Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_11g0006550 | OGI:11015440 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:5146378-5175523 | ||||||||
| Gene Symbol | OsFbox579, Os_F0334, OsFbox582, Os_F0511, OsFbox583, Os_F0363, OsFbox584, Os_F0231, OsFbox585, Os_F0294, Fbox-14, OsFbox586, Os_F0088, Fbox-13, OsFbox588, Os_F0365, Fbox-10, Fbox-9-pseudo, Os_F0394 | ||||||||||
| DNA seq | ctaaaaactgaatcctgtaaaagaaaaggaaaggcacattaagttcaaaatcaagtattatctagagaagtactccagtgttcagtaagttgacaaataaactttatggaacagattttgatcagtataaatttttgcttgcccaccatacagcttaatctcatcgatatgttacttatgcaacatgaaatgacaaaatgttatggacatcaattatcatggatggagtaagggtccaaagtcaaggataaagacaagatagctctcatccacatcggccttgtcctgatggctacgagatcttttaataagctagatctaattttataatcctatacaattaattttacaatcctgatggctacgagatcctttattgcttaattaataatggggtacatgggggagggtcttcctgctacaacaccgcacatactactttcctaagaaataatatctgtaattattaattaaaccaattattttctaatcgtattgttagttgttaacgtgcattgtattggtcatgctacaattccaatgcccataacaactgatgtttttgtcatcaatgggaatgtgaagtttcaataaaacacaatcagctaaaggtttgcgttcaaggataaaagaagaaccaagaaaaagctaaaggaaaaatatacatgtgtaaaaaactcctaacagaaaggggtgactgagtgagtactgtgaaaataatgtactggagatgttattcattggcaatgcaaatgcatacagttagctcgtatAaaaaaacaaccagatgatgcaaaattcatttcaacaaaggtgtgcaaccataacaattctttaataaatgtgaggcatattgttttatcgaattgctgcatagaacgaccaatggaaaatcggtcaagcattcattaaatttcccctacaaggtgtgcagttgatgatttgctacttcttccgttgcaatcgaggatttgtaaccaccaagatgtaactagctgagattttgcactcttggtgtgtaattgtatttttacttaaaacatgaacatgtaaaaatggaaatgctcatgtaccagctattttgtaaattttattaattccAaagccaaccttttgtaacacgtattcaatgcagtcgttctttaggtgagaactaatcaggagtacaatatccagaactattaaacaaatcaacatcttggcatatactatatatgcaaccctgttatactaaataaccctatccatgcatttgtggatataccagccagtttatacccgtgacccAccaaattatcttgtagtcctactgtactatatcattttccggatagacacaagaaattgctgctttcattcaaacacataaaggtgaagacatttttttagataaaccgaaagtgtaagagcagttcttagttagcttacgtaagttaaatgcacacaggaatttcagaactttggagacattctcattgacctcttcgcatttgacttccactatattaaggtgctccggtatttcagctggtctgtccatcataccaaaactcccattcatttccactttatgtccaggtccctgaagaaaacaagggcattataccaagctcaatcaatagtgtataacaactttaatctgttaagagaatacatacccaggagaaaagatgaagagtgagcttctcaagaactggcgagtgtttgagaatgcagcttaatgcgtggaactcaggagccacacaccagtggtcatttagcaataaagtcttcagcttgctaaatgtagggtaccatttcaagtccctgttgaaaataaactagacagaaaacaggacatgcaaaagatcaactaatattacaccgaatactatgtataatccagttagtggcattgcatatgagaatttttgtttgagactttgagcacctttgtaagtgtatagcagtggatatagaaactaccaacagaacaatGggactataatacgtactacgtaaaggagttggggacaaaacaagtgtgtaatcataccgttctgcaatgagctaccaatgccaaattctttgcttctgataaacctttcagaagaacacagcttctgtcatcatttatagggtaacagtagttacaatcctcaaaaccacaataaccagagccagcatttctacaaaagtcggaacatccagagttgaccgtgatggttgcctccaccaatgatggcatgctctcaagcagaggagtcatgcaccaatagtcatccagctgcagtgaaacaagacttgggacacaaatccgagtgcgaaaattcctaacggccccaaaagagcagtgactgatgctcaattgttgcagtgacccggcagatgagctaatcatggggcatgatatcatggagtcggaaatcttcagatgtttcagcgccgagcagcttgagaagttacagaatctgtctgttaggtcgagtttaaagagctctagcctcgtcaggtggcgggagacaagaggcaggtcgtccaattcaaagactccaccggcaatgcttctgaccacgagatgccggacctgcgaggcaacagcatgccggatccagagatttacccggcgggtctcgtcgtcgtcgtcgtagtagtcagaccagaacctgagctcgcacatgtcgagaggctcgcatccgcggaggaggaggaggtggtccacgaactccctaatgtcccgcacacgcggcttctcttccactcgccaccaaacccaatcctcactctcgcccccaatcctcaggcctgtggccgacttccagaggtggcgccagcggccagcgagcacgcacgtctgcacggcgtcccgcgccggcaggaacgacagcatgtggtggaggatctcgtccgggagcgcgccgatgcggtcttcgccgccggcctggtccttcttggacctcttcgctggaggcattccgtcaaacaggctgtgggcgcgcgggcgctcactggcgcaggagagatacggttcagctgcagatgacgcaggagagagatgcgcactagctcacccgaacaacgccgcctcacctccccggaaatggtttgagcttgcgtgccgcggctcgccggcgtgggcgacggcgacggcgacgcgcgggggtgggggagaggtgttttgggcctttggagatggaggtggcgaggtaattctagtaacggggtaagtagccgaggagtagctgttgtttttttttcctaaaaaaaagccttttagtttctggtttctaatttactttttttttaattctataactgtattctctgaatttagatgagaatttagatatataaatatgtaagagcaggtacaataaccatgttcattaggctccatgaaacgccacatcagacttcagatgagctagaagagagatttagagagagAaaaaaaatgtcggggacaaggtgggtctcctgagttacagactttctcgtgagatttatataaactctccggcacaatcttcaaagcaaggtgggtctcctgagttacagactttctcgcgagctataatacaaatcaatgtgtgtgttgcttattcagattcgttgtatttggttgtatcaaattatctcgtacgatggaggggtacctaatagagAaaaaaaataagagaggaagttgggacccatcatataataaaataaattttctacataatataggagacagtaaattctattatatattgtaaaagttatcagttaagatatatacaggtgacatgtctaaaattagagccagcaactgattgtactattcaacatccattagaatcaactgaatcttttacatgcatttggtatgcaccccatgatggcattaccattacctactcagataattatataaaattttagaattataataatataaattatatgccacaagtgtatgcacgaaattagtacaaggctaaatatagtgtgcatttgaataaaaaaacatgcgagaatagtaatgcacagtacaaatacatttttttattttgtttgtccgagtgttaatggaatacttgtcttgatttgtttatccgaaaatttctcgagaccacgaagtgagcgtaggtgacatatccattaacaacgagacgcccataatggctttatcaatcttaagatatgcgcagcttaatctttcagaggtgttcataggattgggtgtgcgtgtatgcgcatgttgtaagcgtttgtatttatactgtgtttcttaaagacaatgcctagactgtgcacatacatatatgcaaatgattatagataaagtgttcaataacgagacattcgtgatgactttgtcaatctcaagttgtctccggcccaatcttttagaggtgtttatagggttgtgagtgtgcatgtgtgagcgtatgcatttgtaccatgtttttcttaaaaaaatatctcgagaccaaggcgcacacatatatgcaaatgattatagacaatgttgaacactacaaatggaaccattgaaggggtctaacaaacatataaaaatatcgaaggaagcagttaacatcagttgactgaaaacttcaatttcaaacgccaaaatgacatttcaaattccactataaaataacggctgatagtgtatggagtagcttgcttataggttacggccattagctagcattgccccagtgacctccaatttcggtcaagcaacatcttgttcaaagaaagctagcttgtcagaaatgtctgtcatttatgagtagttgagaaattataagtttcaagtagagtaaatatcattcaaataacttaagatgctttttatgtatttgcaacatttgtttaggttaagtttattacttcaaggttggcctctttcttaatttgtttaccggaatcatgtgttggtcatcttgtttaaccaaagaagagttgcaattcaagaatgctttctttcgtatgattttagtttgatatggtttatcttgatcaccata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| Function | MEIOTIC F-BOX protein MOF [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7X7A4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_11g0006550 | OsKeNa_11g0006550.02 | Chr11 | 5146378 | 5166032 | - | NAM | ||
