Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_06g0020270 OGI:06063330 | 14/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr06:23613406-23618884
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_06g0020270 OsARC_06g0020270.01 Chr06 23613406 23618884 + NAM
CDS seq

atggccgctcttcgctgctctttccttggtccttgctgcttttgcatcgtcgtcgccaccacccagggctcctcacagcgaggtgcaacaactgtcaacgatgaaccaaacatcgaattccagacacttatttgccttaggctccatctcacgaacactgatggaatcctagcctcatggaagaatgactcgtaccaattctgcagttggtctggtgtcacttgcagcaagagacattcatctcgtgttgttgcactgagccttgagtcattcggcctaaatgggcaaattccaccttgcatcgccaatctcacttccctcacaagaatacacctcccaaataatcagctgagcggcgagatcccacgtgaacttgggcaactaaataaactgcagtaccttaatctcagctcaaacaaactgacaggcaagatcccagactctctagcttcctgctatcagcttcaaaccatggatctcagaagtaacaacctccaaggtgagattccccaaaacctcgggaagttttcaaatcttcaagtgctcgacttgggtcataacatgctcaccggaggaatacctgaagggcttgggatgctccgcaacctttcagttttacgtctaaatggaaacagtctgacaggcaacattccattttcactaggcagtagtccttcacttgtgtctgtgattctggtgaacaatagcctaacaggacctattccatctctcctggcaaacagttcatcacttcaagtgttgagcttaacgaacaaccatttcagtggagagattcctcctgccctgtttaatagcacaaaacttcaaatattatcccttggaaggaacaactttgtggggtcattacctattttaacaaatattgactcacctttgcaatatcttctcgtgcagtcaaatgatcttgcaggcacaataccttcaaatatagggaatttctcttcacttctatggctcttgcttgcagataataattttgaaggcagcattcccatgagtataggtacaattccaaacctgcaaatattagacatgacttacaactttctgtcagcgactgtccccgcatctctttataacatgtcagaactcacataccttagcatgggcaagaacaatctcactgggaaaattccttacagcattggatatacccttccaagtatccaaactttgattatgcaagcaaaccaattccaaggtccaatccccatttcactagcaaatggaacaaatcttgaggtgattaatctccaggacaatgcattccagggagttgttccttcttttgggaccctacctaacttaatagaattggatgtaggaatgaatcagcttgaagctggagattggtctttcttatcgtcattgacaaattgcacacaattagtgagattaaatttgggtttaaacattcttgaaggaacactgccaagtaacattggaagcctttccaaaaacttagaggaactaattttaacaggaaataaaatatctggcaccataccaaaagaaataggacatctcacaaatctctcgcttctttacatggaaaagaatttccttactggaaatcttcctatttcacttggaaatcttcaagaattgtttgccctaagattatcccagaacaaactttctgggcaaatcccacgctcaattggtaatctcaatcaattaagtgagctctatttacaagaaaattttttgagtggtccaatccaagaagcattaggacgttgcaaaaatttagggatgttgaatctctcacacaacagctttaacggtagcataccaacagagatctttactctttcctccctttctgaaggtctggacctgtcccacaacaaactatctggaaaaattccactggagattggtgacctgatcaacctcggcccccttgatatttccaataaccagttatctggacaaatcccctctagtataggcgattgtgtccatttggagacccttcacatggaagggaaccttcttgatggcaaaatccctgattctttcaataatttaagaggaaccattgtcctggatctttcacaaaacaatttatctggtgaaatcccccacttctttgattccttcatcaatctgaggcttctaaatttgtccttcaacaatcttgaaggacaagtaccgacagccaatatggttggttcagggaaatacggatcagtgtacagaggtacatttgagtttgaaaaacaagttgtcgctatcaaagttttcaaacttgatcaacatggaggaccaaagagcttccttgctgagtgtgaggcattgaggaacactcgtcatcgtaatcttgtaagggtgattactgcatgctcaacatttgatccaataggacatgagttcaaagctcttattcttgaatatattcctaatggtaactttgagaactggctacatctgaaccagatcacgtatggattgaatatacaaatgagtttgtcctctagaataacaattgcagcggacatagctgctgccctggattatctacataaccattgcgtaccacctatagtccattgtgatttaaagcccagcaatgtacttgtagatgatgccatgggtgcacgtcttggcgactttgggttaaaatatggttttggaagcaaaatctctacagaaggcgatgtatatagctatggaattattatcctagaaatgctcactgggaagcgtccaactgatggcatgtttaatgatggcttgagccttcacatatttgtggataaggcatttcctcataacattggcaagattatagatcctaagatcattccaaatttagaagatgaacaccataaccatgcaacagtcagaattttgagctgcatcacgcaactggctaaacttggtctctcatgctccgtagagataccaaaagatcgaccagtaatgcaagaggtttatgctgaagttgttgcaatcaaagaagcatttttggagctgcaaggttaa

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0587900 SBH 0.422553 0.000000 0.260348
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g38830 SBH 0.260518 0.066984 0.061100
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0587900 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0020780 SBH 0.134115 1.062366 0.983788
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_06g0011090 SBH 0.0 0.0 1.222288
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0020730 SBH 0.119523 0.974873 2.135322
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0008360 SBH 0.0 0.011065 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0011210 SBH 12.575239 30.748129 6.738047
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_06G0366000 SBH 0.3113895 0.4256115 0.166195
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0010780 SBH 0.0 0.000000 0.232642
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0333200 RBH 0.4696785 0.320735 0.1207575
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0011190 SBH 0.000000 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0011040 SBH 2.607627 24.942671 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0020220 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_06g0011220 SBH 0.000000 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0010980 SBH 0.445477 9.713138 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G010880 SBH 0.000000 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0011190 SBH 0.000000 5.689448 1.144959
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