Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsGoSa_11g0006510 | OGI:11015440 | 16/16 | GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:5299212-5328357 | ||||||||
Gene Symbol | OsFbox572, Os_F0135, OsFbox579, Os_F0334, OsFbox582, Os_F0511, OsFbox583, Os_F0363, OsFbox584, Os_F0231, OsFbox585, Os_F0294, Fbox-14, OsFbox586, Os_F0088, Fbox-13, OsFbox591, Os_F0435, Fbox-5 | ||||||||||
DNA seq | ctaaaaactgaatcctgtaaaagaaaaggaaaggcacattaagttcaaaatcaagtattatctagagaagtactccagtgttcagtaagttgacaaataaactttatggaacagattttgatcagtataaatttttgcttgcccaccatacagcttaatctcatcgatatgttacttatgcaacatgaaatgacaaaatgttatggacatcaattatcatggatggagtaagggtccaaagtcaaggataaagacaagatagctctcatccacatcggccttgtcctgatggctacgagatcttttaataagctagatctaattttataatcctatacaattaattttacaatcctgatggctacgagatcctttattgcttaattaataatggggtacatgggggagggtcttcctgctacaacaccgcacatactactttcctaagaaataatatctgtaattattaattaaaccaattattttctaatcgtattgttagttgttaacgtgcattgtattggtcatgctacaattccaatgcccataacaactgatgtttttgtcatcaatgggaatgtgaagtttcaataaaacacaatcagctaaaggtttgcgttcaaggataaaagaagaaccaagaaaaagctaaaggaaaaatatacatgtgtaaaaaactcctaacagaaaggggtgactgagtgagtactgtgaaaataatgtactggagatgttattcattggcaatgcaaatgcatacagttagctcgtataaaaaaacaaccagatgatgcaaaattcatttcaacaaaggtgtgcaaccataacaattctttaataaatgtgaggcatattgttttatcgaattgctgcatagaacgaccaatggaaaatcggtcaagcattcattaaatttcccctacaaggtgtgcagttgatgatttgctacttcttccgttgcaatcgaggatttgtaaccaccaagatgtaactagctgagattttgcactcttggtgtgtaattgtatttttacttaaaacatgaacatgtaaaaatggaaatgctcatgtaccagctattttgtaaattttattaattccaaagccaaccttttgtaacacgtattcaatgcagtcgttctttaggtgagaactaatcaggagtacaatatccagaactattaaacaaatcaacatcttggcatatactatatatgcaaccctgttatactaaataaccctatccatgcatttgtggatataccagccagtttatacccgtgacccaccaaattatcttgtagtcctactgtactatatcattttccggatagacacaagaaattgctgctttcattcaaacacataaaggtgaagacatttttttagataaaccgaaagtgtaagagcagttcttagttagcttacgtaagttaaatgcacacaggaatttcagaactttggagacattctcattgacctcttcgcatttgacttccactatattaaggtgctccggtatttcagctggtctgtccatcataccaaaactcccattcatttccactttatgtccaggtccctgaagaaaacaagggcattataccaagctcaatcaatagtgtataacaactttaatctgttaagagaatacatacccaggagaaaagatgaagagtgagcttctcaagaactggcgagtgtttgagaatgcagcttaatgcgtggaactcaggagccacacaccagtggtcatttagcaataaagtcttcagcttgctaaatgtagggtaccatttcaagtccctgttgaaaataaactagacagaaaacaggacatgcaaaagatcaactaatattacaccgaatactatgtataatccagttagtggcattgcatatgagaatttttgtttgagactttgagcacctttgtaagtgtatagcagtggatatagaaactaccaacagaacaatgggactataatacgtactacgtaaaggagttggggacaaaacaagtgtgtaatcataccgttctgcaatgagctaccaatgccaaattctttgcttctgataaacctttcagaagaacacagcttctgtcatcatttatagggtaacagtagttacaatcctcaaaaccacaataaccagagccagcatttctacaaaagtcggaacatccagagttgaccgtgatggttgcctccaccaatgatggcatgctctcaagcagaggagtcatgcaccaatagtcatccagctgcagtgaaacaagacttgggacacaaatccgagtgcgaaaattcctaacggccccaaaagagcagtgactgatgctcaattgttgcagtgacccggcagatgagctaatcatggggcatgatatcatggagtcggaaatcttcagatgtttcagcgccgagcagcttgagaagttacagaatctgtctgttaggtcgagtttaaagagctctagcctcgtcaggtggcgggagacaagaggcaggtcgtccaattcaaagactccaccggcaatgcttctgaccacgagatgccggacctgcgaggcaacagcatgccggatccagagatttacccggcgggtctcgtcgtcgtcgtcgtagtagtcagaccagaacctgagctcgcacatgtcgagaggctcgcatccgcggaggaggaggaggtggtccacgaactccctaatgtcccgcacacgcggcttctcttccactcgccaccaaacccaatcctcactctcgcccccaatcctcaggcctgtggccgacttccagaggtggcgccagcggccagcgagcacgcacgtctgcacggcgtcccgcgccggcaggaacgacagcatgtggtggaggatctcgtccgggagcgcgccgatgcggtcttcgccgccggcctggtccttcttggacctcttcgctggaggcattccgtcaaacaggctgtgggcgcgcgggcgctcactggcgcaggagagatacggttcagctgcagatgacgcaggagagagatgcgcactagctcacccgaacaacgccgcctcacctccccggaaatggtttgagcttgcgtgccgcggctcgccggcgtgggcgacggcgacggcgacgcgcGggggtgggggagaggtgttttgggcctttggagatggaggtggcgaggtaattctagtaacggggtaagtagccgaggagtagctgttgtttttttttcctaaaaaaaagccttttagtttctggtttctaatttacTttttttttaattctataactgtattctctgaatttagatgagaatttagatatataaatatgtaagagcaggtacaataaccatgttcattaggctccatgaaacgccacatcagacttcagatgagctagaagagagatttagagagagaaaaaaaatgtcggggacaaggtgggtctcctgagttacagactttctcgtgagatttatataaactctccggcacaatcttcaaagcaaggtgggtctcctgagttacagactttctcgcgagctataatacaaatcaatgtgtgtgttgcttattcagattcgttgtatttggttgtatcaaattatctcgtacgatggaggggtacctaatagagaaaaaaaataagagaggaagttgggacccatcatataataaaataaattttctacataatataggagacagtaaattctattatatattgtaaaagttatcagttaagatatatacaggtgacatgtctaaaattagagccagcaactgattgtactattcaacatccattagaatcaactgaatcttttacatgcatttggtatgcaccccatgatggcattaccattacctactcagataattatataaaattttagaattataataatataaattatatgccacaagtgtatgcacgaaattagtacaaggctaaatatagtgtgcatttgaataaaaaaacatgcgagaatagtaatgcacagtacaaatacatttttttaTtttgtttgtccgagtgttaatggaatacttgtcttgatttgtttatccgaaaatttctcgagaccacgaagtgagcgtaggtgacatatccattaacaacgagacgcccataatggctttatcaatcttaagatatgcgcagcttaatctttcagaggtgttcataggattgggtgtgcgtgtatgcgcatgttgtaagcgtttgtatttatactgtgtttcttaaagacaatgcctagactgtgcacatacatatatgcaaatgattatagataaagtgttcaataacgagacattcgtgatgactttgtcaatctcaagttgtctccggcccaatcttttagaggtgtttatagggttgtgagtgtgcatgtgtgagcgtatgcatttgtaccatgtttttcttaaaaaaatatctcgagaccaaggcgcacacatatatgcaaatgattatagacaatgttgaacactacaaatggaaccattgaaggggtctaacaaacatataaaaatatcgaaggaagcagttaacatcagttgactgaaaacttcaatttcaaacgccaaaatgacatttcaaattccactataaaataacggctgatagtgtatggagtagcttgcttataggttacggccattagctagcattgccccagtgacctccaatttcggtcaagcaacatcttgttcaaagaaagctagcttgtcagaaatgtctgtcatttatgagtagttgagaaattataagtttcaagtagagtaaatatcattcaaataacttaagatgctttttatgtatttgcaacatttgtttaggttaagtttattacttcaaggttggcctctttcttaatttgtttaccggaatcatgtgttggtcatcttgtttaaccaaagaagagttgcaattcaagaatgctttctttcgtatgattttagtttgatatggtttatcttgatcaccata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Protein seq | MSQRKKAKELPGSTGGDRIGALPDEVLHHVLSFLPAQEAVQTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDQKEFLNRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLVWFRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKVRFLLLDVDICYHSPFLMDEMPLVSRHLTRLQLKNIGLNNSFLNFSSCPALEHLVFESCKFDCAKISSSSAKRLSIADSYFSETSRVRIAIPSLVSLQLDYFHGRTPVLETMPSLLDAFVRVLYWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISEHGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALSCILQHAPVLGNLILQIYSKTKMKTLTKANMKTKTTKTKTKTMTMKTKTKTKTKMKMKSKRKRKRKMMPKESPGSTGGDRIGDLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDCDYLGSVKKQKEFLDRLLLLRDGAPLDTCVLMFDYYGDMDIEDTARVNLWFRHALIHKARFLWLDVGYYHSFVIDEMPLVSQHLTRLQLRNIRVNDSFLNFSSCPALEHLVFQSCKFGCAKISSSSAKRLSITNSYFSEISRVRIAIPSLVSLQLDGFHDRAPVLERMPSLVDAFVGVLNWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISERGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALTCILQHAPVLENLILQICSKGPKHRMKIKGNCHSMDSSLVISAHLEIVEIKCETVDKRVLKVLKYLSTFNILFSFKEIEILEGYDNDQDEVEEDEDEDSHEDEDENEDSYGDPYEDEDDDEDGDEVEEENGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKNCVLLEGLSEAKMLVLINEDESFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQISVWRKRRLRRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDDEEDEESKNDARRVNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIISSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTFIFKRDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLWKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSKLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCEEVNENVSKVLKFLCAFNLRFSF |
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Function | MEIOTIC F-BOX protein MOF [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7X7A4] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsGoSa_11g0006510 | OsGoSa_11g0006510.01 | Chr11 | 5299212 | 5328357 | - | NAM | ||
