Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLaMu_11g0006540 | OGI:11015440 | 16/16 | LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:5369894-5401359 | ||||||||
| Gene Symbol | OsFbox572, Os_F0135, OsFbox579, Os_F0334, OsFbox582, Os_F0511, OsFbox583, Os_F0363, OsFbox584, Os_F0231, OsFbox585, Os_F0294, Fbox-14, OsFbox586, Os_F0088, Fbox-13, OsFbox588, Os_F0365, Fbox-10, OsFbox591, Os_F0435, Fbox-5 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MSQRKKAKELPGSTGGDRIGALPDEVLHHVLSFLPAQEAVQTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDQKEFLNRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLVWFRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKVRFLLLDVDICYHSPFLMDEMPLVSRHLTRLQLKNIGLNNSFLNFSSCPALEHLVFESCKFDCAKISSSSAKRLSIADSYFSETSRVRIAIPSLVSLQLDYFHGRTPVLETMQSLLDAFVRVLYWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISEHGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALSCILQHAPVLGNLILQIYSKFLVLRKSRFWKKMKMTRMKRRKMRMKTRTLMKTLLKTKMKTLTKANMKTKTMKTKTKTMTMKTKTKTKMKSKRKRKRKMMPKESPGSTGGDRIGDLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDCDYLGSVKKQKEFLDRLLLLRDGAPLDTCVLMFDYYGDMDIEDTARVNLWFRHALIHKARFLWLDVGYYHSFVIDEMPLVSQHLTRLQLRNIRVNDSFLNFSSCPALEHLVFQSCKFGCAKISSRSAKRLSITNSYFSEISRVRIAIPSLVSLQLDGFHDRAPVLERMPSLVDAFVGVLNWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISERGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALTCILQHAPVLENLILQICSKGPKHRMKIKGNCHSMDRSLVISAHLEIVEIKCETVDKRVLKVLKYLSTFNILFSFKEIEILEGYDNDQDEVEEDEDEDSHEDEDENEDSYGDPYEDEDDDEDGDEVEEENGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKNCVLLEGLSEAKMLVLINEDESFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQISVWRKRRLRRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDEEEDEESKNDARRVNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIISSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTFIFKRDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLRKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSKLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCEEVNENVSKVLKFLELASARRPFDGMPPAKRGKEGGSGRRRRPHRRAAGRTRTSTHVLSFLPARDAVQTCRCVLARRWRELWKSATAGPEDWGRRRRRRRRRRREMARVQDMMEFMDHLFLLRGLRAGAARHARAQVLV |
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| Function | MEIOTIC F-BOX protein MOF [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7X7A4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLaMu_11g0006540 | OsLaMu_11g0006540.01 | Chr11 | 5369894 | 5401359 | - | NAM | ||
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| CDS seq | 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|
|||||||
| Protein seq | MSQRKKAKELPGSTGGDRIGALPDEVLHHVLSFLPAQEAVQTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDQKEFLNRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLVWFRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKVRFLLLDVDICYHSPFLMDEMPLVSRHLTRLQLKNIGLNNSFLNFSSCPALEHLVFESCKFDCAKISSSSAKRLSIADSYFSETSRVRIAIPSLVSLQLDYFHGRTPVLETMQSLLDAFVRVLYWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISEHGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALSCILQHAPVLGNLILQIYSKFLVLRKSRFWKKMKMTRMKRRKMRMKTRTLMKTLLKTKMKTLTKANMKTKTMKTKTKTMTMKTKTKTKMKSKRKRKRKMMPKESPGSTGGDRIGDLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDCDYLGSVKKQKEFLDRLLLLRDGAPLDTCVLMFDYYGDMDIEDTARVNLWFRHALIHKARFLWLDVGYYHSFVIDEMPLVSQHLTRLQLRNIRVNDSFLNFSSCPALEHLVFQSCKFGCAKISSRSAKRLSITNSYFSEISRVRIAIPSLVSLQLDGFHDRAPVLERMPSLVDAFVGVLNWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISERGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALTCILQHAPVLENLILQICSKEIEILEGYDNDQDEVEEDEDEDSHEDEDENEDSYGDPYEDEDDDEDGDEVEEENGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKNCVLLEGLSEAKMLVLINEDESFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQISVWRKRRLRRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDEEEDEESKNDARRVNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIISSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTFIFKRDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLRKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSKLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCEEVNENVSKVLKFLELASARRPFDGMPPAKRGKEGGSGRRRRPHRRAAGRTRTSTHVLSFLPARDAVQTCRCVLARRWRELWKSATAGPEDWGRRRRRRRRRRREMARVQDMMEFMDHLFLLRGLRAGAARHARAQVLV
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.147365 | 0.486698 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0202000 | RBH | 0.372229 | 0.359684 | 1.218415 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g09680 | RBH | 1.041908 | 0.135368 | 0.361848 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0209502 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006540 | RBH | 1.255232 | 11.059969 | 24.505333 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0006550 | RBH | 0.142942 | 0.162571 | 0.531425 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0006600 | SBH | 0.000000 | 2.558610 | 1.576523 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0006430 | RBH | 0.026985 | 0.037452 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0006280 | RBH | 1.941152 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0084300 | RBH | 0.4956525 | 0.1257805 | 0.3707745 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0006310 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0088100 | RBH | 1.0185735 | 2.223057 | 5.09362 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0006490 | SBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0006580 | RBH | 0.079067 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006470 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0006620 | SBH | 0.040105 | 0.0 | 0.065152 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0006510 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G006600 | RBH | 0.107812 | 1.806731 | 0.886747 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0006390 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
