Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsMH63_07G0442700 | OGI:07074680 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr07:28127241-28144961 | ||||||||
Gene Symbol | Os_F0606, qHMS7 ORF3, qHMS7 ORF1 | ||||||||||
DNA seq | 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CDS seq | ATGCACCGCCTCATCTCTTCTCCCTCTTTCATGGCATCTGCAGCGGCTAGCTGGTGCTGGTGGTCACCATTGCTTGCTCGAGGAGGACCTGTCCGTCGTGTTTCCCGATTTTATTGGGAACCTCGGAACATGACCACCATCAGTCGAGTAAAAGGGGACGAGTCTGGTAAACCATCCAGGCGGCTTCCATCCCTGGAGAAGAAGCATACTGCGATCACTCAAGGTATGAAAACCATTGACACCAGGGGCACAATCTTGGAGGCTAGAGCTGGAGATGAGAAAAGTAACAAAGATGCGGCGTCCTCAGAGGTTTCATACATCAAATACGATGTACTGGGGCAAAGTGCGAAGCAGGATGGCTGTGATGAGGATGATCGAAGGAGTGAAACGGAGGAACATGTTGAGGAGGACGAAGTTCTTGATCCTGAAGAATATACTGTGAACAACATACTTCCAAAAAGTAGACACCGTGATGGCTCTATATACAGGGACATCATGGATACACCGTGGAAAAGGGAGTTTCATATTGCAGACCGTAATGAGAGAGTAATCTTGTTTGTGCAATGGATTCATATATATTTGGCAATCACTCACTTATGGATGCAACCTGAACAAAAACAGCTCTGCCCTGCATTCAACAATCTAAAGAAGTTATCTATTCTTTGCATTCATGTTGAATTTGACCTGTTATGGACTATAAACCTCCTTGAAGCTGCACCATCCGTTGAGCTCCTTTGTATTGATGCCTGGGAACATGTATGCTTGGTAAACAAAGAGGATGAAGATGGAAGAAAGCTTGTTCATGGAGAAACAACACATCCTTCATGGGAGATATCTGAGTTCACTGGCACCAGAAATTGGCAATTGAAAGAACTCCAGTTCACTGGCTTTAGGCCACTCAAGCAACAATTGCGGCTAGCTGGTGGTCACCATTGCTTGCTCGAGGAGGACCTGTCCGTCGTGTTTCCGAGCTATACTCTTGCCTGCGCCGTTCCGGCCATCTCCTTCACTCCCTTTGCCAACCACCGACTTCCCCGGATGCGCATCGTTCGGGAACACCATCCTCTACCGGCGCAGTCATATCTTAGCCACCACAGCATCGGCGCCCTTCCTCTCCTCCTCTCGGTTCCCTGGCTAACAGAGAGGAAGAAAACGAAGCAAGGAGAGAAGAACAGGAGGAAGAAGAAGAGACATATGACATGCGGGCCCCACTTCTATAAAATTTTCTTGGGAACCTCGGAACATGACCACCATCAGTCAATAAGGAGGAAGAAGAAGGGATCAGGTCTCCGCGCGCGGCGCCGCTTTGTAGCGGAGTCAGCCTCCACTGCGCGCCGCACGACCGCCATCGTCACGGGCGTCGTCTTCTCGCTGTCCTCCTCATCGTCGTCCCCTTCGACGCCGTCCTCCCAGTTGGCATCGCGGGCCCGATCTGGCGAGGTGGTGGTGGGAGGCCTAGGCGAGGGGGTGGAAGCAAATGTGGCCGGGGAGGTCGAGGAAGGCACAGAAAGAGTCGCCGGGGAGTGTGTAGTGGGCGTAGAAGGCGAGGAGGTGGCTACAAAGAGGAGCAGGACGAGGATGCGGTCGGTCATGGCAGCGGGCAACGACAATCCACCAACTCCACTCCATCCCCGCCAACATCCAGATCTGCCGGCCCGAGCTCCCGGCGTCGGGATCCTCTTTGGCGTCCGTTGCGGCGCGCTCACTACCGCCTGCATGTACCTCGTGTGGTATGTCCTCACCGGCGCCGACGCCGCGCCCTCCCCCTACGGCGTTGAGGACGAGGAGGCGCCGTCTCCGCCTCAATTCCCCACGCAACACACACCACGGCTATTCCCCCTCCCTACCCCCGCCGCCTCCCCGTCCGCCGCCGCGATGCGAATTCTCCGCCCCATTCCGCGTCTTCCCCGACGCTCTAACGCCGCCACCTCTCCTGCCCCGATGCACCGGCTGATCTCTTCTCCCTCTTTCATGGCATCTGCAGCGGCTAGCTGGTGGTCACCATTGCTTGCTCGTGGAGGACCCGTCCGTCGTGTTTCCCGATTTCCTTGGGAACCTCGGAACATCACCACCATCAGTCGAGTAAAAGGCGACGAGTCATACAGGCGGCTTCCATCCCAGGAAAAGAATCATACTGCGATCACTCAAGGTATGAAAACCATTGACACCAGGGGCACAATCTTGGAGGTTAGAGCTGGAGATGAGAAAAGTAATAAAGATGCGGCGTCCTCAGAGGTTTTATATGTCAAATATGATATACTGGGGCAAAGTGCGAAGCATGATGGCTGTGATGCGGAGGACCGAAGGAGTGAAACAGAGGAACATGTGGGGGGAATAGTTGTCAGTGAGGAGGATGAAGTTCTTGATCCTGAAGAATATACTGTGAACAATATACTTCCAAAAAGTAGACACCGTGATGGCTCTATATATATGGACATCATGGACACACCGTGGAAAAAGGAGTTTCATATTGCAGACCGTAATGAGACTCAGTTGGAGGCAATGAAGTTTTCGAATCCCACAAATTGTGTCATTCGCAGAAATGGAACTTGCATGTCACATTATCATCGCTGCATGCTGCAAATTTTATCATTGGAGTTGGCTAAAATTACACTGGATGGTGGTTCAGTAGAGTTGTATGGATACATAGCTGTGCGGGATGATCTGGATCCGTTGCTTAATTATATCGTCAATTGTAGCAGGGATGATCCAATCATTGTGGAGCAGGGTTCGCTCATCAACATAGAAGGCCCTAAGCGAGGAATAGACATGAGGGATTATGCTCTAATTGAATATGACATGAGGATCAAGACAGGCAAACAAGAAAAAGATGACCTACAGCTGATTGATGGTGCATCAATGATAGGCCCTGCAGGCCTATGGAATCGGCCAGAAACAATTTGCATTCCTGGCGATTACGCTGAGGCCACCGTACAGATTCTTATATCAGAAGTGCAAAGCAGTTTCAATTTGTTGCTCGGTTGTTTAACCAGTAACTTGGATAAGGAAATCCGTCTCTTTGATGGTGTCATCAGTGAGTCACGTGGTTTAAAGAGGTCGGTGGTTGCTGTAAGGAGGGATTCTTTCATAGATTTGAAGTTCGAAGTGGGCGCGTTTCCATCCAGTTTCGACCAGCATTATGTTTCCTTCAAGGAGAAAATCCATGGCTATGATACTCAAGAAATAAAGACTGATTTTGCGTTAATCTCAGTAAAGGTGGTTGCGCTGGTGGCGGTGGCGACGCAGCGGCGGTGTTCAAGCCCTAAACCACTTCAAAGTCATGCTAGTGCTAGTACAGATGAGACCGCTGCAACAGCTGATTTGAGTCCCACCGAGGGCACGACCACCATCGCTTGCTCTGAAACCTTATGA
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Function | - |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsMH63_07G0442700 | OsMH63_07T0442700-mRNA-1 | Chr07 | 28127241 | 28144323 | + | maker | ||
CDS seq | ATGCACCGCCTCATCTCTTCTCCCTCTTTCATGGCATCTGCAGCGGCTAGCTGGTGCTGGTGGTCACCATTGCTTGCTCGAGGAGGACCTGTCCGTCGTGTTTCCCGATTTTATTGGGAACCTCGGAACATGACCACCATCAGTCGAGTAAAAGGGGACGAGTCTGGTAAACCATCCAGGCGGCTTCCATCCCTGGAGAAGAAGCATACTGCGATCACTCAAGGTATGAAAACCATTGACACCAGGGGCACAATCTTGGAGGCTAGAGCTGGAGATGAGAAAAGTAACAAAGATGCGGCGTCCTCAGAGGTTTCATACATCAAATACGATGTACTGGGGCAAAGTGCGAAGCAGGATGGCTGTGATGAGGATGATCGAAGGAGTGAAACGGAGGAACATGTTGAGGAGGACGAAGTTCTTGATCCTGAAGAATATACTGTGAACAACATACTTCCAAAAAGTAGACACCGTGATGGCTCTATATACAGGGACATCATGGATACACCGTGGAAAAGGGAGTTTCATATTGCAGACCGTAATGAGAGAGTAATCTTGTTTGTGCAATGGATTCATATATATTTGGCAATCACTCACTTATGGATGCAACCTGAACAAAAACAGCTCTGCCCTGCATTCAACAATCTAAAGAAGTTATCTATTCTTTGCATTCATGTTGAATTTGACCTGTTATGGACTATAAACCTCCTTGAAGCTGCACCATCCGTTGAGCTCCTTTGTATTGATGCCTGGGAACATGTATGCTTGGTAAACAAAGAGGATGAAGATGGAAGAAAGCTTGTTCATGGAGAAACAACACATCCTTCATGGGAGATATCTGAGTTCACTGGCACCAGAAATTGGCAATTGAAAGAACTCCAGTTCACTGGCTTTAGGCCACTCAAGCAACAATTGCGGCTAGCTGGTGGTCACCATTGCTTGCTCGAGGAGGACCTGTCCGTCGTGTTTCCGAGCTATACTCTTGCCTGCGCCGTTCCGGCCATCTCCTTCACTCCCTTTGCCAACCACCGACTTCCCCGGATGCGCATCGTTCGGGAACACCATCCTCTACCGGCGCAGTCATATCTTAGCCACCACAGCATCGGCGCCCTTCCTCTCCTCCTCTCGGTTCCCTGGCTAACAGAGAGGAAGAAAACGAAGCAAGGAGAGAAGAACAGGAGGAAGAAGAAGAGACATATGACATGCGGGCCCCACTTCTATAAAATTTTCTTGGGAACCTCGGAACATGACCACCATCAGTCAATAAGGAGGAAGAAGAAGGGATCAGGTCTCCGCGCGCGGCGCCGCTTTGTAGCGGAGTCAGCCTCCACTGCGCGCCGCACGACCGCCATCGTCACGGGCGTCGTCTTCTCGCTGTCCTCCTCATCGTCGTCCCCTTCGACGCCGTCCTCCCAGTTGGCATCGCGGGCCCGATCTGGCGAGGTGGTGGTGGGAGGCCTAGGCGAGGGGGTGGAAGCAAATGTGGCCGGGGAGGTCGAGGAAGGCACAGAAAGAGTCGCCGGGGAGTGTGTAGTGGGCGTAGAAGGCGAGGAGGTGGCTACAAAGAGGAGCAGGACGAGGATGCGGTCGGTCATGGCAGCGGGCAACGACAATCCACCAACTCCACTCCATCCCCGCCAACATCCAGATCTGCCGGCCCGAGCTCCCGGCGTCGGGATCCTCTTTGGCGTCCGTTGCGGCGCGCTCACTACCGCCTGCATGTACCTCGTGTGGTATGTCCTCACCGGCGCCGACGCCGCGCCCTCCCCCTACGGCGTTGAGGACGAGGAGGCGCCGTCTCCGCCTCAATTCCCCACGCAACACACACCACGGCTATTCCCCCTCCCTACCCCCGCCGCCTCCCCGTCCGCCGCCGCGATGCGAATTCTCCGCCCCATTCCGCGTCTTCCCCGACGCTCTAACGCCGCCACCTCTCCTGCCCCGATGCACCGGCTGATCTCTTCTCCCTCTTTCATGGCATCTGCAGCGGCTAGCTGGTGGTCACCATTGCTTGCTCGTGGAGGACCCGTCCGTCGTGTTTCCCGATTTCCTTGGGAACCTCGGAACATCACCACCATCAGTCGAGTAAAAGGCGACGAGTCATACAGGCGGCTTCCATCCCAGGAAAAGAATCATACTGCGATCACTCAAGGTATGAAAACCATTGACACCAGGGGCACAATCTTGGAGGTTAGAGCTGGAGATGAGAAAAGTAATAAAGATGCGGCGTCCTCAGAGGTTTTATATGTCAAATATGATATACTGGGGCAAAGTGCGAAGCATGATGGCTGTGATGCGGAGGACCGAAGGAGTGAAACAGAGGAACATGTGGGGGGAATAGTTGTCAGTGAGGAGGATGAAGTTCTTGATCCTGAAGAATATACTGTGAACAATATACTTCCAAAAAGTAGACACCGTGATGGCTCTATATATATGGACATCATGGACACACCGTGGAAAAAGGAGTTTCATATTGCAGACCGTAATGAGACTCAGTTGGAGGCAATGAAGTTTTCGAATCCCACAAATTGTGTCATTCGCAGAAATGGAACTTGCATGTCACATTATCATCGCTGCATGCTGCAAATTTTATCATTGGAGTTGGCTAAAATTACACTGGATGGTGGTTCAGTAGAGTTGTATGGATACATAGCTGTGCGGGATGATCTGGATCCGTTGCTTAATTATATCGTCAATTGTAGCAGGGATGATCCAATCATTGTGGAGCAGGGTTCGCTCATCAACATAGAAGGCCCTAAGCGAGGAATAGACATGAGGGATTATGCTCTAATTGAATATGACATGAGGATCAAGACAGGCAAACAAGAAAAAGATGACCTACAGCTGATTGATGGTGCATCAATGATAGGCCCTGCAGGCCTATGGAATCGGCCAGAAACAATTTGCATTCCTGGCGATTACGCTGAGGCCACCGTACAGATTCTTATATCAGAAGTGCAAAGCAGTTTCAATTTGTTGCTCGGTTGTTTAACCAGTAACTTGGATAAGGAAATCCGTCTCTTTGATGGTGTCATCAGTGAGTCACGTGGTTTAAAGAGGTCGGTGGTTGCTGTAAGGAGGGATTCTTTCATAGATTTGAAGTTCGAAGTGGGCGCGTTTCCATCCAGTTTCGACCAGCATTATGTTTCCTTCAAGGAGAAAATCCATGGCTATGATACTCAAGAAATAAAGACTGATTTTGCGTTAATCTCAGTAAAGGTGGTTGCGCTGGTGGCGGTGGCGACGCAGCGGCGGTGTTCAAGCCCTAAACCACTTCAAAGTCATGCTAGTGCTAGTACAGATGAGACCGCTGCAACAGCTGATTTGAGTCCCACCGAGGGCACGACCACCATCGCTTGCTCTGAAACCTTATGA
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Protein seq | MHRLISSPSFMASAAASWCWWSPLLARGGPVRRVSRFYWEPRNMTTISRVKGDESGKPSRRLPSLEKKHTAITQGMKTIDTRGTILEARAGDEKSNKDAASSEVSYIKYDVLGQSAKQDGCDEDDRRSETEEHVEEDEVLDPEEYTVNNILPKSRHRDGSIYRDIMDTPWKREFHIADRNERVILFVQWIHIYLAITHLWMQPEQKQLCPAFNNLKKLSILCIHVEFDLLWTINLLEAAPSVELLCIDAWEHVCLVNKEDEDGRKLVHGETTHPSWEISEFTGTRNWQLKELQFTGFRPLKQQLRLAGGHHCLLEEDLSVVFPSYTLACAVPAISFTPFANHRLPRMRIVREHHPLPAQSYLSHHSIGALPLLLSVPWLTERKKTKQGEKNRRKKKRHMTCGPHFYKIFLGTSEHDHHQSIRRKKKGSGLRARRRFVAESASTARRTTAIVTGVVFSLSSSSSSPSTPSSQLASRARSGEVVVGGLGEGVEANVAGEVEEGTERVAGECVVGVEGEEVATKRSRTRMRSVMAAGNDNPPTPLHPRQHPDLPARAPGVGILFGVRCGALTTACMYLVWYVLTGADAAPSPYGVEDEEAPSPPQFPTQHTPRLFPLPTPAASPSAAAMRILRPIPRLPRRSNAATSPAPMHRLISSPSFMASAAASWWSPLLARGGPVRRVSRFPWEPRNITTISRVKGDESYRRLPSQEKNHTAITQGMKTIDTRGTILEVRAGDEKSNKDAASSEVLYVKYDILGQSAKHDGCDAEDRRSETEEHVGGIVVSEEDEVLDPEEYTVNNILPKSRHRDGSIYMDIMDTPWKKEFHIADRNETQLEAMKFSNPTNCVIRRNGTCMSHYHRCMLQILSLELAKITLDGGSVELYGYIAVRDDLDPLLNYIVNCSRDDPIIVEQGSLINIEGPKRGIDMRDYALIEYDMRIKTGKQEKDDLQLIDGASMIGPAGLWNRPETICIPGDYAEATVQILISEVQSSFNLLLGCLTSNLDKEIRLFDGVISESRGLKRSVVAVRRDSFIDLKFEVGAFPSSFDQHYVSFKEKIHGYDTQEIKTDFALISVKVVALVAVATQRRCSSPKPLQSHASASTDETAATADLSPTEGTTTIACSETL
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsMH63_07G0442700 | OsMH63_07T0442700-mRNA-2 | Chr07 | 28144327 | 28144961 | + | maker | ||
CDS seq | ATGATCGTCGCCGCCAACTGCGAGCCCAAACCGTCGCGGACTATAGTAGGCTGCTGGTTGCTTGTCGTGCGCGATAGGAGGTCCGGCGGGGATCCCCTGCACTCGTCGTGTCCGGCGGAGGCGGCGCCACTGGCTGTGGACGAGGAGGGGAACAGGGACTTGACGTTGTCAGAGACTCGATCTGCGCCCAGCGAATGTGGAAGGAATGAGCCAGCAGCGGACGCGGAGCTGGACGTCGAGGTCGCCTGCTCGGTGGCCTCTGGCTGCTCCGTTGACGTCACGTCGGGTGGTGGTGGGGCCTCAGCGCAGTCGATCGGGGAGCTCGTCGATGGCGGCCTTGGCGTTGCACATGAGCCAGTCGACGACCTTGCGGGGCTGGTCGTAGAACCGAATGGCAGTGTGCCAGTGTGCGCGGTGAGGCGGATGCGCCGGTCCCCGCTGCGTGTCCCAACCGTTGTCCCTCTTCAAGGATCCATCGCCAGTTGTTTACTAGCCGCGCTGCCGCTGCCACGACCACCGCCGTCTCCGCGGCTTCCTCCAGATCTTTCCCATCTTTCTGCCAAACAATGGGAAAACAGATGA
