Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_04G0519900 | OGI:04004540 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr04:34736479-34762542 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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More
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| Protein seq | MSAGEDGVYFRMRFFFFFFLVVLCLLDSNISTSHGCFVEERTAMMDIGSSLTRSNGTVPPSWGRGDGDDDCCLWERVKCSNITGRVSHLYFSNLYDSLEVLNAHGDSFWRFNTTVFSSFPELQFLDLSSIYPSSLNIDGLKLPKLQHLNLSYNWLQESILADLGELVSLEVLDASSNAMSGVVPTAVLKNLTNLKELNLSANGFSGSLPGSLLELPHLDPSGSSLAGRTPINSSLEPVSLQVLNLNNNRMSGALPTERAFGYLRNLRELHLSSNNFTGNISTFLLSLPHIERLDLSGNTFEGPIPITPSSNLSLSLKGLRFSQNNLSGKLSFFWLRNLTKLEEINLSGNINLAVDVNIPGWAPPFQLKQLALSGCGLDKGIIAEPHFLRTQHHLQELDLSNNNLSGRMPNWLFTKEATLVNLNLGNNSLTGSLSPIWHPQTALQSIVISTNRITGKLPANFSAIFPSLSTLDLSDNNFHGEIPMSLCSIKHMKDLSLSNNNFSGKMPTCVFTDFLELWTLSASNNQLGGLVFGGMKKLSIGFAMHLQNNKFEGTLPRNLSGALVLDLSGNHITGSIPQKICSLASIEILDLSNNNLSGSIPRCASASLSSLNLYGNSLSGNISDDLFNTSNLMYLDMRHNKLTGNLNWLRHLDKIKTLSLGWNDFEGQITPNLCKLKCPRIIDFSHNKLSGSLPPCVGNISCESDTAAQNYSPLLLIYVIIEAYIIVHDPIDFTFATKGGQYTYGYNFFDLMSGIDLSGNMLSGEIPWELGNLSHIKSLNLSNNFFTGQIPASFANMSEIESLDLSHNELSGLIPWQLTKLSSLAVFSVAYNNLSGCIPNSGQFGTYGMDSYQGNSNLRSMSKGNICSPDSGAGDLPSEGRDSMADDPVLYAVSAASFVLAFWGTVAFLFFHPLGRRAILATGNLVFWCGEGGASCSKMSCSFPWGSFCFFLVVLCLPDSNISTSSHGCFVEERTALMDIGSSLTRSNGTAPRSWGRGDDCCLWERVNCSNITGRVSHLYFSNLYDSNEVLDAHGHSFWRFDTTVFSSFPELQFLDLSMNNATFQSWDGLLGLTKLRYLKLNNNCLNGTIPASIGKLVSLEVLHLQFTGVGGVLPSSVFESLRNLRELDLSSNRLNGSIPSLFSLPRLEHLSLSQNLFEGSIPVTPSSNITSALKTFNFSMNNLSGEFSFFWLRNLTKLQKIDVSGNANLVVAVNFPSWSPSFQLKVLVLSGCNLDKNIVREPIFLRTQHQLEVLDLSNNSLSGSMPNWLFTEQATLVYLNLGNNSLTGSLGPIWYPQMNLQAISLPMNRISGHLPANISSVFPNMSFLDVSSNTISGEIPSSLCNITRMEYLDLSNNSLSGELPNCLLTEYPILTTLKVSNNKLGGPIFGGTNHLSIKHALYLDGNKFEGTLPRYLTADFDAHGTLDLHDNNLSGAIPNCMTALELDFFIVSHNSLSGHIVPFSFFNSSTVMALDLSHNQFNGNIEWVQYLGESKYLSLGSNKFEGQISPSLCQLQSLRILDFSHNSLSGPLPSCIGNLSFVQNPVGIPLWSLLCENHFRYPIFDYIGCYEERGFSFRTKGNIYIYKHNFINWMSGIDLSANMLSGQIPRELGNLGHIKALNLSYNFFAGPIPATFASMSSVESLDLSHNKLSGAIPWQLTRLSSLSVFSVMYNNLSGCIPNSGQFGSFDMDSYQGNNLLHPASEGSECAPSSGHSLPDDGDGKGNDPILYAVTAASFVTSLLRCGMGAYLLTWGSLSLVLLSVLQSSMMYMSSGCFTEERAALMDIKSSLTRANSMVVLDSWGQGDDCCVWELVVCENSTRRISHLHLSGIYYPPISTPSDRWHLNLSVFSAFHELQFLDLSWNYPSSLSFDGLVGLKKLQYLDFTYCSLEGSFPVFNGEFGALEVLVLNHNHLNRGLSAQAFQNLQNLRQLNLSLNHFGGELPTWLFELPHLKILDLSNNLFEGSIPTSSSLKPFALEILDLSHNHLSGELPTAVLKNIRSLNLRGNQFQGSLPASLFALPQLKFLDLSQNSFDGHIPTRTSSEPLLLEVLNLQNNRMSGSLCLWSERAFGNLQNLRELYLSSNQFSGSLPTFLFSLPHIELLDLSANLLEGPIPISISSNLSLSLKNIRFSQNNLSGTFPFIWLRNLTKLEEIDFSGNPNLAVDINFPGWIPPFQLKRLVLSSCELDKSTLSEPYFLHTQHHLKVLDLSDNHLTGNMPNWLFTKETALVRLNLGNNLLTGSFAPVCRTCEFFQYLNLSMNRIEGQLPSNISSMFPILSTLDFSNNNFSGQIPTSFCQIGSMDYLDLSDNRISGKLPACMFTNYMLVTLKVSNNELSGLIFDGVNNLSIISQLYLDNNKFEGTIPHNLSGQLKIIDLHGNRLSGKLDASFWNLSSLRALNLADNHITGEIHPQICKLTGIVLLDLSNNNLTGSIPDFSCTSELRFLNLSRNYLSGNLSESYFNTSNLIALDITYNQFTGNLNWVGYLGNTRLLSLAGNNFEGQITPNLCKLQYLRIIDFSHNKLSGSLPACIGGLSLIGRANDQTLQPIFETISDFYDTRYSLRGFNFATKGHLYTYGGNFFISMSGIDLSANMLDGEIPWQLGNLSHIRSLNLSYNFFTGQIPATFASMNEIESLDLSHNNLSGPIPWQLTQLASLGAFSVAYNNLSGCIPNYGQLSSFSIDSYLGNDNLHKISQGKRCSPSPGAVAKEDVGERYDDPVLYIGGGRRGKAGEEESAGGGDDVGKGEAAIAKAASAEEGRAASKYASSDFLWISDIISSLARGNLSWAYSPKINILSLGGNNFEGQISPDICNLQFLRIIDFSHNKLSGSVLACIGSILFNNVEDGDDRIFLNRFRLADIEMHDSDLSTTYYDLGFAFSTKWYQYAYGFNFVTMMSGIDLSANMLDGEIPWQLGNLSHIKSLNLSYNFFTGQIPATFANMKEIESLDLSHNNLSGPIPWQLTQLSTLGAFSVAYNNLSGCIPNYGQLASFSMERYVGNNNLYNTSQGSRCSPSGHVSKEEDVEERYDDPVLYIVSAASFVLAFCATVAFSFCHSYGRSVILKM |
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| Function | Receptor-like protein 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LNV9] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_04G0519900 | OsMH63_04T0519900-mRNA-1 | Chr04 | 34738050 | 34762542 | + | maker | ||
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| CDS seq | ATGAGCGCAGGAGAAGACGGAGTTTATTTCAGGATGAGATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGGTTGTGCTATGCTTGCTAGATTCCAATATCTCCACGTCCCATGGCTGCTTCGTGGAGGAGAGGACGGCGATGATGGACATTGGCTCCTCTCTGACGCGCTCAAACGGCACGGTGCCGCCATCATGGGGGCGCGGCGACGGTGACGACGACTGCTGCTTGTGGGAGCGCGTCAAATGCAGCAACATCACTGGGCGAGTATCACATCTCTACTTCTCAAACCTGTATGATTCTCTGGAAGTGCTAAATGCACATGGTGACTCGTTTTGGCGTTTCAACACGACGGTCTTCTCCTCATTCCCGGAGCTTCAGTTCCTGGATCTGTCCAGTATCTATCCCAGTTCTCTAAATATCGATGGGCTGAAGCTGCCCAAGCTACAGCATCTCAACCTCAGTTATAACTGGTTGCAAGAGAGTATCCTCGCAGATCTTGGGGAACTGGTTTCGCTTGAAGTCCTAGATGCCAGCTCCAACGCCATGAGTGGAGTTGTTCCCACTGCAGTTTTAAAAAATCTTACGAATCTGAAGGAGCTGAATTTGAGTGCCAACGGATTCAGCGGAAGCCTTCCGGGGTCATTACTTGAACTACCTCACCTTGATCCCTCAGGAAGTTCGTTAGCAGGACGTACTCCAATTAATTCATCTTTGGAGCCAGTTTCACTACAAGTATTAAATCTCAACAACAACAGGATGAGTGGAGCTCTTCCAACCGAACGAGCATTCGGATATCTAAGGAACCTACGAGAATTGCATTTGAGTTCCAATAACTTCACTGGAAACATTTCTACTTTCTTGCTTTCACTTCCACATATTGAACGATTGGATCTCTCGGGAAATACTTTTGAAGGACCTATCCCTATAACTCCATCTTCAAATCTTTCTCTGTCTCTCAAAGGTCTTCGGTTTTCCCAGAACAATCTGAGTGGTAAACTCTCATTTTTTTGGCTGAGGAACCTCACTAAACTTGAAGAAATCAACTTGTCAGGGAATATTAATTTAGCAGTTGATGTCAATATTCCTGGATGGGCACCTCCATTCCAACTGAAACAGTTAGCTCTCTCTGGTTGTGGTCTTGACAAAGGCATAATTGCAGAACCACACTTTCTACGCACACAACATCATTTGCAGGAGCTTGACTTGTCAAACAATAACTTGTCAGGAAGAATGCCGAATTGGCTTTTTACAAAAGAAGCAACTCTGGTTAACCTAAACCTTGGAAATAACTCGCTAACTGGATCTCTAAGTCCCATATGGCACCCCCAAACAGCTCTACAATCTATTGTTATATCTACCAACCGTATTACAGGGAAGCTACCTGCCAACTTCAGCGCAATATTTCCAAGCTTGTCCACTCTGGATTTGTCAGACAATAACTTTCATGGAGAAATTCCGATGTCACTGTGCAGCATCAAACACATGAAGGACTTGAGCTTATCAAACAATAATTTTTCTGGTAAAATGCCGACTTGTGTGTTCACTGATTTTCTTGAGCTGTGGACCTTGAGTGCCTCAAACAACCAGCTTGGAGGTCTGGTGTTTGGTGGGATGAAAAAACTGTCCATCGGGTTTGCAATGCACCTACAGAACAACAAATTTGAAGGAACACTGCCTCGTAATCTGTCAGGAGCACTAGTACTAGATCTTTCTGGGAACCATATAACTGGCAGTATCCCTCAAAAAATTTGCAGCTTGGCAAGCATTGAAATTTTAGATCTTTCAAACAACAACTTATCAGGATCTATACCAAGATGTGCCAGTGCATCTCTAAGTTCGCTTAATCTGTATGGGAATTCATTATCAGGAAACATCTCGGATGATCTTTTCAACACATCAAATCTTATGTATTTGGATATGAGACATAATAAGTTGACTGGTAACCTCAATTGGTTACGGCATCTTGATAAAATCAAGACACTTTCATTGGGATGGAATGACTTTGAAGGCCAAATCACTCCAAACTTGTGTAAACTAAAGTGCCCAAGGATAATCGACTTCTCACACAACAAACTCTCAGGCTCACTGCCACCATGTGTTGGCAACATCTCTTGTGAGAGTGATACGGCAGCTCAAAATTATTCACCATTGCTACTTATTTATGTTATAATAGAGGCTTACATAATTGTTCATGACCCAATAGACTTCACCTTTGCTACAAAAGGGGGACAATATACATATGGTTACAACTTCTTCGATCTGATGTCTGGTATCGACTTATCCGGGAATATGCTGTCAGGAGAAATTCCATGGGAGCTTGGGAATCTGAGCCATATCAAATCCCTCAACCTGTCCAACAATTTCTTCACTGGTCAAATCCCAGCAAGCTTTGCAAACATGAGCGAGATTGAAAGCTTGGACCTTTCCCACAATGAACTGAGTGGATTGATTCCATGGCAGCTGACCAAATTATCGTCATTAGCGGTGTTCTCTGTGGCATATAACAACTTATCAGGATGTATTCCAAACTCTGGTCAGTTCGGCACGTACGGTATGGATAGCTACCAAGGCAACAGTAATCTTCGGAGTATGTCAAAGGGAAACATATGCTCTCCAGATTCAGGAGCAGGTGACTTGCCATCGGAAGGAAGAGACAGTATGGCAGATGATCCAGTGCTCTATGCAGTCAGTGCTGCCTCATTCGTCCTGGCATTTTGGGGCACCGTTGCTTTCTTGTTTTTCCATCCACTCGGACGGCGTGCAATTCTCGCGACAGGGAATTTGGTGTTTTGGTGTGGAGAAGGTGGAGCTTCTTGTTCCAAGATGAGCTGCAGCTTTCCGTGGGGATCCTTCTGCTTCTTCTTGGTTGTGCTATGCTTGCCAGATTCCAATATCTCCACGTCCTCCCATGGCTGCTTCGTGGAGGAGAGGACGGCGCTGATGGACATCGGCTCCTCTCTGACGCGCTCAAATGGCACGGCGCCGCGTTCATGGGGCCGCGGCGACGACTGCTGCTTGTGGGAGCGCGTCAACTGCAGCAACATCACTGGGCGAGTATCACATCTCTATTTCTCAAACCTGTATGATTCTAATGAAGTGCTAGATGCACACGGTCACTCGTTTTGGCGTTTCGACACTACGGTCTTCTCTTCATTCCCGGAGCTTCAGTTCCTGGATTTGTCCATGAACAATGCTACTTTCCAGAGCTGGGATGGTTTACTAGGATTGACCAAGCTTCGGTATCTCAAGCTCAATAACAACTGCTTGAATGGTACTATCCCGGCATCTATTGGGAAATTGGTTTCCCTGGAAGTCTTGCATCTTCAGTTTACTGGCGTTGGTGGAGTACTTCCGTCTTCAGTTTTTGAAAGTCTTCGGAACCTGCGGGAATTGGATTTAAGTTCCAATCGACTAAATGGAAGCATTCCATCATTGTTCTCACTTCCTCGTCTTGAGCACTTGAGTCTCTCACAAAATCTCTTTGAGGGGAGTATTCCTGTGACACCGTCTTCAAATATTACGTCAGCGTTAAAGACATTCAATTTTTCAATGAATAATTTGAGTGGTGAATTTTCCTTCTTCTGGCTGAGAAACCTCACCAAGCTCCAAAAGATAGATGTCTCAGGAAATGCTAATTTGGTTGTTGCGGTCAACTTTCCTAGCTGGTCACCTTCATTCCAACTGAAAGTGCTAGTCCTCTCTGGCTGCAACCTTGATAAGAACATTGTTAGAGAACCAATTTTTTTACGCACACAGCATCAACTAGAAGTGCTTGATTTGTCGAATAACAGCCTGTCTGGGAGCATGCCCAATTGGTTATTTACAGAGCAAGCCACATTAGTTTACCTTAATCTTGGAAATAACTCACTAACAGGGTCATTAGGTCCAATATGGTATCCCCAAATGAATCTACAAGCTATCAGTCTTCCTATGAACCGTATCTCCGGACATCTACCGGCTAACATCAGCTCAGTATTTCCAAATATGAGTTTTCTTGATGTTTCTAGCAATACGATTTCTGGAGAAATACCATCATCATTGTGCAACATTACTAGAATGGAATACCTGGACCTATCAAATAACAGTCTTTCAGGAGAATTGCCTAATTGCTTGCTCACTGAATATCCTATACTGACAACCTTGAAGGTCTCAAACAACAAACTTGGTGGCCCCATATTTGGTGGTACGAATCATTTGTCGATCAAACATGCATTATACCTTGATGGCAACAAATTTGAAGGAACACTGCCGCGATATCTAACAGCAGATTTCGATGCTCATGGAACATTGGATTTGCATGACAATAATTTATCAGCCTCCTTCGTTGTGGCATGGGTGCCTACTTGCTGA
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|
|||||||
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|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_04G0519900 | OsMH63_04T0519900-mRNA-5 | Chr04 | 34736479 | 34738190 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGGGCAAGCATACGTACGACAAAGAAGCTCCCAAAAGGCCGGGGGAAACAGAAGATTGGGCCAAAAATTTCTTTCGGAGATTTTGCAGGACCGTGCCAGGCTCCGTCGCGGACGCCATCGAGCTCGACGTTCCCGGCTTCAACTATGAGGTCCCGGTTATCGTCAGGTTGTTGGCAGAACGCACCAAGACGAAGTTGCTTCCAGGCGCCGTTACGGACGCGACGTGCGAGTTGCGACTTGACTGTATGCGATCGGGCTTTGCATCTGCTCAAGTTGCTTCCTCCGTATCAAAAATCCCAGACTGCAAAACTTTAAAACCACAAAGCTAG
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|
|||||||
| Protein seq | MGKHTYDKEAPKRPGETEDWAKNFFRRFCRTVPGSVADAIELDVPGFNYEVPVIVRLLAERTKTKLLPGAVTDATCELRLDCMRSGFASAQVASSVSKIPDCKTLKPQS |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.2527125 | 1.349375 | 0.41431 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0648200 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g55440 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0647900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0028770 | SBH | 0.000000 | 1.677204 | 0.202339 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0029550 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.268211 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0029150 | SBH | 0.000000 | 0.890891 | 0.561121 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0029000 | RBH | 0.041309 | 0.000000 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0029240 | RBH | 0.0 | 0.804663 | 0.816257 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0520100 | RBH | 0.686685 | 1.018244 | 0.3692005 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0027900 | SBH | 0.032375 | 0.000000 | 0.124839 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0525000 | RBH | 0.8954085 | 2.5295235 | 2.2227805 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0028320 | SBH | 0.0 | 0.038165 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0028150 | SBH | 0.0 | 0.720277 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0028260 | RBH | 1.255963 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0028860 | RBH | 0.044829 | 0.076417 | 0.122183 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0028850 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G028230 | RBH | 0.043269 | 1.022830 | 1.063177 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0028080 | RBH | 0.355491 | 2.867533 | 0.443310 |
