Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsIR64_11g0006440 | OGI:11015440 | 16/16 | IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:5223056-5254520 | ||||||||
| Gene Symbol | OsFbox572, Os_F0135, OsFbox579, Os_F0334, OsFbox582, Os_F0511, OsFbox583, Os_F0363, OsFbox584, Os_F0231, OsFbox585, Os_F0294, OsFbox586, Os_F0088, Fbox-13, OsFbox588, Os_F0365, Fbox-10 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | MEIOTIC F-BOX protein MOF [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7X7A4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsIR64_11g0006440 | OsIR64_11g0006440.02 | Chr11 | 5223056 | 5245032 | - | NAM | ||
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|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsIR64_11g0006440 | OsIR64_11g0006440.03 | Chr11 | 5247289 | 5249622 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGACAATGACCAGGACGAAGTGGAGGAAGATGAAGATGAGGACTCTCATGAAGACGAAGACGAAAATGAAGACTCTTATGGAGACCCTTATGAAGATGAAGACGACGATGAAGATGGAGACGAAGTGGAAGAGGAAAATGTTTGATGCACCACTG |
|||||||
| Protein seq | MTMTRTKWRKMKMRTLMKTKTKMKTLMETLMKMKTTMKMETKWKRKMFDAPL |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| SE | Chr11 | 5241875 | 5243469 | - | OsIR64_11g0006440.02 | OsIR64_11g0006440.02,OsIR64_11g0006440.01 | All |
| AF | Chr11 | 5249122 | 5254520 | - | OsIR64_11g0006440.03 | OsIR64_11g0006440.03,OsIR64_11g0006440.01 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.080080 | 0.0 | 0.486420 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0205900 | RBH | 1.098092 | 0.617297 | 0.994822 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g09640 | RBH | 0.464481 | 0.490450 | 0.273061 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0202300 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006590 | RBH | 3.885571 | 0.000000 | 4.198319 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0006610 | SBH | 0.079839 | 0.0 | 0.969882 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0006600 | RBH | 0.000000 | 2.558610 | 1.576523 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0006430 | RBH | 0.026985 | 0.037452 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0006280 | RBH | 1.941152 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0084300 | RBH | 0.4956525 | 0.1257805 | 0.3707745 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0006310 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0085700 | RBH | 5.4372965 | 2.440776 | 7.4983255 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0006430 | RBH | 0.084143 | 0.015012 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0006580 | SBH | 0.079067 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006360 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0006620 | SBH | 0.040105 | 0.0 | 0.065152 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0006390 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G006600 | RBH | 0.107812 | 1.806731 | 0.886747 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0006380 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
