Basic Info |
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| Function | Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:F7J0N2] | ||||||||||
Transcripts
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| OsMH63_11G0439700 | OsMH63_11T0439700-mRNA-1 | Chr11 | 32993918 | 33008738 | - | maker | ||
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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| Protein seq | MEAPTCGLWGAVLNLPGRLDGVLLRHGSILPKGAEEEIPLIKRDLHLMISILNGYYSESPELEDATATTVARRRCWTKEVRELSYDIEDCIDHYEHAATAGSAGGRTASGGIPPRRKITRRRWQRTTPLWIPERLKQRLWMANKIREFSLRAQDALKRHAMFCSSVGGNGIATSTASSSTAATGDASSSSSTICWHTTRFRERDFCVPHVGINVAMNKLEDWLTACDDEDQKRLRVVSIVGVGGIGKTTLANELYRKLRRQFECWAFVRSSQKPDVRRILISILSQLRLQQPPESWKVHSLISSIRAHLQDKRYNLRSKLVCALPDGTSSSRVLTTTQYDDLAVQSCGYDTKYVFKMKSLSQHDSRYLFFNTVSGSRFIYSPGSTEVSDDIIRKCGSLPLAIVSITSILEKSRKMEQWGYVNKSLGYNLMKNPTLEGIKQVLDLSYNNLSEHLKPCVLYLSIYQEDYLICKDDLVNQWLAEGLICATKDHTKEEISEACFGELVSSTMIQPVHTDGNGDVMSFVIQHMVLNFIRYKSIEENFVTVIHHSQTATELSDKVRRLSLHFGNVKDAKLPINMRLSQVRTLAFFGAYKYWWRSIKDQFPVLQVLILHFWHDEDIISFDLTIISQLFRLKYLKITSDVTLELQTKTRGLQCLETLKIDARISTAPLDTTHLSGLLHLSLPADTNLANGIGHMTSLHTFGYFDLSYNSVENVLSLGKLTNLRNLQLTCSTIRPNSLEIKLQCLGFILQKLSNLKSVTMSTAGSSCVNSTDASSANVSVRISGDGLSSMSSPPALVERLELLPRICIFSYLPKWISLLSKLRILKIGVRELVRNDIDVLMGLRALTDLSLHVHTKPTEIIFFGGIGFKALKYLKINCCVAWLKFDMGAMHSLYKLKLGYNVDGVDQECTIPDGIQYLHGLKEISVKIGGADPEKYDRRAEELAFMIDSGLHDRCMSITLQCVRQISALSEWDIVHLLRNKLDNQQDGTTCHFPVVASYYVDTCQLTAMGAGAGERWFYFRQHEGWMMDRSTPSGYWKTAAGTASFVYSADRHPVGLKKSMLFYRGREPSGRKTKWKIDEFWALDNAANGSEELLAQLCRSRQNVGLMPRFPLSLCRLYGTKSSSERHVLATSSVEISEDESD
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.012417 | 6.2325165 | 0.042705 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0686900 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g45970 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0686900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0024400 | RBH | 0.000000 | 29.162773 | 0.189769 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0024240 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0023840 | RBH | 0.0 | 43.446110 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0023630 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0024180 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0437900 | SBH | 0.023882 | 1.4003845 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0024580 | RBH | 0.0 | 0.312305 | 0.000000 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0437300 | RBH | 0.031796 | 1.864553 | 0.1563785 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0024450 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0024470 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0023790 | RBH | 0.0 | 25.134550 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0023690 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0024050 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G024070 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.000000 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0024270 | RBH | 0.0 | 10.566753 | 0.0 |
