Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_02g0009660 | OGI:02021150 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:7202945-7224666 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK70, OsRLCK70, RLK5, OsRLK5 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MVGAIAGSRPGAEVGNMEAMLLHRFIPQISSIVAANASTDELQVDQRRTWWSSIDDNLCCRCGREDVISAELLMIKNLQCRLEETMLGIIRHDNIVVLRGSIQSDDDDGTVQLVEAFGYTAPEYATAQINEKVDVYSFGVVLLELVTGRLGNEPGVNNGHLAMWAQRGYGRHLSKDVVDKEIVPHMARYLKEMKAMFKLGVECTSMDPRERPSMLMVLRRLTKLGSLDDGGELQTLLTIQRDWGSPAAFSSWKVGNSNLSVNNLTGEFPTALYSCSALQFLDLSNNEFTGRLPEHVDKLSLGMQHLNLSSNSFIGDVPPAIGRFSKLKSLVLDTNSFNGSYPGAAIGGLVELETLTLACNTFKPDPIPNEFRRLTKLTYLWLSWMNLIGNIPDALSALTELEILDISMNKMEGKIPKWIWKLQKLEYLYLFANNFSGEIGPDIAANLRLLYLYYNNLTGSIPKGVGVLPNLTDIWLFNNKLSGPLPSELGKYSELGNFQVSNNNLSGELPDTLCFNRKLYELVVFNNSFSGVFPVNLGNCDTINKIMASNNHFVGDFPKKTWSFAMLTIVIIGGNNFIGTLPSKISSNISWIDIENNRFSGAIPTSATGLKRFLAKNNLFSGTLPSDMSKLANLTRLDLYGNQQSGSISTFYRSNGDMLGEKINIPPGPLCAKRPDLCKNCWCCEVSDGQCYQSLEACQVTSLSFQSFQIANPIPASICSLKNLTYIDLSYNNLVGDFPTVLYNCSALEFLDLSNNQLSGRLPGDIDKLSLGMLHLNLSSNAFVGNVPSAIGKFSKLKSLVLDTNNFNGNYPGAAIGGLVELETLTLANNPFEPGPVPKEFGNLTKLKLLWLSSMNELDLSMNKLSGSIPDDIANLKQLRLLFLYYNNLTGPIPAGVGMMPNLTDIRLFNNKLSGPLPTELGKHSELGNFEVSNNNLSGELPDTLCFNKKLYDIVVFNNSFSGVFPANLRDCETVNNIMAYNNHFVGDFPEKIWSFELLTNVMIYNNNFTGTLPSEISFNISRIEMENNRFSGALPSAAVGLKSFRAENNQFSGELPTDMSRLANLTELNLAGNHVAITGWLLFLRRKKGPQDVTSWKMTQFRTIDFTEHDIISNISECNVIGKGGSGKVYRIHLAGDVKAGRHGGSCTPTTVAVKRIGNAGKLDTNLDKEFESEVRTLGDLRHSNIVDLLCCISSQETKLLVYEHMENGSLDQWLHRYKRAGKSGPLDWPTRVSVKVDVYSFGVVLLELATGRGPQDGGTESGSCLAKWASKRYINGGPVADLVDGEIQDPSYLDDMVAVFELGVVCTGEEPASRPPMSDVLHRLLQFDHSGTHSDDLVVKGVFDIDDSLDCIV |
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| Function | Leucine-rich repeat receptor protein kinase MSP1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8RZV7] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_02g0009660 | OsKeNa_02g0009660.01 | Chr02 | 7202945 | 7224666 | - | NAM | ||
| CDS seq | atggttggtgccatcgccggcagccggccaggtgccgaggtcgggaacatggaagcaatgctgctccatcgatttattcctcagatcagcagcatcgtcgcagcaaatgcgtcgacagatgagctgcaggttgatcagaggaggacgtggtggtcgtcgatcgacgacaatctttgttgtcgctgcggccgcgaagacgtgatatcggctgaactgctgatgatcaagaacctgcagtgccggttggaggagaccatgctcggcatcatccgtcacgacaacatcgtcgtcctccggggttccatccagagtgacgacgacgacggaacggtccagctcgtcgaggcctttgggtatactgctccagagtatgcaaccgcgcagataaatgagaaggtggacgtgtacagctttggtgtggtgcttctggagctcgtcacgggaagattgggtaacgagccaggcgtaaataatgggcatttggctatgtgggcgcagagagggtacggtcgacatctcagcaaggacgtcgttgataaggagatcgtccctcatatggcacgatacttgaaggagatgaaggccatgttcaagctcggtgtggagtgcacctccatggacccacgggagaggccgtccatgctgatggttcttcgtcgcctcaccaagcttggttccctcgatgacggcggcgagctccaaacacttctaaccatccagagagattggggtagccctgctgcattcagctcgtggaaggtgggaaactccaacctctctgtcaacaatctcacgggtgagttccctacggcgctctacagttgctcagctttgcagttccttgacctatccaacaatgaattcactggcagacttccggaacatgttgacaagttgtccttggggatgcagcacctcaacctgtcaagcaattctttcattggcgacgtgccaccagctattggtcggttttccaagctcaagtcattggtgcttgacactaacagcttcaacgggagctacccaggtgctgccattggaggccttgtggagcttgagacgctgacattggcatgcaatacgttcaagccggatccgattccaaatgagtttagaaggctaacaaagctgacttatctgtggctatcctggatgaacctgattggtaacattcctgatgctctgtcagcattgacggagctcgagatattggacatatcaatgaataagatggaaggaaaaatccCaaagtggatatggaagcttcagaagctcgagtatttgtacctctttgcaaacaattttagtggcgagattggccctgacatcgccgcaaacttgaggttgctatacttgtactacaacaacctcactggatccatcccaaaaggtgtcggtgtgcttccaaaccttaccgacatttggctcttcaataataagctctccgggcccttaccctctgagctTgggaaatattcagaattgggaaattttcaggtgtccaacaacaacctgtccggtgagctgcctgatacgctctgcttcaacagaaagctctatgagcttgtggtgttcaacaatagcttctctggagtgtttccagtgaacctcgggaactgcgacaccatcaacaagatcatggcatccaacaaccactttgtaggggactttccaaagaagacatggtcgtttgcaatgcttaccatagttataattggagggaacaacttcatcggtactctgccaagtaagatatcatccaacatctcgtggattgatatagagaacaataggttctctggtgcaattccaacatctgcaactggactcaaaagatttctagcgaaaaataatttgttctcgggcacgctaccttcagacatgtccaagctcgccaaccttaccaggctagatctttatgggaaccaacaatctggatcgatttcaacattttaccggagcaatggtgacatgttgggagagaagatcaacataccacctgggccgctatgtgcaaagcggccagacctgtgcaagaactgctggtgttgtgaggtcagcgacgggcaatgctaccagagcctcgaggcctgccaggttacatccctctccttccagagcttccaaatagccaatccaatcccagcttctatctgcagccttaagaacctaacctacatagacctctcttacaacaacctcgtcggtgatttccccacggtgctctacaattgctcagctttggagttccttgacctatccaacaatcaattatccggcagacttcctggtgacatcgacaagctgtcgttggggatgttgcacctcaacctgtcgagcaatgcttttgttggcaatgtgccatcggctattggaaagttctcgaagctcaagtcgctagtgcttgacactaacaacttcaatgggaactacccgggtgccgccattggaggccttgtggagcttgagactctgacgttagcgaacaacccgtttgagccgggtccagtcccaaaagagtttggcaatctcacaaagctgaagttgttgtggttgtcatcaatgaacgagcttgatctgtccatgaacaagctctccggatcaataccagacgacattgcaaacttgaagcagttgagattactattcttgtactacaacaacctcactggacccatcccggctggtgttggtatgatgccgaacctcactgatatccggcttttcaataacaagctctccgggcccctacccacggagcttgggaagcattcggaattggggaatttcgaggtttccaacaacaacctctctggtgagctaccggatacgctctgcttcaataagaagctctatgacatcgtggtgttcaacaatagcttctccggtgtgtttccggcgaacctcagggattgcgaaaccgtcaacaacatcatggcatacaacaaccactttgttggggactttcccgagaagatatggtcattcgagttgctcaccaatgtcatgatttacaacaacaacttcaccggcactctacccagtgagatatcatttaacatctcgaggattgagatggagaacaatcgcttctccggtgccctcccgtcggccgccgtcggtctgaagagtttcagggcggagaacaaccagttctccggtgaactgccaactgacatgtctaggctcgccaacctcaccgagttgaacctcgccggcaaccatgtcgccatcACCggatggcttctcttcctcaggcgcaagaaaggtccacaagatgttacgtcgtggaagatgacacaattcagaacgatagatttcaccgagcatgacattatcagcaatatcagcgagtgcaatgtgattggtaagggtggctcagggaaagtgtaccgtatccacctcgccggtgacgtcaaggcaggacgacatggcggtagctgtacgccaacgacggtggccgtgaagaggattggcaatgccgggaaactggacacgaacctcgacaaggagtttgagtcggaggtgaggacgttaggtgatctccgtcatagcaacatcgtcgaccttctctgctgcatctctagccaggagacgaagctgctcgtctacgagcacatggagaacgggagcctcgatcaatggctgcaccgctacaagcgagccggcaaaagcgggccgttggactggccgacgagggtaagcgtcaaggtggacgtgtacagcttcggtgtggtgctgctagagctggctacaggcagggggccgcaagacggcggcacggagtcgggcagctgcttggccaaatgggcATCgaagcggtacatcaatggtggcccggtcgccgacttggtcgacggcgagattcaggatccttcctacctggatgacatggtggccgtgttcgagctcggcgtggtttgcaccggcgaggagccggcgtcgaggccgccgatgagtgatgttctccaccggctcttgcagtttgatcatagcggaacacatagcgatgacttagtagttaaaggtgtgtttgacatcgatgattctttggattgtattgtttaa