| CDS seq | atgtctgcgcggaaggaggccaagggatcggccggcggagaccgcataggggccctcccggacgaggtgctccaccgcgtgctctccttcctaccggcgcaggatgctgtccggacgtgcgtgctagccccgcgctggcgccacctctggaagtccgccacggggctgcgcgttggcgaggacgagagcaatctggggagtgtgaaggagcagcaggagtttcttgaccatctgctggtactccgtgatagcgcgcctcttgaaacctgcgtgctaaggttcaattggtatgacgacgatgacttcgaggacatattccggctgaacgtctggttcaggtatgctatccaccgcaaggttcggttccttcgactcgatgtctggcaggaagaggaatttggcaacccggttccgatagatgagcagcctattgtctctcagcacttgacaaggctacagctttatggtatagtgctaaacgacggcttgcttgacttctcaagctgcccatcattggagcatctagtgtttgagtcatgcgtatttgagtgtgccaagatctcatctaactccgtaaaacatctgagcatcacgttttccaatttccccgctgggacctcacgggttcgtattgatatcccgagtcttgtttctctgcggctggatcgcatctatgaccgtaagccagtgcttgagaggatgccatcattagttgatgcatttgtcagtgtcccaagctctagtgaagacttctgtggtgaatctgactctggggattgtggtcgtgacggctgtgaatcttgttatggtttcACgaacaaaaattgtgtgcttttggaaggtttgtcggaagctaagatgttggtgctgataaacgaagatgaatcgtttattttcaaaagggatttgaaatggtgcccaacatttagcaagttaaagactttgatactcaatgggtactggtgtgtgcctgatgattctcacatgctagctcgcattcttgaacactcgccagccctagaaaaactcgttttccagcttggttaccaggcatataaacgtacaaataaaattaaaggaattctcaatccaatggagagatcagctggaatatcagaacacctccagatagttgaagttcaatgcaatgcgattgatggtcagatttcagtttggaggaagcgacgattgagacgaaagaaggccaagagagcgccttgttctaccggcgtcgaccggataggggccctcccggacgaggtgctccaccgcgtgctctccttcctactggcgccacctctggaagtccgccacgaggctgcgcatcggcggagatcaaccctgggaagcatcaaggaacgccgaaggttcattgagaatctgctgctactccgtgacagcgcgcctctcggcacgttcgtgctaaggttccgtgagtgcgagggcatcgacgacattgcccggctgaacctctggtatcaggcatgctctgctccgcaaggctacaacttcacggtacaaaagctaaacgacatcttcctcaacttctcgagctgtccagcattggagcatctagtgtttgactattgtatacttgagtgtgccaagatctcatctagctccgtgaagctcttgagcattactgattccaatttcagtgagaccttgcgcagcgctaacgcccgtggcctgttcgacgaaatgcctacggggaaggaggggatggaagagcctttgccgaccgacgccgaccacattggggctctcccggacacagtgctccaccacgttctctccttcctgccgtcgcaggatgccgtgaggacgtgcgtgctcgccaagcggtggctcgacctctggaagtctgtcacggcattgcgcattggtgaccgtgacaagaggaagctgtggaccgtgaagggtctccaggggttcgtggaccattttctgctgctccgtgaaagtgtgcctctccacacatgtgtgctcaggttcatcgtgttcagcgaagacctcaacgagacatcccggctaaacctctggattaagcatgctctgctgcgtatggttcagtttctccaggtctccatccggcagaatacagccttctatcaccagattaatctaggcatcctgccttttgtttcacggcacttgtcgatgcttgagcttcacggtgtacggatggtgggaagtttccttgatttctccagatgcccggctttgcaacatctagaatttgaccgctgtgagttgccatgtgacaagatcttatcagagtccctaaaacttctgcgcatcactcgctgcaaattcagtcaaacatcacgggttcgtatttgtgtcccaagtcttgtttcactgcggcttgatgatttttatcgccgtactccagtgcttgagaggatgccatcattagttgaggcatttgtcagagttgtccacaggacttatgattgttgtgggtatgattatattaactccggtgattgtggtaatgagcactgtaagtcatgtcatggcatcaaggacgacaacaattgtgttcttctggatggtttatcagaagctaagactttggcattgattgatggaaccatatcgtttattttcaatagggatttaaaatggtgccctacatttagcaagttaaagactttattactcaatgaatactggtgtgtgcctgatgagtttagtgcactagcctgcattcttgaacatgcaccagttctagagaatctcattcttcagctctattccgagggtcctaagcatacaatgaaaatcaaaggaaactgtcatccaatggatagatcagctgcaatatcaggacaccttgagacagttgaaatcagatgtgaagtggttgataagagagtactcaaagttttgaagtacctgtctacatttaacatactgcagcgcgcacgccgcctgttcgacggaatgcctccggcgaagaggggccggaggatgatggacctggacggcggcggaggcgaagaccgcgtcggcgcgctcccggacgaggtgctccaccacatgctgtcgttcctgccggcgcgggacgccgtgcagacgtgcgtgctcgcccaccgctggcgcgacctctggaagtccgccacggggctgaggattgggagcgacgaggaagacacggcgcgcgtgcgggagatcagggtgttcgtcgaccacctcctgctcctccgcgggtgcgcgcctctcgacatgtgcgagctcaagttctggtttgacagcgacgaggacgacgacgaggaggacgaggagagcaagaacgatgcccgccgggtgaatctctggatccggagtgctgttgcctccaaggttcgtaatctcgtgctcaacaacatctgcagtggaagctttgagctggatgatttgcctcttgtctctcgccacctgacgaggctagagctctttaacctcgagctaaccaacagattctgcaacttctcgagctgcccggcgctggaacatgtaaagattgccaactccaccgtatcatgtcccaggattatctcatcatccaccgggtcactactccgtttgatcatcactcgatgctctttcgttgtcggtactagcttccgcactaaaatctgtgtccccagtcttgtttcactgcagctggacagcaattcgaagactcctctacttgagagtatgccatcgttagcagaggcaactgtcagagtcaccgctggatgttctgacgtttgtggaaatgctgattctgggtattgtggttttgaggattgcaagtactgttatcccatcgatgacaacagaaattgtgtgcttctgaatggtttatcagaagctaagaatttggcattgacagctgaatgcaaaacggacttgcaatggtgccctacatttagcaagctgaagactttattgctaaatgaccactggtgtgtggcccCtgacttccatgcattaagctgcattctcaaacactcaccggttctcgagaagcttactcttcatcttttttccaagggacctgaacataaagtagaattgaatgggagttttggtttgatggacagaccaactggaatatcagagcgccttaacatagtggaagtcaaatgcaaagtggttgatgagaatgtttccaaagttctgaagttcctgtgtgcatgtaacatacctgaaccgtatctctcctgcgccagtgagcgcccgcgcgcccacagcctgtttgacggaatgcctccagcgaagaggtccaagaaggaccaggccggcggcgaagaccgcatcggcgcgctcccggacgagatcctccaccacatgctgtcgttcctgccggcgcgggacgccgtgcagacgtgcgtgctcgctggccgctggcgccacctctggaagtcggccacaggcctgaggattgggggcgagagtgaggattgggtttggtggcgagtggaagagaagccgcgtgtgcgggacattagggagttcgtggaccacctcctcctcctccgcggatgcgagcctctcgacatgtgcgagctcaggttctggtctgactactacgacgacgacgacgagacccgccgggtaaatctctggatccggcatgctgttgcctcgcaggtccggcatctcgtggtcagaagcattgccggtggagtctttgaattggacgacctgcctcttgtctcccgccacctgacgaggctagagctctttaaactcgacctaacagacagattctgtaacttctcaagctgctcggcgctgaaacatctgaagatttccgactccatgatatcatgccccatgattagctcatctgccgggtcactgcaacaattgagcatcagtcactgctcttttggggccgttaggaattttcgcactcggatttgtgtcccaagtcttgtttcactgcagctggatgactattggtgcatgactcctctgcttgagagcatgccatcattggtggaggcaaccatcacggtcaa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| OsKeNa_11g0006550 | OsKeNa_11g0006550.01 | Chr11 | 5146378 | 5175523 | - | NAM | ||
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atgtctcagcggaagaaggccaaggaattgcctggctcgactggcggcgaccgtataggggccctcccggacgaggtgctccaccacgtgctctccttcctaccggcgcaggaggctgtccagacgtgcctgctagcccggcgatggctccacctctggaagtctgccaccgggctgcgcattggcgaagacgatatctatctgcgctgcgtgaaggaccagaaggagtttctcaaccgtctgctgctactccgtgatggcgcacctctcgacacgtgcgtgctaaggttccgttggctcgtttggtttagagacgagggcctcgatgacacagtacgggtgaaccactggttcaggcatgctttgctccacaagctggatggcttccatgacagggctccagtgcttgagaggatgccatcattagttgatgcatttgttggagtcctcaactggactaaagactattgcatttggtctgactCTggggattgtggtcatgagaactgcgaatcttgttacggtatcaaggacaacaattgtgtgcttttggaaggtttatcggaagctaagacgttggggctgataagtgaacgtggatcgttTattttgaaaagggatttgaaatggtgcccaacatttaccaagctaaagactttgttactcaatgaatactggtgtgtgcccgatgattttagtgcactaacttgcattcttcaacatgcaccggttctagagaatctcattcttcagatctgttccaagggacctaaacatagaatgaaaatcaaaggaaactgccattcaatggatagttcacttgtaatatcagcacatcttgagatagttgaaatcaaatgcgaaacggttgataagagagtactcaaagttttgaagtatctgtctacatttaacatactttttagttttaaggaaatcgagattttggaaggatatgacaatgaccaggacgaagtggaggaagatgaagatgaggactctcatgaagacgaagacgaaaatgaagactcttatggagacccttatgaagatgaagacgacgatgaagatggagacgaagtggaAgaggaaaatggtggcgccgacgcccgccgcctgttcggcggaatgtctgcgcggaaggaggccaagggatcggccggcggagaccgcataggggccctcccggacgaggtgctccaccgcgtgctctccttcctaccggcgcaggatgctgtccggacgtgcgtgctagccccgcgctggcgccacctctggaagtccgccacggggctgcgcgttggcgaggacgagagcaatctggggagtgtgaaggagcagcaggagtttcttgaccatctgctggtactccgtgatagcgcgcctcttgaaacctgcgtgctaaggttcaattggtatgacgacgatgacttcgaggacatattccggctgaacgtctggttcaggtatgctatccaccgcaaggttcggttccttcgactcgatgtctggcaggaagaggaatttggcaacccggttccgatagatgagcagcctattgtctctcagcacttgacaaggctacagctttatggtatagtgctaaacgacggcttgcttgacttctcaagctgcccatcattggagcatctagtgtttgagtcatgcgtatttgagtgtgccaagatctcatctaactccgtaaaacatctgagcatcacgttttccaatttccccgctgggacctcacgggttcgtattgatatcccgagtcttgtttctctgcggctggatcgcatctatgaccgtaagccagtgcttgagaggatgccatcattagttgatgcatttgtcagtgtcccaagctctagtgaagacttctgtggtgaatctgactctggggattgtggtcgtgacggctgtgaatcttgttatggtttcACgaacaaaaattgtgtgcttttggaaggtttgtcggaagctaagatgttggtgctgataaacgaagatgaatcgtttattttcaaaagggatttgaaatggtgcccaacatttagcaagttaaagactttgatactcaatgggtactggtgtgtgcctgatgattctcacatgctagctcgcattcttgaacactcgccagccctagaaaaactcgttttccagcttggttaccaggcatataaacgtacaaataaaattaaaggaattctcaatccaatggagagatcagctggaatatcagaacacctccagatagttgaagttcaatgcaatgcgattgatggtcagatttcagtttggaggaagcgacgattgagacgaaagaaggccaagagagcgccttgttctaccggcgtcgaccggataggggccctcccggacgaggtgctccaccgcgtgctctccttcctactggcgccacctctggaagtccgccacgaggctgcgcatcggcggagatcaaccctgggaagcatcaaggaacgccgaaggttcattgagaatctgctgctactccgtgacagcgcgcctctcggcacgttcgtgctaaggttccgtgagtgcgagggcatcgacgacattgcccggctgaacctctggtatcaggcatgctctgctccgcaaggctacaacttcacggtacaaaagctaaacgacatcttcctcaacttctcgagctgtccagcattggagcatctagtgtttgactattgtatacttgagtgtgccaagatctcatctagctccgtgaagctcttgagcattactgattccaatttcagtgagaccttgcgcagcgctaacgcccgtggcctgttcgacgaaatgcctacggggaaggaggggatggaagagcctttgccgaccgacgccgaccacattggggctctcccggacacagtgctccaccacgttctctccttcctgccgtcgcaggatgccgtgaggacgtgcgtgctcgccaagcggtggctcgacctctggaagtctgtcacggcattgcgcattggtgaccgtgacaagaggaagctgtggaccgtgaagggtctccaggggttcgtggaccattttctgctgctccgtgaaagtgtgcctctccacacatgtgtgctcaggttcatcgtgttcagcgaagacctcaacgagacatcccggctaaacctctggattaagcatgctctgctgcgtatggttcagtttctccaggtctccatccggcagaatacagccttctatcaccagattaatctaggcatcctgccttttgtttcacggcacttgtcgatgcttgagcttcacggtgtacggatggtgggaagtttccttgatttctccagatgcccggctttgcaacatctagaatttgaccgctgtgagttgccatgtgacaagatcttatcagagtccctaaaacttctgcgcatcactcgctgcaaattcagtcaaacatcacgggttcgtatttgtgtcccaagtcttgtttcactgcggcttgatgatttttatcgccgtactccagtgcttgagaggatgccatcattagttgaggcatttgtcagagttgtccacaggacttatgattgttgtgggtatgattatattaactccggtgattgtggtaatgagcactgtaagtcatgtcatggcatcaaggacgacaacaattgtgttcttctggatggtttatcagaagctaagactttggcattgattgatggaaccatatcgtttattttcaatagggatttaaaatggtgccctacatttagcaagttaaagactttattactcaatgaatactggtgtgtgcctgatgagtttagtgcactagcctgcattcttgaacatgcaccagttctagagaatctcattcttcagctctattccgagggtcctaagcatacaatgaaaatcaaaggaaactgtcatccaatggatagatcagctgcaatatcaggacaccttgagacagttgaaatcagatgtgaagtggttgataagagagtactcaaagttttgaagtacctgtctacatttaacatactgcagcgcgcacgccgcctgttcgacggaatgcctccggcgaagaggggccggaggatgatggacctggacggcggcggaggcgaagaccgcgtcggcgcgctcccggacgaggtgctccaccacatgctgtcgttcctgccggcgcgggacgccgtgcagacgtgcgtgctcgcccaccgctggcgcgacctctggaagtccgccacggggctgaggattgggagcgacgaggaagacacggcgcgcgtgcgggagatcagggtgttcgtcgaccacctcctgctcctccgcgggtgcgcgcctctcgacatgtgcgagctcaagttctggtttgacagcgacgaggacgacgacgaggaggacgaggagagcaagaacgatgcccgccgggtgaatctctggatccggagtgctgttgcctccaaggttcgtaatctcgtgctcaacaacatctgcagtggaagctttgagctggatgatttgcctcttgtctctcgccacctgacgaggctagagctctttaacctcgagctaaccaacagattctgcaacttctcgagctgcccggcgctggaacatgtaaagattgccaactccaccgtatcatgtcccaggattatctcatcatccaccgggtcactactccgtttgatcatcactcgatgctctttcgttgtcggtactagcttccgcactaaaatctgtgtccccagtcttgtttcactgcagctggacagcaattcgaagactcctctacttgagagtatgccatcgttagcagaggcaactgtcagagtcaccgctggatgttctgacgtttgtggaaatgctgattctgggtattgtggttttgaggattgcaagtactgttatcccatcgatgacaacagaaattgtgtgcttctgaatggtttatcagaagctaagaatttggcattgacagctgaatgcaaaacggacttgcaatggtgccctacatttagcaagctgaagactttattgctaaatgaccactggtgtgtggcccCtgacttccatgcattaagctgcattctcaaacactcaccggttctcgagaagcttactcttcatcttttttccaagggacctgaacataaagtagaattgaatgggagttttggtttgatggacagaccaactggaatatcagagcgccttaacatagtggaagtcaaatgcaaagtggttgatgagaatgtttccaaagttctgaagttcctgtgtgcatgtaacatacctgaaccgtatctctcctgcgccagtgagcgcccgcgcgcccacagcctgtttgacggaatgcctccagcgaagaggtccaagaaggaccaggccggcggcgaagaccgcatcggcgcgctcccggacgagatcctccaccacatgctgtcgttcctgccggcgcgggacgccgtgcagacgtgcgtgctcgctggccgctggcgccacctctggaagtcggccacaggcctgaggattgggggcgagagtgaggattgggtttggtggcgagtggaagagaagccgcgtgtgcgggacattagggagttcgtggaccacctcctcctcctccgcggatgcgagcctctcgacatgtgcgagctcaggttctggtctgactactacgacgacgacgacgagacccgccgggtaaatctctggatccggcatgctgttgcctcgcaggtccggcatctcgtggtcagaagcattgccggtggagtctttgaattggacgacctgcctcttgtctcccgccacctgacgaggctagagctctttaaactcgacctaacagacagattctgtaacttctcaagctgctcggcgctgaaacatctgaagatttccgactccatgatatcatgccccatgattagctcatctgccgggtcactgcaacaattgagcatcagtcactgctcttttggggccgttaggaattttcgcactcggatttgtgtcccaagtcttgtttcactgcagctggatgactattggtgcatgactcctctgcttgagagcatgccatcattggtggaggcaaccatcacggtcaactctggatgttccgacttttgtagaaatgctggctctggttattgtggttttgaggattgtaactactgttaccctataaatgatgacagaagctgtgttcttctgaaaggtttatcagaagcaaagaatttggcattggtagctcattgcagaacgtttattttcaacagggacttgaaatggtaccctacatttagcaagctgaagactttattgctaaatgaccactggtgtgtggctcctgagttccacgcattaagctgcattctcaaacactcgccagttcttgagaagctcactcttcatcttttctcctggggacctggacataaagtggaaatgaatgggagttttggtatgatggacagaccagctgaaataccggagcaccttaatatagtggaagtcaaatgcgaagaggtcaatgagaatgtctccaaagttctgaaattcctgtgtgcatttaacttacgattcagtttttag
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|||||||