CDS seq | 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|
|||||||
Protein seq | MSQRKKAKELPGSTGGDRIGALPDEVLHHVLSFLPAQEAVQTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDQKEFLNRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLVWFRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKVRFLLLDVDICYHSPFLMDEMPLVSRHLTRLQLKNIGLNNSFLNFSSCPALEHLVFESCKFDCAKISSSSAKRLSIADSYFSETSRVRIAIPSLVSLQLDYFHGRTPVLETMPSLLDAFVRVLYWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISEHGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALSCILQHAPVLGNLILQIYSKTKMKTLTKANMKTKTTKTKTKTMTMKTKTKTKTKMKMKSKRKRKRKMMPKESPGSTGGDRIGDLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDCDYLGSVKKQKEFLDRLLLLRDGAPLDTCVLMFDYYGDMDIEDTARVNLWFRHALIHKARFLWLDVGYYHSFVIDEMPLVSQHLTRLQLRNIRVNDSFLNFSSCPALEHLVFQSCKFGCAKISSSSAKRLSITNSYFSEISRVRIAIPSLVSLQLDGFHDRAPVLERMPSLVDAFVGVLNWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISERGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALTCILQHAPVLENLILQICSKGPKHRMKIKGNCHSMDSSLVISAHLEIVEIKCETVDKRVLKVLKYLSTFNILFSFKEIEILEGYDNDQDEVEEDEDEDSHEDEDENEDSYGDPYEDEDDDEDGDEVEEENGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKNCVLLEGLSEAKMLVLINEDESFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQISVWRKRRLRRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDDEEDEESKNDARRVNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIISSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTFIFKRDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLWKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSKLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCEEVNENVSKVLKFLCAFNLRFSF
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|
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsGoSa_11g0006510 | OsGoSa_11g0006510.02 | Chr11 | 5321124 | 5321428 | - | IsoSeq | ||
CDS seq | atgcagtcctctgtaccgataaacctacatcgtctggtaaacaggcgcctagtatccctcatgcagctgataaagcccaatattacagta |
|||||||
Protein seq | MQSSVPINLHRLVNRRLVSLMQLIKPNITV |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 5.264083 | 0.390062 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0202200 | RBH | 0.0 | 0.155320 | 0.368947 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g09640 | RBH | 0.464481 | 0.490450 | 0.273061 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0201900 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006590 | RBH | 3.885571 | 0.000000 | 4.198319 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0006550 | RBH | 0.142942 | 0.162571 | 0.531425 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0006530 | RBH | 0.629927 | 3.859250 | 2.320578 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0006530 | RBH | 0.065425 | 0.226444 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0006280 | RBH | 1.941152 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0084300 | RBH | 0.4956525 | 0.1257805 | 0.3707745 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0006310 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0085800 | RBH | 1.137848 | 0.2856575 | 6.653802 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0006490 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0006500 | RBH | 0.170263 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006550 | RBH | 0.898805 | 0.000000 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0006620 | SBH | 0.040105 | 0.0 | 0.065152 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0006390 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G006490 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0006390 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |