Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_04g0026750 OGI:04041790 | 16/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:30026776-30045362
Gene Symbol RLCK159, OsRLCK159
DNA seq

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Transcripts

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

ARRYHPSHPSSPPRLTASLLPETEKRGRRRAEGSRRETMRVMSHLLLHGGVLLLLLAAAAVQAQRVATKTDPTEAAALNAVFAKLGQQASLSTATWNISGDPCTGAATDGTPIDDNPNFNPAIKCDCTFQNNTVCRITKLKIYALDVPGTIPQELRNLTRLTHLNLGQNTLTGPLPSFIGELTNMQNMTFRINSLSGPIPKELGNLTNLVSLGLGSNRFNGSLPSELGNLDKLQELYIDSAGLSGPLPSSFSKLTRMQTLWASDNDFTGQIPDYIGNWNLTDLRFQGNSFQGPIPSALSNLVQLSSLRIGDIENGSSSSLAFIGNMTSLSILILRNCKISDNLASIDFSKFASLNLLDLSFNNITGQVPTALLGLNLLNSLFLGNNSLSGSLPSSKGPSLSTLDFSYNQLSGNFPPWASGKNLQLNLVANNFVIDSSNNSILPSGLACLQRNTPCFLGSPQSSSFAVDCGSNRLISASDNLRYQTDDASLGPASYSVTGAPTWGVSNVGKFVDAPNGSYIIYSSRQFQNTLDSELFQTSRMSPSSLRYYGIGLENGNYTVTLQFAEFGIEDTQTWKSLGRRVFDIYLQGERQEKNFDIRKAAGDKSYTVVKKSYKVPVTKNFLEIHLFWAGKGTCCIPGQGYYGPTISALSVTPADFTPTVGIVAEQNKSTSKTGVIVGVVVGVAVLGLVALVGIFMWRQKRRKLTLEQQELYSIVGRPNVFSYSELRSATENFSSSNRLGEGGYGAVYKGKLNDGRVVAVKQLSQTSHQGKKQFATEIETISRVQHRNLVKLYGCCLEGNNPLLVYEYMENGSLDKALFGIEKLNIDWPARFDICLGIARGLAYLHEESSIRVVHRDIKASNVLLDANLNPKISDFGLAKLYDDKKTHVSTKVAGTFGYLAPEYAMRGHMTEKVDVFAFGVVLLETLAGRPNYDDTLEEDKIYIFEWAWELYENNNPLGIVDPNLREFNRAEVLRAIHVALLCTQGSPHQRPPMSRVVSMLTGDTEVTDVLMKPSYITEWQIKGGNTSFANSAVRGQSSSAPGSTSQQASSVFLNSIIQEG

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A5 Chr04 30040251 30040366 - OsARC_04g0026750.01 OsARC_04g0026750.01,OsARC_04g0026750.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.767228 0.378999 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g52590 RBH 0.084835 0.000000 0.247825
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0616200 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0026560 RBH 0.431785 2.766697 1.430352
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0027340 RBH 0.087790 2.043086 1.179086
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0027070 RBH 4.737163 31.328411 8.384205
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_08g0006560 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0027040 SBH 3.099421 7.380616 2.684844
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0493100 RBH 3.2457925 28.794131 4.519752
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0025850 SBH 0.0 0.000000 0.016270
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0497100 RBH 5.1998375 90.3632885 9.530799
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0026280 RBH 0.388759 0.306683 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0026110 SBH 0.164607 18.463884 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0026150 SBH 6.280768 28.330269 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0026620 SBH 1.068267 0.108958 0.231745
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0026780 RBH 0.0 0.610552 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G026010 RBH 0.146387 0.396267 0.890258
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0025890 SBH 5.244827 65.479820 3.933135
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