Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsARC_01g0023540 | OGI:01013090 | 16/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:23840359-23859934 | ||||||||
| Gene Symbol | OsSTA22, OsLRP, OsLRR1, LRR1 | ||||||||||
| DNA seq | aaaaaataaatcatataacaacaacatataatacaatgacaacagaatgtcaagcacattacagacaaatatgctagtaggtttcatcggaaaccagatattatagtaggaacagtaaatatccacttggaatagtaaaacacctaaaattattctttgagttactaggtttttcagatactagtagcttgaataattcatttgcagtggaaacaacgctcttcatgctgcatcttggtttttccgcatcaagcgactccagcttatagccacttgtacataggccttatcatataaattgtcaatgatccgaaagtaagccatcatccaggttctcttcatcatcatggtgcaaaacacagtccatagaccaatcacaaatcctatgctcatcccgaggtagagagatcccatatggcttctatcttcatagaaactttgttgtgtaccattagttgaacagttcttcaagagaggaggcccacaaagaccaggatttccaacatatatataaatctggtcatcgagtgcttgtagctgtgatcctgatggtattgtgcctgataaattgttgtatgataggttcaagtggcttagagaagttagagctgacaaacttggggggatttcaccagataattcattgtaggacaagtcaagggattccaactgcttcaaatcaccaatttgatcatggattgttccactgaactgattacttgataaatttaaattggtaagtccaataagtaaatgtatttcttctggaatatgcgctgttaacttgttacatgaaaaatcaagattaaccacctgattgtagatttcaaaggtgtagtcacgctgttgatctttcgtgattactggtatgctctcttcaaaaatatagtcctcactattctgagctataacagtcattgctttgaagtttgctaaggagtctggtatggatcctgatatgttgttgtgtgctatgtccagaaaatgaagtttaccaaggtaaataatgttcttgggaatatggccatggaaaatatttgaccgcaacctcaagatttgcaagtttggcattctttctggtaaccactttggcaaacttccaaaaaacctgttgtgtgaaagatccaggaacaataattgtgaggcattttgaagaaattgaggaaatatacctgaaagttcattgtggttcaaggcaagactgagcatactagaaccaaatttatctgcagagtttgtattgggcatatctgactgtttccagcattgcatttgttcaagatctcctgttattttgtttcctgacaggtccaaacggttcaaaccagtcaattggcacatggatggtgggatgctgcctgtaatattattattggcaagcaacagctcctccagcagtggagctttgagagatggcaatggccctgacaaaaagtttgaagacaaattcaagcaagtcatacttatagggagttgaggaacttgacctgtcaacaagttggaaccgagatatatgcgaccaactgagatgtgttctagacttggcggtaatgagccatgcaacttatttcctgatgcttgcaagaatgaagctcgggaaaatgtcacccagaaccaatccggaataacatcatccaattttgtattttcaagaacaagagcatcaatgtcagtctgccatctaagccacaatggaaagcgcggccccagctgacatgaccggaaagatgcgtttcttagtttgaatggcggagaagaatttgtatgtatatctattttcaagaagttgtatgacaaatccagatacttcagacgagataaatgttcaacatgatccttagagattacgccttggaacctgttatagctaagatccaatgttgtcaaattactgagtgatccaatccctggtggtacaggtccactgaagctattgtgggaaagatccaaaatttgtaaattacctaatgctccaacccacgatggtgcagggccgctgaaattattgtagtacaactctttcaaatgacttactgctccaattccaagaggcacaaaaccgttgaacttgttgttgttaagatacaaaattttcaaatttacagctccaagcccaagcggtactggaccactgaagttattgtagctaagagccaatattttcaaattacccagcgctccgacaccagcaggtagctcgccaaccaacttgttttcagacaatagaagaacactgagattactcattttgcgaatcaacgttgttgggaatgttccgctcatatttgtgtagtctaaactcaactcttccaaagaattccacgagcacattggcaaccgttgcatgaattcccttatgtctgcatcaatattgttgccattcattcgcaatacttgtaaattgcacatattctctaagctcttcggaaacaaaccaacaatagaactggaacttagatctaaaacacgtagagcagacatgttacccaatctatcagggataggtcctgcaggcgctaaatatgcatattctgatagataaagctccttcaggctagtgagatcccaaaaccagttgtgttggagtggcgtgtagatttgttcattgtctgatagatcaaggacctcaagatttgtgaggtttgaatgggatagtttagatacagtatggttaaggccacactcggacaaacgaagaacttgaagagcaggaagcatgttcaccatgtgaacccaatccctcacggaactgaggtcaacgtcagtcatgtcaacatgcctcaaaaaggtgagacgtggcaaccaagaaagatcagttgaagacatgaaaaacgtgttctgttcatggaagaaataattcgagctaacatcaaggtattgtaagctggaaatattaccaatttgcgaaggtattttcccaccgaaacctgcccaggagaggttgagatatctcaagttcttgaaagagcccatgaaaacaggtatgctcgttccgttgaagaaattgcaactcagatcgagatgcctcagatgatgtaaagcaatcaaagaggagctcaattcacctcccaataggctcaagtcaccgcctctcaataggttcaacccatcagcatcatagaaatcgtaccagaaattattagtgttgcggaggttaagcgcaacgatattgccagttctgttgctgcaccggactcccttccactggcagcagtcgtcaccctgccatgacgacagcctgccagaagggtccagaaggcttgccttgaaggagagcagtgcatcacgctcgccggtgacgcatctcgcatgaacacaacaggtagatggtgtctgcgagatgagtagccacaagatcattgcagctcctcggaggaggagcgccagtttagacatattgacctcagttggtggagtaactaattggctgttgaacctaatttcacaagagttgtaagaggctaagagcacgaacgggatggttatgaagcatctatgattctatgcttatcggaagaccaaagtctaacaagacttcatttggtagcagttcggttgtctttttgggtagatgtcctttttactcctttggatatatggatgctgccattgtatctttagcgtgggggatctggcaggaggctccctatcacgtttaattccatatgtgaacaggaagatcgatcagtgtcattgcttggatttttatccaataatcagttccaatgagggtgtgtttagttcacgccaaaattgaaagtgtggttgaaattggaacgatgtgatggaaaagtttaaagtttatgtgtatagaaaagttttgatgtgatgaaaaagttggaagtttgaagaaaaaatttggaactaaacaaggcccgagtatgaggggatgtgtgacccggtgggggaagcgaatttcctttaaggtttctgaacaattctttgactaaaggagaaacaaaaatattacttcctccgttttagattataagacgttttgactttggtcaaagtcaaactgtttcaagtttaactaagtttatagacaaatatagtaatatttataatactaaattagtttcatgaaatcaataatcgaatatattttcataataaatttgtcttgggttgaaaatgttattatttttttctacaaacttgatccaaagtcaaaacgtcttatgacctgaaacagagagagtacattcttttcaaaatgtatgacactgtttacttttagttaaaaatgtttgaccattcgtcttattaaaaaaaataaatatgtaaaagtataagttaaaattatactttatttaatggtaaaacaagttacaagaaaataaataatacttgtataaatttttttgaatatgacgaatggttaaacgttatacgaaaaattgaacgacgtcatacattttgaaatggaggaaatattttggttgccaacatacaccgaaatgcctggtcatcgagaacaagttgaaacgtctcaatgctgtgagagctgatgagctgcgaggaatttcatccgacagctccttgtccttgtgtggtagataggtcagcacgagagttgcggagcggaacgtgtgttgtggcgacaagtgagcagatggaggacttcgcccatttggaagcccaaagctttagaagcggctatgaaatctggctcattagcaaacactgccccactcactcgcaccttaggttttgtgctggaatctggatcaaagtaggaatttggatggatcatatatactaccactacaccatgtcccaaaattggcaacaactaatctgtcggcgaagaccacctttaacatcaatagtctgtcagaaaaggcctctggcgacagaaatggtgtgtcggtggaaagcctgtcggtacacggcattaccgacagatagaacttctacctaaataagtctatttttgtctttttttgaaattcttgtcccttaaacataaaaccggatataacgttttccccattttt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More
