Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsNaBo_02g0004060 | OGI:02001240 | 16/16 | NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2889451-2898959 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK8, OsLRK8, OsPSKR1, PSKR1, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Receptor-like protein 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SHI4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsNaBo_02g0004060 | OsNaBo_02g0004060.01 | Chr02 | 2889451 | 2898959 | - | NAM | ||
| CDS seq | atgaagaacttaaagaatctcactgtcttgctactcggtggcaacttcatgcatgaagctatgccagaggatgaaaccaccttgcccaatctgaaaattttagatttatcttcaaattaCttcattggcacaattccagaaagcatctactcatgcagtaAtttgacttggttgcggctatccacaaacaagcttcatggagagttgacaaagaaaatagaaaatttgaagtccatcaccttcatatctCtttcctacaacaattttaaaaatatTacaaatacactccacatactgaagaacttaaagaatctcactgtcttgctactcggtggcaacttcatgcatgaagctatgccagaggatgaaacaattgatggttttaagaatattcagggtctcggcataaatgattgtgcactgactggaaaaatacctaattggctatcaaagctcagaagtttgcaacttttagcattatataacaatcaactcagtggaccaataccaacctggatcagtagccttaacttccttaagtatgttgacatatcgaataatagcctcactggagaaataccaacagcattgatgcagatgccaatgctaaaatcggacaagattgaagatcaccctgacctaatagtctccccttttacagtttatgtgggcgcatgtttgtGttttcagtaccgtgcgactagtgcattcccaaaaatgttgaatctaggtaacaacaaattaagtggtgtgatccccatggagattggtcagttgaaagaactgctttcactcaacttgagcttcaacaacttaaacggggagatcccacaagcgatcagcaacctcaagaatctgatggtgctagacctgtcttccaaccatctgacaggtccaatcccatcagggctggtgaaccttcattTcctttctgaattcaAtgtttcctacaatgaccttgaagggcctgtaccaattggaggccagttcagcacattcctaagttctagttttgctgggaacCCaaagctatgcagccctatgcttgaacaccattgcaattcagcggtagcagctccaacaacccCtatctccgcaaagcagtatatTgacaaggtagtgtttgcaattgcatttggtgtgttctttggagtagaagcagctccaacttcccctacctcaagaaagcagtatatcgaccaggttgtctttgcaattgcattTggtgtattctttggagtagagaccatgaagatggcaccccattctgcgtggagaagCAGggtagtgatgcctttctctggcctcgctgcttcctcgttatgtctgctgctgttcctgctccccatggccgtctccaccattgcgtgcctcgagcaggagaagagctctctcctccggttccttgctgggctatcacacgacaatggcatcgccatgtcatggcggaatggcatggactgctgcgagtgggaaggcatcacctgcagtgaagatggggctgtcattgaggtctctcttgcctctaaaggccttgaagggaggatctcaccgtcgctgggagagctcaccagcttgtcgcgcctcaacttgtcgtacaactcgctctccgGtggccttccggcagagctgatgtcctctggtagcatcgttgtccttgatgtcagcttcaaccacctcaacggcaacctgcaagagctgaattcatcaGtatctaaccagccactgcaggtactgaatatctcaagcaaccagtttacaggagcatttccCtccagcacatggGagaaaatgagcaacctggttgcaatcaacgtgagcaacaacagttttactgggcatataccttcctctttctgcatcggctcgccatcttttgctgttattgacattggctacaatcagttcagtggcagcatccccccaggaataggtaactgcactgcccttagaatgctaaaagctggtaacaacaacattagcggggccctcccggatgatctcttccatgccacatcattggagtacctctcttttgctaacaacggtttgcaaggaacaattaatggttcactcatcataaagctcagtaatcttgtttttgttgatcttggctggaacagattcagtggcaaaatcccaaattctattggtcagctaaagagactaaaggagcttcacattagcagcaacaacttatctggagagcttccagcatccttgggcgactgcacaaatctagtaatcatcaacctcagcaccaacaagttcacaggagagcttgccaaagttaActtctccaacctgcccaatctgaaagcattagatttttcctggaataattTcaacggcaccattccagagagcatctactcatgcagcaatttgacttggttgcgcctatctgccaataggcttcatggccagttgtcaaaaaatataggaaatcttaagtcgatcaccttcttatctatttcctacaacaattttacaaacataactaatacccttcacatactcaagagcttaaggaacctcactgtcttgtttatggggagcaacttcaagaatgaagctatgccAcaggatgaagcaattgatggttttgagaatattcagggtcttgccatagagcgttgtgcactgtatggtaagatacctaattgGttatcaaaactcagaaattTgcaggttttaacttTatacagcaatcaactcagtggaccaataccgacctggatcaatagccttaacttccttaaGtatgtggatgtatccaataatagccttacaggagaaAtaccagcggcactaatggagatgccaAtgctaaagtcagacaaggttgcagataactcagaacaaagagcatttacattttcgtttTatgcgggtgcatgtttgtgtttgcagtaccatacaactactgctctccctgaaatgttgaatctaggtaacaacAatttcactggtgtgatccccatggagattggtgagttaaaagaacttgtttcactcaacttgagcttcaacaacttaaatggagagatcccagaatcgatcagcaacctcaagaacctgatggttctagacctgtcatacaaccatctgacaggtgcaatccctccagcaatggtgaaccttcacttcctttccgaattcaacgtttcctacaatgaccttaaagggcctgtaccaagcggagaccagttcagcacatttcCaagttctagttttgctggaaacccaaagctatgcagccctatgcttgtacaccactgcaattcagcagaagcagctccaacctccactatcttgacaaagcAgtatatcgacaAggtagtgtttgcaattgcatttggtgtgttctttggagtaggtgtgctatatgatcagataatcatgtacaaatattttggctaa
