Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsMH63_04G0296000 OGI:04059010 | 16/16 Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU Chr04:19981788-19990244
Gene Symbol WAK60, OsWAK60, WAK40, OsWAK40
DNA seq

ATGCATGCGTCAGTAGGAATAGCTCATGCTTGGACTCAAATTCAACAGGCTTTGGATATCTGTGCAGCTGCGATTCTGGCTTCGCAGGAAATCCCTATATTCCGGAGGGCTGCTCTCGTGACAAAGGTAATTCAATTACCCCAAAATTAGATATATAATTATATACAGTTTATCAGCCGGGCGAAATGTCCTGGTGAGATATGTTTCTTAAGTTTTACTGTAAGTATACAAAGAATTTAATACTTTTACACATTTGATCATGCATATATAATTCCAAACATCCCAGTTAGTTTGTATATGTATACTGGTCATGGATAAAGGACATTTTAGACAGGATCTAGTTAACATTTAGAACTTTCACAATTAATGACTTTTATAAAATACTAGTTTAGAAACATAAAAATGGTATGTATATATCTGTATTGAAAAATAATTTAATATTAATTTTCAGAAGCTTAACTTATTCCAATATAAAATTAACGCATAAGGGCATGTACAAAGATAGAGTCTAATATGAGCTCTCTATTTTAATTAATGTCGCTAGAGACTATCCTCCTACAGTAGTAAGACAATAAGATTTATAAGCCATTAATGCACTAAATATTATTTTTATTATACTTATTTCTTTTTCTACACCCTCATGCAACAAACTTTCCGTTAATAAATGCTGAGAGTCGACTCTGAGCTGTTGTCATGTATAGCAACGATGTTTTTCATTCCTTTCCTCTCTTTTTTTGACGTCATAAAATTTACTTGCATGACAACGAAGAGAGCCTGTTATTAGACACCATTGTACATTCCCTAAGAGACCTTAAAAAAGGTGGAACATTGAATAGGTTTGACCAAATCATGTAGCTTTCATGATCAACACCAGATTTTAGGTACCTCAATCTATTCAAGATGGTTCAATTATTTTTGTTGTTTGTTCAATTTATATTGTAGACAACAGATACATCCATTTTAGAGAAATAAATTGGATAGTTACGATTTTATCTTTCTCTCCATTTCGGTCGTAATTTCTATAATTTTCACTACTAGAATAGGAAATATTAACGACCAGTAAAAAAAGTTCTCGGTTGCTAGTTGCTACATGTATTTGGTCAAGGTTTCAGTACAAAATTGGTAGCTAAAGCGTGACTGACGACCAGAGCTTTTTTTACTGCTGTTAATTTTTGTTATTCTGCTGTCGTTAGTATTAGTTTCTGTTGATAATTAATTTTTTTTTGGAAAAAATAAAGTCAAATACAACAACTATATGATGAATGAGTTATGTTATACACGTTTGATGAATAAAGAATTGCCACTAGATTGCAGTTATTGGTCCATTAACAAATTTTTGTAGGTGTGTGGTCATCAATTTGAATATACATACCTTTGTCTCTAAAAAAATTACGATAACACAATTTGACCGTCGTTAATCTAATAACTATGAAAAATGTCACCGTCATTGATAGAATCATGACGGCATAATATGTGGTTATTAATAAGAGCAACGATGGTTAAAAATATGGTCGTTGATAAACTAACGACAGGAAATATTGTGCGGTCATTAATACATTAACGACGCAGCCTTTAATGACCACTAACGAACACAATTTTTGTCGTGCTTAATGATCTTTAATGACCACATTATGACCTTTAGCGACCAAATTTACCATCGTCAATACTTTTTCCCTAGTAGTGTTTTATGAGTAAATTGCTCAAAATTGTAACAAAACTACATTTATAAACTATTGTAGCACAAAACCACACATTTATGTAGGAAGAATACAAAAACCAGGTCTACAAGAGAGGTGAATGGTAGCATTAGCAAAATCAAAATCTTTTCGCGGAATAAAAATATACCTTTGACCTGATGAATTCAGGACCATCCGGTGTGTAGATCTCCGGCTGTCCGAACGTGCCTTAACTGAGTCGGATTCATGCGCTGCTGGAAAATTCACTATGCAGTCGCTGGACTGTCCGATTATCCTAACTATTCATGTCATAGAAGCCAGTGCAACAGTGTGATCTAGTGGACTATTCATGCCCTACAAGCTAGAGCAACCACCGAAATCCAGAAGAACTCTTGAAAGTAGATTAAACTTTTATTTCTTTAAGATGTGCTTACAAAGTACATCCCGAACACTCATCTCTGAACTCACAATCTAAAATAAAAGCCTCAAAGTAAATCTTAACTTTTTGTCTCACAAAATTTCAATATACTCTAGACTCAACCCCTCTTCTATTCAAACCCAAAACCTAGCTATGAATCCAACTAAAACCAGAAAGCCCAATCACATAGGAAACCCCTCAAACTAGGGAAACAACGTCAACCTTTCCAAACTTGAATTCCAATCCAAATTTGAGTCCGCTTACCAAATGCACACATATCCCTGTGTATGCCATATGAAAAATCTCAGTTCCATATTGTTCTCTAGCCTAACCATTCCGCATGATGTCCTTGACCGTACGGATCTATCACAGGCTATACTCCCATGTCGTCAAGCTCGCTCGAACTTAACTAACATAAGCATAACCACAGTTTTATAATATGTATATAAACAATCTAAAAGTCATAAACATAAAGCAATCTAGAAAATCCATGAAAACAACTCGAAATCCACTCAAACATTGAGTCTGCTCTGGTCGGACCGTTGGGCCAGTCAGTCTGACTTCAACCACACCTAGTCCAGCAACATTGTTCATGGTTAGTCCTGCCCATTCAGCACTACTAGGCCGGTCCTCCCGTTGTAGGATCGAAACATAAGAACTAAACCAACCAGAGGGAGGGTGAATGGTTGGTATACCCAAAAACCGAAAACTTTTAGCGGAAATAAAAGTTACCCTCGAAATCAATGAATTGCGGTCTGACCGAAGTAGTAGCGCCGGTCTAACCGCCTAATGAATGTTGGTCGGACCGATGTAGATCGATCGATCGAACCACCGAAATCGCCTGCCGTTGCCTGCCGCCGCAGCCGGTCTGACTGCCTTGCCTTAGCCGGTCTGACCGCCGGTGCGTCGCTGGTCTGACCGCCGGTTAGTCGCCGGTTAGACCGTCGAAACCCGGTGAAACACAAATCGAAGAACTCTCAAAGTAGATGACAACTTTATTTCTTCTCTCTATGTTTACAAAGTGCACCAACAGCACCTCTTACAAAAATCTCGACTAAACTCGAAACCCTAACTAAACTAGCAACTCAATTGCTGTCAAAAGCGATACCGGGAAGCCTTACGCTCCCCCTCTATTTATACATGAGGTAGGCAGCCTAAAGCCATGAACCTAACTCATACTAAGAGTCCTAAACACCTTAGGAGAGTCCTAAACATCTTAGGAAACCCTCTAGTACAAGACACAAACTTTACATAACCAATCATACCAAATTTGGACTCCTTCCAAATTCGACCCCGCATCCCATACGCACACAATACCTCCATCGTATGCCATATGGAATCTCCATCAACCACGTGCATCAACTCTAGCCTTAGTATCCCGCATGATATCTAACCACCACGAACATCGTCTTACCACCAAGCCGACTCCCGGTCCATCACTGCAAATACTCTCCCGAGATATCGAGTCACCTCCACATGAAACAAACAAAGAAACCATATTCCAAGACCAAGCTATCCCCAACTTGACTCATTAGTAGTAAACAACAGTATTACATACGTATAGTATCCATCTAGAAGCCATAACCATGAAACAATCACGGATATCCAAAGAAACAACCCGAAACCGAAACCGACACAGCGTCGGATGGTCAGACCGCGGGCCGGCCGGTTTGACCGCTACACATGAGCCGGTCTGATCGGCAACCACCGCCCGGTCTGACCGGTCCCGACAAAACAGCAATATCCAAAACCACTTCGTGAATAAATTCCAAATATCAAAACCAATAATCACAGATGCCAATTGTTCATCACAGAATAAGAATCAAAACACACGTTGATCTTACACCCGTCATACCCAGAGTGACACCACTTTGCCCATTTTAACACAAACACATACCTTTCAGAATTATTCATCACATAGATTAAATCATCCCACGATCTCATAATTTCCCCATCATGAACACATGACAAAATCACCAAAATGCAAACTGATATTTCTAAAAAATAATAACAAAGAAGTGTCAACAGGCATAAACGGCCTCAAAAATTATGTTTTCAAATGCGACAACAAGATAAACTCTCCCCTTTTGAAAAAAAATAATTTCTCCCTCAAATTTGCAATAAAAGCACAAAATTGACTGTTATTAATTGAAACAATTTTCTCCGTTTCAAGAAACGTGCATTTTGTATAATTTCTCTCCACCGTCCACTGACTTGATTTCATCTAGAATTTGAGAGAGAATAAAACACAAATGTCATGATTTCAAGATTGCCACCTGTAGCCATCAATTTTTTATTTCTGATTTTTTTCCTTTGACAGCTTTGAAATATACCTAAAACAATTTAAGGTCATGTGTTGTATGAAAAGAGAGATAGATTCATCAATTAGTTAACAAGTATACTCCGGAGTATAAACATGTCAAATTTATCATAAAGCTACACATGAAGCCATGGTATAGCCAACATACAGATTTTAATACATAATTATATTTGTGTCAGAACTACATATCATATGTAAAGGTTCCACTCTTTCATTGTTATCATGATTGTCTTTTAACAATTATTTGTGTTAACTTGTTTTCAATATCTGTAATTTTGCAACAATGTGGCTTAAATATGTTATGTTGTAAACTCAATGTCATAAAATTTTGCAATACAATGGCTTAAGTTTCATTAAGTTTTCTCAAAATATACATAACTTTGTAAATATTTACGTTTTTCTATTTATCTAGGAGATTAAGCTACGGTTTCTTGAAGTTCCTCTATTTAGTAAGAGATTTCCCGGTAGAGCAAATGTAATGATTCAAGACTTGATTGTAGTTGTTAGAGATTTCCCAGTAGTCTTTTCAACCAAAGGTCCAGTTCTTTTCAACCTTGTGGTTGCATGTAGATGATTTCAATGACATTTTCCCCATGTAAACAAGATATAATCCTTTTCAACCGAAGGCAAACTGTTCCCGGTGGTGTGGGAACATCAGTGTTCCCTATCCATTTGGCCTCGAAGAGGGTTGTTTTGCAAGAGAACTATTCCATCTCAACTGTACAGACGCAAATTCTTCAACTCTGCAACTCGACAACTATAATCAGGTGATGGCCATACAAGTTGAGGAAGGAGTTGTGTAGATTAAACATGCCGCTAGTGGTAATGATGATCAGGAGTTTATCGCGATAGATGGAGAACCACATCTATATGATGGCTCTTGGGAATACTCTGTCTCTGTTGGATGGGCTGTTGCCAATCTAACATGCCCGGAAGCAAAACAGAATGTCTCTGGATATGCATGCGTTAGCACTAACAGCAATTGTGTTCCTGTGAACTCTACTTTTGGTTATGTTGGTTATCGGTGCAACTGCACTAAAGGTTTCCAAGGAAATCCTTATATCCAGAATGGATGCAAAGGTAAAGAACCTAAGGTACCCATCGAATTGGACTACTTCTTTGTACATTGCTTCTCAGTTCTCACCTAATTGAGATTTGTTACAGATATCGATGAATGCCAAAAACAAGGAATTTGCAATGGTACTGTTTGCAATAATTCTATAGGTAGTTATGGATGCACAAGTTGTCCAGAAAAAACAGAATACGACGTTATGAGAAATCAGTGCACTCCGGCAAATTTTGGGCACAGCCATGTTCTCATAGGTACGCAAATACTACTGTGATTGACTATTATTTTCGACCAGATAAGCTACTGAGGTCAACAAGAACGAAACATATTACAACTTTATTTGTTTTTATGATTACATCAAAAAGAGCTGCACACACCACAACACAGTAGCAACGAGTGCCCCCGGTTAGCGCACGCTCTTTGAGACGTTAATTTCCCAACTTTGCCTTCCCAAACCACGTTATTTTCCTATAATCGTTATAGAGACCTACTAAGATTTTTCTACGGAAAAAAAAGAAGTCCATTACGAAGGAGATTTGGGGTTGGTTGGGTAGTTGCCACACTTTGCCACGCCACACTTTAGTCATGCCACAGTTTTTTAGGCATGTGTTTGGTTTCCTATCACAATTGTGTTATGCCACACTTTCTTAACTTTGGGACCCACATGTCATGCTCTCAAATTTAGAGCTCAGCATGCCACACTTGTAGCCAACTATATCTAAGCCACTTTTGTGCCACCATGCCACATCTAACCTAAACTTAGTTATGGCAAGGTTAGGCATCAACCAAACTTCTCCAAAATGACAAAATAAATCTGATCTTATTCTTTTCTGGCAAAAAAATGATCTTAGATTTTAACTATAATTAAAATAAACTCGTAAATGAGACATAGGTATATGTATTGAGTAATTCAAAAACGTAACAGCTATTTTTACAAAATTATCCGTTTGTTGTAGCTTTACTTAAGCATTTCAGAGAACTAGAACAAAGCATATTAATTTATTAGAGAGATACAACCTTATACTTTCTCCGTCCTATAATAAATTCATTTTTGCCCTCCCATTTGTCCCAAAATAATTTTACTTTAAGCAATCATTGTGCCCGAGTTTGTAAACTTGAGGTATAAATGCATGGCAGTAGATATATAATGGAATAATTGTATTACAATTTGATAAAGTGGGGGTATTCTAGTTTTTTTTTAAATTGATTAATTTGTGTGGCATGAGTAAAAAATGAACTTATTTTGGGATGGAGAGAGTATGCTTGATAAATTTCAGCCCACCTGTCTTACAAGTACTTATGCTATCACAAATCATGAAAATATTATACAGGCATAGGGTATAGAGTTGTACTTATTTATAAAACTGGTTGTTAATTGTTGATATACCTTAGTTAAAGTTGTATGAAATCGATAATTTTCTGAAATTTACTCTTATAAATTTCCAATTCGTTAAACATGGAATGTAATATCATTCTATTAGTTACTCCTCTTAACTTGTTAACTGGTACATTAAAATCATTTATTTACCTACAACGACATCTTACCTAATAGGTACTATTGACCATTAGATCAAAAACCAATGGAACATGGGAAAAACCAGTAGTGTGTGGTGGAGTTGTGGGTGCATGACTCCACCTGGCAAGGTTCAATTCCTGTTGGTCATGAATATTATGCACATACATGTCAGATTTCAACAGGATTTTAGTGAGATGTTGGATGTGCCGCTGTTTTTCTCTCTTAGAATGCTTTAGATGTCAAGTAAATGACTGATGTTTTCGTTCTGCAAGCATTTGTTCTTCAATTTTTGTTGTTCTTATCGCTCTTCTTGGAATGCAAGTGATCATTCATAGACGAAGTATGAAAAGACAATTTCTCATAAGACAGAGGGATGAGTATTTTCAACAACATGGAGGCCAGCTTCTGTCTGACATGATGAAAATCGACCGCAACCTTGAATTTACCTTGTACAGACAAGCAGACATTGAGGTAGCAACAAATAACTTTGACAAGAACCAAATCATTGGAGAAGGAGGACAGGGGACAGTTTACAAGGGATTTATAGAAAACATTCCTGTTGCAATAAAAAGATGCAAAGGGATGGATGAAAGCAGGAGAATGGAATTTGGACAGGAGCTACTTATACTATGTCGCGTCAACCACGATCATGTAGTTAAGCTTCTTGGTTGCTGCCTACTGTTCGAAGTCCCTATTCTGGTTTACGAATTTGTTCCAAACAAGACGTTACATGACTTGTTACATGGTCAAGACAGGAGATATTACATATCACTTGCAACTCGTTTGAGGATAGCTGCTGAATCTTCCCAAGCACTCGGACACTTGCACTCATTGGCACGTCCAATCCTTCATGGGGATGTGAAATCTGCCAACATTCTGCTAGGTGACAATTTGATTGCCAAGGTCGCTGATTTTGGTTGCTCAATAATCGCACGAATGGACGAAGAAGCCCTCGTTGCAAAAGGCACAGTTGGGTACCTAGATCCCGAGTACCTGCAATCATGTAAGCTCACTGACAAGAGTGATGTTTATAGTTTTGGTGTTGTTCTTGTGGAGCTCTTAACGGGTAAGAAGCCGCGGTGCCTTGTGTCGATGTTTCAAGATGCTATGAAGGAAGGCACCGTTGATGAGCTCATAGATGAGGAGATCATCAATGAAGACGACTTGGAGGTCATCCACCAAGTTGCTGAGCTCACAAGCAGGTGTTTAACTATGCCAGGTGATAAGCGGCCAGCGATGTCGCAAGTTGCCCAAGAGCTCCGTCAGTTCACAGAATTGGTGCGACAACATCCGGATGCGGTAGGCGATCTGATTGCCTTGCGCGAGGTGGATAGAAGCTTTACGGGGACAACAGATAGCACAGGTTACACCAGAAGCAGAACAGCCGGCACAATAGATAGCACAGGTTACACCAGAAGTAGAACAACTGAGTATTTCACTCTTGGGATAACATCTTGA

More
CDS seq

ATGCATGCGTCAGTAGGAATAGCTCATGCTTGGACTCAAATTCAACAGGCTTTGGATATCTGTGCAGCTGCGATTCTGGCTTCGCAGGAAATCCCTATATTCCGGAGGGCTGCTCTCGTGACAAAGTTTATCAGCCGGGCGAAATGTCCTGGTGAGATATGTTTCTTAAGTTTTACTATGATTTCAATGACATTTTCCCCATGTAAACAAGATATAATCCTTTTCAACCGAAGGCAAACTGTTCCCGGTGGTGTGGGAACATCAGTGTTCCCTATCCATTTGGCCTCGAAGAGGATTAAACATGCCGCTAGTGGTAATGATGATCAGGAGTTTATCGCGATAGATGGAGAACCACATCTATATGATGGCTCTTGGGAATACTCTGTCTCTGTTGGATGGGCTGTTGCCAATCTAACATGCCCGGAAGCAAAACAGAATGTCTCTGGATATGCATGCGTTAGCACTAACAGCAATTGTGTTCCTGTGAACTCTACTTTTGGTTATGTTGGTTATCGGTGCAACTGCACTAAAGGTTTCCAAGGAAATCCTTATATCCAGAATGGATGCAAAGGTAGTTATGGATGCACAAGTTGTCCAGAAAAAACAGAATACGACGTTATGAGAAATCAGTGCACTCCGGCAAATTTTGGGCACAGCCATGTTCTCATAGTGATCATTCATAGACGAAGTATGAAAAGACAATTTCTCATAAGACAGAGGGATGAGTATTTTCAACAACATGGAGGCCAGCTTCTGTCTGACATGATGAAAATCGACCGCAACCTTGAATTTACCTTGTACAGACAAGCAGACATTGAGGTAGCAACAAATAACTTTGACAAGAACCAAATCATTGGAGAAGGAGGACAGGGGACAGTTTACAAGGGATTTATAGAAAACATTCCTGTTGCAATAAAAAGATGCAAAGGGATGGATGAAAGCAGGAGAATGGAATTTGGACAGGAGCTACTTATACTATGTCGCGTCAACCACGATCATGTAGTTAAGCTTCTTGGTTGCTGCCTACTGTTCGAAGTCCCTATTCTGGTTTACGAATTTGTTCCAAACAAGACGTTACATGACTTGTTACATGGTCAAGACAGGAGATATTACATATCACTTGCAACTCGTTTGAGGATAGCTGCTGAATCTTCCCAAGCACTCGGACACTTGCACTCATTGGCACGTCCAATCCTTCATGGGGATGTGAAATCTGCCAACATTCTGCTAGGTGACAATTTGATTGCCAAGGTCGCTGATTTTGGTTGCTCAATAATCGCACGAATGGACGAAGAAGCCCTCGTTGCAAAAGGCACAGTTGGGTACCTAGATCCCGAGTACCTGCAATCATGTAAGCTCACTGACAAGAGTGATGTTTATAGTTTTGGTGTTGTTCTTGTGGAGCTCTTAACGGGTAAGAAGCCGCGGTGCCTTGTGTCGATGTTTCAAGATGCTATGAAGGAAGGCACCGTTGATGAGCTCATAGATGAGGAGATCATCAATGAAGACGACTTGGAGGTCATCCACCAAGTTGCTGAGCTCACAAGCAGGTGTTTAACTATGCCAGGTGATAAGCGGCCAGCGATGTCGCAAGTTGCCCAAGAGCTCCGTCAGTTCACAGAATTGGTGCGACAACATCCGGATGCGGTAGGCGATCTGATTGCCTTGCGCGAGGTGGATAGAAGCTTTACGGGGACAACAGATAGCACAGGTTACACCAGAAGCAGAACAGCCGGCACAATAGATAGCACAGGTTACACCAGAAGTAGAACAACTGAGTATTTCACTCTTGGGATAACATCTTGA

