Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsNaBo_11g0024450 | OGI:11010520 | 16/16 | NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:30296012-30312088 | ||||||||
Gene Symbol | WAK3 | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MAQGVMLWYDLHALAAAVGPLLLVSSVLVATSSTAANCGRKCGDVRIPYPFGIGVDCAWPGFHVSCNHSFTPPRPYLYNIEIKDISVEAGEMRVYTDVVSNCYTSYNTTEYVTTSSQVDLGTPFLFARSRNEFTAIGCGAIAFLRGRDDASYSTGCITTCASLEEAAHDGDDCTGLGCCQVPSIPPNLSVLNFSFGSGSMIGNPAWRESPCSYAFVSEKGWGNGSCPSTAGEVAPACISAHSECANVTNGEGYLCNYINECKQNPCRDGTCYDLEAIICAVAILSIVLIFLRMEHEKKKLEDTFKKNGGELLKNIGIKTFTKKEISKITDRYGTFLGNGAFGKVYRGTIDNNQHVAVKRPNTFDEVRREDFANEVVIQSYISHKNIVRLVGCCLETKIPMLVFEYVPKGSLQDVLHGNKKINIEKQPLSLQARLAIAIESADALAYMHSSANQNIVLHGDVKSGNILLDNNFMPKVSDFGISRLISIQKHHTSFVIGDMNYMDPVYMKTGMLTEKSDVYSFGVVLLELITRKKPRYDENNSLPINFVKYYMTDSRAREMFDDEIKSPEVNIDCLDMIGKIAVQSLKDDVEERPTMKQVLEHLNLCGDVRIPYPSGIGVDCAWPGFHRSRTSRWRQGISKSFVNRTGDTSVPTVLDWAIRGNGSCSSPTGAPACVSAHSYCVNATNGEGYLCNCSEGYAGNPYCRWYFDNNGGRLLQGMGITIFSKKELENITQKESFEIGRGKFGKVYRGTHNNQPVAVECAITNIEARKGVLMKLINAFYCSKAAAPTPDGNAVVNEIKIHLQVQHTNLVRLIGCCMETENPQLVMEFLPNGSLGEILHRPDN |
||||||||||
Function | Wall-associated receptor kinase 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMN8] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsNaBo_11g0024450 | OsNaBo_11g0024450.01 | Chr11 | 30296012 | 30312088 | + | NAM | ||
CDS seq | atggcacaaggagtgatgctgtggtatgacctccatgctctggctgcagccgtggggccactgctactagtttcttctgtgctggtggctacgtcgtcgacggcggcgaactgcggcaggAagtgtggcgacgttcgcatcccctaCccgttcggcatcggcgtcgactgcgcctggccgggcttccacgtctcttgcaaccatagctttacccctcccagaCcctacttgtacaacatagagatcaaggacatctcggtggaggcaggggagatgcgcgtgtacactgacgtcgTgtccaactgctatacttcgtacaataccaccgaatacgtaacgacctcctcgcaggtcgacctcggtacgccgttcctgTttgcgcggagcaggaacgagttcacggccatcggctgtggcgcgattgcgTttctacggggcagggacgatgcgagctactcgaccggctgcatcacgacgtgcgcgagcttggaggaggccgcccacgacggtgacgactgcacggggctgggttgctgccaGgtgccctccatcccacccaaccttagcgtcttaaacttttccttcggctccggaagcatgatcggcaaccctgcttggagagagagcccgtgtagctacgcattcgtgtccgagaaaggctggggaaatgggtcgtgcccgtcaactgcaggagaggttgctcctgcttgtatcagcgcacatagtgagtgcgccaacgtcaccaacggagaggggtacctctgcaattatattaacgaatgcaagcAaaatccatgccgtgatgggacatgttatgacctcgaagcaataatatgtgccgtcgcaaTtttgtccatcgtactcattttcttgcgcatggaacatgagaagaagaagcttgaagatactttcaaaaaaaatggtggtgaacttctgaaaaacatTggtataaagacattcacgaagaaggaaataagcaaaatcacagatcgctatggCActttccttggaaacggtgccttcggtaaggtctataggggaactattgacaaCaaccaacatgttgcagtgaagcgccccaatacgtttgatgaggtacgtagagaagattttgcaaatgaggtcgtcattcaatcttatatcagtcacaagaacatagttagacttgtgggctgttgtttggagacaaagaTtccgatgctggtcttcgagtacgtcccaaaaggaagccttcaagatgtgcttcatggtaacaagaagatcaatattgaaaagcaacctctctcactacaagcacgtttagcaattgctattgaatctgcagatgctctagcctacatgcactcatcggctaatcaaaatattgtccttcatggagatgtgaagtctggcaacattctCctagataacaacttcatgccaaaggtctcggactttggaatatctagactcatatctatacagaaacaccacacttcatttgtcataggggatatgaactatatggatCctgtttatatgaagactggaatgcttactgagaagagtgatgtgtatagctttggagttgtactcttggaactaattaccaggaaaaaaccaagatatgatgaaaataacagcctcccaataaactttgtgaagtattacatgactgatagcagggcaagggagatgttcgatgatgagatcaagtctcctgaagtcaacattgactgtcttgacatgattggtaagattgcagttcaatccctcaaggatgatgtggaagagaggCccaccatgaagcaagttttggagcaccttaatttgtgtggcgacgtgcgcatCccctacccgtccggcatcggcgtcgactgcgcctggccgggcttccacagatcaaggacatctcgctggaggcaggggatcagcaagagcttcgtcaaccgtactggagatacaagtgtcccaacagtgcttgactgggccatcaggggaaatggatcgtgctcatcaccaacaggggctcctgcctgtgtcagcgCccatagctactgtgtaaacgctaccaacggcgaggggtacctctgcaactgttccgaagggtacgccggcaatccctattgtagatggtacttcgataataacggtggccgactgctgcaaggtatgggcattaccatcttctcaaagaaagagctagaaaatataacacaaaaggagagcttcgagatcgggaggggcaaattcggcaaggtgtatagaggaacccacaacaaccagccggttgcggtcgagtgcgccatcacaaatattgaggcgcgcaaaggcgtgttgatgaagctaataaacgccttttattgctcaaaagctgcagcaccaacgcctgatggaaacgcggttgtgaatgagataaagatccacctacaggtccagcacaccaatttggttcgcctcattgggtgctgcatggagacagagaatCcccagctcgtgatggagttcctccccaatggaagcctcggggagatactccaccgacccgacaattag
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Protein seq | MAQGVMLWYDLHALAAAVGPLLLVSSVLVATSSTAANCGRKCGDVRIPYPFGIGVDCAWPGFHVSCNHSFTPPRPYLYNIEIKDISVEAGEMRVYTDVVSNCYTSYNTTEYVTTSSQVDLGTPFLFARSRNEFTAIGCGAIAFLRGRDDASYSTGCITTCASLEEAAHDGDDCTGLGCCQVPSIPPNLSVLNFSFGSGSMIGNPAWRESPCSYAFVSEKGWGNGSCPSTAGEVAPACISAHSECANVTNGEGYLCNYINECKQNPCRDGTCYDLEAIICAVAILSIVLIFLRMEHEKKKLEDTFKKNGGELLKNIGIKTFTKKEISKITDRYGTFLGNGAFGKVYRGTIDNNQHVAVKRPNTFDEVRREDFANEVVIQSYISHKNIVRLVGCCLETKIPMLVFEYVPKGSLQDVLHGNKKINIEKQPLSLQARLAIAIESADALAYMHSSANQNIVLHGDVKSGNILLDNNFMPKVSDFGISRLISIQKHHTSFVIGDMNYMDPVYMKTGMLTEKSDVYSFGVVLLELITRKKPRYDENNSLPINFVKYYMTDSRAREMFDDEIKSPEVNIDCLDMIGKIAVQSLKDDVEERPTMKQVLEHLNLCGDVRIPYPSGIGVDCAWPGFHRSRTSRWRQGISKSFVNRTGDTSVPTVLDWAIRGNGSCSSPTGAPACVSAHSYCVNATNGEGYLCNCSEGYAGNPYCRWYFDNNGGRLLQGMGITIFSKKELENITQKESFEIGRGKFGKVYRGTHNNQPVAVECAITNIEARKGVLMKLINAFYCSKAAAPTPDGNAVVNEIKIHLQVQHTNLVRLIGCCMETENPQLVMEFLPNGSLGEILHRPDN
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0690332 | RBH | 1.591448 | 1.521705 | 0.750162 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g46850 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0690332 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0024570 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0024510 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0024020 | SBH | 0.0 | 1.132013 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0023920 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0024380 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0443700 | SBH | 0.0665605 | 0.0833025 | 0.0615995 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0024710 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0441600 | SBH | 0.041969 | 0 | 0 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0024620 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0024690 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0023960 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0023810 | SBH | 2.759746 | 0.0 | 0.221914 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0024220 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G024230 | RBH | 0.600835 | 0.0 | 0.000000 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_12g0017010 | SBH | 0.0 | 1.264426 | 0.502127 |