Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLima_11g0006430 | OGI:11015440 | 16/16 | LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:5180568-5209712 | ||||||||
| Gene Symbol | OsFbox572, Os_F0135, OsFbox579, Os_F0334, OsFbox582, Os_F0511, OsFbox583, Os_F0363, OsFbox584, Os_F0231, OsFbox585, Os_F0294, Fbox-14, OsFbox586, Os_F0088, Fbox-13, OsFbox588, Os_F0365, Fbox-10, OsFbox591, Os_F0435, Fbox-5, OsFbox593, Os_F0278, Fbox-3 | ||||||||||
| DNA seq | ctaaaaactgaatcctgtaaaagaaaaggaaaggcacattaagttcaaaatcaagtattatctagagaagtactccagtgttcagtaagttgacaaataaactttatggaacagattttgatcagtataaatttttgcttgcccaccatacagcttaatctcatcgatatgttacttatgcaacatgaaatgacaaaatgttatggacatcaattatcatggatggagtaagggtccaaagtcaaggataaagacaagatagctctcatccacatcggccttgtcctgatggctacgagatcttttaataagctagatctaattttataatcctatacaattaattttacaatcctgatggctacgagatcctttattgcttaattaataatggggtacatgggggagggtcttcctgctacaacaccgcacatactactttcctaagaaataatatctgtaattattaattaaaccaattattttctaatcgtattgttagttgttaacgtgcattgtattggtcatgctacaattccaatgcccataacaactgatgtttttgtcatcaatgggaatgtgaagtttcaataaaacacaatcagctaaaggtttgcgttcaaggataaaagaagaaccaagaaaaagctaaaggaaaaatatacatgtgtaaaaaactcctaacagaaaggggtgactgagtgagtactgtgaaaataatgtactggagatgttattcattggcaatgcaaatgcatacagttagctcgtataaaaaaacaaccagatgatgcaaaattcatttcaacaaaggtgtgcaaccataacaattctttaataaatgtgaggcatattgttttatcgaattgctgcatagaacgaccaatggaaaatcggtcaagcattcattaaatttcccctacaaggtgtgcagttgatgatttgctacttcttccgttgcaatcgaggatttgtaaccaccaagatgtaactagctgagattttgcactcttggtgtgtaattgtatttttacttaaaacatgaacatgtaaaaatggaaatgctcatgtaccagctattttgtaaattttattaattccaaagccaaccttttgtaacacgtattcaatgcagtcgttctttaggtgagaactaatcaggagtacaatatccagaactattaaacaaatcaacatcttggcatatactatatatgcaaccctgttatactaaataaccctatccatgcatttgtggatataccagccagtttatacccgtgacccaccaaattatcttgtagtcctactgtactatatcattttccggatagacacaagaaattgctgctttcattcaaacacataaaggtgaagacatttttttagataaaccgaaagtgtaagagcagttcttagttagcttacgtaagttaaatgcacacaggaatttcagaactttggagacattctcattgacctcttcgcatttgacttccactatattaaggtgctccggtatttcagctggtctgtccatcataccaaaactcccattcatttccactttatgtccaggtccctgaagaaaacaagggcattataccaagctcaatcaatagtgtataacaactttaatctgttaagagaatacatacccaggagaaaagatgaagagtgagcttctcaagaactggcgagtgtttgagaatgcagcttaatgcgtggaactcaggagccacacaccagtggtcatttagcaataaagtcttcagcttgctaaatgtagggtaccatttcaagtccctgttgaaaataaactagacagaaaacaggacatgcaaaagatcaactaatattacaccgaatactatgtataatccagttagtggcattgcatatgagaatttttgtttgagactttgagcacctttgtaagtgtatagcagtggatatagaaactaccaacagaacaatgggactataatacgtactacgtaaaggagttggggacaaaacaagtgtgtaatcataccgttctgcaatgagctaccaatgccaaattctttgcttctgataaacctttcagaagaacacagcttctgtcatcatttatagggtaacagtagttacaatcctcaaaaccacaataaccagagccagcatttctacaaaagtcggaacatccagagttgaccgtgatggttgcctccaccaatgatggcatgctctcaagcagaggagtcatgcaccaatagtcatccagctgcagtgaaacaagacttgggacacaaatccgagtgcgaaaattcctaacggccccaaaagagcagtgactgatgctcaattgttgcagtgacccggcagatgagctaatcatggggcatgatatcatggagtcggaaatcttcagatgtttcagcgccgagcagcttgagaagttacagaatctgtctgttaggtcgagtttaaagagctctagcctcgtcaggtggcgggagacaagaggcaggtcgtccaattcaaagactccaccggcaatgcttctgaccacgagatgccggacctgcgaggcaacagcatgccggatccagagatttacccggcgggtctcgtcgtcgtcgtcgtagtagtcagaccagaacctgagctcgcacatgtcgagaggctcgcatccgcggaggaggaggaggtggtccacgaactccctaatgtcccgcacacgcggcttctcttccactcgccaccaaacccaatcctcactctcgcccccaatcctcaggcctgtggccgacttccagaggtggcgccagcggccagcgagcacgcacgtctgcacggcgtcccgcgccggcaggaacgacagcatgtggtggaggatctcgtccgggagcgcgccgatgcggtcttcgccgccggcctggtccttcttggacctcttcgctggaggcattccgtcaaacaggctgtgggcgcgcgggcgctcactggcgcaggagagatacggttcagctgcagatgacgcaggagagagatgcgcactagctcacccgaacaacgccgcctcacctccccggaaatggtttgagcttgcgtgccgcggctcgccggcgtgggcgacggcgacggcgacgcgcgggggtgggggagaggtgttttgggcctttggagatggaggtggcgaggtaattctagtaacggggtaagtagccgaggagtagctgttgtttttttttcctaaaaaaaagccttttagtttctggtttctaatttactttttttttaattctataactgtattctctgaatttagatgagaatttagatatataaatatgtaagagcaggtacaataaccatgttcattaggctccatgaaacgccacatcagacttcagatgagctagaagagagatttagagagagaaaaaaaatgtcggggacaaggtgggtctcctgagttacagactttctcgtgagatttatataaactctccggcacaatcttcaaagcaaggtgggtctcctgagttacagactttctcgcgagctataatacaaatcaatgtgtgtgttgcttattcagattcgttgtatttggttgtatcaaattatctcgtacgatggaggggtacctaatagagaaaaaaaataagagaggaagttgggacccatcatataataaaataaattttctacataatataggagacagtaaattctattatatattgtaaaagttatcagttaagatatatacaggtgacatgtctaaaattagagccagcaactgattgtactattcaacatccattagaatcaactgaatcttttacatgcatttggtatgcaccccatgatggcattaccattacctactcagataattatataaaattttagaattataataatataaattatatgccacaagtgtatgcacgaaattagtacaaggctaaatatagtgtgcatttgaataaaaaaacatgcgagaatagtaatgcacagtacaaatacatttttttattttgtttgtccgagtgttaatggaatacttgtcttgatttgtttatccgaaaatttctcgagaccacgaagtgagcgtaggtgacatatccattaacaacgagacgcccataatggctttatcaatcttaagatatgcgcagcttaatctttcagaggtgttcataggattgggtgtgcgtgtatgcgcatgttgtaagcgtttgtatttatactgtgtttcttaaagacaatgcctagactgtgcacatacatatatgcaaatgattatagataaagtgttcaataacgagacattcgtgatgactttgtcaatctcaagttgtctccggcccaatcttttagaggtgtttatagggttgtgagtgtgcatgtgtgagcgtatgcatttgtaccatgtttttcttaaaaaaatatctcgagaccaaggcgcacacatatatgcaaatgattatagacaatgttgaacactacaaatggaaccattgaaggggtctaacaaacatataaaaatatcgaaggaagcagttaacatcagttgactgaaaacttcaatttcaaacgccaaaatgacatttcaaattccactataaaataacggctgatagtgtatggagtagcttgcttataggttacggccattagctagcattgccccagtgacctccaatttcggtcaagcaacatcttgttcaaagaaagctagcttgtcagaaatgtctgtcatttatgagtagttgagaaattataagtttcaagtagagtaaatatcattcaaataacttaagatgctttttatgtatttgcaacatttgtttaggttaagtttattacttcaaggttggcctctttcttaatttgtttaccggaatcatgtgttggtcatcttgtttaaccaaagaagagttgcaattcaagaatgctttctttcgtatgattttagtttgatatggtttatcttgatcaccata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| Protein seq | MSQRKKAKELPGSTGGDRIGALPDEVLHHVLSFLPAQEAVQTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDQKEFLNRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLVWFRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKVRFLLLDVDICYHSPFLMDEMPLVSRHLTRLQLKNIGLNNSFLNFSSCPALEHLVFESCKFDCAKISSSSAKRLSIADSYFSETSRVRIAIPSLVSLQLDYFHGRTPVLETMPSLLDAFVRVLYWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISEHGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALSCILQHAPVLGNLILQIYSKTKMKTLTKANMKTKTTKTKTKTMTMKTKTKTKTKMKMKSKRKRKRKMMPKESPGSTGGDRIGDLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDCDYLGSVKKQKEFLDRLLLLRDGAPLDTCVLMFDYYGDMDIEDTARVNLWFRHALIHKARFLWLDVGYYHSFVIDEMPLVSQHLTRLQLRNIRVNDSFLNFSSCPALEHLVFQSCKFGCAKISSSSAKRLSITNSYFSEISRVRIAIPSLVSLQLDGFHDRAPVLERMPSLVDAFVGVLNWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISERGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALTCILQHAPVLENLILQICSKGPKHRMKIKGNCHSMDSSLVISAHLEIVEIKCETVDKRVLKVLKYLSTFNILFSFKEIEILEGYDNDQDEVEEDEDEDSHEDEDENEDSYGDPYEDEDDDEDGDEVEEENGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKNCVLLEGLSEAKMLVLINEDESFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQISVWRKRRLRRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDDEEDEESKNDARRVNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIISSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTFIFKRDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLWKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSKLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCEEVNENVSKVLKFLCAFNLRFSF |
