Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKYG_06g0017860 OGI:06008910 | 16/16 KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr06:20337168-20343853
Gene Symbol OsFbox297, Os_F0442, OsFbox328, Os_F0254, -
DNA seq

ATGGCTGTCGTCACCGGCGCCAAAGAGGAGGGAGAGTTCGCCGGCGGTGGAATAATAAGTCGACGTCCCTCCGGTGAGCTACCCTCTCTCCCTTCCCCCTCATCCCGAGGTTGAAGATGCTTCCCCTAATCCTGAGGTTGAAGATGATGCCCTGGCAATTGGATCATAATCCAACGGCCAGGTCCAGGTGACTGAAATGTGCCTAGCGAATCCTAACATATTCGTTCTTTGGCCCCGGCGATGAGTAGCAAGTTTATTACTCTCTCCGTTTCAGGTTATAAAACATTTTGACTTTGGTCAAAGACAAACTGTTTCAAGTTTAACTAAGTTAGTTTCATCAAATCAATAATTGAATATATTTTTATAATAAATTTATCTTGGGTTGAAAATGTTACTACCTTTTTCTACAAACTTGATCGAACTTAAAACAATTTGACTTTAACCAAAGTCACCAAAGTCAAAACGTCTTATAACCTAAAACGGAGGGAGGGAGTACATGCCAAGTTGTTGTGAATTCCTTGCGGATAATAAAAGTCATCATCAGTAAATTCTATATATTTTTCATATATATCCAAACATTATTTCTTTTATCAGTTCTACACATACTTATTGTGGTATCAGTGCTTTGATGAGACGGATACCATCCTATGGTCGTGTATCAGAATAATTAGGAAAGCCTAGTGCTAAAAGCTCGAATACCTATCCTAAAATTTCTGGGACCCTGCTTGAAAACTGTCACATCCTGTTTTTTGTTTCAGGATTTATAAATTATTTAATAAATTATTATTAGAATTTATATTAAATGTTCATTAATTTACAAGTGAAGTTAAATGTGGGAAATAAAATTTCCTAAATATAAAGCATGGATGGATTTAATTTTTTATTAAATTCTCCATGGTTAATTATACTCTCTGGAATATTCTCGGATTTTTCGGAGCTCAATTCCTAATTTTAATAATACAAAGAACATTTCAGTAATTACCCACATATTAAATTAATCATTAAATGGTCTGATTATAATTTTTTTAAGTACTTTGAGTGTCCAAGTATTTTTAAGATTTTTCTTGGAATTATTTGAGCATAGGAAGTATTTTTAACAATTCAAAGATCATTTCATTGATTAATTTAATTGGAAAAAGTAATAAAAATCCTCCTCCTCAGCTTGGGCCATTTTTGGCCCATTCCTTCCTTTCCTTCCTCTCTCTTCCGCCGGCCCAACCCGAGCCTTCATCCTCTCTTCTTCTCTCAGCCAAAGTCCGGTTTTGCTCCCTCTTCTAATCAAGCTGAGAAAAGAAAAGCCCGGCAAGAAGTCTACTTTTTCCCCCTCCCGCGCAGCCGAGTCGGCCCAGCGCCGCCCGAGTCGGCTTAAGCCGAGCCGTCCGCCCTTCCTCTCATGGGACACCGACATGTGGGGCCCACATGTCGGGCCCTTCTCCTACCTCCGGCCGGCCGGCCTTGCTAGCCCGAGCCGCCCCTTTTCCCCTCCAAATCCACCCAATCCGGCCACCCCGAGTCCTTTTTTTGAGGGATTTTTATCCTCTCGTTCTCCTCTACCTTTCCCCTCAAGAATCGGAGCTAATCGTTGAGTGTCTTATCCGAATCGAACTCGTTTTTGAGTTTATCTCCAAAATCGAGTTTTTGATTTCCCGGATCGATTTCTTGCGGGAGGAGTCCGATCTCTTCAATCCAAGGCTATAAATAGGACCCCCTAGTCCTCCTCTTTCGTTTGCCCCCTCTCCCGAGCCTTCCCGTGCCTCGTAGTCTCGCCGCCACCGCCGCCTAGTCCGTCGTCGCCGCTGGCCGAGCTGCAGCCGCGCCGCCGCGCCGCCTTCGCCGTCGCCGCCGTTTGCCGTCGCCGCCCGTAGGTGCGCCAAGGGGTGGAGAAGCCCGGCCGCCCATCCCCCTTCGCCGCCGGCCGCCGTAGCCCGCCACCACCGTGCAAGCCGAGCCGCCGCCGTCGCCTCTTCGTCGCCGGCCGTCGTCGTTCGTCGTTTGGCACGAGGGTGAGTATCGTTAGGTTCGTCTCGTCGTCCTCTACGTGTTCATGTCCTCTAAAATCCCGGCCGATCATCCTAGCTCCGGCGAGGTCGCCATCCGAGCCGGCCGCCATTGATGACGTCATCATGACATCATCATCTTCCCCTTTTCCAGTTTTTTCTAATAGATTAAATCTTCGGAAAATCATAACTAAATAACCGTAGATCCGTTTCAGGTGGTTCAAGTTGCTAAATTTTTCTAAAATCAAGATCTACATGATAAAAATATCCACATGTACTGTTTATGCTTGTTTTTGTACTGTTTTGTTGATTTTTGTTCTTTCGCTTTAGTTTCCGACGTTCCAGAGGAGAGCGTTTTCGTTGAGGAAGGTTCGGAAGTGTTTGCGGAAGCCCAAGGCAAGTCACACAGATCCCAAATAACCCTTTGAGCATGTTGAACCCGTTTAAAGCTATTATTTTATTTCAACTATGCATTATTTTTTAATGTCATCGGGTGGTGAACCTTTCCCCGTTAATTAATGGCCGAAGATGATCTTATTTTCCTATGGGTTATAATTTGATTAGCATGAACCTTATATATCGGATTGGTTCAGCTAAATGCTATATGTAAGTTTGCTTAGCTATGCTTAGAAACATTAGCTAACTAAAGGGGTTAATTATAAACTATATTATATTATATTATTATTATGGTTATATTTAATGGTCGCTCACGATGGTTAATCGTGTGATGTTAATTAATTGATAATTAAAATCTGGTTAAGGTGGGTTGTGAGCATATGGTTTTGATGGTTGTGCTCATGACAATTAAGGACCGGTTCGCGAGCTACTGTTGTGAAACATTTACCGTGCCAACCACAAGCCAGCATGGGCAACGGCTTTACCTTTTGTATAGCATGATTCATTGCGGGGTGTCAGACTGTGAAGCGGCGAGAAGTCCGTGGGGGTCGCTGGGGAGTCCATTGCCTCTGGTTTTGAGGGGGAGATTATGATCCAGGAACAGTGCACTGTTTTGAGATTATGATCCAGGAACAGTGCACTGTTTTGAGTTGTGTTGTGCAAAGGGTACTGTCACGATTTCCCCCTTTGCAATGCCGTGGTGGTATTTCGGGGCATGGCAACATGTGTGGAATCGTGTCTTGTGGGTACAGTGGTACACCTCTGGCCAGAGTAAAACTATTCGAATAGCCGTGCCCGCGGTTATGGGCGAGTTGAGCAATGTTTTTCGTGATTAGTTTCACACTGCTCATCAATGTTAGTAATGTGATAATTAATTTGACTCCTGGTTTGGAATGGATAATTCCTGGTTTGGAGGTTTGATCTGTACGACCGGGGTTGGTTGTTCAGGTTTGGTTGGGCCTGAGCAGCATGGGTGTGCTGTTCAGTGTTGATTAAAATTGATGATTAACTACTCTACTGTTTTACTTATCTTAAATCTTTGCTAAATGCTGCTTTTGCAAATGAGCCTATATTATGCCATCCTTTGGAATCCTTGTGCACTTGCATATTTGCTGTGTGGCTTGTTGAGTATGTCATATGCTCATTCTTACAATAATCATCAAACCTCAGTTGAAGATAAAGGATCCAGAAGGAGAAGACGTTTGGCTTATACCCCAGTTGAGCTGCCTGTGGGAGTGGAGCTGAAGCCATCGCTAGACCGTTAATTCCGCTGCTGTTTTCTTTTCTTTGTAAGTATGTAACGTTATTATTAAGATGGATTTGTATATTAAATTGTCAGTTTGTGTACCTCGGCTGATTCCTGGACGAGGATTTTATGCACAAATAAGTTCGAAAATTACTAGTGAATTTCCGGGCGTGACAAAAACCAAGATTTTGTCTCAATTCAGACTGAAAATATTTTACACAGTGAAGAAAAATTGTGCAGAAACCAAACGTAAACTAGATGGATCATGCATTGTTTCAGCACCTTCTAATTAGCTAGTTGTCTTGAACAGTACACTCCTTGATTCTTCTGTATTTCCACTTATTGTTCCAATTCCATGGATAACAGAGGAAAGTAACCTTGTTGCATTCGGCATAGAAATGGGTAACAATTTAATACACCAAAGAAAACTACAAGATCGTGGCCATGGTAAACAAATCGATGAGAATGCAAGACCAGGTGTAAGGCTTGAAGACCTTCCATGGGTATGTTCATCTTAACTTCTTTTCTGTTTGAGTGTTGGGTAGAAATGGGATTTATTTATAATCTCCAAATGTATGTGATGCATTTGCTGCAGGACCTTGTAGTATACAAAATTTTATCTAAATTACCACTGAAAGAGGCTGCAAAAACTAGTGTTTTGTCTACCAAGTGGAGGTGCATCTGGTTGACGTGCCCCAGATTGTGTTTTGATGGTCTTGCGATGTTCAAATGCGAAAGGGGTGAACTGTTCTTACACGCTCGGCAATTCATTGCTCAGGTTAATGCTGTTTTGCAAAAATACCAGGGAGAAGTGGTTGAGGAATTTCATATCAGATTTGATTTTCACAGCATACCAGCTCATTATCTTGATAATTGGGTTATCTTTTCCTTGTCATCTGAGATGAAGAATCTAGCTTTAGATCTGCAAACCAATGATATTGAACGATATCCTGCACGCTACAAATTCCCCTTTGAACTTTTGGACAGTGGAAGCTTGTCCGGTCTACAACATGTGCAGTTCAGTTTTGTATCTATCAAACCACCTTCCAAGTTCAGAGGTTTCCCTAACCTGAGAAAGCTTGATCTGCAACTTCTAGATGCCTCTTCAAAGGATTTTGAAACTATGCTGTCAAATTGCAAACTTCTTGAATGGCTAAGCATGGACAGATGCCGCCTGAATGGTGAACTTAGGGTAGGTAGTCCATTGCCCCGTCTGGTATACCTACAAGTTGTGTACTGCCAAGTAACCAAGATACAATTCCATGCTGTGGAGCTAGCTAATTTTGTATATAAAGGAGACTTTGTGCCCATAGCCCTCAAGCATTCGTTGAAGCTGGAAAATGCAAACATCAGGTTATATA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CDS seq

