Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsNaBo_11g0006370 | OGI:11015440 | 16/16 | NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:5049476-5083778 | ||||||||
| Gene Symbol | OsFbox572, Os_F0135, Os_F0390, OsFbox577, Os_F0135, OsFbox579, Os_F0334, OsFbox582, Os_F0511, OsFbox584, Os_F0231, OsFbox585, Os_F0294, Fbox-14, OsFbox586, Os_F0088, Fbox-13, OsFbox587, Os_F0097 | ||||||||||
| DNA seq | ctaaaaactgaatcctgtaaaagaaaaggaaaggcacattaagttcaaaatcaagtattatctagagaagtactccagtgttcagtaagttgacaaataaactttatggaacagattttgatcagtataaatttttgcttgcccaccatacagcttaatctcatcgatatgttacttatgcaacatgaaatgacaaaatgttatggacatcaattatcatggatggagtaagggtccaaagtcaaggataaagacaagatagctctcatccacatcggccttgtcctgatggctacgagatcttttaataagctagatctaattttataatcctatacaattaattttacaatcctgatggctacgagatcctttattgcttaattaataatggggtacatgggggagggtcttcctgctacaacaccgcacatactactttcctaagaaataatatctgtaattattaattaaaccaattattttctaatcgtattgttagttgttaacgtgcattgtattggtcatgctacaattccaatgcccataacaactgatgtttttgtcatcaatgggaatgtgaagtttcaataaaacacaatcagctaaaggtttgcgttcaaggataaaagaagaaccaagaaaaagctaaaggaaaaatatacatgtgtaaaaaactcctaacagaaaggggtgactgagtgagtactgtgaaaataatgtactggagatgttattcattggcaatgcaaatgcatacagttagctcgtataaaaaaacaaccagatgatgcaaaattcatttcaacaaaggtgtgcaaccataacaattctttaataaatgtgaggcatattgttttatcgaattgctgcatagaacgaccaatggaaaatcggtcaagcattcattaaatttcccctacaaggtgtgcagttgatgatttgctacttcttccgttgcaatcgaggatttgtaaccaccaagatgtaactagctgagattttgcactcttggtgtgtaattgtatttttacttaaaacatgaacatgtaaaaatggaaatgctcatgtaccagctattttgtaaattttattaattccaaagccaaccttttgtaacacgtattcaatgcagtcgttctttaggtgagaactaatcaggagtacaatatccagaactattaaacaaatcaacatcttggcatatactatatatgcaaccctgttatactaaataaccctatccatgcatttgtggatataccagccagtttatacccgtgacccaccaaattatcttgtagtcctactgtactatatcattttccggatagacacaagaaattgctgctttcattcaaacacataaaggtgaagacatttttttagataaaccgaaagtgtaagagcagttcttagttagcttacgtaagttaaatgcacacaggaatttcagaactttggagacattctcattgacctctccgcatttgacttccactatattaaggtgctccggtatttcagctggtctgtccatcataccaaaactcccattcatttccactttatgtccaggtccctgaagaaaacaagggcattataccaagctcaatcaatagtgtataacaactttaatctgttaagagaatacatacccaggagaaaagatgaagagtgagcttctcaagaactggcgagtgtttgagaatgcagcttaatgcgtggaactcaggagccacacaccagtggtcatttagcaataaagtcttcagcctgctaaatgtagggtaccatttcaagtccctgttgaaaataaactagacagaaaacaggacatgcaaaagatcaactaatattacaccgaatactatgtataatccagttagtggcattgcatatgagaatttttgtttgagactttgagcacctttgtaagtgtacagcagtggatatagaaactaccaacagaacaatgggactataatacgtactacgtaaaggagttggggacaaaacaagtgtgtaatcataccgttctgcaatgagctaccaatgccaaattctttgcttctgataaacctttcagaagaacacagcttctgtcatcatttatagggtaacagtagttacaatcctcaaaaccacaataaccagagccagcatttctacaaaagtcggaacatccagagttgaccgtgatggttgcctccaccaatgatggcatgctctcaagcagaggagtcatgcaccaatagtcatccagctgcagtgaaacaagacttgggacacaaatccgagtgcgaaaattcctaacggccccaaaagagcagtgactgatgctcaattgttgcagtgacccggcagatgagctaatcatggggcatgatatcatggagtcggaaatcttcagatgtttcagcgccgagcagcttgagaagttacagaatctgtctgttaggtcgagtttaaagagctctagcctcgtcaggtggcgggagacaagaggcaggtcgtccaattcaaagactccaccggcaatgcttctgaccacgagatgccggacctgcgaggcaacagcatgccggatccagagatttacccggcgggtctcgtcgtcgtcgtcgtagtagtcagaccagaacctgagctcgcacatgtcgagaggctcgcatccgcggaggaggaggaggtggtccacgaactccctaatgtcccgcacacgcggcttctcttccactcgccaccaaacccaatcctcactctcgcccccaatcctcaggcctgtggccgacttccagaggtggcgccagcggccagcgagcacgcacgtctgcacggcgtcccgcgccggcaggaacgacagcatgtggtggaggatctcgtccgggagcgcgccgatgcggtcttcgccgccggcctggtccttcttggacctcttcgctggaggcattccgtcaaacaggctgtgggcgcgcgggcgctcactggcgcaggagagatacggttcagctgcagatgacgcaggagagagatgcgcactagctcacccgaacaacgccgcctcacctccccggaaatggtttgagcttgcgtgccgcggctcgccggcgtgggcgacggcgacggcgacgcgcgggggtgggggagaggtgttttgggcctttggagatggaggtggcgaggtaattctagtaacggggtaagtagccgaggagtagctgttgtttttttttcctaaaaaaaagccttttagtttctggtttctaatttacttttttttaattctataactgtattctctgaatttagatgagaatttagatatataaatatgtaagagcaggtacaataaccatgttcattaggctccatgaaacgccacatcagacttcagatgagctagaagagagatttagagagagaaaaaaaatgtcggggagaaggtgggtctcctgagttacagactttctcgtgagatttatataaactctccggcacaatcttcaaagcaaggtgggtctcctgagttacagactttctcgtgagctataatacaaatcaatgtgtgtgttgcttattcagattcgttgtatttggttgtatcaaattatctcgtacgatggaggggtacctaatagagaaaaaaaataagagaggaagttgggacccatcatataataaaataaattttctacataatataggagacagtaaattctattatatattgtaaaagttatcagttaagatatatacaggtgacatgtctaaaattagagccagcaactgattgtactattcaacatccattagaatcaactgaatcttttacatgcatttggtatgcaccccatgatggcattaccattacctactcagataattatataaaattttagaattataataatataaattatatgccacaagtgtatgcacgaaattagtacaaggctaaatatagtgtgcatttgaataaaaaaacatgcgagaatagtaatgcacagtacaaatacatttttttattttgtttgtccgagtgttaatggaatacttgtcttgatttgtttatccgaaaatttctcgagaccacgaagtgagcgtaggtgacatatccattaacaacaagatgcccataatggctttatcaatcttaagatatgcgcagcttaatctttcagaggtgttcataggattgggtgtgcgtgtatgcgcatgttgtaagcgtttgtatttatactgtgtttcttaaagacaatgcctagactgtgcacatacatatatgcaaatgattatagataaagtgttcaataacgagacattcgcgatgactttgtcaatctcaagttatctccggcccaatcttttagaggtgtttatagggttgtgagtgtgcatgtgtgagcgtatgcatttgtaccatgtttttcttaaaaaaatatctcgagaccaaggcgcacacatatatgcaaatgattatagacaatgttgaacactacaaatggaaccattgaaggggtctaacaaacatataaaaatatcgaaggaagcagttaacatcagttgactgaaaacttcaatttcaaacgccaaaatgacatttcaaattccagtataaaataacggctgatattgtatggagtagcttgcttataggttacggccattagctagcattgccccagtgacctccaatttcggtcaagcaacatcttgttcaaagaaagctagcttgtcagaaatgtctgtcatttatgagtagttgagaaattataagtttcaagtagagtaaatatcattcaaataacttaagatgctttttatgtatttgcaacatttgtttaggttaagtttattacttcaaggttggcctctttcttaatttgtttaccggaatcatgtgttggtcatcttgtttaaccaaagaagagttgcaattcaagaatgctttctttcgtatgattttagtttgatatggtttatcttgatcaccatac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| Protein seq | MSPQKKAKESPGSTGGDRIGDLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWRHLWKSATGVRIGEGETDPGSVKDHQEFLDHLLVLRDSAPMETCVLRFSEHSKELIEDAARLNFWFKHALLRKVRFLQLENWEFYDPVPIDELPLVSRHLTRLQLYGISLNNSFLNFSSCPALEHLLFEFCFFECAKISSNSVKRLSITCCSFNATLRVCVDVPSLVSLLLDEFDNRAPVLERMPSLVDAFVRIFFYTKDFCSESNSGDCSHEGCESCYGIKDNKCVLLEGLSNAKTLVLINKQKSFIFRRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDYSALACILEHSPVLENLILQIYSEGPEHIMKINGNCSSVDRSAAISAHLEIVEIRCEMIDNFVDEGTLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDNKEFLDRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLDWYRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKVRFLLLDVDIWYRFPFLIDEMPLVSRHLTRLQLKNIGLNDSFLNFSSCPALEHLVFESCKFDCAKISSSSAKRLSITNSYFSETSRIRIAIPSLVSLKLDDFHGRTPVLEWMPSLVDAFVRVLYCYKESCSHYDFGDCCCEGFEPCYDIKDHKCMRLEGLSEAKTLVLINERRLFIFKRDLEWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALSCILEHALVLENLILQIYSKEIEILEGYDNDQDEVEEDEDEDSHEDEDENEDSYGDPYEDEDDDEDGDEVEEENGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKNCVLLEGLSEAKMLVLINEDESFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDDEEDEESKNDARRMNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIFSSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTFIFKRDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLWKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSRLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCGEVNENVSKVLKFLCAFNLRFSF |
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| Function | F-box/LRR-repeat protein At3g59190 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q1PED9] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsNaBo_11g0006370 | OsNaBo_11g0006370.01 | Chr11 | 5049476 | 5083778 | - | NAM | ||
| CDS seq | atgtctccgcagaagaaggccaaggaatcgcccggctcgaccggcggcgaccggataggggacctcccggacgaggtgctccaccacgtgctctccttcctaccggcgcaggaggccgtccggacgtgcctgctagcccggcgatggcgccacctctggaagtccgccacgggggtgcgcattggcgagggcgagaccgatccgggaagcgtgaaggaccaccaggagtttcttgaccatctgttggtactccgtgatagtgcgcctatggaaacctgcgtgctaaggtttagtgagcacagcaaagagctcatcgaggacgcagcccggctgaatttttggttcaagcatgctctgcttcgcaaagttcggttcctccagcttgaaaactgggagttttatgacccggttccgatagatgagctgcctcttgtctcccggcacttgacaaggctacaactttacggtataagtctaaataatagcttccttaacttctcgagctgtccagcgttggagcatctattgtttgagttttgtttcttcgagtgtgccaagatctcatctaactcggtgaaacgtctgagcatcacttgctgtagtttcaatgcgaccttgcgagtatgtgtagatgtcccaagtcttgtttctctgctgcttgatgagtttgacaaccgggctccagtgcttgagaggatgccatcattagttgacgcatttgtgagaatcttcttctatactaaagacttttgtagtgaatctaactctggggattgtagtcatgagggctgtgaatcttgttatggtatcaaggacaacaaatgtgtgcttctggaaggtttatcgaacgctaagacgttggttctgataaataaacaaaaAtcgtttattttcagaagggatttgaaatggtgcccaacatttacgaagttaaagactttgttactcaatgaatattggtgtgtgcctgatgattatagtgcactagcttgcattcttgaacattcaccggttctggagaatctcattcttcagatatattctgagggacctgaacatataatgaaaatcaacggaaactgctcttcagtggatagatcagctgcaatatcagcacaccttgagatagttgaaatcagatgtgaaatgattgataactttgtagacgaagggaccctcccggacgaggtgctccaccacgtgctctccttcctaccggcgcaggaggctgtccggacgtgcctgctagcccggcgatggctccacctctggaagtctgccaccgggctgcgcattggcgaagacgatatctatctgcgctgcgtgaaggacaataaggagtttctcgaccgtctgctgctactccgtgatggcgcacctctcgacacgtgcgtgctaaggttccgttggctcgattggtacagagacgagggcctcgatgacacagtacgggtgaaccactggttcaggcatgctttgctccacaaggttcggttcctcttgctcgatgtcgatatatggtatcgcttcccgtttctgatagatgagatgccacttgtctcccgacacttgacgaggctacagcttaagaacataggcctaaacgacagctttcttaacttctcgagctgtccagcattggagcatctagtgtttgagtcatgcaaatttgactgtgccaagatctcatctagctctgcaaaacgtttgagcataaccaattcctatttcagtgagacgtctcggatacgtatcgctatcccgagtcttgtttctctgaagctggatgatttccatggcaggactccagtgcttgagtggatgccatcgttagttgacgcatttgttagagtcctctactgttataaagaatcgtgtagtcattatgactttggggattgttgttgtgagggctttgaaccttgttatgatatcaaggaccacaaatgcatgcgtttggaaggtttatcagaagctaagacgttggtgctgataaatgaacgtagattgtttattttcaaaagggatttggaatggtgcccaacatttaccaagttaaagactttgttactcaatgaatactggtgtgtgcctgatgattttagtgcactatcttgcattcttgaacatgcactggttctagagaatctcattcttcagatctattccaaggaaatcgagattttggaaggatatgacaatgaccaggacgaagtggaggaagatgaagatgaggactctcatgaagacgaagacgaaaatgaagactcttatggagacccttatgaagatgaagacgacgatgaagatggagacgaagtggaagaggaaaatggtggcgccgacgcccgccgcctgttcggcggaatgtctgcgcggaaggaggccaagggatcggccggcggagaccgcataggggccctcccggacgaggtgctccaccgcgtgctctccttcctaccggcgcaggatgctgtccggacgtgcgtgctagccccgcgctggcgccacctctggaagtccgccacggggctgcgcgttggcgaggacgagagcaatctggggagtgtgaaggagcagcaggagtttcttgaccatctgctggtactccgtgatagcgcgcctcttgaaacctgcgtgctaaggttcaattggtatgacgacgatgacttcgaggacatattccggctgaacgtctggttcaggtatgctatccaccgcaaggttcggttccttcgactcgatgtctggcaggaagaggaatttggcaacccggttccgatagatgagcagcctattgtctctcagcacttgacaaggctacagctttatggtatagtgctaaacgacggcttgcttgacttctcaagctgcccatcattggagcatctagtgtttgagtcatgcgtatttgagtgtgccaagatctcatctaactccgtaaaacatctgagcatcacgttttccaatttccccgctgggacctcacgggttcgtattgatatcccgagtcttgtttctctgcggctggatcgcatctatgaccgtaagccagtgcttgagaggatgccatcattagttgatgcatttgtcagtgtcccaagctctagtgaagacttctgtggtgaatctgactctggggattgtggtcgtgacggctgtgaatcttgttatggtttcacgaacaaaaattgtgtgcttttggaaggtttgtcggaagctaagatgttggtgctgataaacgaagatgaatcgtttattttcaaaagggatttgaaatggtgcccaacatttagcaagttaaagactttgatactcaatgggtactggtgtgtgcctgatgattctcacatgctagctcgcattcttgaacactcgccagccctagaaaaactcgttttccagcttggttaccaggcatataaacgtacaaataaaattaaaggaattctcaatccaatggagagatcagctggaatatcagaacacctccagatagttgaagttcaatgcaatgcgattgatggtcagcgaaagaaggccaagagagcgccttgttctaccggcgtcgaccggataggggccctcccggacgaggtgctccaccgcgtgctctccttcctactggcgccacctctggaagtccgccacgaggctgcgcatcggcggagatcaaccctgggaagcatcaaggaacgccgaaggttcattgagaatctgctgctactccgtgacagtgcgcctctcggcacgttcgtgctaaggttccgtgagtgcgagggcatcgacgacattgcccggctgaacctctggtatcaggcatgctctgctccgcaaggctacaacttcacggtacaaaagctaaacgacatcttcctcaacttctcgagctgtccagcattggagcatctagtgtttgactattgtatacttgagtgtgccaagatctcatctagctccgtgaagctcttgagcattactgattccaatttcagtgagaccttgcgcagcgctaacgcccgtggcctgttcgacgaaatgcctacggggaaggaggggatggaagagcctttgccgaccgacgccgaccacattggggctctcccggacacagtgctccaccacgttctctccttcctgccgtcgcaggatgccgtgaggacgtgcgtgctcgccaagcggtggctcgacctctggaagtctgtcacggcattgcgcattggtgaccgtgacaagaggaagctgtggaccgtgaagggtctccaggggttcgtggaccattttctgctgctccgtgaaagtgtgcctctccacacatgtgtgctcaggttcatcgtgttcagcgaagacctcaacgagacatcccggctaaacctctggattaagcatgctctgctgcgtatggttcagtttctccaggtctccatccggcagaatacagccttctatcaccagattaatctaggcatcctgccttttgtttcacggcacttgtcgatgcttgagcttcacggtgtacggatggtgggaagtttccttgatttctccagatgcccggctttgcaacatctagaatttgaccgctgtgagttgccatgtgacaagatcttatcagagtccctaaaacttctgcgcatcactcgctgcaaattcagtcaaacatcacgggttcgtatttgtgtcccaagtcttgtttcactgcggcttgatgatttttatcgccgtactccagtgcttgagaggatgccatcattagttgaggcatttgtcagagttgtccacaggacttatgattgttgtgggtatgattatattaactccggtgattgtggtaatgagcactgtaagtcatgtcatggcatcaaggacgacaacaattgtgttcttctggatggtttatcagaagctaagactttggcattgattgatggaaccatatcgtttattttcaatagggatttaaaatggtgccctacatttagcaagttaaagactttattactcaatgaatactggtgtgtgcctgatgagtttagtgcactagcctgcattcttgaacatgcaccagttctagagaatctcattcttcagctctattccgagggtcctaagcatacaatgaaaatcaaaggaaactgtcatccaatggatagatcagctgcaatatcaggacaccttgagacagttgaaatcagatgtgaagtggttgataagagagtactcaaagttttgaagtacctgtctacatttaacatactgcagcgcgcacgccgcctgttcgacggaatgcctccggcgaagaggggccggaggatgatggacctggacggcggcggaggcgaagaccgcgtcggcgcgctcccggacgaggtgctccaccacatgctgtcgttcctgccggcgcgggacgccgtgcagacgtgcgtgctcgcccaccgctggcgcgacctctggaagtccgccacggggctgaggattgggagcgacgaggaagacacggcgcgcgtgcgggagatcagggtgttcgtcgaccacctcctgctcctccgcgggtgcgcgcctctcgacatgtgcgagctcaagttctggtttgacagcgacgaggacgacgacgaggaggacgaggagagcaagaacgatgcccgccggatgaatctctggatccggagtgctgttgcctccaaggttcgtaatctcgtgctcaacaacatctgcagtggaagctttgagctggatgatttgcctcttgtctctcgccacctgacgaggctagagctctttaacctcgagctaaccaacagattctgcaacttctcgagctgcccggcgctggaacatgtaaagattgccaactccaccgtatcatgtcccaggattttctcatcatccaccgggtcactactccgtttgatcatcactcgatgctctttcgttgtcggtactagcttccgcactaaaatctgtgtccccagtcttgtttcactgcagctggacagcaattcgaagactcctctacttgagagtatgccatcgttagcagaggcaactgtcagagtcaccgctggatgttctgacgtttgtggaaatgctgattctgggtattgtggttttgaggattgcaagtactgttatcccatcgatgacaacagaaactgtgtgcttctgaatggtttatcagaagctaagaatttggcattgacagctgaatgcaaaacgtttattttcaaaagggacttgcaatggtgccctacatttagcaagctgaagactttattgctaaatgaccactggtgtgtggcccctgacttccatgcattaagctgcattctcaaacactcaccggttctcgagaagcttactcttcatcttttttccaagggacctgaacataaagtagaattgaatgggagttttggtttgatggacagaccaactggaatatcagagcgccttaacatagtggaagtcaaatgcaaagtggtcgatgagaatgtttccaaagttctgaagttcctgtgtgcatgtaacatacctgaaccgtatctctcctgcgccagtgagcgcccgcgcgcccacagcctgtttgacggaatgcctccagcgaagaggtccaagaaggaccaggccggcggcgaagaccgcatcggcgcgctcccggacgagatcctccaccacatgctgtcgttcctgccggcgcgggacgccgtgcagacgtgcgtgctcgctggccgctggcgccacctctggaagtcggccacaggcctgaggattgggggcgagagtgaggattgggtttggtggcgagtggaagagaagccgcgtgtgcgggacattagggagttcgtggaccacctcctcctcctccgcggatgcgagcctctcgacatgtgcgagctcaggttctggtctgactactacgacgacgacgacgagacccgccgggtaaatctctggatccggcatgctgttgcctcgcaggtccggcatctcgtggtcagaagcattgccggtggagtctttgaattggacgacctgcctcttgtctcccgccacctgacgaggctagagctctttaaactcgacctaacagacagattctgtaacttctcaagctgctcggcgctgaaacatctgaagatttccgactccatgatatcatgccccatgattagctcatctgccgggtcactgcaacaattgagcatcagtcactgctcttttggggccgttaggaattttcgcactcggatttgtgtcccaagtcttgtttcactgcagctggatgactattggtgcatgactcctctgcttgagagcatgccatcattggtggaggcaaccatcacggtcaactctggatgttccgacttttgtagaaatgctggctctggttattgtggttttgaggattgtaactactgttaccctataaatgatgacagaagctgtgttcttctgaaaggtttatcagaagcaaagaatttggcattggtagctcattgcagaacgtttattttcaacagggacttgaaatggtaccctacatttagcaggctgaagactttattgctaaatgaccactggtgtgtggctcctgagttccacgcattaagctgcattctcaaacactcgccagttcttgagaagctcactcttcatcttttctcctggggacctggacataaagtggaaatgaatgggagttttggtatgatggacagaccagctgaaataccggagcaccttaatatagtggaagtcaaatgcggagaggtcaatgagaatgtctccaaagttctgaaattcctgtgtgcatttaacttacgattcagtttttag
More
|
|||||||
| Protein seq | MSPQKKAKESPGSTGGDRIGDLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWRHLWKSATGVRIGEGETDPGSVKDHQEFLDHLLVLRDSAPMETCVLRFSEHSKELIEDAARLNFWFKHALLRKVRFLQLENWEFYDPVPIDELPLVSRHLTRLQLYGISLNNSFLNFSSCPALEHLLFEFCFFECAKISSNSVKRLSITCCSFNATLRVCVDVPSLVSLLLDEFDNRAPVLERMPSLVDAFVRIFFYTKDFCSESNSGDCSHEGCESCYGIKDNKCVLLEGLSNAKTLVLINKQKSFIFRRDLKWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDYSALACILEHSPVLENLILQIYSEGPEHIMKINGNCSSVDRSAAISAHLEIVEIRCEMIDNFVDEGTLPDEVLHHVLSFLPAQEAVRTCLLARRWLHLWKSATGLRIGEDDIYLRCVKDNKEFLDRLLLLRDGAPLDTCVLRFRWLDWYRDEGLDDTVRVNHWFRHALLHKVRFLLLDVDIWYRFPFLIDEMPLVSRHLTRLQLKNIGLNDSFLNFSSCPALEHLVFESCKFDCAKISSSSAKRLSITNSYFSETSRIRIAIPSLVSLKLDDFHGRTPVLEWMPSLVDAFVRVLYCYKESCSHYDFGDCCCEGFEPCYDIKDHKCMRLEGLSEAKTLVLINERRLFIFKRDLEWCPTFTKLKTLLLNEYWCVPDDFSALSCILEHALVLENLILQIYSKEIEILEGYDNDQDEVEEDEDEDSHEDEDENEDSYGDPYEDEDDDEDGDEVEEENGGADARRLFGGMSARKEAKGSAGGDRIGALPDEVLHRVLSFLPAQDAVRTCVLAPRWRHLWKSATGLRVGEDESNLGSVKEQQEFLDHLLVLRDSAPLETCVLRFNWYDDDDFEDIFRLNVWFRYAIHRKVRFLRLDVWQEEEFGNPVPIDEQPIVSQHLTRLQLYGIVLNDGLLDFSSCPSLEHLVFESCVFECAKISSNSVKHLSITFSNFPAGTSRVRIDIPSLVSLRLDRIYDRKPVLERMPSLVDAFVSVPSSSEDFCGESDSGDCGRDGCESCYGFTNKNCVLLEGLSEAKMLVLINEDESFIFKRDLKWCPTFSKLKTLILNGYWCVPDDSHMLARILEHSPALEKLVFQLGYQAYKRTNKIKGILNPMERSAGISEHLQIVEVQCNAIDGQRKKAKRAPCSTGVDRIGALPDEVLHRVLSFLLAPPLEVRHEAAHRRRSTLGSIKERRRFIENLLLLRDSAPLGTFVLRFRECEGIDDIARLNLWYQACSAPQGYNFTVQKLNDIFLNFSSCPALEHLVFDYCILECAKISSSSVKLLSITDSNFSETLRSANARGLFDEMPTGKEGMEEPLPTDADHIGALPDTVLHHVLSFLPSQDAVRTCVLAKRWLDLWKSVTALRIGDRDKRKLWTVKGLQGFVDHFLLLRESVPLHTCVLRFIVFSEDLNETSRLNLWIKHALLRMVQFLQVSIRQNTAFYHQINLGILPFVSRHLSMLELHGVRMVGSFLDFSRCPALQHLEFDRCELPCDKILSESLKLLRITRCKFSQTSRVRICVPSLVSLRLDDFYRRTPVLERMPSLVEAFVRVVHRTYDCCGYDYINSGDCGNEHCKSCHGIKDDNNCVLLDGLSEAKTLALIDGTISFIFNRDLKWCPTFSKLKTLLLNEYWCVPDEFSALACILEHAPVLENLILQLYSEGPKHTMKIKGNCHPMDRSAAISGHLETVEIRCEVVDKRVLKVLKYLSTFNILQRARRLFDGMPPAKRGRRMMDLDGGGGEDRVGALPDEVLHHMLSFLPARDAVQTCVLAHRWRDLWKSATGLRIGSDEEDTARVREIRVFVDHLLLLRGCAPLDMCELKFWFDSDEDDDEEDEESKNDARRMNLWIRSAVASKVRNLVLNNICSGSFELDDLPLVSRHLTRLELFNLELTNRFCNFSSCPALEHVKIANSTVSCPRIFSSSTGSLLRLIITRCSFVVGTSFRTKICVPSLVSLQLDSNSKTPLLESMPSLAEATVRVTAGCSDVCGNADSGYCGFEDCKYCYPIDDNRNCVLLNGLSEAKNLALTAECKTFIFKRDLQWCPTFSKLKTLLLNDHWCVAPDFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSKGPEHKVELNGSFGLMDRPTGISERLNIVEVKCKVVDENVSKVLKFLCACNIPEPYLSCASERPRAHSLFDGMPPAKRSKKDQAGGEDRIGALPDEILHHMLSFLPARDAVQTCVLAGRWRHLWKSATGLRIGGESEDWVWWRVEEKPRVRDIREFVDHLLLLRGCEPLDMCELRFWSDYYDDDDETRRVNLWIRHAVASQVRHLVVRSIAGGVFELDDLPLVSRHLTRLELFKLDLTDRFCNFSSCSALKHLKISDSMISCPMISSSAGSLQQLSISHCSFGAVRNFRTRICVPSLVSLQLDDYWCMTPLLESMPSLVEATITVNSGCSDFCRNAGSGYCGFEDCNYCYPINDDRSCVLLKGLSEAKNLALVAHCRTFIFNRDLKWYPTFSRLKTLLLNDHWCVAPEFHALSCILKHSPVLEKLTLHLFSWGPGHKVEMNGSFGMMDRPAEIPEHLNIVEVKCGEVNENVSKVLKFLCAFNLRFSF
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.242504 | 2.849076 | 0.510408 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0202200 | RBH | 0.0 | 0.155320 | 0.368947 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g09690 | RBH | 0.334878 | 0.0 | 0.228820 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0202400 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006690 | RBH | 0.419972 | 2.097456 | 3.382823 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0006610 | RBH | 0.079839 | 0.0 | 0.969882 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0006600 | RBH | 0.000000 | 2.558610 | 1.576523 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0006430 | RBH | 0.026985 | 0.037452 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0006390 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.969774 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0084300 | RBH | 0.4956525 | 0.1257805 | 0.3707745 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0006520 | RBH | 0.112591 | 0.000000 | 0.288314 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0085700 | RBH | 5.4372965 | 2.440776 | 7.4983255 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0006490 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0006580 | RBH | 0.079067 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006470 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0006620 | RBH | 0.040105 | 0.0 | 0.065152 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0006510 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G006490 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0006390 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