| Protein seq | MSQRKKAKELPGSTGGDRIGALPDEVLHHVLSFLPAQEAVQTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDQKEFLNRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLVWFRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKLDGFHDRAPVLERMPSLVDAFVGVLNWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISERGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALTCILQHAPVLENLILQICSKGPKHRMKIKGNCHSMDSSLVISAHLEIVEIKCETVDKRVLKVLKYLSTFNILFSFKEIEILEGYDNDQDEVEEDEDEDSHEDEDENEDSYGDPYEDEDDDEDGDEVEEENGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKNCVLLEGLSEAKMLVLINEDESFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQISVWRKRRLRRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDDEEDEESKNDARRVNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIISSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLWKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSKLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCEEVNENVSKVLKFLCAFNLRFSF
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|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_11g0006550 | OsKeNa_11g0006550.03 | Chr11 | 5168286 | 5170060 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | atgacaatgaccaggacgaagtggaggaagatgaagatgaggactctcatgaagacgaagacgaaaatgaagactcttatggagacccttatgaagatgaagacgacgatgaagatggagacgaagtggaAgaggaaaatgtttgatgcaccactg |
|||||||
| Protein seq | MTMTRTKWRKMKMRTLMKTKTKMKTLMETLMKMKTTMKMETKWKRKMFDAPL |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.142942 | 0.162571 | 0.531425 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0202000 | RBH | 0.372229 | 0.359684 | 1.218415 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g09630 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0205900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006590 | RBH | 3.885571 | 0.000000 | 4.198319 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0006610 | RBH | 0.079839 | 0.0 | 0.969882 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0006530 | RBH | 0.629927 | 3.859250 | 2.320578 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0006530 | RBH | 0.065425 | 0.226444 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0006500 | RBH | 3.054646 | 0.000000 | 3.525641 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0086700 | SBH | 1.05597 | 2.553869 | 1.688447 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0006520 | SBH | 0.112591 | 0.000000 | 0.288314 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0085800 | RBH | 1.137848 | 0.2856575 | 6.653802 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0006430 | RBH | 0.084143 | 0.015012 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0006580 | SBH | 0.079067 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006510 | RBH | 5.264083 | 0.390062 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0006620 | SBH | 0.040105 | 0.0 | 0.065152 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0006540 | RBH | 0.147365 | 0.486698 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G006600 | RBH | 0.107812 | 1.806731 | 0.886747 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0006390 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
