Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_02G025040 OGI:02001240 | 16/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:25332344-25342907
Gene Symbol -
DNA seq

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CDS seq

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Protein seq

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Function Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R2D5]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_02G025040 OsN22_02G025040_01 Chr02 25332344 25342907 + NAM
CDS seq

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Protein seq

MPKEVFSITTMTSCVLAYNDLDGPIPLDFAELQQLTKLHLSSNRLTGKIPESLGQCHELENIQMDQNLLTGNIPISFSSLKSLTMLNLSHNNLSSTIPTALGELKFLNQLDLSYNNLNGEVPTNGVFENTTAVSIIGNWGICGGPSNLQMPPCPTTYPRKGMLYYLVRILIPLLGFMSVIPLLYLTQVKNKTSKGTYLLLLSFGKQFPKVSYHDLARATGDFSKSNLIGSGSYGSVYEGKLVQVKVQVAIKVFDLKMRCADKSYISKCEVLRSIRHRNLLPILTACSTIDNLGNDFKALVYEFMPNGNLDKWLHKKSSYEAPNSLGLGQRISITANIADALSYLHHDSRTSIVHCDLKPSNILLDADMNAYLGDFGISNLVHNSTSTSACHSGVDSSLNSSIGLWGTIGYIAPEYAQSWQPSICGDVYSFGIVLLEIVLGKRPTDPVFDNGLNIVIDVNLQEECKGFIEATAVEENEVYQCLLSLLQVALSCTRLCPRERMNMKEVANRLHAIKISYDVESKRMQARLHHSDLHPGRVLLSWNARTNFCRWNGVICTTSRPWRVSGLNLSDKSLAGKITSSLANLTSLNLSDNQFQGAIPPKIGSLINLQTVYLEQNYLSGTIPATVGNITQLSVLNLKSNQLEGNIPDGVWQLSNLTWLVLGQNKLSGGIPSALNLPLLTILGLEENMLGQVLPPKIGYALPSLQLISMYSNKFEGQIPTSIGNASGLQLMDFSANNFTGQIPSSIGRLSKLSRLNLERNQLEASDNQGWEFLYLLRNSTSLMVFSLAQNHLQGSLPHSVANLSSNLKILLLSENKLTGIVPPSIGNLCNLSKLGLEQNNFSGEIGEWIGKLKNLQGLNLGGNTFFGPIRPSIVNLTLLIELFLDNNKFEGTIPTALSYLQLLSKLDLSHNHLQGEIPRNGIFGNATAVSLDGNLRLCGGVVDFHMPLCSAASLKIERKSDLVRLLIPIFGVMSLTVLIYIITLGKKTPRRTYLFLFSFGKQFPKVSYNDLARATGNFCESNLIGRGSYGSVYTGKLTQAKIEVAIKVFNLEMRRADRSFISECEVLRTIQHRNLLSILTACSTIDNTGKDFKALVYEFMHNGNLDTWLHHEHAGVVRKRLSMDQRVSIAVNMADALIYLHHECGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFGIASLVLDSPLTSEGNSGCNSSIVVKGTIGYIAPEYAQSARASTSGDVYSFGVVLLEMLIGKRPTDSIPFLYVSGPNRTYEHERSCH

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.195552 0.233716 0.311096

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0615500 SBH 1.178434 1.962854 0.176804
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g40200 SBH 0.796918 1.233021 0.045513
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0615500 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0024960 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0025230 SBH 0.246092 0.000000 0.510617
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0025050 SBH 0.778974 0.000000 0.521185
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0008360 SBH 0.0 0.011065 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0024760 RBH 1.656805 0.0 1.365528
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0396800 SBH 0.89135 0.030226 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0024480 SBH 0.0 0.0 0.116930
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0425400 SBH 1.672875 0.3362355 3.077142
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0024730 SBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0003980 SBH 0.070042 4.234505 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0004260 SBH 3.191976 29.049385 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0024690 SBH 0.035031 0.082412 0.021348
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0004290 SBH 0.032945 0.534010 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G025000 SBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0024850 SBH 0.0 0.0 0.0
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