Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsGoSa_11g0006510 OGI:11015440 | 16/16 GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:5299212-5328357
Gene Symbol OsFbox572, Os_F0135, OsFbox579, Os_F0334, OsFbox582, Os_F0511, OsFbox583, Os_F0363, OsFbox584, Os_F0231, OsFbox585, Os_F0294, Fbox-14, OsFbox586, Os_F0088, Fbox-13, OsFbox591, Os_F0435, Fbox-5
DNA seq

ctaaaaactgaatcctgtaaaagaaaaggaaaggcacattaagttcaaaatcaagtattatctagagaagtactccagtgttcagtaagttgacaaataaactttatggaacagattttgatcagtataaatttttgcttgcccaccatacagcttaatctcatcgatatgttacttatgcaacatgaaatgacaaaatgttatggacatcaattatcatggatggagtaagggtccaaagtcaaggataaagacaagatagctctcatccacatcggccttgtcctgatggctacgagatcttttaataagctagatctaattttataatcctatacaattaattttacaatcctgatggctacgagatcctttattgcttaattaataatggggtacatgggggagggtcttcctgctacaacaccgcacatactactttcctaagaaataatatctgtaattattaattaaaccaattattttctaatcgtattgttagttgttaacgtgcattgtattggtcatgctacaattccaatgcccataacaactgatgtttttgtcatcaatgggaatgtgaagtttcaataaaacacaatcagctaaaggtttgcgttcaaggataaaagaagaaccaagaaaaagctaaaggaaaaatatacatgtgtaaaaaactcctaacagaaaggggtgactgagtgagtactgtgaaaataatgtactggagatgttattcattggcaatgcaaatgcatacagttagctcgtataaaaaaacaaccagatgatgcaaaattcatttcaacaaaggtgtgcaaccataacaattctttaataaatgtgaggcatattgttttatcgaattgctgcatagaacgaccaatggaaaatcggtcaagcattcattaaatttcccctacaaggtgtgcagttgatgatttgctacttcttccgttgcaatcgaggatttgtaaccaccaagatgtaactagctgagattttgcactcttggtgtgtaattgtatttttacttaaaacatgaacatgtaaaaatggaaatgctcatgtaccagctattttgtaaattttattaattccaaagccaaccttttgtaacacgtattcaatgcagtcgttctttaggtgagaactaatcaggagtacaatatccagaactattaaacaaatcaacatcttggcatatactatatatgcaaccctgttatactaaataaccctatccatgcatttgtggatataccagccagtttatacccgtgacccaccaaattatcttgtagtcctactgtactatatcattttccggatagacacaagaaattgctgctttcattcaaacacataaaggtgaagacatttttttagataaaccgaaagtgtaagagcagttcttagttagcttacgtaagttaaatgcacacaggaatttcagaactttggagacattctcattgacctcttcgcatttgacttccactatattaaggtgctccggtatttcagctggtctgtccatcataccaaaactcccattcatttccactttatgtccaggtccctgaagaaaacaagggcattataccaagctcaatcaatagtgtataacaactttaatctgttaagagaatacatacccaggagaaaagatgaagagtgagcttctcaagaactggcgagtgtttgagaatgcagcttaatgcgtggaactcaggagccacacaccagtggtcatttagcaataaagtcttcagcttgctaaatgtagggtaccatttcaagtccctgttgaaaataaactagacagaaaacaggacatgcaaaagatcaactaatattacaccgaatactatgtataatccagttagtggcattgcatatgagaatttttgtttgagactttgagcacctttgtaagtgtatagcagtggatatagaaactaccaacagaacaatgggactataatacgtactacgtaaaggagttggggacaaaacaagtgtgtaatcataccgttctgcaatgagctaccaatgccaaattctttgcttctgataaacctttcagaagaacacagcttctgtcatcatttatagggtaacagtagttacaatcctcaaaaccacaataaccagagccagcatttctacaaaagtcggaacatccagagttgaccgtgatggttgcctccaccaatgatggcatgctctcaagcagaggagtcatgcaccaatagtcatccagctgcagtgaaacaagacttgggacacaaatccgagtgcgaaaattcctaacggccccaaaagagcagtgactgatgctcaattgttgcagtgacccggcagatgagctaatcatggggcatgatatcatggagtcggaaatcttcagatgtttcagcgccgagcagcttgagaagttacagaatctgtctgttaggtcgagtttaaagagctctagcctcgtcaggtggcgggagacaagaggcaggtcgtccaattcaaagactccaccggcaatgcttctgaccacgagatgccggacctgcgaggcaacagcatgccggatccagagatttacccggcgggtctcgtcgtcgtcgtcgtagtagtcagaccagaacctgagctcgcacatgtcgagaggctcgcatccgcggaggaggaggaggtggtccacgaactccctaatgtcccgcacacgcggcttctcttccactcgccaccaaacccaatcctcactctcgcccccaatcctcaggcctgtggccgacttccagaggtggcgccagcggccagcgagcacgcacgtctgcacggcgtcccgcgccggcaggaacgacagcatgtggtggaggatctcgtccgggagcgcgccgatgcggtcttcgccgccggcctggtccttcttggacctcttcgctggaggcattccgtcaaacaggctgtgggcgcgcgggcgctcactggcgcaggagagatacggttcagctgcagatgacgcaggagagagatgcgcactagctcacccgaacaacgccgcctcacctccccggaaatggtttgagcttgcgtgccgcggctcgccggcgtgggcgacggcgacggcgacgcgcGggggtgggggagaggtgttttgggcctttggagatggaggtggcgaggtaattctagtaacggggtaagtagccgaggagtagctgttgtttttttttcctaaaaaaaagccttttagtttctggtttctaatttacTttttttttaattctataactgtattctctgaatttagatgagaatttagatatataaatatgtaagagcaggtacaataaccatgttcattaggctccatgaaacgccacatcagacttcagatgagctagaagagagatttagagagagaaaaaaaatgtcggggacaaggtgggtctcctgagttacagactttctcgtgagatttatataaactctccggcacaatcttcaaagcaaggtgggtctcctgagttacagactttctcgcgagctataatacaaatcaatgtgtgtgttgcttattcagattcgttgtatttggttgtatcaaattatctcgtacgatggaggggtacctaatagagaaaaaaaataagagaggaagttgggacccatcatataataaaataaattttctacataatataggagacagtaaattctattatatattgtaaaagttatcagttaagatatatacaggtgacatgtctaaaattagagccagcaactgattgtactattcaacatccattagaatcaactgaatcttttacatgcatttggtatgcaccccatgatggcattaccattacctactcagataattatataaaattttagaattataataatataaattatatgccacaagtgtatgcacgaaattagtacaaggctaaatatagtgtgcatttgaataaaaaaacatgcgagaatagtaatgcacagtacaaatacatttttttaTtttgtttgtccgagtgttaatggaatacttgtcttgatttgtttatccgaaaatttctcgagaccacgaagtgagcgtaggtgacatatccattaacaacgagacgcccataatggctttatcaatcttaagatatgcgcagcttaatctttcagaggtgttcataggattgggtgtgcgtgtatgcgcatgttgtaagcgtttgtatttatactgtgtttcttaaagacaatgcctagactgtgcacatacatatatgcaaatgattatagataaagtgttcaataacgagacattcgtgatgactttgtcaatctcaagttgtctccggcccaatcttttagaggtgtttatagggttgtgagtgtgcatgtgtgagcgtatgcatttgtaccatgtttttcttaaaaaaatatctcgagaccaaggcgcacacatatatgcaaatgattatagacaatgttgaacactacaaatggaaccattgaaggggtctaacaaacatataaaaatatcgaaggaagcagttaacatcagttgactgaaaacttcaatttcaaacgccaaaatgacatttcaaattccactataaaataacggctgatagtgtatggagtagcttgcttataggttacggccattagctagcattgccccagtgacctccaatttcggtcaagcaacatcttgttcaaagaaagctagcttgtcagaaatgtctgtcatttatgagtagttgagaaattataagtttcaagtagagtaaatatcattcaaataacttaagatgctttttatgtatttgcaacatttgtttaggttaagtttattacttcaaggttggcctctttcttaatttgtttaccggaatcatgtgttggtcatcttgtttaaccaaagaagagttgcaattcaagaatgctttctttcgtatgattttagtttgatatggtttatcttgatcaccata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Protein seq