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| Function | MEIOTIC F-BOX protein MOF [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7X7A4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLima_11g0006430 | OsLima_11g0006430.02 | Chr11 | 5180568 | 5209712 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLima_11g0006430 | OsLima_11g0006430.01 | Chr11 | 5180568 | 5209712 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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| Protein seq | MSQRKKAKELPGSTGGDRIGALPDEVLHHVLSFLPAQEAVQTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDQKEFLNRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLVWFRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKVRFLLLDVDICYHSPFLMDEMPLVSRHLTRLQLKNIGLNNSFLNFSSCPALEHLVFESCKFDCAKISSSSAKRLSIADSYFSETSRVRIAIPSLVSLQLDYFHGRTPVLETMPSLLDAFVRVLYWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISEHGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALSCILQHAPVLGNLILQIYSKTKMKTLTKANMKTKTTKTKTKTMTMKTKTKTKTKMKMKSKRKRKRKMMPKESPGSTGGDRIGDLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDCDYLGSVKKQKEFLDRLLLLRDGAPLDTCVLMFDYYGDMDIEDTARVNLWFRHALIHKARFLWLDVGYYHSFVIDEMPLVSQHLTRLQLRNIRVNDSFLNFSSCPALEHLVFQSCKFGCAKISSSSAKRLSITNSYFSEISRVRIAIPSLVSLQLDGFHDRAPVLERMPSLVDAFVGVLNWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISERGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALTCILQHAPVLENLILQICSKGPKHRMKIKGNCHSMDSSLVISAHLEIVEIKCETVDKRVLKVLKYLSTFNILFSFKEIEILEGYDNDQDEVEEDEDEDSHEDEDENEDSYGDPYEDEDDDEDGDEVEEENGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKNCVLLEGLSEAKMLVLINEDESFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQISVWRKRRLRRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDDEEDEESKNDARRVNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIISSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTFIFKRDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLWKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSKLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCEEVNENVSKVLKFLCAFNLRFSF
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.084143 | 0.015012 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g09960 | RBH | 0.312777 | 0.359230 | 0.187554 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0209502 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006690 | RBH | 0.419972 | 2.097456 | 3.382823 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0006550 | RBH | 0.142942 | 0.162571 | 0.531425 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0006530 | RBH | 0.629927 | 3.859250 | 2.320578 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0006530 | SBH | 0.065425 | 0.226444 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0006390 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.969774 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0086500 | RBH | 1.630338 | 3.605297 | 3.6334705 |
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| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0006370 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006550 | RBH | 0.898805 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0006620 | SBH | 0.040105 | 0.0 | 0.065152 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0006620 | RBH | 0.0 | 1.136861 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G006490 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0006390 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
