Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLiXu_11g0006500 OGI:11015440 | 16/16 LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:5290850-5327403
Gene Symbol OsFbox572, Os_F0135, OsFbox578, Os_F0136, OsFbox579, Os_F0334, OsFbox582, Os_F0511, OsFbox583, Os_F0363, OsFbox584, Os_F0231, OsFbox585, Os_F0294, Fbox-14, OsFbox586, Os_F0088, Fbox-13, Os_F0690, Fbox-12-pseuso, OsFbox588, Os_F0365, Fbox-10, OsFbox591, Os_F0435, Fbox-5
DNA seq

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Protein seq

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Function MEIOTIC F-BOX protein MOF [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7X7A4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLiXu_11g0006500 OsLiXu_11g0006500.01 Chr11 5290850 5327403 - NAM
CDS seq

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Protein seq

MSQRKKAKELPGSTGGDRIGALPDEVLHHVLSFLPAQEAVQTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDQKEFLNRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLVWFRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKVRFLLLDVDICYHSPFLMDEMPLVSRHLTRLQLKNIGLNNSFLNFSSCPALEHLVFESCKFDCAKISSSSAKRLSIADSYFSETSRVRIAIPSLVSLQLDYFHGRTPVLETMPSLLDAFVRVLYWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISEHGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALSCILQRAPVLGNLILQIYSKGPKHRMKIKGNCHSMDRSLVISAHLEIVEIKCKTVDKRMPKESPGSTGGDRIGDLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDCDYLGSVKKQKEFLDRLLLLRDGAPLDTCVLMFDYYGDMDIEDTARVNLWFRHALIHKARFLWLDVGYYHSFVIDEMPLVSQHLTRLQLRNIRVNDSFLNFSSCPALEHLVFQSCKFGCAKISSSSAKRLSITNSYFSEISRVRIAIPSLVSLQLDGFHDRAPVLERMPSLVDAFVGVLNWTKDYCIWSDSGDCGHENCESCYGIKDNNCVLLEGLSEAKTLGLISERGSFILKRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALTCILQHAPVLENLILQICSKGPKHRMKIKGNCHSMDSSLVISAHLEIVEIKCETVDKRVLKVLKYLSTFNIPPSAGGGAGDSSRALLFHEGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKIVCFWKFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDDEEDEESKNDARRVNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIISSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTFIFKRDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLWKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSKLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCEEVNENVSKVLNSCVHLTYVS

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLiXu_11g0006500 OsLiXu_11g0006500.02 Chr11 5320137 5322501 - IsoSeq
CDS seq

atgacaatgaccaggacgaagtggaggaagatgaagatgaggactctcatgaagacgaagacgaaaatgaagactcttatggagacccttatgaagatgaagacgacgatgaagatggagacgaagtggaagaggaaaatgtttgatgcaccactg

Protein seq

MTMTRTKWRKMKMRTLMKTKTKMKTLMETLMKMKTTMKMETKWKRKMFDAPL

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.873359 0.0 0.723187

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0209502 RBH 0.070194 0.336689 1.072266
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g09970 RBH 0.763508 0.308914 0.509416
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0202000 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0006570 RBH 0.054690 1.640683 0.416882
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0006610 RBH 0.079839 0.0 0.969882
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0006600 RBH 0.000000 2.558610 1.576523
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0006430 RBH 0.026985 0.037452 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0006280 RBH 1.941152 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0084100 RBH 0.2520805 0.024792 0.909983
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0006520 RBH 0.112591 0.000000 0.288314
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0085400 RBH 0.432593 0.085564 9.593413
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0006390 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0006500 RBH 0.170263 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0006470 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0006620 RBH 0.040105 0.0 0.065152
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0006510 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G006600 SBH 0.107812 1.806731 0.886747
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0006390 SBH 0.000000 0.000000 0.000000
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