Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLima_11g0024620 OGI:11010520 | 16/16 LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:30675031-30700578
Gene Symbol RLCK353, OsRLCK353, WAK123, OsWAK123, OsiWAK1, WAK1, WAK3, WAK121, OsWAK121, WAK122, OsWAK122
DNA seq

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Function Wall-associated receptor kinase 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q39191]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLima_11g0024620 OsLima_11g0024620.01 Chr11 30675031 30700578 + NAM
CDS seq

atggcacaaggagtgatgctgtggtatgatgatctcctagcagtattagtactttctgtgctggtggctacgtcgtcgacggcggcgaactgcggcaggaagtgtggcgacgtgcgcatccccttccctttcggcatcggcgtcgactgcgcctggccgggcttcgacctctcatgcaaccatagctttacccctcccaggccgtacacggggaacgtagagatcatggacatctcgctggaggcgggggagatgcgcatctatactcccgtgctgcaaaactgcttcgacttgtccaacaccagcagcagccccgacgtcgataacttgctcaacatcaccggcgggacgccgttccttatgtcgccggagaggaacgagttcacggccaccgggtgcgacacgctggggctgatgcacggcagggaggacgggagcttcttcaccggctgcgtcacgacgtgcgcgagcttggagacagccgccgacgacggtgacaactgcacggggcttggttgctgccaggtgcagtccatccctggaaaccttaccatacttgggatgacgctgtcggccaacatcaccgacaagaagattgctgcgtacaattttagtcggaaggatttcggttgctcaggcaacaagatatttgcaaaccgggacggcgagatggtcgtccctacggtgcttgactgggccatcaggggaacaaatgggtcatgctcggggtctgtagcccctgcctgcgtcagcgagcacagctactgcgccaatgccactaacggagatgggtatctctgcaagtgctccacgggatacgacggcaatccctatctcgaaagcaatattggcggatgcaaagcagatgccataacaccgagggtgattattattgcaaatgccgttttccacagacggaagAAaagaaggttcttcaacaacaatggtggccggttgctcaaggcgagtatggaaatcgacctcttcacggagaaagacataaacaagatgacaaagaataagaaaaccgatatcatcggagagggtgccttcggcacggtctacataggaacccacaagaaccagccggttgccgtcaagtactccaagggaaagcgcaaggccgcacggatgcataacaaagacattaagtgcatgaaccaaaatgtgttccaaaacgccttttgttggtccaaagttccatcctcgccagacaaagattcgtcgtcacgagtgtccggcccggagttcgtggacgagctaagggtccagtcacagatccagcacgaaaacgtggtcaccctccttgggtgctgcatggagacggaggaacccacgttgatccttgagtttatccctaacgggagcctcgagaaaatgcttcatgatgaccggcgccccctctcgctattgcaacgccttgacatagctatcggctccgcggaggctctctcctacatgcactcatcgtctcatcacaaaagcattgttcatggagatgtcaagccagccaacatcctccttgatgacaaactgaaccctaaggtctctgactttgggtcatctgagctcacattaaaattcaagcatgtgcgtgttgatatGaaatatgttgaccctctatgcatattgacaagcaagtatactatggagagtgatgtctacagctatggggtagtgctcctagagctcatcacccggaaaagggccaagtacgacgatgggagaagcctcccagtagaatttgtgaaacactacaaagacaacaacgaaaggaggaagatgtatgatcaggatatgttgtcgtctatggatgcactactgcagccttactgcacggagtgccttgacaggattgctgccattgcggtccgatgtctcaaaaacaaggtggacaagagaccaaccatggcggaggtggtcgaggagcttaagcagctgagagagcaaataagcacacatatctactggccagccatggcacaaggagtgatgctgtggtatgacgatctcctagcagtattagtactttctgtgctggtggctacgtcgtcgacggcggcgaactgcggcaggaagtgcggcgacgtgcgcatcccctacccgtttggcatcggcgtcgactgcgcctggccgggcttcgacgtctcttgcgaccatagcttcagccctcccagaccctactacggcaacatagagatcatggacatctcggtggcggcgggggagatgcgcgtctactcccccgtggtgtacggctgctatacctcgtacaataccaccgaatactataccagctccttgcaggacgacctccgcgatacgccgttcctgtttgcgcggagcaggaacgagttcacggccatcggctgtggcgcgattgcgtttctatggggcagggacgatgcgagctactcgaccggctgcatcacaacgtgtgcgagcttggatgaggccgcccacgacggtgacgactgcaccgggctgggttgctgccaggtgccttctatcccgcccaaccttaacatcttaaacatttccttcggccccggaagcatcatcggcaaccttgcctggaaagatagcccatgtagctacgccttcgtcgccgagcaaagctggtacaatttcagccgccaagatttcagtcgtgccggcagcaagagcttcgtcaaccgtactggagatagaagtgtcccaacagtgtttgactgggccatcaggagaaatggatcgtgctcatcagcaacaggagctcctgcctgtgtcagcgcccacagctcctgtgtaaacgctaccaacggcgaggggtacctctgcaaatgttccgcaggtatccaaccattgtgtgcagatattaatgagtgcgagcttaggagagaagggcctgccatgtatccctgttacagtggtagcagatgctatgacacagagggtggttacaagtgcaaatgccgatttctacatagaggagatggcaaaatcgacaagggatgcaaaccgataattccagcgaccgagcatcggaggcggcagcaaaatagatcattcgacaaaaatggtggcaacatactgaacaagatgatggacatcaaaatcttcagcgaagaggagctgaagaagatgacaaaaaactactgtgagaaaagaatgattgggaaaggctacttcggtgAggtttacaaggggatcacccaggacaaccagcaggttgctgtgaagcgctttgtcagaaacggtgaggagcatgacaaacaggatttcgcggatgagatcacgagccaggctcggatccaacatgagaatttggtccgtcttgtcgggtgctgtctgcatacggatgtgcccatgctggttctggagttcatccccaggggtagcctctatgatgtgcttcatggcaatggccggcatacgcatgatctcccgctaccaactcgcgtcgacatcgccgttggctgcgccgaagctttagcatgcatgcactctaacattggccacaaaagcgtcgtccatggggacgtcaagtccggcaatattcttcttggcaacaatctagagcccaaggtctctgactttggatcgtccaagctcatgtctgtcgccaagtctgataactggtccgtgatggctgacaagagctacatcgatcctgcctacatcaagacaggccgtttcacggagaagagcgacgtgtacagttttggagtcgtgctgctggaactcatcacccggaagaaagccttgtacgacgacagaaaaagcctcccgttaagctttgccaagtattacaaggacgactacgcgagaaggaacatgtacgaccaggacatgttgtcatcagccgatgatgctctgcggcctcgctacatggaatgcctcgacaggatggccaacattgcgattcggtgccttaaggaggatattgacgagaggccgaccatggcggaggcgctggaggagctcaagcagttgagtgcaagcctgaacctagtgctgctgtggcctgctactacgactgggcagcgggcggggtgcccgagcaggtgcggcgacgtcgacatccccttccctttcggcgtcggcgacgactgcgcatggccgggtccagatgacttcaccgtcacatgcaaccatagcttcagcccacccagaccctactttatattagtactttctgtgctggtggctacgtcgtcgacggcggcgaactgcggcaggaagtgcggcgacgtgcgcatcccctacccgtttggcatcggcgtcgactgcgcctggccgggcttcgacgtcgtctgcaaccatagctttaccccacccagaccctactacttggacatagagatcatggacaTctcggtggcggcgggggagatgcgcgtctacactcccgtggtctcccagtgctacaactcatccaacaccacggactctgacggattcgagttcttgcagctcaacatcaccggcacgccgttcctggtcgctccggagagaaacgagttcacggccatcggctgctacacattggcgtggctgcagggcagggacgactggagcttcttgaccggctgcatctcgacgtgcgcgagcttggaggaggccgcccacgacggtgaccgctgcacggggctgggttgctgccaggtgtcctccatcccgcccaaccttagcaccgtagcgctcgattggggcaaccgtactgaaaaccctgcgtggacatacagcccctgtaactacgccttcgtggctgagaaagactggtacgtaacccattctcaggctcatcagctctatttgagtcgtgttggcagcaagagctttgccaaccgtactggagagattagtgtccctatggtgcttgattgggccatcaggagaaatggatcgtgctcgtcagctcatgcctgtgtcagcgcacatagtgactgcgtcgacgccaccaacggcgcgggatacctctgcaattgttccaggggatacgccggcaatccctatgt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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0691400 RBH 1.234806 0.352146 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g46900 RBH 0.800670 0.491920 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0691500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0024570 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0024440 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0024030 RBH 0.0 49.671188 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0023910 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0024350 RBH 0.0 0.0 0.529382
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0443700 RBH 0.0665605 0.0833025 0.0615995
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0024710 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0441800 RBH 0.185166 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0024630 SBH 0.126129 0.029693 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0024740 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0024350 RBH 0.0 79.943008 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0023810 RBH 2.759746 0.0 0.221914
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0024250 RBH 0.0 51.140400 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G024260 RBH 0.078979 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0024470 RBH 0.0 1.171621 0.0
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