGWRALGGGQRLRRGDAAAAEVFYIYVSRLKTQRANLTTCKQTKDACPEGAAATALLRWQHRLLNGSTDMLSLLGFKEAITNDPLGVLSSWNKSIHFCSWKGVWCSPKHPGRVTALNLAGQGLSGTIAVSVGNLTSVRSVDLSSNNFSGQIPHLANLQKMQVLNLSFNTLDGIIQDTLTNCSNLRKLDLYTNLLKGMIPSAIGLLRNLVYIDLSRNNLTGIIPASLKNISLLETIYLQDNQLEGSIPDELGRFSNILVLVLGGNRLSGNIPASLFNLSSLQALELRANLLGGTLPTNTGDHLTNLRKLYMGHNMLEGHIPASLSNASMLEDIVLQSNNFTGRIPTSLLTELYLMKNDFIGSIPSTVGNLTRLSWLYLGKNKLQGLIPTSLGNLKQLTRIRCATAPDNSTDISSLLDFRQAINDPTGALNSWSTAVPHCQWKGVSCSRRHVGRVTALNLTRKSLSGSISASVGNLTFLHTLDLSHNNLSGQMPHLNNLQKMQVLNLSYNSLDGIIPDTLTNCSNLQQLILRYNNFRSRIPPQIGLLTNLVYMSMSNNNLSGIIPPTLGNMTSLVILALTTNHLRGRVPDEIGKLPNISIVVLGDNMLSGIELRANLLTGTLPINMGDNLPKLKSLFLGHNMLEGHIPASLGNASTLKQVVLQTNNFTGQIPTTFGKLFGLSRLDLQANMLEAKDSEGWGFLYALRNYSVLQILELTENQLQGIIPNSIGSLSNTLGYLMLGGNELSSIVPSCIGNLSGLVQLTLDANKLTGSISPWIGNLKYLEYLHLGKNRFTGPIPYSIGRLTRLTELYLENNAFEGTIPCEISNLRQLVYLKLASNKLTGNIPNALDRCQNLVTIQMDQNFLTGTIPISLGNLKGLSVLNLSHNILSGTIPAVLGDLPLLSKLDLSYNNLQGEIPRIELFRNATSVYLEGNRGLCGGVMDLHMPSCPQVSHRIERKRNLTRLLIPIVGFLSLTVLICLIYLVKKTPRRTYLSLLSFGKQFPRVSYKDIAQATGNFSQSNLIGRGSYGSEYKAKLSPVKIQVAIKVFDLEMRWADKSFVSECEILRSIRHRNLLPILTACSTIDYSGNDFKALIYEYMPNGNLDMWLHKKNTTVASKCLRLSQRVNIAVDIANALSYLHHECERSIIHCDLKPMNILLNSNMNAYLGDFGISSLVLESKFASLGHSCPNSLIGLNGTIGYIAPEYAQCGNASTYGDVYGFGIVLLETLTGKRPTDPMFENELNIVNFVEKNFPEQIPHIIDAQLQEECKGFNQERIEQENRCLPNHDDYSVDLQALLGFKQGITSDPNGALSNWNTSTHFCRWNGVNCSQVRPWRVTGLNLTRKSLSGQISSSLGNLTFLRKLLLHDLQQREVLNLRQNSLNGIIPDGLANCSSLTALALSSNNLMGRIPPTIGNLSMLLGLDLSQNNLAGIIPQDLGKIASLQYVDLSRNQLNGGIPNEFWQSQNIRVLYLNQNNLSVRLPQILPNVSYLTELSLASNMLVSTLPCNIGDAIPNIQLLYLGNNTFEGNIPDSIGNASELTELDLLSNNFDGRVPSPLGKLSRMSYLNLERNEFEANDSEGWEFFYGLANCSLEFLSLSTNQLQGVIPNSVGNLSKSLTRVLLGGNKLCGTVPQSIGKLHNLTQLSLDENNLTGKIEEWLQHLNLQSNNFIGIIPLSIGNLTQLASLILAENEFDGPIPSSLGNFSQLLKLNLSYNNFHGHMPKEVFSITTMTSCVLAYNDLDGPIPLDFAELQQLTKLHLSSNRLTGKIPESLGQCHELENIQMDQNLLTGNIPISFSSLKSLTMLNLSHNNLSSTIPTALGELKFLNQLDLSYNNLNGEVPTNGVFENTTAVSIIGNWGICGGPSNLQMPPCPTTYPRKGMLYYLVRILIPLLGFMSVIPLLYLTQVKNKTSKGTYLLLLSFGKQFPKVSYHDLARATGDFSKSNLIGSGSYGSVYEGKLVQVKVQVAIKVFDLKMRCADKSYISKCEVLRSIRHRNLLPILTACSTIDNLGNDFKALVYEFMPNGNLDKWLHKKSSYEAPNSLGLGQRISITANIADALSYLHHDSRTSIVHCDLKPSNILLDADMNAYLGDFGISNLVHNSTSTSACHSGVDSSLNSSIGLWGTIGYIAPEYAQSWQPSICGDVYSFGIVLLEIVLGKRPTDPVFDNGLNIVIDVNLQEECKGFIEATAVEENEVYQCLLSLLQVALSCTRLCPRERMNMKEVANRTNFCRWNGVICTTSRPWRVSGLNLSDKSLAGKITSSLANLTSLNLSDNQFQGAIPPKIGSLINLQTVYLEQNYLSGTIPATVGNITQLSVLNLKSNQLEGNIPDGVWQLSNLTWLVLGQNKLSGGIPSALNLPLLTILGLEENMLGQVLPPKIGYALPSLQLISMYSNKFEGQIPTSIGNASGLQLMDFSANNFTGQIPSSIGRLSKLSRLNLERNQLEASDNQGWEFLYLLRNSTSLMVFSLAQNHLQGSLPHSVANLSSNLKILLLSENKLTGIVPPSIGNLCNLSKLGLEQNNFSGEIGEWIGKLKNLQGLNLGGNTFFGPIRPSIVNLTLLIELFLDNNKFEGTIPTALSYLQLLSKLDLSHNHLQGEIPRNGIFGNATAVSLDGNLRLCGGVVDFHMPLCSAASLKIERKSDLVRLLIPIFGVMSLTVLIYIITLGKKTPRRTYLFLFSFGKQFPKVSYNDLARATGNFCESNLIGRGSYGSVYTGKLTQAKIEVAIKVFNLEMRRADRSFISECEVLRTIQHRNLLSILTACSTIDNTGKDFKALVYEFMHNGNLDTWLHHEHAGVVRKRLSMDQRVSIAVNMADALIYLHHECGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFGIASLVLDSPLTSEGNSGCNSSIVVKGTIGYIAPGKHHCLVPFKASSCTNNCHLILFSQSMLKVLVHQPVVMFIVLE |
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| Function | Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R2D5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsCMeo_02g0025050 | OsCMeo_02g0025050.01 | Chr02 | 24479620 | 24509255 | + | NAM | ||
| CDS seq | atggcgcgagcagggaagcaggcagcggcaggtagggtgaggctcctccgccgggcgcatgcgagaggaggcaagcagttccggcgggaggtggcagcagcgggctggcgcgcgctaggaggaggccagcggctccggcggggggatgcggcggcagctgaagtgttctacatatacgtgtcaagactcaaaactcagagagccaacctgacaacctgtaaacaaacaaaagatgcttgtcctgaaggtgctgctgctactgctctactgcgttggcaacatcggttgctcaacggttcaacagatatgctctctctgcttggtttcaaggaagccatcaccaatgatccattaggagtcttgagcagttggaacaaaagcatccacttctgcagttggaagggcgtctggtgcagccccaagcaccctgggcgagtcacggcgctcaacctcgccggccaaggtttgtccggcaccatcgccgtttcggttggaaacctgacttctgttcgttcagttgatttatccagtaataacttctccggccagatacctcatcttgccaatctccagaagatgcaagtccttaatcttagcttcaatacactggatgggattattcaagacaccctcacaaactgttccaacctgaggaaactagacctctatacaaacttgctaaagggtatgattccttcggcaataggtctgcttagaaatctagtttacattgacctttcccggaataatctgactgggatcatcccggcaagcctaaaaaatatatccctcttagaaacaatctatcttcaagacaaccaacttgaaggaagcattcctgatgagcttggccgattttcaaatattttggttctggtcctagggggaaacaggctatcaggtaatatcccagcaagccttttcaatttatcttctcttcaagcactagaactacgtgcaaatctgctaggagggactctacctactaacacgggtgatcatctcaccaatctccgaaagctttacatgggtcacaacatgctcgagggtcacattccagcttccttaagcaatgcctcaatgctagaagatattgttctacaatccaacaatttcacaggccggatccctacttccttgttgacagagctatacctgatgaaaaatgacttcatcggatcaattccgtcaactgttggaaaccttactcggttgtcgtggctatatttgggaaaaaataaattgcaaggcctcataccaaccagcttgggaaaccttaaacagctcacacgcatccgttgcgcaacggcccctgacaacagcacggatatatcatcgttactagatttcaggcaagccatcaatgatccaacgggagcgctaaacagttggagcacggccgttccccattgccagtggaagggcgtcagttgtagccggaggcacgtcggccgagtcacggcgctcaaccttaccaggaaaagtttatcgggttccatttctgcctctgttggaaacctgacattccttcatacacttgacctgtcccataataacttgtccgggcagatgcctcatcttaacaatctgcagaagatgcaggtccttaatctgagctacaattccttagatggaattattccagacacgctcaccaattgttccaacctacagcaattaattctaagatataataacttccgaagtcgtattcctccgcaaataggtctccttaccaaccttgtttacatgtccatgtccaataataatctctctggcattattcccccaaccctcggtaacatgacctcgctagtaatcctcgctcttacaacaaatcatcttagaggaagagttcccgatgaaattgggaaacttcccaatatcagcatcgtagtcctaggagataacatgttgtcaggaatagaattacgtgcaaatcttcttacggggactctacctataaacatgggtgataatctccctaaactcaaatctctcttcttgggccacaacatgcttgagggtcacatcccagcttccttaggcaacgcttcaacgctaaaacaagtagttctacaaaccaacaatttcactggccagattcctactacctttggaaagctttttggactgtccagactagatcttcaggcaaacatgcttgaagcaaaagacagtgaaggctggggatttctgtatgcactgagaaactacagtgttctacaaattcttgaattaactgagaatcaactacagggaattataccaaattcaatcggtagcctatcgaacactcttgggtatctcatgttgggtggaaatgaactatctagcatagttccctcatgcatagggaacctttctgggttagttcaactgacattagatgcaaacaagctaacaggttcgatcagtccatggattggaaatcttaaatacttggaatatttacatcttggaaagaacaggttcactgggcctattccatattctattggcagacttacacggctgacagagctctatctggaaaacaatgcatttgaaggcaccataccttgcgagattagtaatcttagacaactcgtctacctgaaacttgcatcaaacaagcttactgggaatatacctaatgctttggaccgatgccaaaacttagtgaccatccaaatggaccaaaactttctcacaggaaccattccaatttctcttggcaacctaaaaggcttgagcgtactaaatctttcccataacatcttatcgggcaccatcccagcagtactgggggatctacctctactcagcaagctggacctttcttacaataatctccaaggagaaataccaaggattgaattattcagaaatgctacatctgtttatcttgaaggcaataggggactatgcggaggagttatggatctccatatgccatcgtgcccccaagtttctcacagaatagaaaggaagagaaatttgaccagattgttgattccaatagttggtttcttgtcactcacagtgctgatatgccttatataccttgtgaagaagacaccaagaagaacatatctatcattgctttcttttggaaagcagttccctagggtttcttacaaggatatagcccaagctacagggaacttctcacagtcaaacttaattggaagaggaagttacggttcagaatataaagcgaaattaagtccggttaaaatacaagttgctattaaagtttttgacctagagatgagatgggcagacaaaagcttcgtatcagaatgtgagatcttaagaagcattcgacatcgaaaccttcttcctatcctaacggcgtgttcaacaatagactatagtggaaatgatttcaaagctctgatttatgaatacatgcctaatgggaacttggatatgtggttgcataaaaaaaataccactgttgcttcaaaatgtttgaggttatctcagagagtaaatatagctgttgacattgctaatgcactgtcctatttacaccacgaatgtgaaagatctattatccattgtgatttgaagccaatgaatatccttcttaacagtaatatgaatgcatatttgggagacttcggaatttcaagcctcgttcttgagtctaaatttgcctcacttggacattcctgtccgaatagcttaatcggattgaatggaaccatagggtatatagctccagagtatgcacagtgtggcaatgcatcgacctatggggatgtttacggttttggaatagtacttctagagacgctgacaggtaaaagaccaacagatcctatgtttgagaatgagctcaacattgtcaactttgtggagaagaacttcccagaacagataccacatataattgatgctcaactccaagaagaatgcaaaggcttcaatcaagaaaggattgagcaagaaaataggtgcctacctaaccatgatgattacagcgtcgatctgcaggcgctgctcgggttcaagcagggcatcaccagcgatccaaatggagccttgagcaattggaacaccagcacccacttctgtaggtggaacggtgtcaactgcagccaggtgagaccttggcgcgtcacggggctcaacctcactagaaaaagtctatcaggccagatctcatcttctcttggaaacttaacgttcctacgaaagcttcttctccatgatcttcaacaacgagaagtccttaatctgagacaaaacagtttgaacggaattattccagatggacttgcaaattgctccagcctgaccgccttagccctctctagcaacaatctaatgggcaggattcctcctaccatagggaatctttccatgctacttggtttggacctttcccagaacaatctcgctgggatcatcccgcaagacctcggaaaaattgccagtttacagtatgtcgatctttcaagaaatcaactcaacggtggcattcctaacgagttttggcagtcgcaaaacataagggtgttgtacctaaaccaaaataatctgtcagttagactcccacaaattctccctaacgtgtcttatcttacggaattatccttggcgtccaatatgttagtcagcacattgccatgtaacatcggcgacgccatacctaacatccaactcctatacttaggaaataacacgttcgaaggtaacatcccagattcaataggcaatgcttcagagctaacagaattggatctattgtcaaataattttgatggccgtgtcccaagccctttaggaaagctttcgaggatgtcctatctaaaccttgagagaaacgagtttgaagcaaacgacagcgaaggctgggaattcttctatgggttagcaaattgttctctcgagtttctttcgttatcaaccaatcagctgcagggagtcataccaaattcagttggtaacctttcaaaaagtctgacacgtgtgttgttgggtggaaacaaattatgtggaactgttccacaaagcataggaaaacttcataatttaactcaactctcactagatgaaaacaatcttactggcaaaatcgaagaatggctacaacatttaaatctccaatcgaacaacttcattgggataattccactttccattggcaatcttacacaattggcatcgctcattctagcagaaaatgaattcgatggtcccataccatctagcctaggcaatttttcacaactcttgaagttgaaccttagctacaacaatttccatggtcatatgcctaaggaggtctttagcatcacaacaatgacatcatgtgtattggcctataacgatttagatgggccaatacctctggattttgctgagctgcaacagcttacaaagttacatctttcatcaaacaggttaactgggaaaattcctgaaagcttgggccaatgccatgagctagaaaatatccagatggaccaaaaccttctaacaggaaacattccaatatcattcagtagcctcaaaagcttgaccatgcttaatctttcccataacaacttatctagcaccatacctacagctttaggtgagctaaaatttctcaaccagctggacttatcgtacaacaatctcaatggagaagtaccaacaaatggagtattcgaaaacaccacggcggtgtctataattgggaattggggtatctgtggaggaccatcaaatctacagatgccaccatgccctactacttaccccagaaaaggaatgctatactacttggtcagaatactaattccattattgggcttcatgtcagttataccgttgctctacttaacacaagttaaaaacaagacgtcaaagggaacatatttgttgttactttcattcggcaagcaattccccaaagtctcctaccatgatctggctcgagctacaggagacttctccaagtcaaacttaattgggagtggcagctacggttcagtgtatgaaggaaagttagttcaagttaaagtgcaagtggctattaaagtatttgaccttaagatgagatgtgcagacaaaagctatatatcaaaatgtgaggttttgaggagtattcggcatagaaatctcctacctatcctaacagcatgttcaacaatagataatctagggaatgatttcaaagctctagtttatgaattcatgccaaatgggaatttggacaaatggttacataagaaatcatcttatgaagctccaaatagtttgggcctagggcaaagaataagcataactgctaatatagctgatgcattaagctatttgcaccatgacagcagaacatccattgtccattgtgatttgaagcctagcaatatcctcctagatgctgatatgaatgcttatttgggcgactttgggatttcgaaccttgtccataattctacatcaacatcggcttgccattcaggtgtagattcaagtttgaacagctcaatcggattgtggggaactattggatatattgctccagagtatgctcaaagttggcaaccatcaatttgtggggatgtttacagtttcggaatagtacttctagagatagtgctcggcaaaagacctacggatcccgtgtttgacaatggactgaacattgtaattgatgttaatctccaagaagagtgcaagggattcattgaagcaaccgcagtagaagaaaatgaggtttatcaatgcctattgtccctcctgcaagttgctctttcttgtacacgcctatgcccaagggaacggatgaacatgaaagaagtagctaacagaaccaatttctgtcggtggaatggtgtcatctgcaccacttcacgaccatggcgcgtctcaggactgaatctctccgacaaaagcttggcaggcaaaatcacctcctctcttgcaaacctcacatctcttaacctctctgataaccagtttcagggtgcaattcctcctaaaataggctcacttatcaatcttcaaactgtgtaccttgagcagaattatctcagtggaaccatccctgcaactgttggaaacatcacccagttaagcgttctcaaccttaaatccaatcagttagaagggaatatcccagatggggtctggcaattgtcaaatctaacatggcttgtcctaggtcagaataagctatcaggtggaattccatcggccctaaacctgcctcttctcacgatacttggtttggaggaaaatatgttgggccaagttttgccaccaaagattggctatgccctcccaagtctccaactgataagcatgtattctaacaagtttgaaggtcagattccaacttctataggcaatgcttcaggtctgcaattaatggatttctcagcaaataattttactggtcaaatccctagttctattggaaggctttcaaagctgtcgcgactaaaccttgagcgaaaccagcttgaagcaagtgacaatcaaggctgggaattcttatatttgttaagaaattccacatctctgatggtgttctcccttgctcaaaatcatctgcagggatctctaccacattccgtggctaatctgtctagcaatctcaagattttactgttgagtgaaaacaaactaacagggatagtccccccaagtatagggaacttatgtaacttaagtaaactcgggctagagcaaaataattttagtggggaaattggagaatggattgggaagctgaaaaatctgcaaggtttaaatcttggagggaacaccttcttcgggccaattcggccctccattgtaaatcttactctgttgatagagctctttctagataataataaattcgaagggaccataccaactgctctgagttacctacaactcctcagtaagctagacctttcacacaatcatctgcaaggagaaataccaagaaatggaatcttcggaaatgccacagctgtttcacttgacggcaacttgaggctttgtgggggagtggtggattttcatatgcctttgtgctctgcagcttctctaaaaatagaaaggaagagtgatttggtgagattgttgattccaatatttggcgtcatgtccctcaccgtgttgatttacattataacccttggaaagaagacaccaagaagaacctatttatttctgttttcttttggtaagcaattccctaaagtttcttacaatgatctagctcgagctacaggaaacttctgtgagtcaaacctaattggaagaggaagctatggttcggtatatacagggaagttaacacaggccaaaatagaagtggctattaaggtttttaatcttgagatgagacgtgcagatagaagttttatatcagaatgtgaggttttgagaaccattcagcaccggaaccttctttctatactaactgcatgctcgacgatagacaatacaggaaaagatttcaaagctctagtttatgagtttatgcataatggtaatttggatacatggttgcatcatgaacatgctggtgtagttcgcaaacgtttgtccatggatcaaagagtaagcatagctgttaacatggctgatgctttgatctatttacaccatgaatgtggaaggcctattgtccattgtgatgtgaagcccactaatatccttctggatgaggatatgagtgcccatttgggtgacttcggcattgcaagtcttgttcttgattctccattgacatcagaagggaattctggttgtaacagttcaatagttgtgaagggaaccattggatacatagctccaggtaaacatcattgtcttgtgccatttaaagcttcaagttgcactaataactgccatttaatccttttttctcagagtatgctcaaagtgctcgtgcatcaaccagtggtgatgtttatagttttggagtag
