Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsMH63_04G0025900 OGI:04004740 | 1/16 Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU Chr04:1606151-1616504
Gene Symbol OsSub34, SUB34, OsSub37, SUB37
DNA seq

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Function Subtilisin-like protease SBT3.6 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8L7I2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_04G0025900 OsMH63_04T0025900-mRNA-4 Chr04 1606151 1615960 + maker
CDS seq

ATGGCTGATGCTAGTAATGGAGGTAGAGGCCATTTCCGACTCGTCATCGTCGTCCTCCTCGCTCTCCTGCTTCCATTGCAGAGATCCTACGTGGTCTGCCAGCAGACTGCAACAAAACAGCTGTATGTAGTGTACCTAGGGGAGAAGCAGCATGAAGATCCAGAACAAACAACGGCTTCGCACCATGACATGCTCACTGCCATCCTTGGAAGGCAAGAACACCAGTTAACAAATTAG

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Protein seq

MADASNGGRGHFRLVIVVLLALLLPLQRSYVVCQQTATKQLYVVYLGEKQHEDPEQTTASHHDMLTAILGRQEHQLTN

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_04G0025900 OsMH63_04T0025900-mRNA-5 Chr04 1606151 1615960 + maker
CDS seq

ATGGCTGATGCTAGTAATGGAGGTAGAGGCCATTTCCGACTCGTCATCGTCGTCCTCCTCGCTCTCCTGCTTCCATTGCAGAGATCCTACGTGGTCTGCCAGCAGACTGCAACAAAACAGCTGTATGTAGTGTACCTAGGGGAGAAGCAGCATGAAGATCCAGAACAAACAACGGCTTCGCACCATGACATGCTCACTGCCATCCTTGGAAGGCAAGAACACCAGTTAACAAATTAG

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MADASNGGRGHFRLVIVVLLALLLPLQRSYVVCQQTATKQLYVVYLGEKQHEDPEQTTASHHDMLTAILGRQEHQLTN

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 10.7700505 0 0.033892

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0127600 SBH 0.334520 1.015521 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g02990 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0127600 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0001110 SBH 0.135130 2.416801 0.651734
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0001140 SBH 0.0 0.0 0.144493
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0001150 SBH 0.121354 0.000000 2.362240
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0001210 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0001160 SBH 1.832482 1.355214 3.115292
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0027900 SBH 1.427744 0.0559445 0.1931925
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0001330 SBH 0.0 0.0 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0024500 SBH 3.4636695 0 0.0505775
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0001100 SBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0001330 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0001200 SBH 0.775168 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0001040 SBH 1.123384 0.0 1.277411
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0001300 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G001200 SBH 0.000000 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0001210 SBH 0.000000 0.0 0.000000
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