Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_01g0023950 | OGI:01013090 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:23902747-23922932 | ||||||||
| Gene Symbol | CYP72A31, CYP72A32, OsCYP72A32, CYP72A33, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Cytochrome P450 72A15 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LUC5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_01g0023950 | OsKeNa_01g0023950.01 | Chr01 | 23902815 | 23922932 | - | NAM | ||
| CDS seq | atgtgggctccggcctcatcgccaacaatcctcgcggcgttcggtctcgtcggcctcgtcctcgcgtggcaggccggcctccagctccaccgcctgtggtggcggccgcggcggctggagaaggcgctgcgggcgcggggcctccgcggctcgcgctaccgcttcctcaccggcgacctcgcggaggagagccggcggaggaaggaggcctgggcgaggccgctgccgctgcggtgccacgacatcgcgccgcgcgtcgagccgttcctccacggcgccgtcggcgtcggggcggcgcacggcaagccgcgcatcacctggttcggcccgacgccggaggtgcacgtcgccgatcccgagctggccagggtcgtcctgtccaacaagttcggccacttcgagaaggtcagtttcccggagctatcgaagctgatcccccaaggcctgtccgcccacgagggcgagaagtgggccaagcacaggaggatcctcaacccggtggactgctggccggagttcaagagcctcactggagatgtcatctcgcgcaccgcgttcggaagcagctatcttgaaggaagaaggatcttcgagctgcagggcgagctatttgagcgtgtcatcaaatccatccagaagatgttcatcccgggttacatgtatttgcctattgaaaacaaccggaagatgcatcaaatgaataaagagatcgaatctattctgaggggtatgattgggaaaagaatgcaagctatgaaagaaggtgaaagcacaaaagatgatttacttggtatattgcttgagtcaaacacgagacacatggaagttaatggtcaatcaaaccaaggcttgacgatcaaggatatcatggaggaatgcaagctattctactttgcaggagcggatacaacatcagtgcttctcacatggaccatgctgctattaagcatgcaccccgagtggcaggatcgtgcaagggaagagatcctaggaatatgtgggaagaacaaaccagactacgatgacctaagccgcctcaaaattgtgacaatgatcctctacgaggttcttaggttgtacccaccgttcatcgagcttactcgaaaaacatacaaggagatggagataggaggcatcacttaccctgctggtgtcatcattaacctccccgtgatgttcatccaccatgatccagaaatctggggaagtgatgtgcatgagttcaaaccagagaggttctccgaggggatctctaaggcgtctaaggatctaggtgcattccttccattcggttggggaccgcgaatctgcatcggccaaaacttcgcattgcttgaggccaagatggcgttgtgcctgattcttcaatgcttggagtttgagcttgcgacatcggtggctgttgatgtgggctccggcctcatcgccaacaatcctcgtggcgttcggtctcctcttcggcctcgtcctcgcgtggcaggccggcctccagctccaccgcctgtggtggcggccgcggcggctggagaaggcgctgcgggcgcgggcctccgcggctcgcgctaccgcttcctcaccggcgacctcgcggaggagagccggcggaggaaggaggcctgggcgaggccgctgccgctgcggtgccacgacatcgcgccccgcatcgagccgttcctccacgacgccgtcgtcagggatgagcagcactacggcaagctgtgcatcacctggctcggcccgacgccggaggtgcacgtcaccgatcccgagctggccaaggtcgtcatgtccaacaagttcggccacttcgagaagatcagtttcccggagctatcgaagctgatcccccaaggcctgtccgcccacgagggcgagaagtgggccaagcacaggaggatcctcaacccggctttccagctcgagaagctcaagctcatgctgccagcgttttctgcatgctgtgaggaactgatcagcaggtggatagggtccattggctctgatggctcgtacgaggtggattgctggccggagatgaagagcctcaccggagatgtcatctcgcgcaccgcgttcggaagcagctatcttgaaggaagaagggtcttcgagctgcaggccgagcaatttgagcgcgcaatgaaatgcatgcagaagatttccatcccgggttacatgtatttgcctaccgagaacaacaggaagatgcatcaaataaataaagagatcgaatcgattctaagaggtataattgggaaaagaatgcaagctatgaaagaaggagaaagtacaaaagatgatttacttggcatattgcttgagtcaaacacaaagcacacggaagagaatggtcaatcaagccaggggttgacaatcaaggatatcatggaggagtgcaagctgttctactttgcaggagcggagacaacatcagtgcttctcacatggaccatgctgctattaagcatgcacctggagtggcaggaccgtgcaagggaagagatccttggattatttaggacgaacaaacctgactacgatggcttgagccacctcaaaattgtgacgatgatcctctacgaggttcttcggttgtacccaccgttcatcgagcttggtcggaaaacatacaaagagatggagataggaggagtcacttacccagctgatgtcagcattaaaatccccgtgttgttcatccaccatgattcggacatctggggaagtgatgtgcatgagttcaagcctgagaggttctctgaggggatctctaaggcgtctaaagatccgggtgcattcctcccatttggttgggggccacgaatctgcatcggccaaaacttcgcgttgcttgaggccaagatggcgttgtgcctgattcttcaacgcttggagtttgagcttgcgtcctcgtacactcatgcgccacataccatggtaactctgcatcccatgcatggtgcacagattaaagttagagctatatga