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Function MEIOTIC F-BOX protein MOF [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7X7A4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsGoSa_11g0006510 OsGoSa_11g0006510.01 Chr11 5299212 5328357 - NAM
CDS seq

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Protein seq

MSQRKKAKELPGSTGGDRIGALPDEVLHHVLSFLPAQEAVQTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDQKEFLNRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLVWFRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKVRFLLLDVDICYHSPFLMDEMPLVSRHLTRLQLKNIGLNNSFLNFSSCPALEHLVFESCKFDCAKISSSSAKRLSIADSYFSETSRVRIAIPSLVSLQLDYFHGRTPVLETMPSLLDAFVRVLYWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISEHGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALSCILQHAPVLGNLILQIYSKTKMKTLTKANMKTKTTKTKTKTMTMKTKTKTKTKMKMKSKRKRKRKMMPKESPGSTGGDRIGDLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDCDYLGSVKKQKEFLDRLLLLRDGAPLDTCVLMFDYYGDMDIEDTARVNLWFRHALIHKARFLWLDVGYYHSFVIDEMPLVSQHLTRLQLRNIRVNDSFLNFSSCPALEHLVFQSCKFGCAKISSSSAKRLSITNSYFSEISRVRIAIPSLVSLQLDGFHDRAPVLERMPSLVDAFVGVLNWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISERGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALTCILQHAPVLENLILQICSKGPKHRMKIKGNCHSMDSSLVISAHLEIVEIKCETVDKRVLKVLKYLSTFNILFSFKEIEILEGYDNDQDEVEEDEDEDSHEDEDENEDSYGDPYEDEDDDEDGDEVEEENGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKNCVLLEGLSEAKMLVLINEDESFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQISVWRKRRLRRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDDEEDEESKNDARRVNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIISSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTFIFKRDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLWKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSKLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCEEVNENVSKVLKFLCAFNLRFSF

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsGoSa_11g0006510 OsGoSa_11g0006510.02 Chr11 5321124 5321428 - IsoSeq
CDS seq

atgcagtcctctgtaccgataaacctacatcgtctggtaaacaggcgcctagtatccctcatgcagctgataaagcccaatattacagta

Protein seq

MQSSVPINLHRLVNRRLVSLMQLIKPNITV

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 5.264083 0.390062 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0202200 RBH 0.0 0.155320 0.368947
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g09640 RBH 0.464481 0.490450 0.273061
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0201900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0006590 RBH 3.885571 0.000000 4.198319
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0006550 RBH 0.142942 0.162571 0.531425
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0006530 RBH 0.629927 3.859250 2.320578
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0006530 RBH 0.065425 0.226444 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0006280 RBH 1.941152 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0084300 RBH 0.4956525 0.1257805 0.3707745
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0006310 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0085800 RBH 1.137848 0.2856575 6.653802
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0006490 RBH 0.000000 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0006500 RBH 0.170263 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0006550 RBH 0.898805 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0006620 SBH 0.040105 0.0 0.065152
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0006390 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G006490 SBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0006390 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
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