Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsNaBo_01g0002580 OGI:01002250 | 16/16 NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:1988751-2007352
Gene Symbol RLCK21, OsRLCK21, RLCK20, OsRLCK20, RLCK22, OsRLCK22, RLCK23, OsRLCK23
DNA seq

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Function LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.5 [UniProtKB/Swiss-Prot:F4HQ20]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsNaBo_01g0002580 OsNaBo_01g0002580.01 Chr01 1988751 2007352 + NAM
CDS seq

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.259614 0.0 0.677685

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0137282 RBH 0.000000 0.000000 0.762090
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g04550 RBH 0.179368 0.323679 0.128419
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0137282 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0002660 RBH 0.112014 0.0 0.373943
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0002480 RBH 0.000000 0.000000 0.315367
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0002650 RBH 1.453925 0.0 1.284384
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0002550 RBH 0.071853 0.034780 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0002550 RBH 0.595844 3.099725 1.351150
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0033300 RBH 0.3599865 0.7996085 1.4546695
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0002580 RBH 0.105404 0.0 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0033800 RBH 0.4648405 0.345734 3.123703
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0002370 RBH 0.049578 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0002560 RBH 0.075790 0.585201 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0002670 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0002630 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0002480 RBH 0.000000 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G002770 RBH 0.0 0.902375 0.522365
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0028950 SBH 0.0 0.0 0.0
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