Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsNaBo_08g0006290 OGI:08015860 | 16/16 NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr08:6020663-6037054
Gene Symbol SHR5
DNA seq

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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGH2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsNaBo_08g0006290 OsNaBo_08g0006290.01 Chr08 6020663 6037054 + NAM
CDS seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 2.782911 17.499987 6.217990

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os08g10330 RBH 0.039552 0.302178 0.266092
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os08g0203600 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_08g0006650 SBH 2.053545 3.530581 8.296441
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_08g0006600 SBH 0.140585 1.337147 4.148973
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_08g0006720 RBH 1.894804 2.803652 8.249969
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_08g0006560 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_08g0006610 SBH 4.170760 1.612104 56.630119
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_08G0091400 SBH 10.8169235 14.028789 0.731616
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0006330 SBH 2.277794 0.190318 4.557525
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_08G0094100 SBH 7.2143315 14.259834 5.57544
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_08g0006250 SBH 0.020270 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_08g0006320 RBH 0.207751 5.179120 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_08g0006360 RBH 2.114534 3.288301 None
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N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_08G006440 RBH 1.226671 0.304876 1.482515
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0025890 SBH 5.244827 65.479820 3.933135
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