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| Protein seq | MKNLKNLTVLLLGGNFMHEAMPEDETTLPNLKILDLSSNYFIGTIPESIYSCSNLTWLRLSTNKLHGELTKKIENLKSITFISLSYNNFKNITNTLHILKNLKNLTVLLLGGNFMHEAMPEDETIDGFKNIQGLGINDCALTGKIPNWLSKLRSLQLLALYNNQLSGPIPTWISSLNFLKYVDISNNSLTGEIPTALMQMPMLKSDKIEDHPDLIVSPFTVYVGACLCFQYRATSAFPKMLNLGNNKLSGVIPMEIGQLKELLSLNLSFNNLNGEIPQAISNLKNLMVLDLSSNHLTGPIPSGLVNLHFLSEFNVSYNDLEGPVPIGGQFSTFLSSSFAGNPKLCSPMLEHHCNSAVAAPTTPISAKQYIDKVVFAIAFGVFFGVEAAPTSPTSRKQYIDQVVFAIAFGVFFGVETMKMAPHSAWRSRVVMPFSGLAASSLCLLLFLLPMAVSTIACLEQEKSSLLRFLAGLSHDNGIAMSWRNGMDCCEWEGITCSEDGAVIEVSLASKGLEGRISPSLGELTSLSRLNLSYNSLSGGLPAELMSSGSIVVLDVSFNHLNGNLQELNSSVSNQPLQVLNISSNQFTGAFPSSTWEKMSNLVAINVSNNSFTGHIPSSFCIGSPSFAVIDIGYNQFSGSIPPGIGNCTALRMLKAGNNNISGALPDDLFHATSLEYLSFANNGLQGTINGSLIIKLSNLVFVDLGWNRFSGKIPNSIGQLKRLKELHISSNNLSGELPASLGDCTNLVIINLSTNKFTGELAKVNFSNLPNLKALDFSWNNFNGTIPESIYSCSNLTWLRLSANRLHGQLSKNIGNLKSITFLSISYNNFTNITNTLHILKSLRNLTVLFMGSNFKNEAMPQDEAIDGFENIQGLAIERCALYGKIPNWLSKLRNLQVLTLYSNQLSGPIPTWINSLNFLKYVDVSNNSLTGEIPAALMEMPMLKSDKVADNSEQRAFTFSFYAGACLCLQYHTTTALPEMLNLGNNNFTGVIPMEIGELKELVSLNLSFNNLNGEIPESISNLKNLMVLDLSYNHLTGAIPPAMVNLHFLSEFNVSYNDLKGPVPSGDQFSTFPSSSFAGNPKLCSPMLVHHCNSAEAAPTSTILTKQYIDKVVFAIAFGVFFGVGVLYDQIIMYKYFG
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.000000 | 0.916466 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0156200 | SBH | 0.250807 | 0.765182 | 1.044408 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06070 | SBH | 0.076225 | 0.0 | 0.070212 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0156200 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004190 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.752527 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004470 | RBH | 0.0 | 1.147084 | 0.356581 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004220 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 2.371537 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004020 | RBH | 0.031011 | 0.040793 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004110 | SBH | 2.410689 | 8.209851 | 3.171613 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0051100 | RBH | 1.1443825 | 3.0523805 | 4.2669345 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004280 | SBH | 0.048594 | 0.017924 | 0.096358 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0053300 | SBH | 0.566111 | 0.406608 | 4.084004 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004550 | RBH | 0.022579 | 0.127643 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004040 | SBH | 0.085514 | 0.000000 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004320 | RBH | 1.197016 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004280 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.106284 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004180 | SBH | 0.052786 | 0.650104 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004310 | SBH | 0.850914 | 0.737580 | 0.524094 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_06g0027120 | SBH | 0.0 | 2.179937 | 0.302101 |
