Basic Info |
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| OsLiXu_Ung0007720 | OGI:99018170 | 1/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | ChrUN-Ctg62:97955-110681 | ||||||||
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| Protein seq | MFSGNIPDSIGKLKRLEEIHLHHNSMAGELTPAIGSCTNLKALNLGSNNFSGELGKVNFSKLSSLKSLHVSYNSFAGTIPESVYTCSNLNALQLSFNKFHGQLSFRITNLKSLTYLSLAENSFTNISNTLQILKSSRDLTTLLIGGNFRDEEISDETVDGFENLKVLAMENCPLFGNIPIWISKLKNLEMLFLFNNHLSGSIPVWISTLNSLFYLDLSNNSLSGEIPAELTEMPMLRSEMVTSHLDIKIFELPVYTGPSPKYFTVSDFPAVMILENNKLTGVIPTEIADLNNLNFLSALNVSNNDLQGPVPTGGHLDTFPRSSFDGNPRLCGHILDQDCDDPVMVDSPQGSSRQGGYKVIFVIAFGAFFGVGERESLLQFLSGLSNDGGLGVSWQNGTDCCTWEGITCSGNGAVVEVISLASRGLEGSISPSLGDLTGLLRLNLSRNSLSGGLPLELVSSSSIVVLDVSFNYLTGGLSELPSSTPDRPLQVLNISSNLFTGNFPSTTWERMNNLVVLNASNNRFTGQMPTSFCASAPSFAVLELSYNQFSGRIPAGLSNCSKLTLLSASYNNLTGTLPDELFDLTSLKHLCFLRNQLEGSIKGITKLKNLVTIDLGQNRLSGSIPNSIGQLKRLEKLHLAYNSMSGELPSTVGNCRNLKNMNLGGNNFSGDLGNVNFSTLRNLQSLDLMSNNFTGTVPESIYSCRNLSALQLSNNSFHGQLSEKIRNLKCLSFVSLVDISLTNITGSLQILQSCRNLTTLLIGYNFMQETMPEDDEIYGFENLRIFSLNDCSLSGKIPKWLSKLTNLEMLSLYNNQLNGAIPDWISSLNFLFHIDISNSSLSGEIPSALVEMPMLKSDNVPPKVFELPICTGYALQYRINSAFPKVLNLGINNFTGIIPNEIGQLKALQLLNLSSNRLSGEIPESIYKLTNLQVLDLSSNNLTGTIPDGLNKLHFLSAFNISNNDLEGPVPNAGQLSTFPSTSFDGNPKLCGPMLARHCGLAQTPFVSTKQNADKEKSSLLQFLAELSHDGGIAMSWQNGTNCCVWEGITCNEDGAVIEVRLTSKGLEGQIAPSLGELTSLSRLNLSYNSLSGGLPAELMSSGSIVVLDVSFNRLNGDLQELNPSVSDRPLQVLNISSNRFTGEFPSITWEKMRNLVAINASNNSFTGHIPSSFCSNSPSFAVLDLGYNQFSGNVPPGIGKCSALRLLKANANNIRGPLPGDLFNATSLEYLSFANNGLQGTIDDALIVKLINLVFVDLGWNRFSGKIPNSIGQLKRLKELHICSNNLSGELPSSLGDCTKLVTINLRGNKLTGELAKVNYSNLPNLKTLDFASNHFTGKIPESIYSCSNLTWLRLSSNRLHGQLTKNIQNLNSITFLSLSYNNFTNIKNTLHILKSLRNLNVLLIGGNFMHEAMPQDETIDGFENIFGISIHDCALTGKIPSWLSKLGNLAVLDLSNNKLRGPIPTWINSLNFLKYADISNNSLSGEIPQALMEIPMLKSDKIADNSDPRAFPFPVYAGACLCFQYRTVTAFPKMLNLGNNKFTGAIPMEIGELKALVSLNLSFNNLNREIPQSISNLKNLMVLDLSYNHLTGAIPPALVNLHFLSEFNVSHNDLKGSVPIGGQFSTFPSSSFAGNPELCSPILLHRCNVAEVDLSSPNSTKEYINKVIFVIAFCVFFGVGVLYDQIVLSRYFRLN |
||||||||||
| Function | Receptor-like protein 2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SHI3] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLiXu_Ung0007720 | OsLiXu_Ung0007720.01 | ChrUN-Ctg62 | 97955 | 110681 | - | NAM | ||