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| Protein seq | MVGAIAGSRPGAEVGNMEAMLLHRFIPQISSIVAANASTDELQVDQRRTWWSSIDDNLCCRCGREDVISAELLMIKNLQCRLEETMLGIIRHDNIVVLRGSIQSDDDDGTVQLVEAFGYTAPEYATAQINEKVDVYSFGVVLLELVTGRLGNEPGVNNGHLAMWAQRGYGRHLSKDVVDKEIVPHMARYLKEMKAMFKLGVECTSMDPRERPSMLMVLRRLTKLGSLDDGGELQTLLTIQRDWGSPAAFSSWKVGNSNLSVNNLTGEFPTALYSCSALQFLDLSNNEFTGRLPEHVDKLSLGMQHLNLSSNSFIGDVPPAIGRFSKLKSLVLDTNSFNGSYPGAAIGGLVELETLTLACNTFKPDPIPNEFRRLTKLTYLWLSWMNLIGNIPDALSALTELEILDISMNKMEGKIPKWIWKLQKLEYLYLFANNFSGEIGPDIAANLRLLYLYYNNLTGSIPKGVGVLPNLTDIWLFNNKLSGPLPSELGKYSELGNFQVSNNNLSGELPDTLCFNRKLYELVVFNNSFSGVFPVNLGNCDTINKIMASNNHFVGDFPKKTWSFAMLTIVIIGGNNFIGTLPSKISSNISWIDIENNRFSGAIPTSATGLKRFLAKNNLFSGTLPSDMSKLANLTRLDLYGNQQSGSISTFYRSNGDMLGEKINIPPGPLCAKRPDLCKNCWCCEVSDGQCYQSLEACQVTSLSFQSFQIANPIPASICSLKNLTYIDLSYNNLVGDFPTVLYNCSALEFLDLSNNQLSGRLPGDIDKLSLGMLHLNLSSNAFVGNVPSAIGKFSKLKSLVLDTNNFNGNYPGAAIGGLVELETLTLANNPFEPGPVPKEFGNLTKLKLLWLSSMNELDLSMNKLSGSIPDDIANLKQLRLLFLYYNNLTGPIPAGVGMMPNLTDIRLFNNKLSGPLPTELGKHSELGNFEVSNNNLSGELPDTLCFNKKLYDIVVFNNSFSGVFPANLRDCETVNNIMAYNNHFVGDFPEKIWSFELLTNVMIYNNNFTGTLPSEISFNISRIEMENNRFSGALPSAAVGLKSFRAENNQFSGELPTDMSRLANLTELNLAGNHVAITGWLLFLRRKKGPQDVTSWKMTQFRTIDFTEHDIISNISECNVIGKGGSGKVYRIHLAGDVKAGRHGGSCTPTTVAVKRIGNAGKLDTNLDKEFESEVRTLGDLRHSNIVDLLCCISSQETKLLVYEHMENGSLDQWLHRYKRAGKSGPLDWPTRVSVKVDVYSFGVVLLELATGRGPQDGGTESGSCLAKWASKRYINGGPVADLVDGEIQDPSYLDDMVAVFELGVVCTGEEPASRPPMSDVLHRLLQFDHSGTHSDDLVVKGVFDIDDSLDCIV
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
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Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g13420 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.125496 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0227900 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0009580 | RBH | 0.0 | 1.875847 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_06g0019360 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.634953 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0009530 | RBH | 0.095448 | 1.284628 | 0.192024 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0009370 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
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| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0009470 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
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| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0009770 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0009460 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G009670 | RBH | 0.078277 | 0.0 | 0.000000 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0009470 | RBH | 0.000000 | 1.650543 | 0.0 |