More
Protein seq

MHASVGIAHAWTQIQQALDICAAAILASQEIPIFRRAALVTKFISRAKCPGEICFLSFTMISMTFSPCKQDIILFNRRQTVPGGVGTSVFPIHLASKRIKHAASGNDDQEFIAIDGEPHLYDGSWEYSVSVGWAVANLTCPEAKQNVSGYACVSTNSNCVPVNSTFGYVGYRCNCTKGFQGNPYIQNGCKGSYGCTSCPEKTEYDVMRNQCTPANFGHSHVLIVIIHRRSMKRQFLIRQRDEYFQQHGGQLLSDMMKIDRNLEFTLYRQADIEVATNNFDKNQIIGEGGQGTVYKGFIENIPVAIKRCKGMDESRRMEFGQELLILCRVNHDHVVKLLGCCLLFEVPILVYEFVPNKTLHDLLHGQDRRYYISLATRLRIAAESSQALGHLHSLARPILHGDVKSANILLGDNLIAKVADFGCSIIARMDEEALVAKGTVGYLDPEYLQSCKLTDKSDVYSFGVVLVELLTGKKPRCLVSMFQDAMKEGTVDELIDEEIINEDDLEVIHQVAELTSRCLTMPGDKRPAMSQVAQELRQFTELVRQHPDAVGDLIALREVDRSFTGTTDSTGYTRSRTAGTIDSTGYTRSRTTEYFTLGITS

Function Wall-associated receptor kinase 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMN8]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_04G0296000 OsMH63_04T0296000-mRNA-1 Chr04 19981788 19990244 + maker
CDS seq