| CDS seq | ATGTTCAGTGGCAACATCCCTGATTCCATTGGGAAGCTCAAGAGGCTGGAGGAGATTCACTTGCACCACAACAGCATGGCAGGGGAGCTGACACCAGCTATAGGCAGCTGCACGAATCTCAAAGCATTAAATCTTGGGAGCAACAACTTCAGTGGAGAGCTTGGCAAGGTCAACTTCTCCAAACTGTCTAGTCTAAAATCTTTGCATGTCTCATATAACAGCTTCGCTGGCACAATTCCTGAGAGTGTCTACACATGTAGCAACCTGAATGCATTGCAACTATCGTTTAACAAGTTCCATGGTCAGCTCTCATTCAGAATAACCAACCTCAAGTCACTAACCTACCTATCACTTGCTGAAAACTCTTTTACAAATATTTCAAATACACTTCAAATCCTCAAGAGCTCTAGAGATCTCACCACCTTGCTTATTGGAGGCAACTTTAGGGATGAGGAAATTTCAGACGAAACAGTTGATGGTTTTGAGAATCTTAAGGTTCTTGCTATGGAAAACTGTCCACTGTTTGGAAATATACCTATTTGGATATCAAAACTCAAGAATCTGGAGATGCTATTCTTGTTTAACAATCATTTAAGTGGATCAATACCGGTTTGGATCAGCACCTTAAACTCCCTATTCTATCTAGATTTATCAAACAACAGCCTTTCAGGGGAAATCCCAGCAGAGTTAACAGAGATGCCAATGCTAAGATCAGAAATGGTTACATCTCATTTGGACATAAAGATCTTTGAGCTGCCTGTTTACACTGGTCCATCACCTAAGTACTTCACTGTCAGTGATTTCCCTGCAGTGATGATTCTGGAAAACAACAAATTAACAGGTGTGATCCCAACAGAGATTGCTGACCTGAACAACCTGAACTTCCTCTCTGCACTCAACGTCTCCAACAATGACTTGCAAGGGCCTGTTCCAACTGGAGGACACCTGGATACATTCCCAAGATCCAGCTTCGATGGAAATCCGAGGCTATGCGGCCATATACTAGATCAAGATTGTGATGATCCAGTAATGGTAGATTCACCTCAAGGTTCCAGCAGACAAGGAGGTTACAAGGTCATCTTTGTGATTGCATTTGGTGCCTTCTTTGGAGTAGGGGAGAGGGAATCTCTCCTCCAGTTCCTCTCCGGGCTATCGAACGATGGCGGCCTTGGTGTGTCATGGCAAAACGGCACAGACTGCTGCACCTGGGAAGGCATCACCTGCAGCGGAAACGGAGCGGTGGTCGAGGTGATCTCTCTGGCATCAAGAGGCCTTGAAGGGAGCATCTCACCATCCCTCGGCGACCTCACCGGTTTACTGAGGCTGAACTTGTCCCGCAACTCGTTGTCCGGTGGCTTACCGCTGGAACTGGTGTCATCCAGCAGCATTGTGGTCCTTGATGTCAGTTTTAACTACTTAACAGGAGGACTGAGTGAGCTGCCATCTTCAACCCCTGACCGGCCGCTGCAGGTATTGAACATCTCGAGCAACTTGTTTACAGGGAATTTTCCATCAACCACATGGGAGAGGATGAACAATCTGGTTGTGCTTAATGCCAGCAACAACAGATTTACTGGGCAGATGCCAACCTCGTTCTGTGCCAGCGCGCCATCTTTTGCTGTGCTTGAACTCAGCTATAACCAATTCAGTGGAAGAATCCCTGCGGGGCTCAGCAATTGCTCCAAGCTGACACTTCTGAGCGCTAGCTACAACAACCTCACCGGGACTCTTCCAGACGAGCTATTTGATCTGACCTCTTTGAAGCACCTCTGTTTTCTTAGAAACCAGTTAGAAGGATCAATCAAAGGCATCACCAAGCTTAAAAATCTAGTGACCATTGATCTTGGACAAAACAGGCTTAGTGGAAGTATCCCAAATTCGATAGGTCAGCTTAAGAGACTGGAGAAGCTCCATTTGGCATACAACAGCATGTCCGGGGAGTTGCCATCAACTGTAGGAAATTGCAGAAATCTTAAGAACATGAACCTCGGGGGCAACAACTTTTCAGGAGATCTTGGCAATGTCAACTTCTCCACATTACGCAATTTACAGTCCTTAGATCTTATGTCGAACAATTTCACCGGAACAGTGCCAGAAAGCATCTACTCATGCAGAAATCTAAGTGCATTGCAGCTGTCTAACAATAGCTTCCATGGCCAGCTCTCGGAGAAAATCCGCAATCTGAAGTGCCTCTCATTTGTATCACTTGTTGACATCTCTCTTACAAATATCACAGGTTCACTTCAGATACTTCAGAGCTGCAGGAACCTGACCACCTTGCTTATTGGGTACAACTTCATGCAAGAGACCATGCCAGAGGATGACGAGATTTATGGTTTTGAGAATCTTCGGATTTTTTCCCTGAACGATTGTTCATTGTCTGGAAAAATACCTAAATGGTTATCAAAGCTCACAAATCTGGAGATGCTATCTTTATATAACAATCAACTAAACGGAGCAATACCTGACTGGATCAGCAGCCTAAACTTCTTGTTCCATATAGACATTTCAAACAGCAGCCTTTCAGGGGAAATTCCATCAGCCTTAGTTGAGATGCCAATGCTAAAATCAGATAATGTTCCACCAAAGGTCTTTGAGCTGCCTATCTGTACAGGTTATGCACTTCAATACCGAATAAACAGTGCATTCCCTAAAGTGCTGAATCTAGGCATCAATAATTTCACTGGCATCATCCCGAACGAGATTGGTCAGTTGAAGGCACTCCAGTTACTCAATTTGAGTTCCAACAGATTGTCTGGAGAGATACCAGAATCAATCTACAAGCTCACAAACCTACAGGTGCTTGATTTGTCCAGCAATAATCTCACTGGTACAATTCCTGATGGGCTGAACAAACTTCACTTCCTTTCAGCATTCAACATTTCTAACAATGACCTTGAAGGGCCAGTTCCAAATGCAGGACAGCTTAGCACATTCCCAAGTACTAGCTTTGATGGGAACCCAAAGTTGTGTGGTCCTATGCTTGCACGCCATTGTGGTTTAGCACAAACACCATTTGTCTCCACAAAACAAAATGCTGACAAGGAGAAGAGTTCTCTCCTCCAGTTCCTTGCTGAGCTGTCGCATGACGGTGGCATCGCCATGTCATGGCAGAATGGCACGAACTGCTGTGTGTGGGAGGGCATCACCTGCAATGAAGATGGGGCTGTCATTGAGGTTCGTCTCACCTCTAAAGGCCTTGAAGGGCAAATCGCACCGTCGCTGGGAGAGCTCACCAGCTTGTCGCGCCTCAACCTGTCGTACAACTCCCTATCTGGCGGCCTTCCAGCAGAGCTGATGTCTTCTGGCAGCATTGTCGTCCTTGATGTCAGCTTCAATCGCCTCAACGGGGACCTGCAAGAGTTGAATCCATCAGTATCTGACAGGCCACTGCAGGTACTGAATATCTCAAGCAACCGGTTTACAGGAGAATTTCCATCCATCACATGGGAGAAAATGAGGAACCTGGTCGCAATCAACGCGAGCAACAACAGTTTTACCGGGCACATACCTTCCTCCTTCTGCAGCAATTCGCCATCTTTTGCTGTTCTTGATCTTGGGTACAACCAGTTCAGTGGCAACGTCCCCCCTGGAATAGGTAAATGTTCTGCCCTTAGACTTCTCAAGGCTAATGCCAACAACATCAGAGGGCCTCTCCCAGGTGATCTCTTCAATGCCACATCATTGGAGTACCTCTCTTTCGCTAACAATGGATTGCAAGGAACAATTGATGATGCTCTCATCGTAAAGCTCATCAATCTTGTTTTTGTTGATCTTGGATGGAATAGATTCAGTGGCAAGATCCCAAATTCTATAGGCCAGTTGAAAAGACTAAAGGAGCTTCACATTTGCAGCAACAACTTATCTGGAGAGCTGCCATCATCATTGGGAGATTGCACAAAACTAGTAACCATCAACCTCAGGGGAAACAAGTTGACGGGTGAGCTTGCCAAGGTTAACTACTCCAATCTACCCAATCTGAAAACATTAGATTTTGCCTCGAATCACTTCACCGGCAAAATTCCAGAAAGCATATACTCATGTAGTAATTTGACTTGGTTGCGGCTATCTTCCAATAGGCTTCACGGCCAGTTGACAAAGAACATACAGAATCTGAATTCTATCACCTTCTTATCTCTTTCCTACAACAATTTTACAAATATCAAAAATACTCTTCACATACTCAAGAGCTTAAGGAACCTCAATGTCTTGTTAATTGGGGGCAACTTCATGCACGAAGCTATGCCACAGGATGAAACAATTGATGGTTTCGAGAATATTTTTGGTATTAGCATACATGATTGTGCATTGACTGGAAAAATACCTAGTTGGCTCTCAAAGCTCGGAAATTTGGCAGTTTTAGATTTATCCAACAATAAACTCAGGGGACCTATACCAACCTGGATCAATAGCCTAAACTTCCTTAAGTATGCAGACATATCCAATAATAGCCTTTCAGGAGAAATACCACAAGCACTAATGGAGATACCAATGCTAAAATCAGATAAGATTGCAGATAACTCAGACCCAAGAGCCTTTCCGTTTCCAGTGTATGCAGGCGCATGTCTGTGTTTTCAGTACCGTACAGTTACTGCTTTCCCTAAAATGTTGAATCTAGGTAATAACAAATTCACTGGTGCGATCCCGATGGAGATTGGTGAGTTGAAAGCACTCGTTTCACTCAACTTGAGCTTCAACAACCTAAACAGGGAGATCCCACAATCGATCAGCAACCTCAAGAATCTGATGGTTCTAGACCTGTCATACAACCATCTGACAGGTGCAATCCCTCCAGCACTGGTGAACCTTCACTTCCTTTCTGAATTCAATGTTTCCCACAATGATCTAAAAGGGTCTGTACCAATTGGAGGCCAGTTCAGCACATTTCCAAGTTCTAGTTTTGCTGGAAACCCAGAGCTATGCAGCCCGATACTTTTGCACCGTTGCAATGTAGCAGAAGTAGATTTGTCTTCCCCAAACTCAACAAAAGAGTACATCAACAAGGTCATCTTTGTGATTGCTTTTTGTGTATTCTTTGGAGTAGGAGTGCTATATGATCAGATAGTTCTATCCAGATATTTTCGGTTGAACTGA
More
|
|||||||
| Protein seq | MFSGNIPDSIGKLKRLEEIHLHHNSMAGELTPAIGSCTNLKALNLGSNNFSGELGKVNFSKLSSLKSLHVSYNSFAGTIPESVYTCSNLNALQLSFNKFHGQLSFRITNLKSLTYLSLAENSFTNISNTLQILKSSRDLTTLLIGGNFRDEEISDETVDGFENLKVLAMENCPLFGNIPIWISKLKNLEMLFLFNNHLSGSIPVWISTLNSLFYLDLSNNSLSGEIPAELTEMPMLRSEMVTSHLDIKIFELPVYTGPSPKYFTVSDFPAVMILENNKLTGVIPTEIADLNNLNFLSALNVSNNDLQGPVPTGGHLDTFPRSSFDGNPRLCGHILDQDCDDPVMVDSPQGSSRQGGYKVIFVIAFGAFFGVGERESLLQFLSGLSNDGGLGVSWQNGTDCCTWEGITCSGNGAVVEVISLASRGLEGSISPSLGDLTGLLRLNLSRNSLSGGLPLELVSSSSIVVLDVSFNYLTGGLSELPSSTPDRPLQVLNISSNLFTGNFPSTTWERMNNLVVLNASNNRFTGQMPTSFCASAPSFAVLELSYNQFSGRIPAGLSNCSKLTLLSASYNNLTGTLPDELFDLTSLKHLCFLRNQLEGSIKGITKLKNLVTIDLGQNRLSGSIPNSIGQLKRLEKLHLAYNSMSGELPSTVGNCRNLKNMNLGGNNFSGDLGNVNFSTLRNLQSLDLMSNNFTGTVPESIYSCRNLSALQLSNNSFHGQLSEKIRNLKCLSFVSLVDISLTNITGSLQILQSCRNLTTLLIGYNFMQETMPEDDEIYGFENLRIFSLNDCSLSGKIPKWLSKLTNLEMLSLYNNQLNGAIPDWISSLNFLFHIDISNSSLSGEIPSALVEMPMLKSDNVPPKVFELPICTGYALQYRINSAFPKVLNLGINNFTGIIPNEIGQLKALQLLNLSSNRLSGEIPESIYKLTNLQVLDLSSNNLTGTIPDGLNKLHFLSAFNISNNDLEGPVPNAGQLSTFPSTSFDGNPKLCGPMLARHCGLAQTPFVSTKQNADKEKSSLLQFLAELSHDGGIAMSWQNGTNCCVWEGITCNEDGAVIEVRLTSKGLEGQIAPSLGELTSLSRLNLSYNSLSGGLPAELMSSGSIVVLDVSFNRLNGDLQELNPSVSDRPLQVLNISSNRFTGEFPSITWEKMRNLVAINASNNSFTGHIPSSFCSNSPSFAVLDLGYNQFSGNVPPGIGKCSALRLLKANANNIRGPLPGDLFNATSLEYLSFANNGLQGTIDDALIVKLINLVFVDLGWNRFSGKIPNSIGQLKRLKELHICSNNLSGELPSSLGDCTKLVTINLRGNKLTGELAKVNYSNLPNLKTLDFASNHFTGKIPESIYSCSNLTWLRLSSNRLHGQLTKNIQNLNSITFLSLSYNNFTNIKNTLHILKSLRNLNVLLIGGNFMHEAMPQDETIDGFENIFGISIHDCALTGKIPSWLSKLGNLAVLDLSNNKLRGPIPTWINSLNFLKYADISNNSLSGEIPQALMEIPMLKSDKIADNSDPRAFPFPVYAGACLCFQYRTVTAFPKMLNLGNNKFTGAIPMEIGELKALVSLNLSFNNLNREIPQSISNLKNLMVLDLSYNHLTGAIPPALVNLHFLSEFNVSHNDLKGSVPIGGQFSTFPSSSFAGNPELCSPILLHRCNVAEVDLSSPNSTKEYINKVIFVIAFCVFFGVGVLYDQIVLSRYFRLN
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.135693 | 0.0 | 0.000000 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0156400 | SBH | 0.385070 | 0.098806 | 1.175082 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06200 | SBH | 1.233311 | 0.576956 | 0.430655 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0156200 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004230 | SBH | 0.0 | 0.950084 | 2.805610 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004510 | SBH | 0.087645 | 0.000000 | 0.391188 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004250 | SBH | 0.223182 | 0.0 | 1.172257 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004250 | SBH | 0.061636 | 0.022630 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004200 | SBH | 0.379013 | 3.746506 | 6.403961 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0051300 | SBH | 0.3972695 | 1.3156905 | 1.0603295 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004280 | SBH | 0.048594 | 0.017924 | 0.096358 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0054700 | SBH | 1.783247 | 2.5954695 | 5.951546 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004390 | SBH | 0.111663 | 0.049798 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004040 | SBH | 0.085514 | 0.000000 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004240 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004210 | SBH | 0.087713 | 0.227309 | 0.100002 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004250 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004310 | SBH | 0.850914 | 0.737580 | 0.524094 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004250 | SBH | 0.144083 | 0.0 | 1.478623 |