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| Protein seq | MARAGKQAAAGRVRLLRRAHARGGKQFRREVAAAGWRALGGGQRLRRGDAAAAEVFYIYVSRLKTQRANLTTCKQTKDACPEGAAATALLRWQHRLLNGSTDMLSLLGFKEAITNDPLGVLSSWNKSIHFCSWKGVWCSPKHPGRVTALNLAGQGLSGTIAVSVGNLTSVRSVDLSSNNFSGQIPHLANLQKMQVLNLSFNTLDGIIQDTLTNCSNLRKLDLYTNLLKGMIPSAIGLLRNLVYIDLSRNNLTGIIPASLKNISLLETIYLQDNQLEGSIPDELGRFSNILVLVLGGNRLSGNIPASLFNLSSLQALELRANLLGGTLPTNTGDHLTNLRKLYMGHNMLEGHIPASLSNASMLEDIVLQSNNFTGRIPTSLLTELYLMKNDFIGSIPSTVGNLTRLSWLYLGKNKLQGLIPTSLGNLKQLTRIRCATAPDNSTDISSLLDFRQAINDPTGALNSWSTAVPHCQWKGVSCSRRHVGRVTALNLTRKSLSGSISASVGNLTFLHTLDLSHNNLSGQMPHLNNLQKMQVLNLSYNSLDGIIPDTLTNCSNLQQLILRYNNFRSRIPPQIGLLTNLVYMSMSNNNLSGIIPPTLGNMTSLVILALTTNHLRGRVPDEIGKLPNISIVVLGDNMLSGIELRANLLTGTLPINMGDNLPKLKSLFLGHNMLEGHIPASLGNASTLKQVVLQTNNFTGQIPTTFGKLFGLSRLDLQANMLEAKDSEGWGFLYALRNYSVLQILELTENQLQGIIPNSIGSLSNTLGYLMLGGNELSSIVPSCIGNLSGLVQLTLDANKLTGSISPWIGNLKYLEYLHLGKNRFTGPIPYSIGRLTRLTELYLENNAFEGTIPCEISNLRQLVYLKLASNKLTGNIPNALDRCQNLVTIQMDQNFLTGTIPISLGNLKGLSVLNLSHNILSGTIPAVLGDLPLLSKLDLSYNNLQGEIPRIELFRNATSVYLEGNRGLCGGVMDLHMPSCPQVSHRIERKRNLTRLLIPIVGFLSLTVLICLIYLVKKTPRRTYLSLLSFGKQFPRVSYKDIAQATGNFSQSNLIGRGSYGSEYKAKLSPVKIQVAIKVFDLEMRWADKSFVSECEILRSIRHRNLLPILTACSTIDYSGNDFKALIYEYMPNGNLDMWLHKKNTTVASKCLRLSQRVNIAVDIANALSYLHHECERSIIHCDLKPMNILLNSNMNAYLGDFGISSLVLESKFASLGHSCPNSLIGLNGTIGYIAPEYAQCGNASTYGDVYGFGIVLLETLTGKRPTDPMFENELNIVNFVEKNFPEQIPHIIDAQLQEECKGFNQERIEQENRCLPNHDDYSVDLQALLGFKQGITSDPNGALSNWNTSTHFCRWNGVNCSQVRPWRVTGLNLTRKSLSGQISSSLGNLTFLRKLLLHDLQQREVLNLRQNSLNGIIPDGLANCSSLTALALSSNNLMGRIPPTIGNLSMLLGLDLSQNNLAGIIPQDLGKIASLQYVDLSRNQLNGGIPNEFWQSQNIRVLYLNQNNLSVRLPQILPNVSYLTELSLASNMLVSTLPCNIGDAIPNIQLLYLGNNTFEGNIPDSIGNASELTELDLLSNNFDGRVPSPLGKLSRMSYLNLERNEFEANDSEGWEFFYGLANCSLEFLSLSTNQLQGVIPNSVGNLSKSLTRVLLGGNKLCGTVPQSIGKLHNLTQLSLDENNLTGKIEEWLQHLNLQSNNFIGIIPLSIGNLTQLASLILAENEFDGPIPSSLGNFSQLLKLNLSYNNFHGHMPKEVFSITTMTSCVLAYNDLDGPIPLDFAELQQLTKLHLSSNRLTGKIPESLGQCHELENIQMDQNLLTGNIPISFSSLKSLTMLNLSHNNLSSTIPTALGELKFLNQLDLSYNNLNGEVPTNGVFENTTAVSIIGNWGICGGPSNLQMPPCPTTYPRKGMLYYLVRILIPLLGFMSVIPLLYLTQVKNKTSKGTYLLLLSFGKQFPKVSYHDLARATGDFSKSNLIGSGSYGSVYEGKLVQVKVQVAIKVFDLKMRCADKSYISKCEVLRSIRHRNLLPILTACSTIDNLGNDFKALVYEFMPNGNLDKWLHKKSSYEAPNSLGLGQRISITANIADALSYLHHDSRTSIVHCDLKPSNILLDADMNAYLGDFGISNLVHNSTSTSACHSGVDSSLNSSIGLWGTIGYIAPEYAQSWQPSICGDVYSFGIVLLEIVLGKRPTDPVFDNGLNIVIDVNLQEECKGFIEATAVEENEVYQCLLSLLQVALSCTRLCPRERMNMKEVANRTNFCRWNGVICTTSRPWRVSGLNLSDKSLAGKITSSLANLTSLNLSDNQFQGAIPPKIGSLINLQTVYLEQNYLSGTIPATVGNITQLSVLNLKSNQLEGNIPDGVWQLSNLTWLVLGQNKLSGGIPSALNLPLLTILGLEENMLGQVLPPKIGYALPSLQLISMYSNKFEGQIPTSIGNASGLQLMDFSANNFTGQIPSSIGRLSKLSRLNLERNQLEASDNQGWEFLYLLRNSTSLMVFSLAQNHLQGSLPHSVANLSSNLKILLLSENKLTGIVPPSIGNLCNLSKLGLEQNNFSGEIGEWIGKLKNLQGLNLGGNTFFGPIRPSIVNLTLLIELFLDNNKFEGTIPTALSYLQLLSKLDLSHNHLQGEIPRNGIFGNATAVSLDGNLRLCGGVVDFHMPLCSAASLKIERKSDLVRLLIPIFGVMSLTVLIYIITLGKKTPRRTYLFLFSFGKQFPKVSYNDLARATGNFCESNLIGRGSYGSVYTGKLTQAKIEVAIKVFNLEMRRADRSFISECEVLRTIQHRNLLSILTACSTIDNTGKDFKALVYEFMHNGNLDTWLHHEHAGVVRKRLSMDQRVSIAVNMADALIYLHHECGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFGIASLVLDSPLTSEGNSGCNSSIVVKGTIGYIAPGKHHCLVPFKASSCTNNCHLILFSQSMLKVLVHQPVVMFIVLE
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|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsCMeo_02g0025050 | OsCMeo_02g0025050.02 | Chr02 | 24490498 | 24494164 | + | IsoSeq | ||
| CDS seq | atgcggaggagttatggatctccatatgccatcgtgcccccaagtttctcacagaatagaaaggaagagaaatttgaccagattgttgattccaatagttggtttcttgtcactcacagtgctgatatgccttatataccttgtgaagaagacaccaagaagaacatatctatcattgctttcttttggaaagcagtt |
|||||||
| Protein seq | MRRSYGSPYAIVPPSFSQNRKEEKFDQIVDSNSWFLVTHSADMPYIPCEEDTKKNISIIAFFWKAV |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.778974 | 0.000000 | 0.521185 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0615400 | RBH | 1.810530 | 3.247144 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g40190 | RBH | 0.669016 | 2.108611 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0615400 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0024960 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0025120 | SBH | 0.148515 | 0.000000 | 0.000000 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0018330 | RBH | 2.641817 | 11.035939 | 6.852427 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0024670 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0024600 | RBH | 1.744725 | 5.268727 | 0.000000 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0396500 | RBH | 0.7189395 | 0.971307 | 0.895161 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0024600 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.063692 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0425700 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0024820 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0024640 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0024950 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0024830 | RBH | 0.183171 | 0.0 | 0.157437 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0024430 | RBH | 7.177341 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G024460 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0024730 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.990536 |
