Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsZS97_11G0435100 | OGI:11080140 | 5/16 | Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | Chr11:30870852-30887079 | ||||||||
| Gene Symbol | WRKY41, OsWRKY41 | ||||||||||
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| Protein seq | MDEEGELPPRYSDPVYSGGNPGNHGGHGGGDCLQEEMEFSASDTHGGGDGGDEEAMDATVTVSHGGMGRLLRQLRSLKATSIDGVIDEKDLQTFKDILERLCGKLKHLAEVESPSYTAKGWMEEMRNLCYDTEDYLDKVTQSAADVGESDLIKAHHRGKPKRQRQFAADFSVLRARARGAQQRYKSLTIYSLPAQSTKPASAELSVLDNTNRDDIHKHTDDLVELIDFDAPKQFKVVAILGFAGVGKTTLARRLYDKYGARFEYCAFVRVSRNPDLRRLLISMLSQIKGERAHVFSDVHDLLDNINGHLQQKRYLIVIDDLWASITWDMISRALPRDNDYSRIIITTQTEDVAMGCCSYDSRDVFKIRPCNYLQSCGEPFETTIMVDNLLRHNLTEAQPWHLQISLLSGLRTNPTSEGMKELLDHIYGSLPHHLKTCLLHFNMYPEDYTIKKDDLVKQWVAEGFIGEVNEQDRFKVAEGYFHELTRRGLIQEVDTNYNNDELPCTVHHIVMDFIRYKSEEESFISIADYLQTTPGNPDRIRRLSVQFGGSKGAKIPGSVRMSQLRSLAYFGFFNCVPSIAEYILLRVLILHVWADKDKTNFDLSSIQELFRLRYLKIACNVSVKLPTKIRWLQYLETLDIDARVVNFPSDIVHLKHLLHLRLPREINMPREIDKMTSLCSLAYFQLSRDSVLNLGKLANLQDLHLICYKVKSDRLVVIMKSLGSIMEKFSKLKTLVLDAGASTMGILCD |
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| Function | Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R8L1] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsZS97_11G0435100 | OsZS97_11T0435100.1 | Chr11 | 30870852 | 30887079 | + | makerRMon | ||
| CDS seq | ATGGACGAGGAGGGAGAGCTGCCGCCTAGATATTCAGATCCAGTATATTCAGGCGGAAATCCTGGTAATCACGGCGGGCACGGAGGCGGAGATTGTCTTCAGGAGGAGATGGAATTTTCGGCTTCCGATACGCACGGGGGTGGAGATGGAGGAGATGAGGAGGCGATGGATGCTACTGTAACTGTTTCGCACGGCGGGATGGGCCGTCTCCTCCGGCAACTCCGGTCATTAAAGGCTACCAGTATCGATGGTGTCATTGACGAGAAAGACTTGCAGACTTTCAAAGATATTCTCGAGAGATTATGCGGCAAGCTCAAGCATCTGGCGGAGGTGGAGAGCCCTAGTTACACGGCCAAGGGCTGGATGGAGGAGATGCGGAACCTTTGCTATGACACCGAGGACTACTTGGACAAAGTTACGCAATCCGCCGCCGATGTAGGTGAAAGTGATCTGATTAAGGCTCATCATCGAGGTAAGCCGAAGCGACAACGTCAGTTTGCTGCAGATTTCTCAGTATTAAGGGCCCGTGCAAGGGGTGCGCAACAGAGATATAAAAGTCTTACCATATATAGCCTTCCGGCACAATCCACCAAACCGGCTTCTGCTGAACTCTCTGTCCTGGATAATACTAACCGTGATGATATCCATAAACATACTGATGATCTTGTAGAGCTGATCGATTTCGATGCCCCGAAACAATTCAAGGTGGTGGCTATCCTTGGATTTGCAGGTGTTGGCAAAACAACATTAGCCAGAAGATTATATGATAAATATGGGGCGCGGTTCGAATACTGCGCTTTTGTACGGGTGTCCAGAAATCCCGATTTGAGAAGATTACTCATCAGCATGCTCTCACAAATTAAGGGGGAACGGGCCCATGTCTTTTCTGATGTGCATGATCTGCTCGACAATATCAACGGACATCTACAACAAAAGAGGTATTTGATTGTAATCGATGATTTATGGGCCTCTATAACATGGGATATGATTAGCCGTGCTTTACCGAGGGATAATGATTACAGCAGAATAATAATAACCACACAAACTGAGGATGTAGCGATGGGATGCTGTAGTTATGATTCAAGGGATGTATTTAAGATACGACCATGTAATTACCTTCAATCCTGTGGAGAACCTTTCGAAACTACGATAATGGTAGACAATTTGTTGCGACACAATCTTACGGAGGCGCAACCTTGGCATCTACAAATCTCCCTACTGTCAGGTTTAAGGACCAATCCTACTTCCGAAGGGATGAAAGAACTTCTAGACCATATCTACGGTAGTCTTCCACACCATTTGAAGACATGCTTGCTACATTTTAATATGTATCCGGAGGACTACACGATCAAGAAGGATGATTTGGTGAAGCAATGGGTAGCTGAAGGGTTTATTGGTGAAGTAAATGAGCAAGACAGGTTCAAGGTTGCTGAAGGATATTTTCATGAACTTACAAGGAGAGGATTGATCCAAGAAGTTGATACCAATTATAATAATGATGAGTTGCCATGTACAGTTCATCACATCGTGATGGACTTTATTAGGTACAAATCCGAGGAGGAGAGTTTCATCAGTATTGCCGACTATCTTCAAACAACACCAGGCAATCCTGACAGGATTCGTCGATTGTCCGTCCAGTTTGGAGGTTCAAAAGGTGCAAAGATACCAGGAAGCGTCAGAATGAGCCAACTTCGGTCACTTGCATATTTTGGATTCTTCAATTGTGTACCTTCCATTGCAGAGTATATCCTCCTGCGAGTTCTGATTCTTCATGTTTGGGCTGATAAAGACAAGACAAATTTTGACCTCTCCAGCATTCAAGAACTATTTCGACTGAGATATCTGAAGATTGCATGTAATGTTAGCGTCAAGCTTCCAACAAAGATTCGATGGTTACAATACTTGGAGACTCTGGATATTGATGCAAGAGTAGTAAATTTTCCCTCAGATATCGTTCATTTGAAGCATTTGTTGCACCTCCGCCTTCCACGTGAGATTAATATGCCCCGCGAGATCGATAAGATGACATCGCTTTGCAGTTTAGCGTATTTTCAGCTCTCAAGAGACAGTGTGTTGAACCTTGGCAAGCTGGCCAATTTACAGGATCTCCATCTAATCTGTTATAAAGTAAAATCTGATCGTTTGGTTGTTATCATGAAAAGTCTTGGATCTATCATGGAGAAATTCAGCAAACTCAAAACTCTAGTTCTAGATGCTGGTGCTTCAACAATGGGCATTCTCTGTGATG
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|||||||
| Protein seq | MDEEGELPPRYSDPVYSGGNPGNHGGHGGGDCLQEEMEFSASDTHGGGDGGDEEAMDATVTVSHGGMGRLLRQLRSLKATSIDGVIDEKDLQTFKDILERLCGKLKHLAEVESPSYTAKGWMEEMRNLCYDTEDYLDKVTQSAADVGESDLIKAHHRGKPKRQRQFAADFSVLRARARGAQQRYKSLTIYSLPAQSTKPASAELSVLDNTNRDDIHKHTDDLVELIDFDAPKQFKVVAILGFAGVGKTTLARRLYDKYGARFEYCAFVRVSRNPDLRRLLISMLSQIKGERAHVFSDVHDLLDNINGHLQQKRYLIVIDDLWASITWDMISRALPRDNDYSRIIITTQTEDVAMGCCSYDSRDVFKIRPCNYLQSCGEPFETTIMVDNLLRHNLTEAQPWHLQISLLSGLRTNPTSEGMKELLDHIYGSLPHHLKTCLLHFNMYPEDYTIKKDDLVKQWVAEGFIGEVNEQDRFKVAEGYFHELTRRGLIQEVDTNYNNDELPCTVHHIVMDFIRYKSEEESFISIADYLQTTPGNPDRIRRLSVQFGGSKGAKIPGSVRMSQLRSLAYFGFFNCVPSIAEYILLRVLILHVWADKDKTNFDLSSIQELFRLRYLKIACNVSVKLPTKIRWLQYLETLDIDARVVNFPSDIVHLKHLLHLRLPREINMPREIDKMTSLCSLAYFQLSRDSVLNLGKLANLQDLHLICYKVKSDRLVVIMKSLGSIMEKFSKLKTLVLDAGASTMGILCD
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 2.5612015 | 0.070775 | 0.0102995 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0686400 | SBH | 0.830266 | 0.567043 | 0.670688 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g45924 | SBH | 0.620005 | 0.443831 | 0.108706 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0686400 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0024380 | SBH | 0.099646 | 2.008879 | 0.759783 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0024210 | SBH | 0.198599 | 2.936731 | 2.884382 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0023890 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0023680 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0024240 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0427200 | RBH | 6.6683825 | 128.104786 | 0.2345625 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0024450 | SBH | 0.156799 | 0.040792 | 0.934761 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_12G0338700 | SBH | 0.8979755 | 3.9494195 | 1.665244 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0024000 | RBH | 0.841491 | 0.217777 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0023990 | RBH | 1.229021 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0023740 | SBH | 2.832259 | 19.498186 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0023720 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0024030 | SBH | 0.085596 | 5.207169 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G022860 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0024020 | RBH | 1.496225 | 0.0 | 5.879279 |