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Protein seq

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Function Putative F-box/LRR-repeat protein At3g28410 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LSJ3]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_06g0017860 OsKYG_06g0017860.01 Chr06 20337168 20343671 + NAM
CDS seq

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Protein seq

MAVVTGAKEEGEFAGGGIISRRPSVVLNSTLLDSSVFPLIVPIPWITEESNLVAFGIEMGNNLIHQRKLQDRGHGKQIDENARPGVRLEDLPWDLVVYKILSKLPLKEAAKTSVLSTKWRCIWLTCPRLCFDGLAMFKCERGELFLHARQFIAQVNAVLQKYQGEVVEEFHIRFDFHSIPAHYLDNWVIFSLSSEMKNLALDLQTNDIERYPARYKFPFELLDSGSLSGLQHVQFSFVSIKPPSKFRGFPNLRKLDLQLLDASSKDFETMLSNCKLLEWLSMDRCRLNGELRVGSPLPRLVYLQVVYCQVTKIQFHAVELANFVYKGDFVPIALKHSLKLENANIRLYSLNDRHAISDLTKLLSDTPWKFSHLRAAPFIEKLEIHFSMNLLILDESHEDHPIRQQLGRCEYNNLKNMRIIGYKGSRDQIEFLLHVVENAPALEVLTLEAAGIEYQEVSFVLNEAI

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_06g0017860 OsKYG_06g0017860.02 Chr06 20343480 20343853 + IsoSeq
CDS seq

GATATAAAGGTTCAAGAGATCAGATCGAATTTCTTCTACATGTTGTGGAGAATGCCCCTGCACTTGAGG

Protein seq

DIKVQEIRSNFFYMLWRMPLHLR

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.594960 0.609840 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0713400 SBH 0.185495 0.734148 2.910670
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g49930 SBH 0.136030 0.476322 0.722779
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0713400 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0004510 SBH 0.623865 0.000000 2.284978
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_06g0004420 SBH 0.182280 1.001310 1.664626
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0004360 SBH 1.099971 4.044620 5.882079
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_06g0004470 SBH 0.052187 0.043166 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0018070 RBH 0.000000 0.000000 8.598825
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_06G0304200 SBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0017570 SBH 0.000000 0.000000 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0279100 SBH 2.3414015 12.884489 12.1672225
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0017940 SBH 0.000000 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0004360 SBH 0.125042 2.563911 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0017610 SBH 0.000000 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_06g0018250 SBH 0.000000 0.000000 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0017750 SBH 0.000000 1.083282 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G004190 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0017880 SBH 1.472878 15.858396 6.579690
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