Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsZS97_06G0279100 | OGI:06008910 | 16/16 | Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | Chr06:20212362-20236932 | ||||||||
Gene Symbol | OsFbox297, Os_F0442, OsFbox328, Os_F0254 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Putative F-box/LRR-repeat protein At3g28410 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LSJ3] |
Transcripts
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CDS seq | ATGGGTAACAATTTAATACACCAAAGAAAACTACAAGATCGTGGCCATGGTAAACAAATCGATGAGAATGCAAGACCAGGTGTAAGGCTTGAAGACCTTCCATGGGACCTTGTAGTATACAAAATTTTATCTAAATTACCACTGAAAGAGGCTGCAAAAACTAGTGTTTTGTCTACCAAGTGGAGGTGCATCTGGTTGACGTGCCCCAGATTGTGTTTTGATGGTCTTGCGATGTTCAAATGCGAAAGGGGTGAACTGTTCTTACACGCTCGGCAATTCATTGCTCAGGTTAATGCTGTTTTGCAAAAATACCAGGGAGAAGTGGTTGAGGAATTTCATATCAGATTTGATTTTCACAGCATACCAGCTCATTATCTTGATAATTGGGTTATCTTTTCCTTGTCATCTAAGATGAAGAATCTAGCTTTAGATCTGCAAACCAATGATATTGAACGATATCCTGCACGCTACAAATTCCCCTTTGAACTTTTGGACAGTGGAAGCTTGTCCGGTCTACAACATGTGCAGTTCAGTTTTGTATCTATCAAACCACCTTCCAAGTTCAGAGGTTTCCCTAACCTGAGAAAGCTTGATCTGCAACTTCTAGATGCCTCTTCAAAGGATTTTGAAACTATGCTGTCAAATTGCAAACTTCTTGAATGGCTAAGCATGGACAGATGCCGCCTGAATGGTGAACTTAGGGTAGGTAGTCCATTGCCCCGTCTGGTATACCTACAAGTTGTGTACTGCCAAGTAACCAAGATACAATTCCATGCTGTGGAGCTAGCTAATTTTGTATATAAAGGAGACTTTGTGCCCATAGCCCTCAAGCATTCGTTGAAGCTGGAAAATGCAAACATCAGGTTATATAGTTTGAATGATCGGCATGCTATCAGTGACCTGGTAAAATGTTTTCCGAACTTGCAAAATCTGAATTTTCACCTTTCTTGGAACGATGCAGAGATTCTGGGATCGTGGAGACGAATTTTTTTGTCTCTTTTCTCAGGGCTGCTCCTTTTATTGAGAAGTTAG
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 2.3414015 | 12.884489 | 12.1672225 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_06g0161300 | SBH | 1.406937 | 1.722493 | 4.482995 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os06g06600 | SBH | 0.938528 | 1.054955 | 0.773807 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os06g0161300 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_06g0004510 | SBH | 0.623865 | 0.000000 | 2.284978 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_06g0004420 | SBH | 0.182280 | 1.001310 | 1.664626 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_06g0004360 | SBH | 1.099971 | 4.044620 | 5.882079 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_06g0004470 | SBH | 0.052187 | 0.043166 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_06g0018070 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 8.598825 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_06G0304500 | RBH | 0 | 1.7421605 | 0 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_06g0017550 | RBH | 0.064675 | 0.000000 | 0.235323 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_06G0053100 | RBH | 0 | 0 | 0.00337 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_06g0018040 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_06g0017840 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_06g0017670 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_06g0018250 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_06g0017820 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_06G017710 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 1.768515 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_06g0017880 | RBH | 1.472878 | 15.858396 | 6.579690 |