Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_09g0007010 OGI:09033490 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr09:11952870-11960324
Gene Symbol -
DNA seq

tactgaagttatgtagttttctttattttgatttagaatttgaagtaaacaattcctaatgacatgtaaaaatcaacacaaaatcgaaatagtaaggaaatgtgtaaacatttcaatatctttggtacatattatttgagcaacgacaccagagttaggaatctcacaaatagcttactgttggacattgaagcaaactattgcatcacaatacaggaaccaattaaggatctgtcggctctgttttttatgaacacaagatatataaactattgtgtcttaacacacaaaaaatcgtctatgaaaactagttttatttcagacttgaagcagcatcaactatatgtcccaaatccatgtatcaatggtttcttcatcttgccgatggactaaacatggacatcgaagacgtgtcatctcttgctacattttccatgtcacccttgttcccaggagcttcctccaattctaggctttccttcaattgcgttaccacagcggacatcattggtctttgagaagcaatatctgctgtgcacatcatggcggcatcaagaaccttccacatggagttgacattataagaacctcccagacgtgcgtcggcaactgagctgatgttgccagtgaccatcttctgcatcacacgctgaataatgtgaccatttccaggtattatgggaggttcaccactagttacctctagtaaaacaataccgaagctgtagacgtcacttttttcagtgagcctaccggtaacatagtacctaaaaaatagcccacattgataaacatgatgattgcaccaagtggttaaggatagcattgcatagaatcatttaaacatctgaatacacaacataaaagtaagagtttgttcaaagaagctcatactcagggtcaatgtagcccatagatccagctacagttgctgatacgtgagtctgggagtcgctatggtaggttttagaaagcccaaaatctgctatttttgcttttagatttcgacccaagagaatgttatttgtttttacatccccatgaattattggcaggttacaacccttatgtagataatctaggcctacatatgagaaaaactacagttagatgaagagatgagcgtgtgataacacatttttttattgtctttgccgtcttcatgtaccataccttgtgcagcttcaagcataactcttatgcgtgttgcccaattcaaggttccacccagtccagctttaccttcatacattaattgcatacaattataaggagatgggaggaggaggaggggggtatttgacaaatcaaaacaatattattgctttaacaaaagaaaagaaccagtgtaatgagaatcattctcagaaagatgctactttgtacttgtcatttttttagataatgggtaaaacccggcctctataccaaaattggtttatccggccaaatgtactagtcattacattgctattatatattagcaaagattagaagctggccatgtcagtatgtcttcgcaatcagtcaatatagacgttcaacaatgcaaaaccaattattttgtatacaattttaaacatccacacaattcattattgttttttgttaatcagcggatttgagaatgagacgatgaaaaattatgacaaactttggaaatgcaagattatgatactccatatgcggggcagaattaagggtagggtagagcaagtaaataatcagcatcgtaaaaaccactacaaTtttttttggtagttagagctgaatggatcatgtttggttagaaccaatttagagccaaattttattggtacaagtagagttaccatattaatgaaggcattgccaatattttggcttcaatgcaactactcatatctactattttttaaagggaaaactgccacatatctactattcaaacaactagttgatatcccacccttttatgtgggatatgtagatgaatgtgtattatacattatagaaatggacgatgtatatgtttaaataatgtgaaaatgatttggagataatgatttgacagtgcttgcatattcagttctaaaaatacaacaaaattgtaaatgatacgtctggtttgcatgatatttaaaatactctagacactaattgctagtgggtaatgatgtggcatacttacatgttattaaaatactctagataataattaatagtgggtgatgatgtgacacacttgcatgttgagctttagaggttagtgagcatcaactttatagtaagatagcatcaatgaattgttagggcacattttagtatctaaatggcccaaaatccgttaaggtatatcttgagtgagtttatacgatggcaatattataatgaacacccttaggtagagactaatagtatgttgtcactaaagaaacaacagtctacttctttgtgttcttataaaaagttaactatgctctctccagatatgcaacatgatcagtgaattggcttagccgtgtgctgcttcagtcatgtagagggcatatgcacagtattgaagttgtaagaaggaaaatatgactatagccaactagttggtctgcgcaatgtataggttctcacatacgtgcagtatcctccctcggattttaccatacattcagtacataaaatattgcaggggacaaacctctcaaataatcagaaagattgccactagacatgtactcatagacaagtgctaaatgctccttctcccagcagtaaccaatcaaggaaacaagattcctgtgattcaccttggtcaagttctgaacctatgtaatgtgataaaacaaaaggttaaatctcttaatgtgtatgaaacctcatagtggatatgactgagttcctattcaaatatatgccattgcatttttttgttttatctgtggttaatcataagagtaacattatttggcacctcagctaagaattcatcaagcccgtgtggcgatgattcagatcgcatcttaacagcaacctcagtaccgtcttctaaacagccgtaatacacatttccgaagcctccatgcccaattaaacgtttgaagctatcagtgaacttctctaattcctcatatgtgaatcggcgattttcaggtttttttagatggtccaaatgatttgtccgatgtcttggagaacatataagttgtggtaccatgggagaatcatctgtagaaactggtgtagaaagaacagatttagcagtattaaatgcagatattaaacaatgtgtttttcaatgcagattatagtagtacacaccatggggctttcttttggctctccagatcaaaaatgctacaacaagcatggtgactacaagtactggagccactacagaaacagctaaggtagctgctctgtttcttgatgaggatgaagttattggttttttgcacatatctccgtcagactcgtagctgaaattacataaaactatcagtccatgcttttaaattggttcaaaagaaacaatattttcttttaggatgcccaaagtttacattaagaacaaccccacaatctggaaaatgctaaaagggaaatcaataataataaaagtaggtacacctgaaaacaatcgatccattacttttgcggaggtagtctggaattgtcccggttagttggttgcatgacaagtttctgtataaagtgggatacaatttggcattaaaaatagacatcctgacttggtaacaatctgcaaacaaatttatcaactaaaatatttatatgaattgccgacaacatggtaatgtaccaggaatcatgcttcgaaccactttaattaatgcctgatatatttcaaatctatacttctccacagagggtggtgcaatataaaaggcaaaagcatgatgatcgttggcttagtgccaatctgacatgaaacaatttgctcgaaaaattaaaaaaaacagtaaacagatatactccatcatgcaattggcaatctcacatgaaaaaatcgtttatggcataaataaaaatgacacagcaatcagatatactccgtcatgcaagcatctgtttgtatcattatgctccatgatttgcaacatctcattgcctattcaatgatcctggaaatatctatctaaagataattcatatcaaattcctatagatgcatgagccattcagagacattggtatgggaataacaaaatattgatgcatcctaggctctaagatgatttgaaagttgattttgcatgttttttcatcaaagtttattatttacattgacttttaaaacttttaaactgctgccaaaataatgctaattataaaagttttgctcacaaattattattttttattttgttaataagccatacagtttataatcagcattagagttaccggatggatagagtgttgatgcatgccttcaattgtgatatctacgaatttttaaaggtaagcacatgtgttgatggaattctgatatatcatagaccataatatagattattcttggtctactttcagattcagattgccccatatgtaatAaaaaaaattcctccatatgtggcttgcaagtttaaactacaggagaaaagcctacttttggtcgttcaactgtagccttggttcggttttcatcctcaactatatatgaaaccgattactggtcggtcatttagttggtgttttcgggtgattttaaatagcatacgactatatatccccattcatttcagtcgggaatttcggatgtggctaatgaaaggaagagaaaatttcatgtatacttacaaatacttgagcgcactaaacaatgtgaagttataggatatcggcccttgcaactcgctgttggagagatcactgcataataatttcaagcaatccaacgtgaatgaaaggtaccaactatatacaataattcaagtacgatagtacgtacaaatcttccgaatcatactcacagagatattatcctcatggttttatca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Function Putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g19210 [UniProtKB/Swiss-Prot:O65924]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_09g0007010 OsPr106_09g0007010.01 Chr09 11952870 11960324 - NAM
CDS seq

atggcgtggaaaggggtcaccgtttctagcgccagcaagctgagaaaggctttcggctcaagtttcctaagcatcgactgtggcctggaacaagattccagcacagacaatctggtcggtggcatcacctacgtccccgacggcgcgtacgtcgacgctggcaacaacagcaaggtgaccaccgtgtacaagaccgactggaagggccctcactaccagactctcgacacgctcaggagcttcccatcatctgttaccggtgatcggaactgctactcgttgcccaccaacaaaggggacaagtacattgttcggctggagttcttgtacggcaactatgatggcaaggacagcacgtcactgcaattcaacctgacccttggggtcaaccactgggacaccgtgattttggacaccggcaccaactacgggtataaggcatacgccgcggtgttcgacgcgtggtctaggtggacaccggtgtgcctggtgaatatcggcagtggcacgccgttcgtgtccacggtggagctgaggccactcgaaagcttggcctacccaaccgtcaatcagtcactctccctctatgaacggaggagcatgagatcaggcactgacttcgatataataaggtttcctgatgataaatacgaccgttactggtatgcgtgggacttaacggaaaatgaaccttattcaaacatttccaccccatcagccatcgaaccgaataccacattcatggtgtcctcgcatgttctccaaacagcatttgtgccggttggcaactccaatgaactagttttatcttcaaagagaatagacagacctcccggtgattacttggtgatcctgcacttcgccgacttccaggataacaagagtcgggagttcaccgtttcaattgacagcggcgtgcaaagtggaccgatcagtccacaatacctgaaaggtggttatatcatcaattggtccagtgattctcaagttttgaccatcaaacttgctgccactgccacgtctgctcttcccccgatcctcaatgcttatgaggtgtacagtcgcatcatccatgaatatccaatgacgttctcccaagactttgaagcgatcatggccattaaatatgagtacggaataaggaagaactggatgggcgatccttgttatccatctaattctgtatgggatggtgtgcaatgtaccaatcctggtgatgataaaaccatgaggataatatctcttgatctctccaacagcgagttgcaagggccgatatcctataacttcacattgtttagtgcgctcaagtatttaaacttgtcatgcaaccaactaaccgggacaattccagactacctccgcaaaagtaatggatcgattgttttcagctacgagtctgacggagatatgtgcaaaaaaccaataacttcatcctcatcaagaaacagagcagctaccttagctgtttctgtagtggctccagtacttgtagtcaccatgcttgttgtagcatttttgatctggagagccaaaagaaagccccatgtttctacagatgattctcccatggtaccacaacttatatgttctccaagacatcggacaaatcatttggaccatctaaaaaaacctgaaaatcgccgattcacatatgaggaattagagaagttcactgatagcttcaaacgtttaattgggcatggaggcttcggaaatgtgtattacggctgtttagaagacggtactgaggttgctgttaagatgcgatctgaatcatcgccacacgggcttgatgaattcttagctgaggttcagaacttgaccaaggtgaatcacaggaatcttgtttccttgattggttactgctgggagaaggagcatttagcacttgtctatgagtacatgtctagtggcaatctttctgattatttgagaggtaaagctggactgggtggaaccttgaattgggcaacacgcataagagttatgcttgaagctgcacaaggcctagattatctacataagggttgtaacctgccaataattcatggggatgtaaaaacaaataacattctcttgggtcgaaatctaaaagcaaaaatagcagattttgggctttctaaaacctaccatagcgactcccagactcacgtatcagcaactgtagctggatctatgggctacattgaccctgagtactatgttaccggtaggctcactgaaaaaagtgacgtctacagcttcggtattgttttactagaggtaactagtggtgaacctcccataatacctggaaatggtcacattattcagcgtgtgatgcagaagatggtcactggcaacatcagctcagttgccgacgcacgtctgggaggttcttataatgtcaactccatgtggaaggttcttgatgccgccatgatgtgcacagcagatattgcttctcaaagaccaatgatgtccgctgtggtaacgcaattgaaggaaagcctagaattggaggaagctcctgggaacaagggtgacatggaaaatgtagcaagagatgacacgtcttcgatgtccatgtttagtccatcggcaagatga

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.672150 0.0 1.472044

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_09g0350900 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os09g18159 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os09g0350900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_09g0006840 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_09g0006840 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_09g0007050 RBH 1.275999 0.0 0.272804
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_09g0006920 RBH 0.096316 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_09g0007000 RBH 2.922249 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_09G0194500 RBH 0.4693075 0.0022385 0.0026715
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_09g0007070 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_09G0172000 RBH 0.21765 0 0.0234925
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_09g0006910 SBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_09g0006800 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_09g0006760 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_09g0006670 SBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_09g0006740 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_09G007270 RBH 0.000000 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_09g0007080 SBH 0.0 0.0 0.0
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