ATGCATGCGTCAGTAGGAATAGCTCATGCTTGGACTCAAATTCAACAGGCTTTGGATATCTGTGCAGCTGCGATTCTGGCTTCGCAGGAAATCCCTATATTCCGGAGGGCTGCTCTCGTGACAAAGTTTATCAGCCGGGCGAAATGTCCTGGTGAGATATGTTTCTTAAGTTTTACTATGATTTCAATGACATTTTCCCCATGTAAACAAGATATAATCCTTTTCAACCGAAGGCAAACTGTTCCCGGTGGTGTGGGAACATCAGTGTTCCCTATCCATTTGGCCTCGAAGAGGATTAAACATGCCGCTAGTGGTAATGATGATCAGGAGTTTATCGCGATAGATGGAGAACCACATCTATATGATGGCTCTTGGGAATACTCTGTCTCTGTTGGATGGGCTGTTGCCAATCTAACATGCCCGGAAGCAAAACAGAATGTCTCTGGATATGCATGCGTTAGCACTAACAGCAATTGTGTTCCTGTGAACTCTACTTTTGGTTATGTTGGTTATCGGTGCAACTGCACTAAAGGTTTCCAAGGAAATCCTTATATCCAGAATGGATGCAAAGGTAGTTATGGATGCACAAGTTGTCCAGAAAAAACAGAATACGACGTTATGAGAAATCAGTGCACTCCGGCAAATTTTGGGCACAGCCATGTTCTCATAGTGATCATTCATAGACGAAGTATGAAAAGACAATTTCTCATAAGACAGAGGGATGAGTATTTTCAACAACATGGAGGCCAGCTTCTGTCTGACATGATGAAAATCGACCGCAACCTTGAATTTACCTTGTACAGACAAGCAGACATTGAGGTAGCAACAAATAACTTTGACAAGAACCAAATCATTGGAGAAGGAGGACAGGGGACAGTTTACAAGGGATTTATAGAAAACATTCCTGTTGCAATAAAAAGATGCAAAGGGATGGATGAAAGCAGGAGAATGGAATTTGGACAGGAGCTACTTATACTATGTCGCGTCAACCACGATCATGTAGTTAAGCTTCTTGGTTGCTGCCTACTGTTCGAAGTCCCTATTCTGGTTTACGAATTTGTTCCAAACAAGACGTTACATGACTTGTTACATGGTCAAGACAGGAGATATTACATATCACTTGCAACTCGTTTGAGGATAGCTGCTGAATCTTCCCAAGCACTCGGACACTTGCACTCATTGGCACGTCCAATCCTTCATGGGGATGTGAAATCTGCCAACATTCTGCTAGGTGACAATTTGATTGCCAAGGTCGCTGATTTTGGTTGCTCAATAATCGCACGAATGGACGAAGAAGCCCTCGTTGCAAAAGGCACAGTTGGGTACCTAGATCCCGAGTACCTGCAATCATGTAAGCTCACTGACAAGAGTGATGTTTATAGTTTTGGTGTTGTTCTTGTGGAGCTCTTAACGGGTAAGAAGCCGCGGTGCCTTGTGTCGATGTTTCAAGATGCTATGAAGGAAGGCACCGTTGATGAGCTCATAGATGAGGAGATCATCAATGAAGACGACTTGGAGGTCATCCACCAAGTTGCTGAGCTCACAAGCAGGTGTTTAACTATGCCAGGTGATAAGCGGCCAGCGATGTCGCAAGTTGCCCAAGAGCTCCGTCAGTTCACAGAATTGGTGCGACAACATCCGGATGCGGTAGGCGATCTGATTGCCTTGCGCGAGGTGGATAGAAGCTTTACGGGGACAACAGATAGCACAGGTTACACCAGAAGCAGAACAGCCGGCACAATAGATAGCACAGGTTACACCAGAAGTAGAACAACTGAGTATTTCACTCTTGGGATAACATCTTGA

More
Protein seq

MHASVGIAHAWTQIQQALDICAAAILASQEIPIFRRAALVTKFISRAKCPGEICFLSFTMISMTFSPCKQDIILFNRRQTVPGGVGTSVFPIHLASKRIKHAASGNDDQEFIAIDGEPHLYDGSWEYSVSVGWAVANLTCPEAKQNVSGYACVSTNSNCVPVNSTFGYVGYRCNCTKGFQGNPYIQNGCKGSYGCTSCPEKTEYDVMRNQCTPANFGHSHVLIVIIHRRSMKRQFLIRQRDEYFQQHGGQLLSDMMKIDRNLEFTLYRQADIEVATNNFDKNQIIGEGGQGTVYKGFIENIPVAIKRCKGMDESRRMEFGQELLILCRVNHDHVVKLLGCCLLFEVPILVYEFVPNKTLHDLLHGQDRRYYISLATRLRIAAESSQALGHLHSLARPILHGDVKSANILLGDNLIAKVADFGCSIIARMDEEALVAKGTVGYLDPEYLQSCKLTDKSDVYSFGVVLVELLTGKKPRCLVSMFQDAMKEGTVDELIDEEIINEDDLEVIHQVAELTSRCLTMPGDKRPAMSQVAQELRQFTELVRQHPDAVGDLIALREVDRSFTGTTDSTGYTRSRTAGTIDSTGYTRSRTTEYFTLGITS

More
Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0 0 0.293012

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0367000 SBH 0.315103 0.433783 0.543453
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g29770 RBH 0.0 0.0 0.263250
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0367000 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0009880 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0010610 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0010430 RBH 0.0 0.768515 2.653475
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0010020 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0010280 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0010090 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0283400 SBH 0 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0010060 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0010280 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0010330 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0010820 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0010160 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G009310 RBH 0.273893 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0009480 SBH 0.0 0.0 0.0
Powered by

© 2021- Rice Gene Index @Zhang Lab. All Rights Reserved.

National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement

Huazhong Agricultural University

Any comments and suggestions, please contact us.