Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_08G0305700 | OGI:08056670 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr08:21058556-21075997 | ||||||||
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_08G0305700 | OsMH63_08T0305700-mRNA-1 | Chr08 | 21058556 | 21066447 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGATCGTGATGCGGCCGGAAGTTCCAAAGGCAGTGAGCTCCCCGTGCGGCGGCGCCGGCGAGGCAGCAGGCAGCAGGCGAAGCGCGCGGCGCCGCGAGCGCGAGCAGCCGCAGGCCAGTGGCGGCGGAGTCTGCAGGCCGGCGCCGGCGACGCCACGGCAGCACGTGAAGGACCAGGCGAGCAGCAGGCAGCCCCTTAGCCCGACGGCTGCAAAATACAAGGATGTTGAGCCCACCCCCCCCCCCCCCCAATTTTTCATTCCTGGATCCGCCACTGTTGGATCCACCTTGCATTGCTTCCCTGAGAAGGCTATTCGTTCGTTCCCCCTGTATCCTGAGGATGTGCTGGCCGTGCTGGCCAATGGCCACAAGAAGCAGATGGCTTTTTCATCAGTTTTCAGGAGAGGAAATGTCAAAGAATTGATCTCAAATGTTTCGGTCTACACTAGCGCAACAGAGTCATCTGGAGGATTGAGCTTGATTTTTAAGCGTTGGGCCACCAAAAAGACAGCTGGATCAACAAAAAATGGCCGTGACTCTAACCCTAAGTATTTGGGTGTTAAAAAGTTTGGCGGAGAGAAAGTGGAGCCAGGAAACATCATCATCCGCCAAAGAGGAACCCGCTTCCATCCTGGGAACTACGTTGGCATGGGGAAGGACCATACTCTCTTCTGTCTGAAAGAAGGACATGTGCGATTCGAGCGCAACAAGCTGACTGGCAGGAAATGGGTTCATGTTGATCCTGTTGCTGGGCATGTGCTCCACCCTGTCTACGCCAGTGATTCCACCCCTGCAGCTGAAATGGAGCCATTGTAA
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| Protein seq | MIVMRPEVPKAVSSPCGGAGEAAGSRRSARRREREQPQASGGGVCRPAPATPRQHVKDQASSRQPLSPTAAKYKDVEPTPPPPQFFIPGSATVGSTLHCFPEKAIRSFPLYPEDVLAVLANGHKKQMAFSSVFRRGNVKELISNVSVYTSATESSGGLSLIFKRWATKKTAGSTKNGRDSNPKYLGVKKFGGEKVEPGNIIIRQRGTRFHPGNYVGMGKDHTLFCLKEGHVRFERNKLTGRKWVHVDPVAGHVLHPVYASDSTPAAEMEPL
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_08G0305700 | OsMH63_08T0305700-mRNA-2 | Chr08 | 21066453 | 21071609 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGGCTTTTTCATCAGTTTTCAGGAGAGGAAATGTCAAAGAATTGATCTCAAATGTTTCGGTCTACACTAGCGCAACAGAGTCATCTGGAGGATTGAGCTTGATTTTTAAGCGTTGGGCCACCAAAAAGACAGCTGGATCAACAAAAAATGGCCGTGACTCTAACCCTAAGTATTTGGGTGTTAAAAAGTTTGGCGGAGAGAAAGTGGAGCCAGGAAACATCATCATCCGCCAAAGAGGAACCCGCTTCCATCCTGGGAACTACGTTGGCATGGGGAAGGACCATACTCTCTTCTGTCTGAAAGAAGGACATGTGCGATTCGAGCGCAACAAGCTGACTGGCAGGAAATGGGTTCATGTTGATCCTGTTGCTGGGCATGTGCTCCACCCTGTCTACGCCAGTGATTCCACCCCTGCAGCTGAAATGGAGCCATTGTAA
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| Protein seq | MAFSSVFRRGNVKELISNVSVYTSATESSGGLSLIFKRWATKKTAGSTKNGRDSNPKYLGVKKFGGEKVEPGNIIIRQRGTRFHPGNYVGMGKDHTLFCLKEGHVRFERNKLTGRKWVHVDPVAGHVLHPVYASDSTPAAEMEPL |
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_08G0305700 | OsMH63_08T0305700-mRNA-3 | Chr08 | 21071615 | 21075997 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGGCTTTTTCATCAGTTTTCAGGAGAGGAAATGTCAAAGAATTGATCTCAAATGTTTCGGTCTACACTAGCGCAACAGAGTCATCTGGAGGATTGAGCTTGATTTTTAAGCGTTGGGCCACCAAAAAGACAGCTGGATCAACAAAAAATGGCCGTGACTCTAACCCTAAGTATTTGGGTGTTAAAAAGTTTGGCGGAGAGAAAGTGGAGCCAGGAAACATCATCATCCGCCAAAGAGGAACCCGCTTCCATCCTGGGAACTACGTTGGCATGGGGAAGGACCATACTCTCTTCTGTCTGAAAGAAGGACATGTGCGATTCGAGCGCAACAAGCTGACTGGCAGGAAATGGGTTCATGTTGATCCTGTTGCTGGGCATGTGCTCCACCCTGTCTACGCCAGTGATTCCACCCCTGCAGCTGAAATGGAGCCATTGTAA
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| Protein seq | MAFSSVFRRGNVKELISNVSVYTSATESSGGLSLIFKRWATKKTAGSTKNGRDSNPKYLGVKKFGGEKVEPGNIIIRQRGTRFHPGNYVGMGKDHTLFCLKEGHVRFERNKLTGRKWVHVDPVAGHVLHPVYASDSTPAAEMEPL |
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 5.039104 | 13.0379445 | 17.6349825 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_08g0404200 | RBH | 2.744123 | 1.739778 | 11.597155 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os08g31219 | RBH | 0.914329 | 0.852502 | 1.491409 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os08g0404200 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_08g0015410 | SBH | 2.172698 | 52.778629 | 19.630312 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_08g0015280 | SBH | 0.371577 | 3.511472 | 5.113299 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_08g0015210 | SBH | 1.688152 | 56.927177 | 38.872955 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_08g0015510 | RBH | 0.000000 | 0.991391 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_08g0015310 | SBH | 23.485239 | 26.640648 | 21.998865 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_08G0305600 | RBH | 4.827434 | 14.2017075 | 10.6131765 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_08g0015340 | RBH | 0.430481 | 3.429292 | 3.021912 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_08G0328000 | RBH | 4.7153825 | 5.831512 | 8.495797 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_08g0014810 | RBH | 1.191718 | 0.689922 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_08g0014940 | SBH | 1.697475 | 55.090618 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_08g0014860 | SBH | 16.672585 | 77.881912 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_08g0015550 | SBH | 2.051788 | 4.198605 | 5.157159 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_08g0014970 | SBH | 0.769244 | 9.563818 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_08G015050 | SBH | 0.0 | 19.364340 | 5.438639 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_08g0015210 | SBH | 0.000000 | 27.699352 | 17.014030 |