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| Protein seq | MIAPTLLAQRATATAILVFFFVSLAQSASSFHPANTTTRPAVSGSCIPSERKALLTFKDSFWDRAGRLYSWRGEDCCRWKGVRCDNTTEHVVKLDLRNTDDWRYRTVSTLSHSNLTHLEVLDLTSNWFSSPLARNWFWDLTTLKKLFLYDCAWSGPIPDALGNMSALESIDLHDTDLSGNIPTTMKNLCNLQELNLYNININSFISELMERLPKCSWNKLRKMDLHSANLTGELPTWIGNLASLSYLDLSENMIVGSVPDGMGNLTNLNYLDLSQNMLVGHLPVGMGQLTGLTFLDLSQNLLVGHIPVGIGAFGNLTSLNLGQNSFSGVLTEHHFAALERLEYLNLSRNSLKLDLHEAWIPPFKLTEGYFESCDLGPQFPSWLRWQTGIVFLDISNTSIKDDLPGWFWTILSNASELYLSRNQLGGALPEKLELPSMQAMDLSDNYLSGKLPANLTVPNLMTLHLHHNQIGGTIPACLCQLRSLRVINLSYNQLTGEIPQCSVDQFGFSFLVIDMKNNNLSGEFPSFLQNAGWLLFLDLSYNKLSGNVPTWIAQRMPYLEVLILRSNMFCGNLSNQLNKLDQLHFLDVAHNNISGSIYSSIRSLTAMKYSHTSGLDNYTGASISMSIKDQELNYTFQSTNNIMLIDMSYNSFTGPIPRELTLLKGLQSLNLSGNQLSGTIPNDIGILRRLESLDLSYNDLVGEIPSSLSDLTFLSCLNLSYNNLSGRIPSGQQLQTLNNLYMYIGNPGLCGLPLSTNCSTNRTNKIVQNEHDDASHDTTYLYISTSAGFVVGLWIVFCTILFKKSWRIAYFQFFDQIYDKIYVQAAVSKAVLIRKFLCIHVLIALALLMFTPIISKEASASANSTGGCIPSERSALISFKSGLLDPGNLLSSWEGDDCFQWNGVWCNNETGHIVELNLPGGSCNILPPWVPLEPGLGGSIGPSLLGLKQLEHLDLSCNYFSGTLPEFLGSLHNLRSLDLSWSTFVGTVPPQLGNLSNLRYFSLGSNDNSSLYSTDVSWLSRLSSLEHLDMSLVNLSAVVDWVSVVNKLPSLRFLRLFGCQLSSTVDSVPNNNLTSLETLDLSLNNFNKRIAPNWFWDLTSLKNLDISYSGFYGPFPNEIGNMTSIVDIDLSGNNLVGMIPFNLKNLCNLEKFAAAGTNINGNITEVFNRLPRCSWNMLQVLFLPDCNLTGSLPTTLEPLSNLSMLELGNNNLTGPVPLWIGELTNLTKLGLSSNNLDGVIHEGHLSGLESLDWLILSDNNHIAIKVNSTWVPPFKQITDIELRSCQLGPKFPTWLRYLTHVDNLDISNTSISDKVPDWFWKAASSVTHLNMRNNQIAGALPSTLEYMRTIEMDLSSNRFSGPVPKLPINLTSLDISKNNLSGPLPSDIGASALASLVLYGNSLSGSIPSYLCKMQSLELLDISRNKITGPLPDCAINSSSANSTCMNIINISLRNNNISGQFPSFFKNCKNLVFLDLAENQLSGTLPTWIGGKLPSLVFLRLRSNSFSGHIPIELTSLAGLQYLDLAHNNFSGCIPNSLAKFHRMTLEQDKEDRFSGAIRYGIGINDNDLVNYIENITVVTKGQERLYTGEIVYMVNIDLSSNNLTGEIPEEIISLVALTNLYLSWNSLSGQIPEKIGSLSQLESLDLSHNVLSGGIPSSIASLTYLSHMNLSYNNLSGRIPAGNQLDILEDPASMYVGNIDLCGHPLPNNCSINGDTKIERDDLVNMSFHFSMIIGFMVGLLLTPSTCCVHARCVTGERDALLSFKASLLDPSGRLSSWQGDDCCQWKGVRCSNRTGNIVALNLRNTNNFWYDFYDADGLNLLRGGDLSLLGGELSSSLIALHHLRHLDLSCNFFNGTSIPVFMGSFKNLRYLNLSWAGFGGKIPSQIGNISSLQYLDVSSNYFFHEQNTFFMSSTDLSWLPRLTFLRHVDMTDVDLSSVRDWVHMVNMLPALQVLRLSECGLNHTVSKLSHSNLTNLEVLDLSDNEQIYTPLQHNWFWDLTSLKELYLSEYAYLAPAGPIPDRLGNMSALRVLDLSSSSIVGLFPKSLENMCNLQVLRMNGNNIDADIREFMQRLPMCSWNSLEELSLDYTNMSGTFPTTLIRKMSNLSVLLLSENKLVGELPAGVGALGNLKILALSYNNFSGPVPLGLGAVNLKILYLNNNKFNGFVPLGIGAVSHLKELYYNNFSGPAPSWVGALGNLQILDLSHNSFSGPVPPGIGSLSNLTTLDLSYNRFQGVISKDHVEHLSRLKYLDLSYNFLKIDIHTNSSPPFKLRNASFRSCQLGPRFPLWLRWQTDIDALVLENTKLDDVIPDWFWVTFSRASFLQASGNKLHGSLPPSLEHISVGRIYLGSNLLTGQVPQLPIRPLPSLKAPLLEELLLANNNITGSIPPSMCQLTGLNRLDLSGNKITGDLEQMQCWKQSDMPNTNSADKFGSSMLSLALNHNELSGIFPQFLQNASQLLFLDLSHNRFFGSLPKWLPERMPNLQILRLRSNIFHGHIPKNIIYLGKLHFLDIAHNNISGSIPDSLANFKAMTVIAQNSEDYIFEESIPVITKDQQRDYTFEIYNQVVNLDFSCNKLTAHIPEEIHLLIGLTNLNLSSNQFSGTIHDQIGDLKQLESLDLSYNELSGEIPPSLSALTSLSHLNLSYNNLSGTIPSGSQLQALDDQIYIYVGNPGLCGPPLLKNCSTNGTQQSFYEDRSHMGSLYLGMSIGFVIGLWTVFCTMMMKRTWMMAYFRIIDNLYDKAYVQVAISWSRLMRKNQDAA |
