Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsZS97_01G0385300 | OGI:01013090 | 16/16 | Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | Chr01:25095806-25136399 | ||||||||
| Gene Symbol | CYP72A31, CYP72A32, OsCYP72A32, CYP72A33, CYP72A17, OsCYP72A17, CYP72A19, OsCYP72A19, CYP72A1, OsCYP72A1, OsLRP, OsLRR1, LRR1 | ||||||||||
| DNA seq | 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|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsZS97_01G0385300 | OsZS97_01T0385300.2 | Chr01 | 25095806 | 25136399 | - | makerRMon | ||
| CDS seq | ATGGTTCTTGGAGGGGGGTGGTTGTCGATGTGGGCTCCGGCCTCATCGCCAACAATCCTCGCGGCGTTCGGTCTCGTCGGCCTCGTCCTCGCGTGGCAGGCCGGCCTCCAGCTCCACCGCCTGTGGTGGCGGCCGCGGCGGCTGGAGAAGGCGCTGCGGGCGCGGGGCCTCCGCGGCTCGCGCTACCGCTTCCTCACCGGCGACCTCGCGGAGGAGAGCCGGCGGAGGAAGGAGGCCTGGGCGAGGCCGCTGCCGCTGCGGTGCCACGACATCGCGCCGCGCGTCGAGCCGTTCCTCCACGGCGCCGTCGGCGTCGGGGCGGCGCACGGCAAGCCGCGCATCACCTGGTTCGGCCCGACGCCGGAGGTGCACGTCGCCGATCCCGAGCTGGCCAGGGTCGTCCTGTCCAACAAGTTCGGCCACTTCGAGAAGGTCAGTTTCCCGGAGCTATCGAAGCTGATCCCCCAAGGCCTGTCCGCCCACGAGGGCGAGAAGTGGGCCAAGCACAGGAGGATCCTCAACCCGGTTTTCCAGCTCGAGAAGCTCAAGCTCATGCTGCCGGTGTTTTCAGCATGCTGCGAGGAGCTGATCAGCAGGTGGATGGGGTCCATTGGTTCGGATGGCTCGTACGAGGTGGACTGCTGGCCGGAGTTCAAGAGCCTCACTGGAGATGTCATCTCGCGCACCGCGTTCGGAAGCAGCTATCTTGAAGGAAGAAGGATCTTCGAGCTGCAGGGCGAGCTATTTGAGCGTGTCATCAAATCCATCCAGAAGATGTTCATCCCGGGTTACATGTATTTGCCTATTGAAAACAACCGGAAGATGCATCAAATGAATAAAGAGATCGAATCTATTCTGAGGGGTATGATTGGGAAAAGAATGCAAGCTATGAAAGAAGGTGAAAGCACAAAAGATGATTTACTTGGTATATTGCTTGAGTCAAACACGAGACACATGGAAGTTAATGGTCAATCAAACCAAGGCTTGACGATCAAGGATATCATGGAGGAATGCAAGCTATTCTACTTTGCAGGAGCGGATACAACATCAGTGCTTCTCACATGGACCATGCTGCTATTAAGCATGCACCCCGAGTGGCAGGATCGTGCAAGGGAAGAGATCCTAGGAATATGTGGGAAGAACAAACCAGACTACGATGACCTAAGCCGCCTCAAAATTGTGACAATGATCCTCTACGAGGTTCTTAGGTTGTACCCACCGTTCATCGAGCTTACTCGAAAAACATACAAGGAGATGGAGATAGGAGGCATCACTTACCCTGCTGGTGTCATCATTAACCTCCCCGTGATGTTCATCCACCATGATCCAGAAATCTGGGGAAGTGATGTGCATGAGTTCAAACCAGAGAGGTTCTCCGAGGGGATCTCTAAGGCGTCTAAGGATCTAGGTGCATTCCTTCCATTCGGTTGGGGACCGCGAATCTGCATCGGCCAAAACTTCGCATTGCTTGAGGCCAAGATGGCGTTGTGCCTGATTCTTCAACGCTTGGAGTTTGAGCTTGCGACATCGTACACTCATGCGCCACATACTATAATAAGTCTGCATCCGATGCACGTAAGTAATGGTTCTTGGAGGGTGGCTGTTGATGTGGGCTCCGGCCTCATCGCCAACAATCCTCGTGGCGTTCGGTCTCCTCTTCGGCCTCGTCCTCGCGTGGCAGGCCGGCCTCCAGCTCCACCGCCTGTGGTGGCGGCCGCGGCGGCTGGAGAAGGCGCTGCGTGCGAGAGCCGGCGGAGGAAGGAGGCCTGGGCGAGGCCGCTGCCGCTGCGGTGCCACGACATCGCGCCGCGCATCGAGCCGTTCCTCCACGACGCCGTCGTCAGGCCGGAGCAGCACTACGGCAAGCCGTGCATCACCTGGCTCGGCCCGACGCCGGAGGTGCACGTCACCGATCCCGAGCTGGCCAAGGTCGTCATGTCCAACAAGTTCGGCCACTTCGAGAAGATCAGGTTCCAGGCGCTATCGAAGCTGCTGCCCCAGGGCCTCTCCTACCACGAGGGCGAGAAGTGGGCCAAGCACAGGAGGATCCTCAACCCGGCTTTCCAGCTCGAGAAGCTCAAGCTCATGCTGCCGGTGTTTTCTGCGTGCTGCGAGGAGCTGATCAGCAGGTGGATGGGGGCCATTGGTTCTGATGGCTCGTACGAGGTGGATTGCTGGCCGGAGATGAAGAGCCTCACCGGAGATGTCATCTCACGCACCGCGTTCGGAAGCAGCTATCTTGAAGGAAGAAGGATCTTCGAGCTGCAGGGCGAGCTATTTGAGCGTGTAATGAAATCCGTCGAGAAGATTTTCATCCCGGGTTACATGTATTTGCCTACTGAGAACAACCGGAAGATGCATCAAATTAATAAAGAGATCGAATCGATTCTAAGGAGTATGATTGGGAAAAGAATGCAAGCTATGAAAGAAGGTGAAAGCACAAAAGATGATTTACTTGGCATATTGCTTGAGTCAAACATGAGACACACGGAAGAGAATAGTCAATCAAGCCAGGGCTTGACAATCAAGGATATCATGGAGGAATGCAAGTTGTTCTACTTTGCAGGAGCGGATACAACATCAGTGCTTCTCACATGGACCATATTGCTATTAAGCATGCACCCCGAGTGGCAGGATCGTGCAAGGAAAGAGATCCTAGGACTATTTGGGAAGAACAAACCTGAGTACGATGGCTTGAGCCACCTCAAAATTGTGACAATGATCCTCTACGAGGTTCTTAGGTTGTACCCACCGTTCATCGAGCTTAAGCGGAGAACATACAAGGAGATGAAGATAGGAGGCGTCACTTACCCTGCTGGTGTCATCATTAATCTTCCCGTGCTGTTTATCCACCATGATCTGGAAATCTGGGGAAGTGACGTGCATGAGTTCAAACCAGAGAGGTTCTCTGAGGGGATCTCTAAGGCGTCTAAGGATCCGGGTGCGTTCCTCCCATTCGGTTGGGGACCGCGAATCTGCATCGGCCAAAACTTCGCGTTGCTTGAGGCCAAGATGGCGTTGTGTCTGATTCTTCAACGCTTGGAGTTTGAGCTTGCGCCAACAGGGTGGTTGATGTGGGCTCCGGCCTCAGCGCCAGTCCTCGTGGTGTTCGGTCTCCTCTTCGGCCTCGCCCTCGTGTGGCAGGCCGGCCGCCTGCTTCACCGGCTGTGGTGGCGGCCGCGGCGGCTGGAGAAGGCGCTGCGCGCGCGGGGCCTCCGCGGCTCGTCCTACCGCTTCCTCACCGGCGACCTCGCGGAGGAGAGCCGGCGGAGGAAGGAGGCCTGGGCGAGGCCGCTGCCGCTGCGGTGCCACGACATCGCGCCGCGCATCAAGCCGTTCCTCCACGACACCCTCGGGGAGCACGGCAAGCAGCGGCAGCCGTGCATCACCTGGTTCGGCCCGACGCCGGAGGTGAACATCACCGATCCCGAGCTGGCCAAGGTCGTCCTGTCCAACAAGTTCGGCCACTTGGAGAGGGTCAGGTTCAAGGAGGTGTCGAAGCTGCTATCCCAAGGCCTCACCTACCACGAGGGCGAGAAGTGGGTCAAGCACAGGAGGATCATCAACCCGGCTTTCCAGCTCGAGAAGCTCAAGCTCATGCTGCCAGCGTTTTCTGCATGCTGCGAGGAACTGATAAGCAGGTGGATAGGGTCCATTGGCTGTGATGGCTCGTACGAGGTGGATTGCTGGCCGGAGCTCAAGAGCCTCACCGGAGATGTCATCTCGCGCACCGCGTTCGGAAGCAGCTATCTTGAAGGAAGAAGGGTCTTCGAGCTGCAGGCCGAGCAATTTGAGCGCGCAATGAAATGCATGCAGAAGATTTCCATCCCGGGTTACATGTCTTTGCCTATTGAGAACAACCGGAAGATGCATCAAATAAATAAAGAGATCGAATCGATTCTAAGAGGTATAATTGGGAAAAAAATGCAAGCTATGAAAGAAGGTGAAAGCACAAAAGATGATTTACTTGGCATATTGCTTGAGTCAAACACAAAGCACATGGAAGAGAATGGTCAATCAAGCCAGGGGTTGACAATGAAGGATATCGTGGAGGAGTGCAAGCTGTTCTACTTTGCAGGAGCGGAGACAACATCAGTGCTTCTCACATGGGCCATGCTGCTATTAAGCATGCACCCGGAGTGGCAGGACCGTGCAAGGGAAGAGATCCTGGGATTATTTAGGAAGAACAAACCTGACTACGAAGGCTTGAGCCGCCTCAAAATTGTGACGATGATCCTCTACGAGGTTCTTCGGTTGTACCCACCGTTCATCGAGATTGGTCGGAAAACATACAAAGAGATGGAGATAGGAGGAGTCACTTACCCAGCTGGTGTCAGCATTAAAATCCCCGTGTTGTTCATCCACCATGATCCGGACACCTGGGGAAGTGATGTGCATGAGTTCAAACCTGAGAGGTTCTCTGAGGGGATCTCTAAGGCGTCTAAGGATCCGGGTGCATTCCTCCCGTTCGGTTGGGGGCCACGAATCTGCATCGGCCAAAACTTCGCGCTGCTTGAGGCCAAGATGGCATTGTGCCTGATTCTTCAACGCTTGGAGTTTGAGCTTGCGCCATCGTATACTCATGCGCCGCATACTATGGTAACTCTGCATCCAATGCACGAGTGCTCCAATGGAACATCTGCCTATAATCCCAATGAAACGGTCATCATCACCAGGTGCATCACCACCGAGAGGTCAGCTCTTCTGGCCTTCAGAGCAGGGTTATCAGACCCTGCAAACCTCCTCCCGTCGTGGGAGGGTGACGACTGCTGTCGATGGAAGGGCGTCGGGTGCAGCAACAGAACCGGCCGCGTCGTCAAGCTCGATCTCCAAGGCGATTGTGGCAATAGTATTATCAGTAAGCAGGTGCTGGGAGGAAGCATAAGTGATTCACTGCTTGATTTACATCACCTGCAGTATCTCGACCTCAGCTGCAACAGGTTCAATGGCCAGCAAGTACCGAAATTCCTGTCATCGCTGCACAGCTTGAGATATCTCGACCTATCACAGTCGAGCTTCAGTGGAAGGATACCACCGCAGCTCGGGTTCAACGATAGTTTCAAGGTAGTCACAAAGGGTCAAGAGCAGTTGTATACAAGAGAAATCGTATATATGGTGAACCTTGACTTATCTTGTAACAATATCATTGGAAAGATCCCTGAAGAGATTGGTACTCTTGTTGCATTGAAGAATCTAAACTTATCTTGGAATGCCTTCAGTGGGAATATTCCTGATAAGATTGGCGCCTTGTTGCAGGTGGAGTCTCTCGACCTATCACACAACGATTTGTCTGGTGAAATTCCTAACAGCTTATCTGCTCTCGCATCTTTGAGTCACTTGAACTTATCCTACAACAATCTTTCAGGAAAGATACCATCTGGGAATCAACTACGAACACTCGATGACCAGCCATCAATCTATATTGGTAACCCGGGTCTTTGCGGTCCTCCTCTGTCCAAGAGTTTGTTCACAAACTGA
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|||||||
| Protein seq | MVLGGGWLSMWAPASSPTILAAFGLVGLVLAWQAGLQLHRLWWRPRRLEKALRARGLRGSRYRFLTGDLAEESRRRKEAWARPLPLRCHDIAPRVEPFLHGAVGVGAAHGKPRITWFGPTPEVHVADPELARVVLSNKFGHFEKVSFPELSKLIPQGLSAHEGEKWAKHRRILNPVFQLEKLKLMLPVFSACCEELISRWMGSIGSDGSYEVDCWPEFKSLTGDVISRTAFGSSYLEGRRIFELQGELFERVIKSIQKMFIPGYMYLPIENNRKMHQMNKEIESILRGMIGKRMQAMKEGESTKDDLLGILLESNTRHMEVNGQSNQGLTIKDIMEECKLFYFAGADTTSVLLTWTMLLLSMHPEWQDRAREEILGICGKNKPDYDDLSRLKIVTMILYEVLRLYPPFIELTRKTYKEMEIGGITYPAGVIINLPVMFIHHDPEIWGSDVHEFKPERFSEGISKASKDLGAFLPFGWGPRICIGQNFALLEAKMALCLILQRLEFELATSYTHAPHTIISLHPMHVSNGSWRVAVDVGSGLIANNPRGVRSPLRPRPRVAGRPPAPPPVVAAAAAGEGAACESRRRKEAWARPLPLRCHDIAPRIEPFLHDAVVRPEQHYGKPCITWLGPTPEVHVTDPELAKVVMSNKFGHFEKIRFQALSKLLPQGLSYHEGEKWAKHRRILNPAFQLEKLKLMLPVFSACCEELISRWMGAIGSDGSYEVDCWPEMKSLTGDVISRTAFGSSYLEGRRIFELQGELFERVMKSVEKIFIPGYMYLPTENNRKMHQINKEIESILRSMIGKRMQAMKEGESTKDDLLGILLESNMRHTEENSQSSQGLTIKDIMEECKLFYFAGADTTSVLLTWTILLLSMHPEWQDRARKEILGLFGKNKPEYDGLSHLKIVTMILYEVLRLYPPFIELKRRTYKEMKIGGVTYPAGVIINLPVLFIHHDLEIWGSDVHEFKPERFSEGISKASKDPGAFLPFGWGPRICIGQNFALLEAKMALCLILQRLEFELAPTGWLMWAPASAPVLVVFGLLFGLALVWQAGRLLHRLWWRPRRLEKALRARGLRGSSYRFLTGDLAEESRRRKEAWARPLPLRCHDIAPRIKPFLHDTLGEHGKQRQPCITWFGPTPEVNITDPELAKVVLSNKFGHLERVRFKEVSKLLSQGLTYHEGEKWVKHRRIINPAFQLEKLKLMLPAFSACCEELISRWIGSIGCDGSYEVDCWPELKSLTGDVISRTAFGSSYLEGRRVFELQAEQFERAMKCMQKISIPGYMSLPIENNRKMHQINKEIESILRGIIGKKMQAMKEGESTKDDLLGILLESNTKHMEENGQSSQGLTMKDIVEECKLFYFAGAETTSVLLTWAMLLLSMHPEWQDRAREEILGLFRKNKPDYEGLSRLKIVTMILYEVLRLYPPFIEIGRKTYKEMEIGGVTYPAGVSIKIPVLFIHHDPDTWGSDVHEFKPERFSEGISKASKDPGAFLPFGWGPRICIGQNFALLEAKMALCLILQRLEFELAPSYTHAPHTMVTLHPMHECSNGTSAYNPNETVIITRCITTERSALLAFRAGLSDPANLLPSWEGDDCCRWKGVGCSNRTGRVVKLDLQGDCGNSIISKQVLGGSISDSLLDLHHLQYLDLSCNRFNGQQVPKFLSSLHSLRYLDLSQSSFSGRIPPQLGFNDSFKVVTKGQEQLYTREIVYMVNLDLSCNNIIGKIPEEIGTLVALKNLNLSWNAFSGNIPDKIGALLQVESLDLSHNDLSGEIPNSLSALASLSHLNLSYNNLSGKIPSGNQLRTLDDQPSIYIGNPGLCGPPLSKSLFTN
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 5.83854 | 4.3827855 | 1.476269 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0628700 | RBH | 3.367444 | 2.029474 | 2.174823 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g43760 | RBH | 1.110929 | 2.376680 | 0.108479 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0627600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0024360 | RBH | 0.569233 | 0.0 | 0.714197 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0025620 | RBH | 1.560648 | 6.911301 | 5.147695 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0025990 | RBH | 3.066462 | 10.867725 | 1.865559 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0025300 | RBH | 0.000000 | 0.027641 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0025030 | RBH | 5.137291 | 0.0 | 0.000000 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0396200 | SBH | 5.855111 | 0.394289 | 0.027785 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0023300 | RBH | 0.546497 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0410000 | RBH | 4.3267405 | 48.070711 | 0.2372585 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0023320 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0023260 | SBH | 0.085755 | 1.744840 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0023520 | RBH | 0.0 | 3.874355 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0025240 | RBH | 0.268269 | 0.396007 | 0.489102 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0025110 | RBH | 0.629048 | 6.607557 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G025340 | RBH | 0.0 | 2.587313 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0023350 | RBH | 1.032590 | 0.0 | 0.686715 |
