Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsMH63_03G0509800 | OGI:03083480 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr03:32956152-32979013 | ||||||||
Gene Symbol | SCP19, OsSCP19, SCP20, OsSCP20, SCP21, OsSCP21 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Serine carboxypeptidase-like 18 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7Z9] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsMH63_03G0509800 | OsMH63_03T0509800-mRNA-1 | Chr03 | 32956152 | 32979013 | + | maker | ||
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CDS seq | ATGGTCTTGGAGCTTCTCACAATGGCTGCTCACCGCGTGGGGCGATGCATGCTCCTGCAACCACCGCGCCTCGCCACCTGCGTCCTCTTCCTCCTGCTACCGCTGCTGCTGCCGTGCTCGGCGTCGTCGTCGGTGATCACCCACCTCCCGGGCTTCCACGGCCGCTTGCCGTTCCACCTTGAGACCGGCCGCCGCGCGGAGACGGGCGGCCTCTTCAACCTCCGCCTTGGCCTCGACCTCGGCCACCGCGACCTCGTCCACCTTCGACTTGGCCTCCTCCGCGCGGCGGCGAGAGAGAGGCAAGCAGCGGTGACGCAAGAGAGAGGAGAAAGCGGCGGCGGCGACGGCTGGGGAGGGAGGTGGCGCCGGCGCTCGTGGGAGAGAGAGGGAGAGGAAGGGGGAGGACGGCGACGACGCCGAGTTGAGGAAGCGAGGCGGGTCCGAGCGAAGAAAAAAAGAAGAGGAGGGGAAAGAGGCGGAGAAAAAAAGAGGAAAGAGAGAGAGGGTGGGGGCGGGGAGGGAGAGGGGTATGTTGGTGTGGACGAGGAGACGGGCACTGAGCTCTTCTACTACTTCGTTGAATCGGAGAGGAGCCCAAGTACAGGCCCTGTGATCCTCTGGTTGACAGGCGGGCCTGGCTGCTCCGGATTCAGCGGTGTCGTCTTTGAAGTAGGACCTATGAAATACGTGTTGGAGCCTTATAATGGTAGTTTGCCACGATTGGTTTATAATCAGTATTCATGGACACAGATGGCAAGCATCCTCTTCTTGGACACTCCTGTTGGTTCTGGTTTCTCATACGCTCATGATCCTAAAGGTTATAATGTCGGGGACATATCATCGTCTTTGCAAGTCGTAACATTTCTGAAGAAGTGGTTCAATGATCACCCACGCTATCTCTCAAATCATTTCTATGTTGGAGGAAGCTCATACGCTGGAAAGGGGTATATAGTTGGCAACCCCATTACAGGCTCGAAGATTGATGATAATTTCAAAATTCCATATTCTCATGGTGTTGGGATCATATCTGATCAATTATACGAGGCTGCAGTAGCAAACTGCAATGGAGATTATGTGACCACAACAAATAAATTATGTGCTAAGGCCCTAAATGCTATTGATAATCTCATGTCTGAAGTTGATTATGGAAATATCTTGGATGATAAATGTGTTCGTGCTACACCAAAACCCATAAATGAAGTTTCAAGAAGTAGGAGTCTGCTAGAAGATTACATTCGGCTAAGTGAGCCGACTTCATACCGTTACTATCTATCATTCTTGTGGATGAACAACAATTTGACTAGAGAAGCTCTTAAGATCAAGAAGGGAACAGTCGGCGAATGGATAAGATGCAAGACAGGGCTACCCTATGTTCAAGATGTCGCAAGCAGCATCAAGTATCATTTTGACCTCACCACAGGAGGTTACCGGGCACTTGTGTTCAGTGGTGACCATGATCTCATATTGCCATTTCTGAGCACCCAGGCATGGATAAGATCCTTGAACTTCTCCATAGTTGATGAGTGGAGAGCATGGCATGTGGATGGCCAGGCTGCAGGATTTACAATTTTGTACGCCAACAACTTGACCTTTGCCACAGTAAAGAGCAACAAGAGGAAGCCTGCAGCCACGCTCCTCCTGGATCTCCTCACGATGGGTTCGCATCGTCACCGCAGCGCAGGGCAATGCAGCCTCGTGCAGCCGCCACGCCTCATCACCTGCCTTCTCCTACTGCTGCTTCTGCTTCTGTCGCCACCGGCGCTCCCGTGCTCGGCGTCGTCGTCGTCGGTGATCACTCACCTCCCGGGATTCCTTGGTCGCCTGCCGTTCTACCTCGAGACTGGTCCTGTCGGTTCTGGTTTCTCATACGCACGTGATTCCAATGGTTACGATGTTGGGGATATATCATCTTCTTTACAAGTGGTCACATTTATGAAGGAGTGGCTCAATGATCACCCACGCTACCGCTCACATAATTTCTATGTTGGTGGAGCCTCATATGCTGGAAAGGTGGTTCCAGTTATCGTGCAATACATTTCAGAAGGCTGCGGTAACGCATTGCAAAGGAGATTTTGTGAACCCAACAAACCAATTCTCATGTCTGAAGTTTCGGATGGAAATATCTTGGAGGATAAATGTGTTAAAGCTGCACCAAAACCTACAATAGATGTTTCAGCAAGCAGGGCACTGCTGGAAGAATACAGCCGGCTAAGCAAGCCACCTATTCGACCTTCTATGAATTGCGCTGCGAGGCAGGAGACTGGCTTGATGCCAAAGGCGTCGTCATATGGTTACTACCTATCATACTGCTGGATGAATGACAATACGACTAGAGATGCTCTTAAGATCAAGAAGGGAACCATTGGTGAGTGGTTAAGATGCAATAGAGGTGTATTTCCCTATGCTAAAGACATCCCAAACGCCTTGGATTACCATTTTAATCTCACCACAAGAGGTTACCGAGCACTTGTGATGAGCGGTGACCATGATCTCAAGGTGCCATTTTTGAGCACTCAGGCATGGATAAGATCCTTTAACTTCTTCATAGTTGATGACTGGAGAGCATGGCATGTGGATGGCCAAGCTGCTGGATTCACAATTACGTATGCCAACAACTTGACCTTTGCCACAGTAAAGGGTGGTTCCCATGTCGCTACAGTAAACAAGCCTAAAGAATCTTTCGCCATGGGGAAACGTTTAGTTCCATGTGGCATATTGCTCCCTTCATGGCTTGCTGACAACTCGATCTTTCCCAGAAAAGGATTGACAATTAACTATATCATCGAGTTCTTGGAGCATTGA
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
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Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os03g52040 | RBH | 0.000000 | 0.110022 | 1.170091 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os03g0730400 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_03g0033460 | RBH | 0.0 | 26.226118 | 2.756449 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_03g0033160 | RBH | 0.061128 | 5.233663 | 2.898850 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_03g0033230 | RBH | 0.0 | 33.996284 | 5.481895 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_03g0033550 | RBH | 0.0 | 0.558627 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_03g0033160 | RBH | 4.530792 | 29.704414 | 38.734978 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | NA | NA | NA | NA | NA |
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Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_03G0510800 | RBH | 8.850739 | 7.067128 | 4.8354455 |
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KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_03g0033370 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_03g0033160 | RBH | 0.618060 | 47.915791 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_03g0033100 | RBH | 0.642138 | 0.515224 | 0.785306 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_03g0033100 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_03G032890 | RBH | 0.000000 | 2.657251 | 5.664279 |
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