Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_11g0006430 OGI:11015440 | 16/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:5197674-5230188
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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_11g0006430 OsARC_11g0006430.02 Chr11 5222955 5225285 - IsoSeq
CDS seq

ATGACAATGACCAGGACGAAGTGGAGGAAGATGAAGATGAGGACTCTCATGAAGACGAAAATGAAGACTCTTATGGAGACCCTTATGAAGATGAAGACGACGATGAAGATGGAGACGAAGTGGAAGAGGAAAATGTTTGATGCACCACTG

Protein seq

MTMTRTKWRKMKMRTLMKTKMKTLMETLMKMKTTMKMETKWKRKMFDAPL

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.026985 0.037452 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0202400 RBH 0.287599 0.0 0.888899
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g09670 RBH 0.0 0.096173 0.087435
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0202300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0006540 RBH 1.255232 11.059969 24.505333
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0006610 RBH 0.079839 0.0 0.969882
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0006600 SBH 0.000000 2.558610 1.576523
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0006310 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0006390 RBH 0.0 0.0 0.969774
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0086700 RBH 1.05597 2.553869 1.688447
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0006440 RBH 0.080080 0.0 0.486420
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0087900 RBH 1.645992 3.97096 7.203659
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0006390 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0006470 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0006550 RBH 0.898805 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0006500 RBH 0.873359 0.0 0.723187
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0006540 RBH 0.147365 0.486698 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G006490 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0006370 RBH 0.242504 2.849076 0.510408
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