Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsARC_11g0006430 | OGI:11015440 | 16/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:5197674-5230188 | ||||||||
Gene Symbol | OsFbox572, Os_F0135, Os_F0031, OsFbox577, Os_F0135, OsFbox579, Os_F0334, OsFbox582, Os_F0511, OsFbox583, Os_F0363, OsFbox584, Os_F0231, OsFbox585, Os_F0294, OsFbox586, Os_F0088, Fbox-13, OsFbox587, Os_F0097, OsFbox588, Os_F0365, Fbox-10, OsFbox591, Os_F0435, Fbox-5 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | MEIOTIC F-BOX protein MOF [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7X7A4] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsARC_11g0006430 | OsARC_11g0006430.01 | Chr11 | 5197674 | 5230188 | - | NAM | ||
CDS seq | 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Protein seq | MSQRKKAKELPGSTGGDRIGALPDEVLHHVLSFLPAQEAVQTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDQKEFLNRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLVWFRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKVRFLLLDVDICYHSPFLMDEMPLVSRHLTRLQLKNIGLNNSFLNFSSCPALEHLVFESCKFDCAKISSSSAKRLSIADSYFSETSRVRIAIPSLVSLQLDYFHGRTPVLETMPSLLDAFVRVLYWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISEHGSGPKHRMKIKGNCHSMDRSLVISAHLEIVEIKCKTVDKRMPKESPGSTGGDRIGDLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDCDYLGSVKKQKEFLDRLLLLRDGAPLDTCVLMFDYYGDMDIEDTARVNLWFRHALIHKARFLWLDVGYYHSFVIDEMPLVSQHLTRLQLRNIRVNDSFLNFSSCPALEHLVFQSCKFGCAKISSSSAKRLSITNSYFSEISRVRIAIPSLVSLQLDGFHDRAPVLERMPSLVDAFVGVLNWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISERGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALTCILQHAPVLENLILQICSKGPKHRMKIKGNCHSMDSSLVISAHLEIVEIKCETVDKRVLKVLKYLSTFNILFSFKEIEILEGYDNDQDEVEEDEDEDSHEDEDENEDSYGDPYEDEDDDEDGDEVEEENGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKNCVLLEGLSEAKMLVLINEDESFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDDEEDEESKNDARRMNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIFSSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTFIFKRDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLWKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSRLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCGEVNENVSKVLKFLCAFNLRFSF
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|
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsARC_11g0006430 | OsARC_11g0006430.02 | Chr11 | 5222955 | 5225285 | - | IsoSeq | ||
CDS seq | ATGACAATGACCAGGACGAAGTGGAGGAAGATGAAGATGAGGACTCTCATGAAGACGAAAATGAAGACTCTTATGGAGACCCTTATGAAGATGAAGACGACGATGAAGATGGAGACGAAGTGGAAGAGGAAAATGTTTGATGCACCACTG |
|||||||
Protein seq | MTMTRTKWRKMKMRTLMKTKMKTLMETLMKMKTTMKMETKWKRKMFDAPL |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.026985 | 0.037452 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0202400 | RBH | 0.287599 | 0.0 | 0.888899 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g09670 | RBH | 0.0 | 0.096173 | 0.087435 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0202300 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006540 | RBH | 1.255232 | 11.059969 | 24.505333 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0006610 | RBH | 0.079839 | 0.0 | 0.969882 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0006600 | SBH | 0.000000 | 2.558610 | 1.576523 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0006310 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0006390 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.969774 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0086700 | RBH | 1.05597 | 2.553869 | 1.688447 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0006440 | RBH | 0.080080 | 0.0 | 0.486420 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0087900 | RBH | 1.645992 | 3.97096 | 7.203659 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0006390 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0006470 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006550 | RBH | 0.898805 | 0.000000 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0006500 | RBH | 0.873359 | 0.0 | 0.723187 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0006540 | RBH | 0.147365 | 0.486698 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G006490 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0006370 | RBH | 0.242504 | 2.849076 | 0.510408 |