Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_09G0194500 | OGI:09033490 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr09:12383198-12400042 | ||||||||
| Gene Symbol | OsRPK2, RPK2 | ||||||||||
| DNA seq | 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| OsMH63_09G0194500 | OsMH63_09T0194500-mRNA-6 | Chr09 | 12383198 | 12400042 | - | maker | ||
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| OsMH63_09G0194500 | OsMH63_09T0194500-mRNA-7 | Chr09 | 12383198 | 12400042 | - | maker | ||
| CDS seq | ATGGCGCTCTTGCTGGCTTACTTCACCGTTTTCGTGTTAGCAGCATCTGTTCCTGCCACCGGCCAACAAGGTTTCCTAAGCATCGACTGTGGCCTGGATCAAGATTACAACACAGACTACCTGGTTGGCGGAATCACCTACGTCTCCGACGGTGCGTACGTCGACGCCGGCGAAAATAGAAGGGTGACCACCGTGTACAAGGACGACTGGAAGGGCCCTCGCTACCAGACACTCTACACGCTCAGGAGCTTCCCAACATCCGTTACCGGTGAACGGAGCTGCTACTCGCTACCCACCAAAAAAGGGGACAAGTACAATGTTCGGCTGGAGTTTCTGTACGGCAACTACGATGGCCTGGACAGCGCATCCCTGACGTTCAACCTGACCCTTGGGGTGAACCACTGGGACACCGTGATCTTGGACACCGCCATCCACTACGGTTATAAAGCATACGCCGCGGTGTTCGTCGCATGGGCTATGTCGGCGCCGGTGTGCCTGGTGAATACCGGCGGTGGTACACCATTCGTGTCCACGGTGGAGCTGAGGCCGTTTGAAAGCTTGGCCTACCCGACCGACAATCAGTCACTCTCCCTCTATGAACGGAAGAGCATGAGATCAGGTGCTGACGTCGATATAATAAGGTTTCCTGATGATCAGTACGATCGTTATTGGTATGCGTGGGAATTAACTGGAAATGACCCTTATTCAAACATTTCTACCCAATCAGCCATCGAACTGAATACCACATTTATGGTGCCCTTGCGTGTTCTCCAAACAGCCTTTGTGCCGGTTGGTAACTCCAATGAACTAGTTTTACGTTCAAAGAGAAGAGGCAGACTTCCCGGTGATCACTTGGTGATCCTGCACTTCGCCGACTTCCAGGATAACAAGACTAGGGAGTTCACCGTTTCAATTGACAGCGGCGTGCAAAGTCGACCGATCAGTCCACCATACCTGAAAGGTTGGTCTATCATCAATTGGTCCAGTGATTCTGAAGATCTGTCCATCAAACTTGTTGCCACTGCCGCATCTGCTCTTCCCCCGATCCTCAATGCTTATGAGGTCTACAGTCGCATCATCCATGAATATCCAATGACGTTCTCCCAGGACTGTAAGCTCTATCTGTCTCTAACAATGTACACTAATTAA
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_09G0194500 | OsMH63_09T0194500-mRNA-8 | Chr09 | 12383580 | 12400042 | - | maker | ||
| CDS seq | ATGCTAGTTGATGCGATCATGGCCATTAAACATGAGTACGGAATAAGGAAGAATTGGATGGGTGATCCTTGTTATCCATCTAATTCTGTTTGGGATGGTGTGGAATGTACCAATCCTGGTGATGATAAAACCATGAGGATAATATCTCTTGATCTCTCCAACAGCGAGTTGCAAGGGCAGATATCCTATAATTTCACATTGTTTAGTGCCCTCAAGTATTTAAACTTGTCATGCAACCAACTAACCGGGACAATTCCAGACTACCTTCGCAAAAGCAATGGATCAATTATAAGTCCTCCAGGACATTGGACAAATCATTGGGACCATCTACAAAAACCTGAGAATCGTCGATTCACATATGAGGAACTAGCGAAGTTCACTGATAGCTTCAAATGTTTAATTGGGCATGGAGGCTTTGGAAATGTCTATTACGGCTGTTTAGAAGACAATACCGAGGTTGCTGTTAAGATGCGATCTGAATCATCGTCCCATGGGCTCGATGAGTTCTTAGCTGAGGTTCAGAGCTTGACCAAGGTGAATCACAGGAATCTTGTTTCTTTGATTGGTTACTGCTGGGAGAAGGATCATTTAGCACTTGTCTACGAGTACATGTCTAGTGGCAATCTTAGTGATTATCTGAGAGGGCTAGATTATCTACATAAGGGTTGTAACCTGCCAATAATTCATGGGGATGTAAAGACAAATAACATTCTCTTGGGTGGAAATTTAAAAGCAAAAATAGCAGATTTTGGGCTTTCAAAAACCTACCATAGTGACTCCCAGACTCACATATCAGCCATTGCAGCGGGATCTATGGGCTACATTGACCCTGAGTACTACATCACCGGTAGACTCACTGAGAGCAGTGACGTAACTAGTGGTGAACCTACCATAATACCTGGAAATGGTCACATTGTTGAACGTGTGAAGCAGAAGATGGTCACTGGTAACATCAGCTCAGTTGCCGATGCACGTCTTGGAGGTTCTTATAACGTCAACTCCATGTGGAAGGTTCTAGATGCTGCCATGATGTGCACAGCAGATATTGCTGCTCAAAGGCCAATGATGTCCGCCGTGGTCATGCAATTGAAGGAAAGCCTGGAATTGGAGGAAGCTCATGGGGACATGGGCGACATGGAAAATATAGCAAGAGATAACAAGTTTTCGATGTCCATGTTGGGTCCATCGGCAAGATGA
