Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsN22_11G024230 | OGI:11010520 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:30970796-30986997 | ||||||||
| Gene Symbol | WAK3 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MAQGVMLWYDLHALAAAVGPLLLVSSVLVATSSTAANCGRKCGDVRIPYPFGIGVDCAWPGFHVSCNHSFTPPRPYLYNIEIKDISVEAGEMRVYTDVVSNCYTSYNTTEYVTTSSQVDLGTPFLFARSRNEFTAIGCGAIAFLRGRDDASYSTGCITTCASLEEAAHDGDDCTGLGCCQVPSIPPNLSVLNFSFGSGSMIGNPAWRESPCSYAFVSEKGCVPTVLDWAIRGNGSCPSTAGEVAPACISAHSECANVTNGEGYLCNYINECKQNPCRDGTCYDLEAIICAVAILSIVLIFLRMEHEKKKLEDTFKKNGGELLKNIGIKTFTKKEISKITDRYGTFLGNGAFGKVYRGTIDNNQHVAVKRPNTFDEVRREDFANEVVIQSYISHKNIVRLVGCCLETKIPMLVFEYVPKGSLQDVLHGNKKINIEKQPLSLQARLAIAIESADALAYMHSSANQNIVLHGDVKSGNILLDNNFMPKVSDFGISRLISIQKHHTSFVIGDMNYMDPVYMKTGMLTEKSDVYSFGVVLLELITRKKPRYDENNSLPINFVKYYMTDSRAREMFDDEIKSPEVNIDCLDMIGKIAVQSLKDDVEERPTMKQVLEHLNLCGDVRIPYPSGIGVDCAWPGFHRSRTSRWRQGISKSFVNRTGDTSVPTVLDWAIRGNGSCSSPTGAPACVSAHSYCVNATNGEGYLCNCSEGYAGNPYCRWYFDNNGGRLLQGMGITIFSKKELENITQKESFEIGRGKFGKVYRGTHNNQPVAVECAITNIEARKGVLMKLINAFYCSKAAAPTPDGNAVVNEIKIHLQVQHTNLVRLIGCCMETENPQLVMEFLPNGSLGEILHRPDN |
||||||||||
| Function | Wall-associated receptor kinase 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMN8] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_11G024230 | OsN22_11G024230_01 | Chr11 | 30970799 | 30986997 | + | NAM | ||
| CDS seq | ATGGCACAAGGAGTGATGCTGTGGTATGACCTCCATGCTCTGGCTGCAGCCGTGGGGCCACTGCTACTAGTTTCTTCTGTGCTGGTGGCTACGTCGTCGACGGCGGCGAACTGCGGCAGGAAGTGTGGCGACGTTCGCATCCCCTACCCGTTCGGCATCGGCGTCGACTGCGCCTGGCCGGGCTTCCACGTCTCTTGCAACCATAGCTTTACCCCTCCCAGACCCTACTTGTACAACATAGAGATCAAGGACATCTCGGTGGAGGCAGGGGAGATGCGCGTGTACACTGACGTCGTGTCCAACTGCTATACTTCGTACAATACCACCGAATACGTAACGACCTCCTCGCAGGTCGACCTCGGTACGCCGTTCCTGTTTGCGCGGAGCAGGAACGAGTTCACGGCCATCGGCTGTGGCGCGATTGCGTTTCTACGGGGCAGGGACGATGCGAGCTACTCGACCGGCTGCATCACGACGTGCGCGAGCTTGGAGGAGGCCGCCCACGACGGTGACGACTGCACGGGGCTGGGTTGCTGCCAGGTGCCCTCCATCCCACCCAACCTTAGCGTCTTAAACTTTTCCTTCGGCTCCGGAAGCATGATCGGCAACCCTGCTTGGAGAGAGAGCCCGTGTAGCTACGCATTCGTGTCCGAGAAAGGCTGTGTCCCAACTGTACTTGACTGGGCCATCAGGGGAAATGGGTCGTGCCCGTCAACTGCAGGAGAGGTTGCTCCTGCTTGTATCAGCGCACATAGTGAGTGCGCCAACGTCACCAACGGAGAGGGGTACCTCTGCAATTATATTAACGAATGCAAGCAAAATCCATGCCGTGATGGGACATGTTATGACCTCGAAGCAATAATATGTGCCGTCGCAATTTTGTCCATCGTACTCATTTTCTTGCGCATGGAACATGAGAAGAAGAAGCTTGAAGATACTTTCAAAAAAAATGGTGGTGAACTTCTGAAAAACATTGGTATAAAGACATTCACGAAGAAGGAAATAAGCAAAATCACAGATCGCTATGGCACTTTCCTTGGAAACGGTGCCTTCGGTAAGGTCTATAGGGGAACTATTGACAACAACCAACATGTTGCAGTGAAGCGCCCCAATACGTTTGATGAGGTACGTAGAGAAGATTTTGCAAATGAGGTCGTCATTCAATCTTATATCAGTCACAAGAACATAGTTAGACTTGTGGGCTGTTGTTTGGAGACAAAGATTCCGATGCTGGTCTTCGAGTACGTCCCAAAAGGAAGCCTTCAAGATGTGCTTCATGGTAACAAGAAGATCAATATTGAAAAGCAACCTCTCTCACTACAAGCACGTTTAGCAATTGCTATTGAATCTGCAGATGCTCTAGCCTACATGCACTCATCGGCTAATCAAAATATTGTCCTTCATGGAGATGTGAAGTCTGGCAACATTCTCCTAGATAACAACTTCATGCCAAAGGTCTCGGACTTTGGAATATCTAGACTCATATCTATACAGAAACACCACACTTCATTTGTCATAGGGGATATGAACTATATGGATCCTGTTTATATGAAGACTGGAATGCTTACTGAGAAGAGTGATGTGTATAGCTTTGGAGTTGTACTCTTGGAACTAATTACCAGGAAAAAACCAAGATATGATGAAAATAACAGCCTCCCAATAAACTTTGTGAAGTATTACATGACTGATAGCAGGGCAAGGGAGATGTTCGATGATGAGATCAAGTCTCCTGAAGTCAACATTGACTGTCTTGACATGATTGGTAAGATTGCAGTTCAATCCCTCAAGGATGATGTGGAAGAGAGGCCCACCATGAAGCAAGTTTTGGAGCACCTTAATTTGTGTGGCGACGTGCGCATCCCCTACCCGTCCGGCATCGGCGTCGACTGCGCCTGGCCGGGCTTCCACAGATCAAGGACATCTCGCTGGAGGCAGGGGATCAGCAAGAGCTTCGTCAACCGTACTGGAGATACAAGTGTCCCAACAGTGCTTGACTGGGCCATCAGGGGAAATGGATCGTGCTCATCACCAACAGGGGCTCCTGCCTGTGTCAGCGCCCATAGCTACTGTGTAAACGCTACCAACGGCGAGGGGTACCTCTGCAACTGTTCCGAAGGGTACGCCGGCAATCCCTATTGTAGATGGTACTTCGATAATAACGGTGGCCGACTGCTGCAAGGTATGGGCATTACCATCTTCTCAAAGAAAGAGCTAGAAAATATAACACAAAAGGAGAGCTTCGAGATCGGGAGGGGCAAATTCGGCAAGGTGTATAGAGGAACCCACAACAACCAGCCGGTTGCGGTCGAGTGCGCCATCACAAATATTGAGGCGCGCAAAGGCGTGTTGATGAAGCTAATAAACGCCTTTTATTGCTCAAAAGCTGCAGCACCAACGCCTGATGGAAACGCGGTTGTGAATGAGATAAAGATCCACCTACAGGTCCAGCACACCAATTTGGTTCGCCTCATTGGGTGCTGCATGGAGACAGAGAATCCCCAGCTCGTGATGGAGTTCCTCCCCAATGGAAGCCTCGGGGAGATACTCCACCGACCCGACAATTAG
More
|
|||||||
| Protein seq | MAQGVMLWYDLHALAAAVGPLLLVSSVLVATSSTAANCGRKCGDVRIPYPFGIGVDCAWPGFHVSCNHSFTPPRPYLYNIEIKDISVEAGEMRVYTDVVSNCYTSYNTTEYVTTSSQVDLGTPFLFARSRNEFTAIGCGAIAFLRGRDDASYSTGCITTCASLEEAAHDGDDCTGLGCCQVPSIPPNLSVLNFSFGSGSMIGNPAWRESPCSYAFVSEKGCVPTVLDWAIRGNGSCPSTAGEVAPACISAHSECANVTNGEGYLCNYINECKQNPCRDGTCYDLEAIICAVAILSIVLIFLRMEHEKKKLEDTFKKNGGELLKNIGIKTFTKKEISKITDRYGTFLGNGAFGKVYRGTIDNNQHVAVKRPNTFDEVRREDFANEVVIQSYISHKNIVRLVGCCLETKIPMLVFEYVPKGSLQDVLHGNKKINIEKQPLSLQARLAIAIESADALAYMHSSANQNIVLHGDVKSGNILLDNNFMPKVSDFGISRLISIQKHHTSFVIGDMNYMDPVYMKTGMLTEKSDVYSFGVVLLELITRKKPRYDENNSLPINFVKYYMTDSRAREMFDDEIKSPEVNIDCLDMIGKIAVQSLKDDVEERPTMKQVLEHLNLCGDVRIPYPSGIGVDCAWPGFHRSRTSRWRQGISKSFVNRTGDTSVPTVLDWAIRGNGSCSSPTGAPACVSAHSYCVNATNGEGYLCNCSEGYAGNPYCRWYFDNNGGRLLQGMGITIFSKKELENITQKESFEIGRGKFGKVYRGTHNNQPVAVECAITNIEARKGVLMKLINAFYCSKAAAPTPDGNAVVNEIKIHLQVQHTNLVRLIGCCMETENPQLVMEFLPNGSLGEILHRPDN