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Protein seq | MIVAANCEPKPSRTIVGCWLLVVRDRRSGGDPLHSSCPAEAAPLAVDEEGNRDLTLSETRSAPSECGRNEPAADAELDVEVACSVASGCSVDVTSGGGGASAQSIGELVDGGLGVAHEPVDDLAGLVVEPNGSVPVCAVRRMRRSPLRVPTVVPLQGSIASCLLAALPLPRPPPSPRLPPDLSHLSAKQWENR |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 4.5853915 | 3.4709785 | 3.309221 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_07g0646300 | SBH | 4.650752 | 5.683068 | 11.366956 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g45195 | RBH | 2.903098 | 3.401609 | 2.690468 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os07g0646600 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0025390 | SBH | 4.494284 | 19.975655 | 17.351009 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0025310 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_07g0025290 | RBH | 5.052930 | 5.726491 | 22.455086 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_07g0025160 | RBH | 0.694508 | 0.142098 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_07g0025330 | RBH | 26.414890 | 9.363059 | 24.355761 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_07G0444400 | SBH | 22.604575 | 14.355679 | 15.064616 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_07g0026020 | RBH | 0.860199 | 1.275691 | 1.102993 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_07G0454400 | RBH | 0 | 7.5595935 | 5.5632465 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_07g0025140 | RBH | 1.286270 | 0.195170 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_07g0025370 | RBH | 4.018462 | 1.643575 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_07g0025300 | RBH | 21.961807 | 7.338263 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_07g0025350 | RBH | 2.708338 | 0.958452 | 1.230944 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_07g0025060 | RBH | 2.100840 | 0.000000 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_07G025210 | RBH | 1.325499 | 6.854395 | 5.749860 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_07g0025270 | RBH | 2.865501 | 13.447166 | 15.906452 |