Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsAzu_06g0020780 | OGI:06063770 | 16/16 | Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr06:23093003-23114316 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK213, OsRLCK213 | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q1MX30] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsAzu_06g0020780 | OsAzu_06g0020780.01 | Chr06 | 23093003 | 23114316 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.134115 | 1.062366 | 0.983788 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_06g0588800 | RBH | 0.208262 | 0.391048 | 1.527611 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os06g38730 | RBH | 0.228536 | 0.241480 | 0.101591 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os06g0587000 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_06g0020920 | RBH | 0.114306 | 0.000000 | 1.295127 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_06g0020770 | RBH | 0.115735 | 0.948394 | 0.371496 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_06g0020720 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_06g0020540 | RBH | 0.0 | 0.024653 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_06g0021030 | RBH | 0.0 | 3.202118 | 2.678037 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_06G0364900 | RBH | 1.1548545 | 4.9738295 | 3.1319425 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_06g0020250 | RBH | 0.0 | 0.045285 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_06G0340900 | RBH | 0.542916 | 3.126143 | 1.807958 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_06g0020780 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_06g0019760 | RBH | 1.567951 | 4.968778 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_06g0020340 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_06g0021050 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.198038 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_06g0020670 | RBH | 0.162480 | 0.820269 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_06G020460 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.049194 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_06g0020850 | RBH | 0.137123 | 3.362489 | 0.459822 |