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|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_11G024230 | OsN22_11G024230_02 | Chr11 | 30970796 | 30975549 | + | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGGAGCCAAAAGTGTCCCAACTGTACTTGACTGGGCCATCAGGGGAAATGGGTCGTGCCCGTCAACTGCAGGAGAGGTTGCTCCTGCTTGTATCAGCGCACATAGTGAGTGCGCCAACGTCACCAACGGAGAGGGGTACCTCTGCAATTGTTCCACGGGATACGCCGGCAATCCCTATGTCATCGGCGGAT |
|||||||
| Protein seq | MEPKVSQLYLTGPSGEMGRARQLQERLLLLVSAHIVSAPTSPTERGTSAIVPRDTPAIPMSSAD |
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| A3 | Chr11 | 30971487 | 30972110 | + | OsN22_11G024230_02 | OsN22_11G024230_02,OsN22_11G024230_01 | All |
| A5 | Chr11 | 30972246 | 30973889 | + | OsN22_11G024230_02 | OsN22_11G024230_02,OsN22_11G024230_01 | All |
| A5 | Chr11 | 30973945 | 30974192 | + | OsN22_11G024230_02 | OsN22_11G024230_02,OsN22_11G024230_01 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.600835 | 0.0 | 0.000000 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0690332 | RBH | 1.591448 | 1.521705 | 0.750162 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g46850 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0690332 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0024570 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0024450 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0024020 | SBH | 0.0 | 1.132013 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0023920 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0024380 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0443700 | SBH | 0.0665605 | 0.0833025 | 0.0615995 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0024710 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0441600 | SBH | 0.041969 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0024620 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0024690 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0023960 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0023810 | SBH | 2.759746 | 0.0 | 0.221914 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0024220 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G024240 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0024450 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