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_09G0194500 | OsMH63_09T0194500-mRNA-9 | Chr09 | 12383198 | 12400042 | - | maker | ||
| CDS seq | ATGGCGCTCTTGCTGGCTTACTTCACCGTTTTCGTGTTAGCAGCATCTGTTCCTGCCACCGGCCAACAAGGTTTCCTAAGCATCGACTGTGGCCTGGATCAAGATTACAACACAGACTACCTGGTTGGCGGAATCACCTACGTCTCCGACGGTGCGTACGTCGACGCCGGCGAAAATAGAAGGGTGACCACCGTGTACAAGGACGACTGGAAGGGCCCTCGCTACCAGACACTCTACACGCTCAGGAGCTTCCCAACATCCGTTACCGGTGAACGGAGCTGCTACTCGCTACCCACCAAAAAAGGGGACAAGTACAATGTTCGGCTGGAGTTTCTGTACGGCAACTACGATGGCCTGGACAGCGCATCCCTGACGTTCAACCTGACCCTTGGGGTGAACCACTGGGACACCGTGATCTTGGACACCGCCATCCACTACGGTTATAAAGCATACGCCGCGGTGTTCGTCGCATGGGCTATGTCGGCGCCGGTGTGCCTGGTGAATACCGGCGGTGGTACACCATTCGTGTCCACGGTGGAGCTGAGGCCGTTTGAAAGCTTGGCCTACCCGACCGACAATCAGTCACTCTCCCTCTATGAACGGAAGAGCATGAGATCAGGTGCTGACGTCGATATAATAAGGTTTCCTGATGATCAGTACGATCGTTATTGGTATGCGTGGGAATTAACTGGAAATGACCCTTATTCAAACATTTCTACCCAATCAGCCATCGAACTGAATACCACATTTATGGTGCCCTTGCGTGTTCTCCAAACAGCCTTTGTGCCGGTTGGTAACTCCAATGAACTAGTTTTACGTTCAAAGAGAAGAGGCAGACTTCCCGGTGATCACTTGGTGATCCTGCACTTCGCCGACTTCCAGGATAACAAGACTAGGGAGTTCACCGTTTCAATTGACAGCGGCGTGCAAAGTCGACCGATCAGTCCACCATACCTGAAAGGTTGGTCTATCATCAATTGGTCCAGTGATTCTGAAGATCTGTCCATCAAACTTGTTGCCACTGCCGCATCTGCTCTTCCCCCGATCCTCAATGCTTATGAGGTCTACAGTCGCATCATCCATGAATATCCAATGACGTTCTCCCAGGACTGTAAGCTCTATCTGTCTCTAACAATGTACACTAATTAA
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| Protein seq | MALLLAYFTVFVLAASVPATGQQGFLSIDCGLDQDYNTDYLVGGITYVSDGAYVDAGENRRVTTVYKDDWKGPRYQTLYTLRSFPTSVTGERSCYSLPTKKGDKYNVRLEFLYGNYDGLDSASLTFNLTLGVNHWDTVILDTAIHYGYKAYAAVFVAWAMSAPVCLVNTGGGTPFVSTVELRPFESLAYPTDNQSLSLYERKSMRSGADVDIIRFPDDQYDRYWYAWELTGNDPYSNISTQSAIELNTTFMVPLRVLQTAFVPVGNSNELVLRSKRRGRLPGDHLVILHFADFQDNKTREFTVSIDSGVQSRPISPPYLKGWSIINWSSDSEDLSIKLVATAASALPPILNAYEVYSRIIHEYPMTFSQDCKLYLSLTMYTN
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.4693075 | 0.0022385 | 0.0026715 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0350900 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g18159 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0350900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0006840 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0006840 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0007070 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0006940 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0007010 | RBH | 1.672150 | 0.0 | 1.472044 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0195400 | RBH | 0.084177 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_09g0007070 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_09G0172000 | RBH | 0.21765 | 0 | 0.0234925 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0006910 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0006830 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0006760 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0006670 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0006740 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G007280 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0007080 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
