Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsZS97_06G0317000 OGI:06007290 | 16/16 Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU Chr06:22440648-22491092
Gene Symbol RCS3, rcs3, OsOASTL-A1, OASTL-A1, -
DNA seq

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ATGACCGTTGGATATGCAAGAGATCGTCAAGTCTTGCTCGGGAGTCACAGACCAGCGGAGAGAGACTCTCTCTCTCTCCATCAGGCGTTAACTGAGCTCGTACGGCCGGCGCTGGCGAAGAAGGCGACGGAAGAAGATATCACCGAATTCCACAGGATAAATGCCGCTTTCTGCAGCAGCTGGGTTGAGATGGGGGAAGAAATCAAGAACGGAGAGGAGGGACCAGACATGGCTGCACCGGGCGAGGAGGAGCAGGAGCAGGGGAGGAAAGGCATCCCGTCTCTGCTCTCCTCCAGGGAGGAGAACATCGCCTCTAACATCACTCAGCTGATTGGATGGACACCGCTTGTTGAGATGAAGAACATCGCGAAGAACGAAGGCGTACAGGCTCGATTGGTTGGGAAGATGGAAGCATACCAGCCACTCTGCTCTGTCAAGGACAGGAGTGCCCTCAGAATGATTGAAGATGCAGAGGAGAAAGGGTTGATCACACCTGGTGTTACCACGCTGATTGAGCCAACGAGTGGTAATCTCGGTATCGGTTTGGTGCTGGTTGCTGTTCAGAAAGGCTACAGGTTTATTGCTGTCATGCCTGCTAAATATTCGCTTGACAAGCAGATGCTACTGAGGTTTTTGGGTGCTGAATTGATATTGACAGATCCTGCAATTGGGTTTAATGGTATGATGGACAAGGTGGAAGAGCTCATGAAGAGCATACCAAATTCTCATTGTCTCAATCAAGTAACAAACCCAGCAAATCCAGAGGCACACTTTATGTGGACTGGACCTGAAATATGGAAAGACACAGCCGGCAAAGTGGATGTGTTTGTGGCCTCTGTTGGTTCAGGTGGCACATTGACAGGTGTAGGGAGGTATCTGAAGATGAAAAATCCATCTATAAATATTGTGTGCGTGGAACCTTCAGAAAGCCCTGTAATTTCAGGTGGTTCACCAGGGCCACACAAGATTCAAGGCACTGGGGCAGGTTTCATACCTGAAATTTTGGACAAATCTGTCATCGATGAAGTAGTGACAGTAAACACAGAGGAATCCATGGCAATGGCGAGGAGGCTGGCGAAGGAGGAAGGATTGCTTGTTGGCATATCTTCTGGTGCAAATGTAGCTGCTTGCATCAAGATTGCAGACAGAGAGGAGAACAAGGGGAAAATGATTGTGACAATGTTCCCGAGCGGCGGTGAAAGATACATGAACTCTGATCTCTTTGCACCTTTAGTGGAAACAATGGCGATGGCGGCTGCGGCGGTGGAGGTGGAAGAGGGGAGGACGGGGATCCCTTCTCTGCTGCGGCTCTCCGCCGTGGGGGAGGAGGCCATCGCCTCCAATGTCGCTCAGCTGATAGGCTGGACGCCACTGATTGAGATGAAGAACATCGCCAAGAAAGAAGGCATCCAAGCTCGTTTGGTTGGAAAGATGGAAGCATACCAACCCCTTTTCTCGGTCAAGGACAGAACTGCTCTCGGTATGGTTGAAGATGCAGAGGAGAAAGGCTTGATTACACCTGGTGTTACGACGCTGATTGAACCAACTGGTGGTAATCTTGGTACCGGTTTGGTATTGGTTGCTATTCAGAGAGGCTACAGGTTCATTGCTGTTATGCCTGCTGGATATTCACTTGACAAGCAGATGCTACTGAGGTTTTTGGGTGCTGAAGTGATATTAACAGATCCTGCAGGTGGATTCAAGGGTATGATGGACAAAGTGGAAGAGCTCACCAAGGTCATGCCAAATTATCACTGTTTTAACCAATCAATTAACCCAGCGAACCCAGATGCACACTTCAAATGGACTGGACCTGAGATCTGGAAGGATACAGCCGGCAAAGTTGATATCTTTGTAACCGCCGCTGGAACAGGGGGCACACTGTCAGGTGTAGGAAGGTACCTGAAGATGAAAAATCCATCTATAAATATAGTGTGCGTGGAACCTTCAGAAAGCGCTCATCGGAGGGAAGAGGTCCAAACCTGCAAGCCTGCATACTGCCTCATCTCAAGTCCTCATCACCTTCATCGGTGCCTCCTACTGCTTGGGCTCTGCCAGTCCGGAAGAGCAGTGGCAGTCGGCGTGAAAGCAGGAGGTGGGAGCACGGGGGCAGCGACGGACGGGCCGACCGGCGGCTGGCTCCTCTTCTCCCCACCTCAGCCCCAGCTCTGTCCTCTCTGGCGGTGCTTGGTTGGAGTGGAGGTTGTCCGAATAGCTTCTCGATCCCAACGGAGGAGCCGAGAAAGGAGAGCAGCTCTTCGTTCTGGAGGAATCGTCGTGGTGATCTGGATATGGCGAGGCGGCGCGCCGAGATATAGGGATGGGGGATCACACGGCTATGTGGCCACGGACGACGGGCGACAGCGACGAACCGTGGACGGCGGAGTAGTCGCGGGGCTGGGGAGTAGACAGCGGCGACACACAGATCCGAGGCGGCGACGGCCGCGTGTGAGGAAGTGGTGGGGTAGAGCGAGCGGCTCCGGCAGGTGCGCGCGCGGGGCGGTGGCGCACCATTGCTTGATTGATTCAGGTGGTTCACCAGGTTTTCACAAGATTCAAGGCACTGGGCCAGGTTTCATACCGGAAAATTTGGATAGATCTATCATCGATGAAGTTGTGACCGTAAGCTCGGAGGAATCCATAACAATGGCCAGAAGGCTTGCAAAGGAGGAGGGGCTGCTTGTTGGCATATCTTCTGGTGCAAATGTGTCTGCTTGCATCAAGATTGCAGCTAGAGAGGAGAACAAGGGTAAGATGATTGTTACAATGCTGCCGAGTGGGGGTGAAAGATACATGAACTCTGATCTCTTTGCAGATGTAAGGGAGGAATGTGCTAATATGACCTTCTAA

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 4.2233925 2.004298 3.8527105

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0564700 RBH 0.0 0.0 0.786706
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g36830 RBH 0.419790 0.000000 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0564800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0019750 RBH 3.204084 6.071916 6.053240
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_06g0019630 RBH 2.389735 2.608440 6.487336
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0019690 RBH 5.986929 6.079491 15.584403
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_06g0019460 RBH 0.845020 0.063212 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0019890 RBH 23.270489 0.500802 29.218830
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_06G0342300 RBH 13.653495 4.1981005 2.8100225
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0019360 RBH 1.876882 0.087896 2.189108
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0118100 RBH 0.17198 7.645266 0.102741
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0019810 RBH 0.301598 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0019800 RBH 3.747961 2.069201 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0019430 RBH 23.203489 0.756957 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_06g0020140 RBH 0.000000 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0019590 RBH 1.207079 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G019490 RBH 1.012165 0.000000 1.169915
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0019690 RBH 0.0 0.0 0.0
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