Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsNaBo_04g0025890 | OGI:04041790 | 16/16 | NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:31081855-31138586 | ||||||||
Gene Symbol | RLCK159, OsRLCK159, - | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MALSVLLLLLAAVAQAQKAPTAKTDRIEAEALKAVFDKLNQKAEWNTTGDLCSGTATDGTDINDSSINPAIKCDCSDQNNTVCHITGLKIYAKDANGQIPGELRNLTHLTYLNLSKNLLKGPIPPFIGELTAMQYIFMWLTCTNLGYVFRGIGSNSFSGFLPSELGNLFKLEQLYIDSAGLSGPLPSSWASDNNFTGQIPDYIGGWNLTDLRFQGNNFHGPLPATLSNLVQLTNLVLRNCRISDNLASINFLNFSNLTLLDLSFNNITGLVPQTLLNLNSLNYLKPSKLKGTFTYKFVFGGKQFCDRQIQQCLAFGTGVPSAKYNLFSWSTFPFAVNCGGYRSMTDSENIYQTDDASLGPASYYVKNTSSPIWVVSNVGKFMDASDRNYTIFSGSQSQNTLASELFQSARVSPSSLRYYGIGLENGNYTGERKEQNFDIRNAVGGKSNTAIKKDYIIHVTKNIIEIHLFWAGKGTCCIPYEGYYGPSISALSVTPMDLMSDFTPGAHNAAQKNSSSKKGVIVGVVTGVTVLGLVALAAIFMWMQKRRKLSLEQQELYSIVGRPNVFSYGELRSGTENFSSSNLLGEGGYGVVYKGNLIDGRIVAVKQLSQSSHQGKRQFATEIETISRVQHRNLVKLYGCCLEGNNPLLVYEYMENGSLDKALFGSRRLNLDWATRFEIFLGIARGLAYLHEESRIRVVHRDIKASNVLLDTNLNPKISDFGLAKLYDDKTTHVSTKVAGTFGYLAPEYAMRGHMTEKVDVFAFGVVLLETLAGRTNYDDALEEDKVWRLYESDRALDIVDPDLTEFNSEEVLRAIHVALLCTQGSPHRRPSMSRVVAMLTGDAELGEVAAKPSYITEWQIKGGGTTTTGSSSTSSSAANGQWSSAPPPPRATSSPKMSSPFLSSVVDEGRGGEVSRRKMGWRMAVSRLLHGCVLVLLLAAAVVQAQRAATRTDPTEAAALNAVFAKLGQQAQSSWNLSGDPCTGRATDGSAIDDTSFNPAITCDCTFQNSTICRITKLKIYAVDASGQIPEELRNLTRLTDLGLGSNHFNGSLPTELGNLIKLQELYIDSAGLSGPLPSSLSKLTRMQILWASDNNFTGQIPDYIGSWNLTDLRFQGNSFQGPIPAALSNLVQLSSLRIGDIENGSSSSLAFISNMTSLSILILRNCRISDNLVSLDFSKDLSFNNITGEVPATLLASSFAVNSGSNRFISGSDNLRYETDDVNLRAASYYVTGAPTWGVSNVGKFMEAPNGSYIIYSSRQFQNTLDSELFQTSRMSPSSLRYYGIGLENGNYTVTLQFAEFGIEDTQSWKSLGRRGERKEKNFDIRKTAGDKSYTVVKKQYKVPVTKNFLEIHLFWAGKGTCCIPTQGYYGPTISALSVIPADFTPTVGNTAQKNKSTSKTGVIVGVVVGVTVLGLVALVGIFMWRQKRRKLSLEQQELYSIVGRPNVFSYSELRSATENFSSSNRLGEGGYGAVYKGKLTDGRVVAVKQLSQTSHQGKKQFATEIETISRVQHRNLVKLYGCCLEGNNPLLVYEYMENGSLDKALFGTEKLTIDWPARFEICLGIARGLAYLHEESSIRVVHRDIKASNVLIDTNLNPKISDFGLAKLYDDKKTHVSTKVAGTFGYLAPEYAMRGHMTEKVDVFAFGVVLLETLAGRPNYDDTLEEDKIYIFEWAWELYENNNPLGLVDPKLKEFNREEVLRAIRVALLCTQGSPHQRPPMSRVASMLAGDVEVPDVLTKPSYITEWQIKGGNTSFANSAVSGQSSSAPGSASEQQGSSLFLNSVIPEGRVSHLLLHGGVLLLLLAAAAVQAQRVATRTDPTEAAALNAVFAKLGQQAASTWNLSGDPCTGAATDGTPIDDNPNFNPAIKCDCTFQNNTICRITKLKIYALDVPGTIPQELRNLTRLTHLNLGQNILTGPLPSFIGELTNMQNILLFNFLCWFWVAAACVSAAAALNAMMARLGLSAPPSWNISVDPCSGAATDDTPLDDNPAFNPAIKDFRKNYFTGPLPAFIGELTALKYITVGINALSGPIPKELGNLTNLVSLALGSNNFNGSLPDELGKLTKLQQLYIDSNDFSGPLPTTLSQLTNLSTLRLQGNSFQGPIPRSLYNLVKLRSFVLRNSRISDSLASVDFSKFGSLNLLDSNLVFATMFFLLLCADVCKYLIPKHPFRKSASHEKSSAFKFVCSYFPCMFPFCLNDQNMYRSNSKISHRFFIQPPLRKLSFLDCPERFTTVYRKNLKVISDVHFLRNLVANDFVIDGTDMSGLSWGLNCLQRNTPCFLAASFAVDCGGSRTISGSDNAMYQADNANLGAASYYVAGTPTWGVSTTGRFMDPPNGSYIIYSSRQFDSTLDSGLFQTARMSPSSLRYYGIGLENGNYTVTLQFAEVDFPDVQSWRSRGRRIFDIYVQVACKLIISLGERKQQNFDIRKAAGGKSFTVVKKQYVVPVTKNFLEIHLFWAGKGTCCIPHQGYYGPAISALSATPIFALAALAGHFIWRQKKRKILLELEELYNIVGRPNVFSYNELRSATENFSSSNLLGEGGYGLVHKGRLSYGRAVAVKQLSQSSNQGKKQFATEIETISRVQHRNLVTLYGCCLESNTPLLVYEYLENGSLDQALFGKGSLNLDWPTRFEICLGLARGIAYLHEDSTVRIVHRDIKASNVLLDAGLNPKISDFGLAKLYDNKKTHVSTKVAGTFGYLAPEYAMRGHMTEKVDVFAFGVVALETVAGESNYQNTLEEDRTYIFERVWELYENGHPLDFVDPKLSEFNSEEVIRVIRVALLCTQGSPHKRPPMSKVVSMLTGDADITEDAAKPSYITEWQIKVGSCHHTGSSQVGSASTPPSSGDGGAGQASSQGAGEGSPLTPSPLFTSIIDEGR |
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Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGH2] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsNaBo_04g0025890 | OsNaBo_04g0025890.04 | Chr04 | 31081855 | 31118490 | - | NAM | ||
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
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A5 | Chr04 | 31095742 | 31099038 | - | OsNaBo_04g0025890.06 | OsNaBo_04g0025890.01,OsNaBo_04g0025890.02,OsNaBo_04g0025890.06,OsNaBo_04g0025890.04,OsNaBo_04g0025890.05 | All |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 5.244827 | 65.479820 | 3.933135 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g52606 | RBH | 0.118893 | 0.040288 | 0.659019 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0616200 | RBH | None | None | None |
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KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0027340 | RBH | 0.087790 | 2.043086 | 1.179086 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0027080 | RBH | 0.562506 | 3.908379 | 3.085461 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0026760 | RBH | 0.027891 | 0.127751 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0027050 | RBH | 4.165082 | 21.620441 | 9.249182 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0492500 | RBH | 0.2865575 | 2.573822 | 0.459313 |
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Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0497100 | RBH | 5.1998375 | 90.3632885 | 9.530799 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0026280 | RBH | 0.388759 | 0.306683 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0026110 | RBH | 0.164607 | 18.463884 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0026140 | RBH | 0.0 | 2.241474 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0026620 | RBH | 1.068267 | 0.108958 | 0.231745 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0026800 | RBH | 0.040776 | 1.921849 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G026010 | RBH | 0.146387 | 0.396267 | 0.890258 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_08g0006230 | RBH | 6.022739 | 0.000000 | 0.0 |