Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsIR64_02g0020370 OGI:02001240 | 16/16 IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:21975104-21992843
Gene Symbol OGG, Ogg, OsOGG
DNA seq

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Protein seq

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Function N-glycosylase/DNA lyase OGG1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FNY7]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsIR64_02g0020370 OsIR64_02g0020370.01 Chr02 21975104 21992843 - NAM
CDS seq

ATGGATCCCTTATCTCCCCTAAATTTGGTCCTGCCATTAGCTATACTACTGTCCTCACTCCTTGCCCCTCCTGCCATTGCCATGCCATCCATCGAAGAGCAAGCGTGGAAGGCCACCCTGCAAACCCAGGAACCCCTGCAGTCCTGGGATCGCAAGGCATGGCCATGCCACAGCTGGCGTGGCATTGGGTGCGATCTCAAGTCCTTGGATCTTTCAGATAATAACCTCTCTGGATATATTCCTGAGCAGATTGGAAATTTGGTGAAGTTGAGGTCCATGAAACTTAATTCCAATAGATTATTAGAAGTTGGGAACTTAGCGATCTTAGAAGACTTGAGGCTTGGCATAAACAAACTTTCAAGTTCCATTTCAAACAGTATTGGGAACTTGGCTAAGCTCTCTGTGTTGATTCTTTGGGGCAATCAACTTTCCGGGCACATTCCAAACAACTTAGGGAATTTGACTAAACTCTCGCTCTTGGATCTTTGTCACAACCAACTTTCTGGGCACATTCCTCAAGAACTAGGTTACCTGGTGAACTTAAAGGGCCTAAGGCTTTGTGACAACATGCTCTCAGGTTCCATTCCAAACAACTTAGAGAATTTGACTAAACTCACTGTCTTATCACTTTATAAAAACCAACTTTCTGGACACATTCCTCAAGAACTAGGTTACCTTGTGAACTTAAAGAACTTATCGCTTTATTCAAACAACTTCACAGGTTTGATCCCACGTAGCTTAGGGAATCTGTCTAAACTCTCCCACTTGTTTCTTTGGCACAAACAACTTTCTGGGCATATTTCTCAAGAACTATGTAAGCTAGTGAATTTAGAGAAATTAGATCTTTCCTTTAACATGCTCACAGGTTCCATTCCAAACTGCTTAGGGAATTTGACTAAACTCACTGACTTAGCACTTTTTGAAAACCAATTTTCTGGTCATATTTCTCAAGAACTAGGTTCCATCCCGAACAGCTTAGGGAATTTGAATAAACTCTATTCCATAAATCTTGTATCTAACCAACTTTCTGGATTTATTCCTCAAGAACTTGGCAACTTAGTGAATCTAGAGTTTTTGGAAATCAGTCTTAATAATCTCTCTGGTGAGTTACCATCAGGACTATGCGCAGCAAGTCGGCTACAAAATTTCACTGCTGATCACAACAGCCTTGTTGGACCATTGCCAACAAGCTTACTAAACTGCAAAACCCTAGTTAGAGTTCGTCTTGAGCGAAATCAACTTGAAGGAGATATCTCCGAGTTGGGCCTTCATCCAAACCTTGTCTATATTGACATGAGCTCAAATAAACTGTTTGGACAATTATCTCCTCGGTGGGGGCACATTCCACCAGAAATTGGTAGTATGGTGTCTCTATTCAATTTGAGCCTCGCGAACAACTTGCTCCATGGAAACATACCAGAGGAACTAGGTTCTCTACAGAATCTCGAGTATTTGGATTTATCATTGAACAACCTAAGCGGACCAATACAGGGATCAATTGAGAACTGTTTGAAACTTCAATCACTAAGGCTGGGACATAATCACCTCGGAGGAAGCATACCTATTAAACTAGGGATGCTGACATACCTTCAAGAATTGGTGACGGAGAAGTGCGATGTTTACAGCTTTGGAGTGCTCGTCTTTGAGCTGTTCATGGGGTGTCATCCTGGTGATTTCCTGTTGTCCCTCTCCATGGCCAAGGAAAGTACAACCCTGAAGGATTTGTTGGACGCCCGGCTCCCACTTCCTGAAGCTGAGACAACAAGTGAAATATTCAGAGTGATCATGGCTGCTGTCCAGTGCTTGGACCCCAACCCATTACATCGTCCAACAATGCTGCATGTAACTAGGATGTTCTCTACAGCTGAAGTACATGGCAATCTCCGGCCGCCGCTCCCACCCTCCCCTCCCCTCCTCTCTTCCACCACCGCAACACCACCGCCAACCCCGCCCGTGGGCACCCCCAAATCCGAGGCCGCCGACCGCCGCCCTCCTCCCGCCCGCCGCCGCCTCCCCCTCGTCTCCGCCGCCGCCGTCGAGGAGGAGGACGGAGAGTGGCACCCCCTGCCGCTCTCCGCCGCCGACCTGTCCCTCCCGCTCACCCTCCCCACGGGGCAGACCTTCCTGTGGCGCCGCACGTCTCTCTCCCCGCTCCGCTTCACCGGCGCCGTGGGGCCTCACCTCGTCTCCCTCTCCCACCTCCCGTCCTCCGACGGCCGCCTCGCCTTCCTCCTCCACAACAACGGCGGCTCCTCCTCCTCCTCCGTCCCCGCGGCGGCCCGCGCCGCGCTCTCCGACTACCTCAACGCCGCCGTGCCGCTCGCCGACCTCTGGCGCCGGTTCGCCGCCGCGGACGCGCGGTTCGCGGAGGTCTCCGCGCGGCTCGGGGGCGGCGGCGCCCGGGTGCTCAGGCAGGACCCCGTCGAGTGCGTGTTCCAGTTCCTCTGCTCCTCCAACAACAACATCGCGCGGATCGAGAAGATGGTGTGGGCGCTGGCCGGCTACGGGGAGCGGCTCGGCGAGGTTGGAGGATACCAATTCCACCAATTCCCCACGATCGAGCGGCTCGCGCGCGTGTCGGAGCAAGAGCTCCGGGATGCCGGGTTCGGGTACAGGGCAAAGTACATCGTCGGCACTGCTAAAATATTACAGGCCAAGCCTGGTGGAGGCGAGAAATGGCTTGCCTCATTGCGTACAAGGGAACTCCCGGAGGTGATTGAGGCTCTTTGCACCCTTCCAGGTGTTGGGCCAAAAGTTGCTACACAATATCTGATGCCGGAGCTAGCTGGCAAGAGCTTAACCCCAAAACTTAGTGTTGCTGTTGCCGATGCATTTGTTGCTAAATTTGGGAACTATGCTGGTTGGGCACAGAATGTTCTCTTTATTGGCCAGCTGTCTGCTCAAAAACTCATGGTTGCTGAAACTACAAACACTTCCACGAAACCTACTAAAAGGAAGCGTAGTGGAAACAATGTCAAAACATGA

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.000000 0.030874

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0552600 RBH 0.585477 0.855951 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g34770 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0552600 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0020930 SBH 0.224015 0.0 1.065708
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0021010 SBH 0.036886 0.207486 0.122091
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0020990 SBH 0.000000 0.323324 0.581727
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0020740 SBH 0.027518 0.028389 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0020640 RBH 1.418057 0.0 0.518677
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0344300 RBH 0.634974 1.5460675 1.0839395
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0012980 SBH 0.041475 0.997256 1.472669
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0369600 RBH 0.7525595 1.963957 1.8896305
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0020870 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0020610 RBH 0.053822 0.000000 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0021050 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0020740 SBH 0.000000 0.052192 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0020560 SBH 0.094109 0.146955 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G021010 RBH 0.045803 0.000000 0.179761
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0020740 RBH 0.000000 2.283685 0.000000
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