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| Protein seq | MWAPASSPTILAAFGLVGLVLAWQAGLQLHRLWWRPRRLEKALRARGLRGSRYRFLTGDLAEESRRRKEAWARPLPLRCHDIAPRVEPFLHGAVGVGAAHGKPRITWFGPTPEVHVADPELARVVLSNKFGHFEKVSFPELSKLIPQGLSAHEGEKWAKHRRILNPVDCWPEFKSLTGDVISRTAFGSSYLEGRRIFELQGELFERVIKSIQKMFIPGYMYLPIENNRKMHQMNKEIESILRGMIGKRMQAMKEGESTKDDLLGILLESNTRHMEVNGQSNQGLTIKDIMEECKLFYFAGADTTSVLLTWTMLLLSMHPEWQDRAREEILGICGKNKPDYDDLSRLKIVTMILYEVLRLYPPFIELTRKTYKEMEIGGITYPAGVIINLPVMFIHHDPEIWGSDVHEFKPERFSEGISKASKDLGAFLPFGWGPRICIGQNFALLEAKMALCLILQCLEFELATSVAVDVGSGLIANNPRGVRSPLRPRPRVAGRPPAPPPVVAAAAAGEGAAGAGLRGSRYRFLTGDLAEESRRRKEAWARPLPLRCHDIAPRIEPFLHDAVVRDEQHYGKLCITWLGPTPEVHVTDPELAKVVMSNKFGHFEKISFPELSKLIPQGLSAHEGEKWAKHRRILNPAFQLEKLKLMLPAFSACCEELISRWIGSIGSDGSYEVDCWPEMKSLTGDVISRTAFGSSYLEGRRVFELQAEQFERAMKCMQKISIPGYMYLPTENNRKMHQINKEIESILRGIIGKRMQAMKEGESTKDDLLGILLESNTKHTEENGQSSQGLTIKDIMEECKLFYFAGAETTSVLLTWTMLLLSMHLEWQDRAREEILGLFRTNKPDYDGLSHLKIVTMILYEVLRLYPPFIELGRKTYKEMEIGGVTYPADVSIKIPVLFIHHDSDIWGSDVHEFKPERFSEGISKASKDPGAFLPFGWGPRICIGQNFALLEAKMALCLILQRLEFELASSYTHAPHTMVTLHPMHGAQIKVRAI
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_01g0023950 | OsKeNa_01g0023950.02 | Chr01 | 23902747 | 23905938 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | atgtcagcattaaaatccccgtgttgttcatccaccatgattcggacatctggggaagtgatgtgcatgagttcaagcctgagaggttctctgaggggatctctaaggcgtctaaagatccgggtgcattcctcccatttggttgggggccacgaatctgcatcggccaaaacttcgcgttgcttgaggccaagatggcgttgt
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| Protein seq | MSALKSPCCSSTMIRTSGEVMCMSSSLRGSLRGSLRRLKIRVHSSHLVGGHESASAKTSRCLRPRWRC |
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.255419 | 1.194231 | 4.003400 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0602200 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g41810 | RBH | 4.397040 | 3.310292 | 0.811658 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0602200 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0024370 | RBH | 1.084527 | 0.0 | 0.366171 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0025650 | SBH | 0.089938 | 0.415210 | 0.324732 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0024250 | RBH | 3.246173 | 0.0 | 1.355323 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0023600 | SBH | 0.058752 | 0.186390 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0023370 | SBH | 0.0 | 3.616535 | 8.243108 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0396100 | RBH | 9.6058605 | 11.421525 | 10.038611 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0023290 | RBH | 0.0 | 1.474855 | 0.417657 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0385300 | SBH | 5.83854 | 4.3827855 | 1.476269 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0023310 | SBH | 0.476392 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0023280 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0023520 | RBH | 0.0 | 3.874355 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0023540 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0023450 | SBH | 0.515966 | 0.315297 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G023640 | RBH | 0.252606 | 0.0 | 2.405939 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0023350 | SBH | 1.032590 | 0.0 | 0.686715 |