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| Function | Receptor-like protein EIX2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q6JN46] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_01g0023540 | OsARC_01g0023540.01 | Chr01 | 23840359 | 23859934 | - | NAM | ||
| CDS seq | atgattgctcccacgctccttgcgcaaagagccactgctactgcaatcctcgtgttcttttttgtctccctagcacaatccgcgtcttctttccatcctgcaaacacgacgacacggcccgccgtcagcgggagttgcattccgagtgagcggaaggcgctcctgaccttcaaggatagcttttgggatcgtgctggtcgtctttattcatggcggggcgaagactgctgccggtggaagggagtccgatgcgacaacacaactgagcatgtcgtcaagctcgacctccgcaacacagacgattggcgctatcgtaccgtctctactctatctcattccaatctcacacatcttgaagtcctagatttaacatccaactggtttagctctcctcttgcacgcaactggttttgggatctcactacacttaaaaagctctttctatatgattgtgcctggtctgggccaattcctgatgcattaggaaacatgtctgcccttgagtccatagatctgcatgacaccgatttatcgggtaacataccgacaacaatgaaaaatctgtgtaatttacaagagctgaatttatacaacattaatattaacagtttcatatcagaactgatggagagattaccgaagtgttcatggaataagttgcgtaagatggacctgcattctgcaaatttgacaggggaactaccaacttggataggaaatctagcaagtctcagttatcttgatctttctgagaacatgattgttggttctgtacctgatggaatgggaaatcttacaaatctcaactatcttgacctctcgcagaacatgttggttggtcatttgcctgttggaatgggacaattgacaggcctcacctttcttgacctctctcagaacttgctggttggccatatacctgttgggattggcgcatttggcaacttgactagcttgaaccttggccaaaatagcttcagtggtgtgctcacagaacaccattttgcagctctagaaagactggaatatttgaacctctcaaggaactcgctgaaattagatttacatgaagcttggattcccccctttaaattaacggagggatattttgagtcatgtgacttggggcctcaattcccttcatggctaagatggcaaactggcatagttttccttgatatttcaaatacaagcataaaggatgacttgcctggctggttttggactattttatctaatgcttccgaattgtacctgtcaaggaatcaactgggtggagctttaccagagaaattggaactgccatcaatgcaagcaatggatctctccgataattatttgtcagggaagttaccagcaaatctcactgttcccaatctaatgacactgcatcttcaccacaatcaaattggaggcactattccagcttgtttgtgtcaactgcggagtttgagagtaataaatctgtcatacaatcaactaacaggggaaatcccacaatgttcagtggatcaatttggtttctcattcttggttatagatatgaagaataacaatctatctggtgaattccctagctttcttcaaaatgctggttggttattatttcttgacctttcatataacaagttgtctggaaatgtcccaacatggattgcacagagaatgccttacctggaagttttgattctaagatcgaacatgttttgtggtaacctttctaaccaattaaacaagcttgatcaacttcattttctcgatgtagcacataacaacatatcaggaagtatatattcatctataagaagcttgacagccatgaaatattcacacacatcagggttggacaactacactggtgctagcatatccatgtccataaaagaccaggagcttaactatacctttcaatccacaaataatattatgttgattgacatgtcgtacaatagtttcactggacctattccaagagaattaactctactcaaggggcttcaaagtttgaatctatcaggcaatcaattaagtggaacaattccaaatgatattggcattttaaggagattggagtccctggacctatcctacaatgatttagttggtgaaatcccctcgagtttatcagaccttacttttttgagctgcttaaacttgtcctacaacaatctatcaggaagaatcccctcaggacaacaactacaaacacttaataatctttatatgtacatcggcaatcctggactttgtggacttcctctttccaccaattgttccacgaacagaacaaacaaaattgtccagaatgaacatgatgacgcatcacatgatacaacatatttgtacatcagcacaagtgcagggtttgtggtggggctctggatagtgttctgcaccatcctgttcaagaaatcatggaggatcgcttattttcagttttttgatcagatatatgacaagatatatgtgcaagcagctgtcagtaaggctgttttgataagaaaattcctatgcatccacgttctaatagccttagccttgcttatgttcaccccaatcatctccaaggaggcctcagccagtgccaatagcacaggtggttgtattccaagtgagagatctgcacttatcagcttcaaatcaggattattagaccctggaaacctcctttcgtcatgggagggtgacgattgttttcaatggaatggcgtgtggtgcaacaacgagaccgggcatattgttgagctaaatctcccaggaggtagctgcaacatcttgcccccatgggttccgctggaaccaggactcggaggcagcataggcccctcgttgcttggcttaaagcaactggagcatctcgacctcagctgcaactatttcagtgggacgctaccggagttcttgggttctctccacaacctgagatctctcgacctatcctggtcgacattcgttgggacagtgccaccgcagctgggtaatctctccaacttgcgctacttcagtcttggttctaatgataattctagcttatattcaacggatgtatcctggttgtcacggttatcttctctcgagcatctagacatgagccttgtgaatctcagtgcggttgtggactgggtttcggtggtgaacaagcttccatctcttagatttctccgtttgtttggatgccagcttagcagcacggtcgattctgttccgaacaacaacctaacatctcttgaaactctggacctttcacttaataatttcaacaagaggatcgcacccaattggttttgggatttaactagccttaaaaatctagatatctcatatagtggtttctatggaccatttccaaacgagataggcaatatgacctctattgtggatattgatttatcgggcaataatcttgtggggatgataccatttaatctgaagaacctatgtaacttggagaaatttgccgctgctggaaccaacatcaatgggaatataacggaagtattcaatagattgcctagatgctcatggaatatgttacaagtgttgtttctaccggactgcaacttgactggaagcctaccaacaacactagaacccttgagcaatttgagcatgcttgagcttggtaataacaatctcacaggtccggttccgctctggataggagagctcactaatctaacaaagttgggcctcagctccaacaatctagatggggtcatacatgaaggccatttatcaggcctagaaagtctagattggttgatcttgtcagataacaaccacatagccatcaaggtgaattcaacctgggttcctcctttcaagcaaataacagatattgaacttcggtcctgtcagttagggcctaaattcccaacttggctcagatatctaacacatgtagacaatcttgatatctcaaacacaagcatatcagacaaggttcctgactggttttggaaagcagcgtcctcagtaacacatttaaatatgagaaacaatcagattgcaggtgccctcccatctacattggagtacatgagaacgatcgaaatggatctcagttctaataggtttagtggtccagtacccaagcttcctatcaatctcaccagcttagacatctcaaagaacaatttatccgggcctctaccatcagacataggagcgtcagctctagcatcacttgttctttatggcaactccctttctggttcaattccatcttatttgtgcaagatgcagtctctggaactgttggatatatcaagaaacaagataactgggccacttcctgattgcgcaatcaattcaagctcagcaaattccacatgtatgaatattatcaatataagcttgagaaacaataatatctctggacaatttccttcattctttaagaactgcaaaaaccttgtttttctggatcttgctgaaaatcaattatctgggacactgcctacatggatcgggggaaaattaccttctttggtattcttacggctacgttctaatagctttagtggtcatattccaattgaacttaccagtctggcgggtcttcaatatttagaccttgcacataacaacttttcaggatgcataccgaattctttggcgaaatttcataggatgacactcgaacaagataaagaagacagattttcaggggctattagatatggaattgggatcaatgataatgacctggttaattatattgagaacataactgtagtcacaaaaggtcaagaacgcctatatacaggtgaaatcgtatacatggtgaacattgatttatctagtaacaatcttactggagagattcctgaagagattatcagtcttgttgcgttgacaaacctgtacttatcatggaatagcttaagtggacaaattcctgagaagattggttccttgtcacaattggagtcccttgatttgtcacacaatgtgctttctggtgggattcccagcagtatagcatctcttacctacttgagccacatgaatttgtcgtacaacaatctttctggaagaattccagcaggaaatcaactcgacattcttgaagaccctgcatctatgtatgttggaaacatcgatctctgtgggcatcctctaccaaataactgctctatcaatggtgatactaaaattgaacgagatgacttggtcaacatgtcatttcacttcagcatgatcatcggtttcatggttggcctcttgctaacaccatctacctgttgtgttcatgcgagatgcgtcaccggcgagcgtgatgcactgctctccttcaaggcaagccttctggacccttctggcaggctgtcgtcatggcagggtgacgactgctgccagtggaagggagtccggtgcagcaacagaactggcaatatcgttgcgcttaacctccgcaacactaataatttctggtacgatttctatgatgctgatgggttgaacctattgagaggcggtgacttgagcctattgggaggtgaattgagctcctctttgattgctttacatcatctgaggcatctcgatctgagttgcaatttcttcaacggaacgagcatacctgttttcatgggctctttcaagaacttgagatatctcaacctctcctgggcaggtttcggtgggaaaataccttcgcaaattggtaatatttccagcttacaataccttgatgttagctcgaattatttcttccatgaacagaacacgtttttcatgtcttcaactgatctttcttggttgccacgtctcacctttttgaggcatgttgacatgactgacgttgacctcagttccgtgagggattgggttcacatggtgaacatgcttcctgctcttcaagttcttcgtttgtccgagtgtggccttaaccatactgtatctaaactatcccattcaaacctcacaaatcttgaggtccttgatctatcagacaatgaacaaatctacacgccactccaacacaactggttttgggatctcactagcctgaaggagctttatctatcagaatatgcatatttagcgcctgcaggacctatccctgatagattgggtaacatgtctgctctacgtgttttagatctaagttccagttctattgttggtttgtttccgaagagcttagagaatatgtgcaatttacaagtattgcgaatgaatggcaacaatattgatgcagacataagggaattcatgcaacggttgccaatgtgctcgtggaattctttggaagagttgagtttagactacacaaatatgagcggaacattcccaacaacgttgattcgcaaaatgagtaatctcagtgttcttctattgtctgaaaacaagttggttggcgagctacctgctggtgtcggagcgctgggtaatttgaaaatattggctcttagctacaataacttcagtggtccagtaccgcttgggcttggagctgtaaatttgaaaattttgtatcttaacaacaacaagttcaacggttttgtgcctcttggaattggagcagtaagtcatttgaaagagttgtactacaataatttcagcggccctgcaccatcgtgggttggagcattaggtaatttacaaattttggatctttcccacaatagcttcagtggacctgtaccaccagggattggatcactcagtaatttgacaacattggatcttagctataacaggttccaaggcgtaatctctaaggatcatgttgaacatttatctcgtctgaagtatctggatttgtcatacaacttcttgaaaatagatatacatacaaattcttctccgccattcaaactaagaaacgcatctttccggtcatgtcagctggggccgcgctttccattgtggcttagatggcagactgacattgatgctcttgttcttgaaaatacaaaattggatgatgttattccggattggttctgggtgacattttcccgagcttcattcttgcaagcatcaggaaataagttgcatggctcattaccgccaagtctagaacacatctcagttggtcgcatatatctcggttccaacttgttgacaggtcaagttcctcaactccctataaggccattgccatctctcaaagctccactgctggaggagctgttgcttgccaataataatattacaggcagcatcccaccatccatgtgccaattgactggtttgaaccgtttggacctgtcaggaaacaaaataacaggagatcttgaacaaatgcaatgctggaaacagtcagatatgcccaatacaaactctgcagataaatttggttctagtatgctcagtcttgccttgaaccacaatgaactttcaggtatatttcctcaatttcttcaaaatgcctcacaattattgttcctggatctttcacacaacaggttttttggaagtttgccaaagtggttaccagaaagaatgccaaacttgcaaatcttgaggttgcggtcaaatattttccatggccatattcccaagaacattatttaccttggtaaacttcattttctggacatagcacacaacaacatatcaggatccataccagactccttagcaaacttcaaagcaatgactgttatagctcagaatagtgaggactatatttttgaagagagcataccagtaatcacgaaagatcaacagcgtgactacacctttgaaatctacaatcaggtggttaatcttgatttttcatgtaacaagttaacagcgcatattccagaagaaatacatttacttattggacttaccaatttaaatttatcaagtaatcagttcagtggaacaatccatgatcaaattggtgatttgaagcagttggaatcccttgacttgtcctacaatgaattatctggtgaaatccccccaagtttgtcagctctaacttctctaagccacttgaacctatcatacaacaatttatcaggcacaataccatcaggatcacagctacaagcactcgatgaccagatttatatatatgttggaaatcctggtctttgtgggcctcctctcttgaagaactgttcaactaatggtacacaacaaagtttctatgaagatagaagccatatgggatctctctacctcgggatgagcataggatttgtgattggtctatggactgtgttttgcaccatgatgatgaagagaacctggatgatggcttactttcggatcattgacaatttatatgataaggcctatgtacaagtggctataagctggagtcgcttgatgcggaaaaaccaagatgcagcatga
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| Protein seq | MIAPTLLAQRATATAILVFFFVSLAQSASSFHPANTTTRPAVSGSCIPSERKALLTFKDSFWDRAGRLYSWRGEDCCRWKGVRCDNTTEHVVKLDLRNTDDWRYRTVSTLSHSNLTHLEVLDLTSNWFSSPLARNWFWDLTTLKKLFLYDCAWSGPIPDALGNMSALESIDLHDTDLSGNIPTTMKNLCNLQELNLYNININSFISELMERLPKCSWNKLRKMDLHSANLTGELPTWIGNLASLSYLDLSENMIVGSVPDGMGNLTNLNYLDLSQNMLVGHLPVGMGQLTGLTFLDLSQNLLVGHIPVGIGAFGNLTSLNLGQNSFSGVLTEHHFAALERLEYLNLSRNSLKLDLHEAWIPPFKLTEGYFESCDLGPQFPSWLRWQTGIVFLDISNTSIKDDLPGWFWTILSNASELYLSRNQLGGALPEKLELPSMQAMDLSDNYLSGKLPANLTVPNLMTLHLHHNQIGGTIPACLCQLRSLRVINLSYNQLTGEIPQCSVDQFGFSFLVIDMKNNNLSGEFPSFLQNAGWLLFLDLSYNKLSGNVPTWIAQRMPYLEVLILRSNMFCGNLSNQLNKLDQLHFLDVAHNNISGSIYSSIRSLTAMKYSHTSGLDNYTGASISMSIKDQELNYTFQSTNNIMLIDMSYNSFTGPIPRELTLLKGLQSLNLSGNQLSGTIPNDIGILRRLESLDLSYNDLVGEIPSSLSDLTFLSCLNLSYNNLSGRIPSGQQLQTLNNLYMYIGNPGLCGLPLSTNCSTNRTNKIVQNEHDDASHDTTYLYISTSAGFVVGLWIVFCTILFKKSWRIAYFQFFDQIYDKIYVQAAVSKAVLIRKFLCIHVLIALALLMFTPIISKEASASANSTGGCIPSERSALISFKSGLLDPGNLLSSWEGDDCFQWNGVWCNNETGHIVELNLPGGSCNILPPWVPLEPGLGGSIGPSLLGLKQLEHLDLSCNYFSGTLPEFLGSLHNLRSLDLSWSTFVGTVPPQLGNLSNLRYFSLGSNDNSSLYSTDVSWLSRLSSLEHLDMSLVNLSAVVDWVSVVNKLPSLRFLRLFGCQLSSTVDSVPNNNLTSLETLDLSLNNFNKRIAPNWFWDLTSLKNLDISYSGFYGPFPNEIGNMTSIVDIDLSGNNLVGMIPFNLKNLCNLEKFAAAGTNINGNITEVFNRLPRCSWNMLQVLFLPDCNLTGSLPTTLEPLSNLSMLELGNNNLTGPVPLWIGELTNLTKLGLSSNNLDGVIHEGHLSGLESLDWLILSDNNHIAIKVNSTWVPPFKQITDIELRSCQLGPKFPTWLRYLTHVDNLDISNTSISDKVPDWFWKAASSVTHLNMRNNQIAGALPSTLEYMRTIEMDLSSNRFSGPVPKLPINLTSLDISKNNLSGPLPSDIGASALASLVLYGNSLSGSIPSYLCKMQSLELLDISRNKITGPLPDCAINSSSANSTCMNIINISLRNNNISGQFPSFFKNCKNLVFLDLAENQLSGTLPTWIGGKLPSLVFLRLRSNSFSGHIPIELTSLAGLQYLDLAHNNFSGCIPNSLAKFHRMTLEQDKEDRFSGAIRYGIGINDNDLVNYIENITVVTKGQERLYTGEIVYMVNIDLSSNNLTGEIPEEIISLVALTNLYLSWNSLSGQIPEKIGSLSQLESLDLSHNVLSGGIPSSIASLTYLSHMNLSYNNLSGRIPAGNQLDILEDPASMYVGNIDLCGHPLPNNCSINGDTKIERDDLVNMSFHFSMIIGFMVGLLLTPSTCCVHARCVTGERDALLSFKASLLDPSGRLSSWQGDDCCQWKGVRCSNRTGNIVALNLRNTNNFWYDFYDADGLNLLRGGDLSLLGGELSSSLIALHHLRHLDLSCNFFNGTSIPVFMGSFKNLRYLNLSWAGFGGKIPSQIGNISSLQYLDVSSNYFFHEQNTFFMSSTDLSWLPRLTFLRHVDMTDVDLSSVRDWVHMVNMLPALQVLRLSECGLNHTVSKLSHSNLTNLEVLDLSDNEQIYTPLQHNWFWDLTSLKELYLSEYAYLAPAGPIPDRLGNMSALRVLDLSSSSIVGLFPKSLENMCNLQVLRMNGNNIDADIREFMQRLPMCSWNSLEELSLDYTNMSGTFPTTLIRKMSNLSVLLLSENKLVGELPAGVGALGNLKILALSYNNFSGPVPLGLGAVNLKILYLNNNKFNGFVPLGIGAVSHLKELYYNNFSGPAPSWVGALGNLQILDLSHNSFSGPVPPGIGSLSNLTTLDLSYNRFQGVISKDHVEHLSRLKYLDLSYNFLKIDIHTNSSPPFKLRNASFRSCQLGPRFPLWLRWQTDIDALVLENTKLDDVIPDWFWVTFSRASFLQASGNKLHGSLPPSLEHISVGRIYLGSNLLTGQVPQLPIRPLPSLKAPLLEELLLANNNITGSIPPSMCQLTGLNRLDLSGNKITGDLEQMQCWKQSDMPNTNSADKFGSSMLSLALNHNELSGIFPQFLQNASQLLFLDLSHNRFFGSLPKWLPERMPNLQILRLRSNIFHGHIPKNIIYLGKLHFLDIAHNNISGSIPDSLANFKAMTVIAQNSEDYIFEESIPVITKDQQRDYTFEIYNQVVNLDFSCNKLTAHIPEEIHLLIGLTNLNLSSNQFSGTIHDQIGDLKQLESLDLSYNELSGEIPPSLSALTSLSHLNLSYNNLSGTIPSGSQLQALDDQIYIYVGNPGLCGPPLLKNCSTNGTQQSFYEDRSHMGSLYLGMSIGFVIGLWTVFCTMMMKRTWMMAYFRIIDNLYDKAYVQVAISWSRLMRKNQDAA
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.025093 | 0.039633 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0750400 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g41780 | RBH | 0.188767 | 0.0 | 0.329391 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0750400 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0024270 | RBH | 0.098474 | 0.0 | 0.165734 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0023860 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.000000 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0024190 | RBH | 0.0 | 0.885465 | 0.211562 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0023690 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0023300 | SBH | 0.352614 | 0.000000 | 0.306255 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0395100 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0023210 | RBH | 0.069891 | 0.000000 | 0.031217 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0384800 | RBH | 0.00217 | 0 | 0.2913575 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0012140 | RBH | 0.391875 | 0.322095 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0012220 | SBH | 1.858305 | 27.295940 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0023450 | SBH | 1.194769 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0012280 | SBH | 2.698003 | 2.435953 | 4.170121 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0023350 | SBH | 0.050005 | 0.167608 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G023570 | RBH | 0.038315 | 0.0 | 0.000000 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0023430 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
