Basic Info |
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Function | Putative disease resistance protein RGA1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA42] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsMH63_11G0105200 | OsMH63_11T0105200-mRNA-1 | Chr11 | 6711484 | 6717802 | + | maker | ||
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Protein seq | MAEVEVTLLEGGIEWLAQTILENLESDKLDEWIRQVGLSDATEKLKSEMERVEVVVAAVRQRAIGNKLTRSLGRLRELLYDADNAVDELDYYRLQHQVQGGNISVRTHVRCTSPLSSVGSNAWQQSAPESAHKHAPVQADQVVRPKFTTDISRSSGRPGGKRRSKVWKYFDGTKYENKKAVKCIFCNTELKCQNGASGLHIHLRSKRCTDKRKDLSSADKHAPLQAEAVTPKSTTDISSSSGGKTGRSGAWENLRITELENGKPLKARCVRNTVLECGSHTGTSVLRNHLYSISCKNKRRASYPNLSSTSDTTANSTIPDESTHNNAVDSHPWNNNAVDSRPWNKAQCSSRIQQITGGLQLAIGAVSEVLKLHGKDLDGNSNHRTSTTTTLIRTSSLSPHKIYGRHAEKNAILKIITDDSYDGVTVLPIVGIAGVGKTALAQLVYNDPMVKRNFDQVWVWVSKDYDEVMLTMEILDFVSQERHEISHQRKERHNGISSFAKLQEILNGHMDIRTKKFLLVLDDVWDSMDGNTWNILLAPLKSNRAKGNMILVTTRNLSLAQRVGTVEPIELGPLSNEDFWLFFKACAFGDENYKAHPSLNIIGQKIAEKLNGNPLAAETTGRILRKHVTIDHWSNTLRGEDWKSLNISRGIMPSLKLSYDQLPYHLQQCFLYCSIFPSGYCFLGQELIHIWISQGFVHRNSSSKRLEEIGREYLSNLVNSGFFQPGAQTNQFTQVDKTSYVMCGLIHDFARMVSRTEYATIDNPQCNKMLPTIRHLSILTDSTHQEDRDCGKVEERIRNAVKPVKHLRTLVLIGQHNHIFLKSFKDIVQKEHHLRVLQISAPFTDIDPSLLNLVNPTHIRYIKFDDGALPLSVGKFYHLQVFDAGSESDLIIPNDMDNLVSLRHLVAAKQVFSSITSIGKMTSLQELNDFSVHNSLGLNQLQSLNQLVQLGVSGLETITTRIEACGARLRDKHNLEKLHLSSKDAKDGYDSGMSSENEYDTVMSFENETDSGIEPLMEGLTMADTNISPVLKNLPGIAREVLDGLEPHHSLKHLRISGYNGATSPTWFPSSLTCLQTLHLEKCGKWQRLPLERLTLLRKLVLIKMRNATEVSIPSVEELVLTELISLKACSCTSIRNLNDNLKVLKIKSCPALEVFPLFENYPQFEIEQSSWFSRLREITIYGCPHLRVHKPLPPSPNVEKLSITRVSTLPSIEGSSSGTLRIGFSYDWMDEWDESSDQMITLDDKVMAFRNLRFLSGLVICGCQNLTTISLDSLRQLRSLKSLEISNCLELFAPNVPSDTREDMAAADHNTLLCLKLLDIRNCGITGKWLSLLLQHMKTLQELRLQDCEQITGLSIGEEECGQPNLMSATETPSLGFSAENKLPRLPLNIICSLKKIYIKWCSDLTFHGSKDGLAGFTSLEQLEISVCPKLIDSLLHNDGNVEQANRRWLLPISLEELIVQYDGPFEMLQLCFPGNLTRLKKLFLMREVKGLRAHMGYLLPQSLEELCINNCFIETLCPRFQMNLTCLKKLEVHHSEFLISLELQSCTALEELTIEYCKSLAVLEGLQFLYGLRSLQVHECPRLPPCLDNLSWQGHLRLEKLCIDDTSILTTSFCKHLTSLEYLKIYSCRSEEGRLTDEQERALQLLTTLQELRFTHCYSLQDLPAGLHSLHSLKRLDIWGCYRIRKLPEKGLPPSLEELDISCCTKELADQCRTLGSKLKVKINGSLVSS
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0044755 | 0.0344415 | 0 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0213800 | SBH | 1.724913 | 1.375861 | 2.385128 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g10770 | SBH | 1.124987 | 1.032293 | 0.597353 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0213800 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0008070 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0009680 | RBH | 0.145431 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0009680 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0009510 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0007820 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0105900 | SBH | 0.109065 | 0.603869 | 0.012481 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0007830 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0101000 | SBH | 2.1805425 | 55.4515915 | 2.8706485 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_Ung0000490 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0008930 | SBH | 0.100594 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0007960 | SBH | 0.000000 | 7.199078 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0009480 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0007940 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G009780 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0009540 | RBH | 0.497449 | 11.340217 | 1.387056 |