Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsARC_11g0018430 | OGI:11067340 | 13/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:21790969-21810242 | ||||||||
| Gene Symbol | XA39, Xa39, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MEFATGAMGTLLPKLAELLKEQYDLQKSVKDGITFLMAEFKSIQAALEKISKVPLDQLDKQTKIWAWDIRELSYDIEDNIDTFMLRVDGLEPAKKQNFTWLINKCRKSLSKIKICHKIANEIKDIKSQVREVMERRDRYKIDDITTNLPTFVDPRILALYESVTKLVGVDKASDDLMKKLSVGDEAPKKLKMVSVVGIGGLGKTTLSKVVFDKLKLQFDCAAFVPVGQNPEIKKVLKDILVELNKDKYMSFDVTTVCERHMINEIREYLDNRRYLIVIDDIWEPSKWTIIRFALIDSNCGSRVITTTRICQVADEVAKGFGDIYKMEPLSDDNSKKLFYNRIFGVTCNGPTSNQSVEATEKILKRCGGIPLSIITIASLLVDKPAREWSVIYDSISFGTGDQNEAVQNMRKILLSSRRSNIHRIALYKSWNPGKDNDLSVGMTHLRSFNAIKCTIGMMPSLLSFQVLRVLELHDCNVTGGLHLKHIGKLRQLRYLGMKDTHVPELPVEIGDLMHLQTLDIWHTGLKELPSTICKLSKLMRLHVAGRPGVRVPMGVGNLSSLQDLELQSGSIKSKEDFAMEVGKLMELRILKICVYYKIDEGTKKALLESLCGLRRLQNLVIKFDRNTTRIWEGWDHWEPPLRLREFHIFHTDLPRLPAWVNSMCVPYLSKLQLDVLAMEARDLDMLSMMPALRTLILRTQQRISWTVGGAGLFPNLRFCRMNIALTFLQGSMPMLVELRLGLWPSEDGAASDVGLGHLPLLNHVMVLLYCEGAMARQVEEVDAVWRRMGNAHPNCPAIAVYRFGELLMKRDDDQDDEEISTKDHVDENGDDENSARTKSRTMIQPKKRMRRRRRLRTNLEPALCTHPVMLSGAMGTLLPKLSKLLKEEYDLQKNVKEGIKFLKAELESMQAALEDVSKVPLDQLAKPIKIWARDIRELSYNIEDNIDTFMLRVDSLEPSKKNKFTWLIDECKKSLSKVKIRHKIANDIKDVKSQVKMVMERRDRYNINNVIARLPTTVDPRILTLYEKATKLIGIEKASNDLIKRLSVEGEASKKLKMVSVVGFGGLGKTTLARVVSDMLKEQFDCVKPNIKNVLKGILIDLNKHKYMEFDSAILSERHLIDELREYLGNRRYLIVVDDIWETSTWKIIKCALIDSNCRSRVIATTRISQVAKEVAEEFGDIYIMEPLSEDNSKKLFYSRMFGVNHKDAADNQSIEVTKNILKKCGGVPLSITTIASLLIDKPMGEWSTVYDSIGFGPTDENEEQGKGLFEVGERYFTELINKNMIQPTEMYGSVYGCRIHDMVLDLIRILAIEGNFVKILNRVHEEHNSSSQSNTVRRLALHKRENLYENDSMAKDLTQLRSFKATYVEAPRSKRH |
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| Function | Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:F7J0N2] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_11g0018430 | OsARC_11g0018430.01 | Chr11 | 21790969 | 21810242 | + | NAM | ||
| CDS seq | ATGGAGTTCGCCACAGGGGCAATGGGCACGCTTCTCCCCAAGCTGGCGGAGCTGCTCAAGGAACAATATGATCTGCAAAAGAGTGTGAAGGATGGGATAACATTCCTCATGGCTGAGTTCAAGAGCATACAAGCTGCCCTTGAGAAGATCTCAAAGGTGCCCTTAGACCAACTAGACAAGCAAACCAAGATCTGGGCATGGGACATTAGGGAGTTGTCCTATGACATTGAGGACAACATTGATACCTTCATGCTACGGGTGGATGGCCTTGAGCCAGCCAAGAAACAAAATTTCACATGGTTAATTAACAAGTGTCGTAAGTCGTTGTCCAAGATAAAGATCTGCCACAAAATAGCCAATGAAATCAAAGATATCAAGAGCCAAGTCAGGGAGGTGATGGAACGACGCGATAGGTACAAGATTGATGATATCACTACTAATCTTCCAACATTTGTGGATCCTCGCATCTTGGCATTATATGAGAGTGTCACCAAACTTGTTGGCGTTGATAAGGCAAGTGATGATCTAATGAAGAAGTTGTCCGTGGGAGATGAGGCGCCCAAGAAGCTCAAGATGGTCTCTGTTGTTGGAATCGGAGGATTGGGCAAGACAACTCTTTCCAAAGTAGTGTTTGACAAGCTTAAACTGCAATTTGATTGTGCTGCTTTTGTTCCTGTCGGTCAAAACCCTGAAATCAAGAAAGTCCTGAAGGACATCCTAGTTGAACTTAACAAGGACAAGTACATGTCATTTGATGTAACAACAGTATGTGAAAGGCATATGATTAATGAGATTCGAGAATACCTGGACAATAGGAGGTACTTGATTGTTATTGATGACATATGGGAGCCATCAAAATGGACCATTATTAGATTTGCTTTGATTGATAGTAATTGTGGAAGTAGAGTAATCACAACAACTCGGATTTGTCAAGTTGCCGATGAAGTTGCTAAAGGATTTGGTGATATTTACAAGATGGAACCACTTTCTGATGATAACTCAAAAAAGTTATTCTACAATAGAATATTTGGTGTTACCTGCAATGGTCCAACTAGTAATCAATCGGTTGAGGCAACCGAAAAGATCTTAAAGAGATGTGGTGGCATACCTCTCTCTATAATTACAATAGCTAGTTTGTTGGTTGATAAACCTGCGAGGGAATGGTCCGTAATTTATGACTCTATTAGTTTTGGGACTGGAGATCAAAATGAGGCAGTTCAAAACATGAGGAAGATATTGCTATCTTCACGGAGGAGTAATATTCATAGGATAGCACTGTACAAGAGTTGGAACCCAGGCAAAGACAATGACCTATCTGTTGGCATGACACACTTGAGGTCATTCAATGCCATTAAATGTACTATTGGCATGATGCCCTCGCTTTTGAGCTTCCAAGTTCTACGTGTGCTAGAGCTACATGACTGTAATGTCACGGGAGGTTTACACCTCAAGCATATCGGGAAGCTACGTCAGTTGAGGTACCTAGGAATGAAAGACACACATGTTCCTGAGCTTCCAGTGGAAATAGGGGATCTCATGCACCTGCAGACACTGGATATCTGGCACACAGGTCTGAAGGAACTGCCGTCGACCATTTGCAAGCTAAGCAAGCTGATGCGGCTGCATGTTGCTGGAAGACCGGGCGTGCGTGTGCCGATGGGTGTTGGGAATCTGAGTTCACTGCAAGACCTAGAGTTGCAGAGTGGGTCCATCAAAAGTAAGGAAGACTTCGCCATGGAGGTGGGCAAGCTGATGGAGCTGAGAATCCTCAAGATTTGCGTATATTACAAGATTGACGAGGGCACGAAGAAGGCTTTGCTAGAGTCTTTGTGTGGCCTACGTAGACTCCAGAATCTGGTGATAAAGTTCGACAGAAATACAACGAGGATCTGGGAAGGCTGGGACCACTGGGAGCCCCCGCTACGGCTTCGTGAGTTCCATATATTCCACACAGACCTGCCTCGGCTGCCAGCGTGGGTGAACTCCATGTGCGTCCCATATCTATCCAAGCTACAACTTGATGTGTTAGCCATGGAAGCACGGGACCTGGACATGCTTTCAATGATGCCAGCACTTCGCACACTCATCCTGAGAACCCAGCAGAGAATTTCGTGGACGGTTGGTGGTGCTGGACTGTTTCCGAATCTGAGATTCTGTAGGATGAACATAGCGCTCACGTTTCTTCAAGGATCCATGCCGATGCTCGTGGAGCTTCGATTAGGGCTATGGCCATCTGAAGATGGTGCCGCCAGTGATGTTGGCTTGGGGCACCTCCCTCTGCTCAATCACGTCATGGTTCTCCTCTACTGCGAGGGTGCGATGGCCAGGCAGGTGGAGGAAGTGGATGCGGTGTGGAGGCGCATGGGGAATGCTCACCCGAACTGTCCTGCCATTGCTGTGTACCGATTTGGAGAGTTACTGATGAAAAGAGATGATGATCAAGACGACGAGGAGATTTCAACTAAGGATCACGTCGACGAAAATGGTGACGATGAGAATTCAGCACGGACCAAGAGCCGGACAATGATCCAGCCAAAGAAGAGGATGAGGAGGAGGAGGAGACTACGAACTAATCTAGAACCGGCTCTCTGCACTCATCCGGTCATGCTTTCAGGGGCAATGGGTACACTTCTTCCCAAGCTGAGTAAGCTGCTCAAGGAAGAGTATGACCTACAAAAGAATGTGAAGGAGGGGATCAAGTTCCTCAAGGCTGAGCTCGAGAGCATGCAAGCTGCCCTTGAGGATGTCTCGAAGGTGCCGCTAGACCAACTTGCCAAACCAATCAAAATATGGGCTAGGGACATTAGGGAGTTGTCCTACAACATTGAGGACAACATCGATACCTTCATGTTGCGTGTCGATAGTCTTGAACCAAGCAAGAAAAACAAATTCACATGGTTAATTGATGAGTGCAAGAAGTCATTGTCCAAGGTAAAGATTCGCCACAAAATAGCCAATGACATCAAAGATGTTAAGAGCCAAGTCAAGATGGTGATGGAACGCCGTGATAGGTACAACATCAATAATGTGATTGCTAGGCTGCCTACTACTGTTGATCCTCGTATCTTGACACTATATGAGAAGGCCACAAAGCTCATTGGCATTGAGAAGGCAAGTAATGATCTAATCAAGAGGTTGTCAGTGGAGGGCGAGGCATCCAAGAAGCTTAAGATGGTCTCTGTTGTTGGATTTGGAGGATTGGGCAAGACAACTCTTGCTAGAGTAGTGTCTGATATGCTGAAAGAGCAATTTGACTGTGTCAAACCTAACATCAAGAATGTTCTCAAGGGCATCTTGATTGATCTTAACAAGCACAAATACATGGAATTCGATTCAGCAATACTAAGTGAAAGGCATCTCATTGATGAGCTCCGAGAATATCTTGGAAATAGAAGGTACTTGATTGTTGTTGATGATATATGGGAGACATCAACATGGAAAATTATTAAATGTGCCCTGATTGATAGCAATTGTAGAAGCAGAGTAATCGCAACAACTCGTATCTCTCAAGTTGCTAAAGAAGTTGCTGAAGAGTTTGGTGATATTTACATCATGGAGCCGCTTTCTGAAGATAACTCGAAGAAGTTATTCTACAGCAGAATGTTTGGTGTTAATCACAAAGATGCAGCTGATAATCAATCAATTGAGGTAACTAAAAATATCTTAAAGAAGTGTGGTGGCGTACCATTATCTATAACTACAATAGCTAGTTTGTTGATTGATAAACCTATGGGCGAGTGGTCCACTGTTTATGACTCTATTGGTTTTGGACCGACAGATGAAAATGAGGAACAAGGGAAGGGGTTATTCGAGGTTGGAGAGAGGTACTTCACTGAGCTTATAAATAAAAACATGATCCAACCAACAGAGATGTATGGCAGCGTGTATGGTTGCCGCATCCACGACATGGTTCTAGATCTCATTCGCATATTGGCAATAGAAGGAAACTTTGTAAAAATATTGAATAGAGTACACGAGGAGCACAACTCGTCTTCACAGAGCAATACTGTCCGCAGATTAGCGTTGCATAAAAGGGAAAACCTATATGAAAATGATAGCATGGCTAAAGACTTAACACAATTGAGGTCATTTAAAGCTACATATGTTGAGGCACCTAGGTCTAAGAGACACTAG
More
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| Protein seq | MEFATGAMGTLLPKLAELLKEQYDLQKSVKDGITFLMAEFKSIQAALEKISKVPLDQLDKQTKIWAWDIRELSYDIEDNIDTFMLRVDGLEPAKKQNFTWLINKCRKSLSKIKICHKIANEIKDIKSQVREVMERRDRYKIDDITTNLPTFVDPRILALYESVTKLVGVDKASDDLMKKLSVGDEAPKKLKMVSVVGIGGLGKTTLSKVVFDKLKLQFDCAAFVPVGQNPEIKKVLKDILVELNKDKYMSFDVTTVCERHMINEIREYLDNRRYLIVIDDIWEPSKWTIIRFALIDSNCGSRVITTTRICQVADEVAKGFGDIYKMEPLSDDNSKKLFYNRIFGVTCNGPTSNQSVEATEKILKRCGGIPLSIITIASLLVDKPAREWSVIYDSISFGTGDQNEAVQNMRKILLSSRRSNIHRIALYKSWNPGKDNDLSVGMTHLRSFNAIKCTIGMMPSLLSFQVLRVLELHDCNVTGGLHLKHIGKLRQLRYLGMKDTHVPELPVEIGDLMHLQTLDIWHTGLKELPSTICKLSKLMRLHVAGRPGVRVPMGVGNLSSLQDLELQSGSIKSKEDFAMEVGKLMELRILKICVYYKIDEGTKKALLESLCGLRRLQNLVIKFDRNTTRIWEGWDHWEPPLRLREFHIFHTDLPRLPAWVNSMCVPYLSKLQLDVLAMEARDLDMLSMMPALRTLILRTQQRISWTVGGAGLFPNLRFCRMNIALTFLQGSMPMLVELRLGLWPSEDGAASDVGLGHLPLLNHVMVLLYCEGAMARQVEEVDAVWRRMGNAHPNCPAIAVYRFGELLMKRDDDQDDEEISTKDHVDENGDDENSARTKSRTMIQPKKRMRRRRRLRTNLEPALCTHPVMLSGAMGTLLPKLSKLLKEEYDLQKNVKEGIKFLKAELESMQAALEDVSKVPLDQLAKPIKIWARDIRELSYNIEDNIDTFMLRVDSLEPSKKNKFTWLIDECKKSLSKVKIRHKIANDIKDVKSQVKMVMERRDRYNINNVIARLPTTVDPRILTLYEKATKLIGIEKASNDLIKRLSVEGEASKKLKMVSVVGFGGLGKTTLARVVSDMLKEQFDCVKPNIKNVLKGILIDLNKHKYMEFDSAILSERHLIDELREYLGNRRYLIVVDDIWETSTWKIIKCALIDSNCRSRVIATTRISQVAKEVAEEFGDIYIMEPLSEDNSKKLFYSRMFGVNHKDAADNQSIEVTKNILKKCGGVPLSITTIASLLIDKPMGEWSTVYDSIGFGPTDENEEQGKGLFEVGERYFTELINKNMIQPTEMYGSVYGCRIHDMVLDLIRILAIEGNFVKILNRVHEEHNSSSQSNTVRRLALHKRENLYENDSMAKDLTQLRSFKATYVEAPRSKRH
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.008935 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0588600 | RBH | 7.568878 | 7.147371 | 7.533903 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g37790 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0588600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0018800 | SBH | 0.0 | 2.681500 | 1.106877 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0018890 | SBH | 0.083474 | 0.000000 | 0.872841 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0018670 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 2.007686 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0018310 | SBH | 0.000000 | 0.310080 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0018760 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0344600 | SBH | 0.028829 | 0.8824205 | 0.0846545 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0019280 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0356800 | SBH | 1.8868395 | 5.834602 | 6.9888025 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0019070 | RBH | 0.029859 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0019190 | SBH | 0.130008 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0018720 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0018470 | SBH | 0.619366 | 0.0 | 0.136617 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0019340 | SBH | 0.000000 | 1.212775 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G018790 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0019010 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
