Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsMH63_02G0270500 OGI:02047370 | 16/16 Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU Chr02:17368975-17385631
Gene Symbol -
DNA seq

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Protein seq

MALLLRRLIPRHYANRAASAALALDPPPAPAMVSAPIIPPLPFFPVAAHELRNFTCSLSISYVLPFQLGVSQRCSYTFMPYSPFRPCEMCGVSVTNNSSRQLSSIRSRLPVRLKSGSFFATGLMSNHNFVTNNIGNSRCFLTVCNKNLSFLIRNKSLFGNPNMRREEGSDMHSLFHRSEKKKSTLPSCSIITDEASTSTSNHSKSAIGTENSSTSRIKDVSEDKKVSIKKQSKSAKTIAAAKIGTTDVSEEENKREISKSEKNANISRDKKTSNRLKKFSKAKKSAAAKAEICTKSSVDSSDSEQKPLVPLYPPTAKSVIVVESVTKAKVIQKYLGDMYEVLPSYGHVRDLAGRSKSVRPDDDFSMVWEVPAAAWTHLKRIRTALRGAENLILASDPDREGETIAWHIKEMLERQDALGCNVTVARVVFHEITEDAVKNALMSPRYIDMNLINAYLARRSLDYLIGFGISPLLWRKLPGCQSAGRDQFAALALLCDREAEIEQFNPEEYWTIDTDFKTQHSGPSNGLNLQAQIKHLNSKKLDQLSIWSQEEAQDIEKRIYSSQFEVIGIKRSKIHKNPPMPYITSSLQQDAANKLHFSAGYTMKVIAQKLYEGITLSSEDATGLITYIRTDGFHISDVAAEDILSLVKQRYGEEYASEGIRKYFKKIQVDIGNSKGDMIFHSSASNLDFKGYQAVYDDTEASPSSNNSEDDAVHQDNFEALSKLKVKDLMSPVNVHLAQNFTKPPSRYSESALIKRLEELGIGGPSTYSSIMKVLQDRNHVTVKGQVVHPEFRGRMVSAFLTHHFSEVADLSFTANLETELDNVSAGSTEWKGLLKDFWERFNKYCGNASRLQVRKVERMLEEKFGSILFPDLDNDSRICPSCSEGTLRLKVSKHGEGYFIGCDRHPKCKYDHMILS

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_02G0270500 OsMH63_02T0270500-mRNA-9 Chr02 17384105 17385631 + maker
CDS seq

ATGCGTACCAAACTTGAAGGTACATTGCTCGCACATTGTCGGTTGAAGTTGATGAAACTGAGGCATCTGATGAAATTCAAAGCACTTTTACACCTAGGTTACTTGGGGTGCTACCTGATTCTGATGAGAAGGTATATTCTAGTATTTCTGAAACAAGGTCCTTACGGTCACTATATCCAGGTTGGAGAGGATATAAAAGGAGTGTCTCGGAAAAGAGCTCCTCTTTCTGAAGTGAAAGATATTGACTCAATCACTTTAGAAGATGCAATCGAGCTATTGCAGTATCCCAAAATCCTGGGAAAACACCCTGATGATGATCTTCCTGTACTTGTAACACATTCTAAATCTGGATTTAGAATCAGACACAGGAGAACTCTTGCTCCATTGCCGAAGAGCGCAGACCCAAAGGAGATTACGCTCGAGCGTGCATTGAAGCTTTTGACAGGTAAAAACGTGATAAGGTTTGGTCGCCCTAAGGGAATCAAGAACCCAGAACCCCTTGAATACCATTCGTAA

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Protein seq

MRTKLEGTLLAHCRLKLMKLRHLMKFKALLHLGYLGCYLILMRRYILVFLKQGPYGHYIQVGEDIKGVSRKRAPLSEVKDIDSITLEDAIELLQYPKILGKHPDDDLPVLVTHSKSGFRIRHRRTLAPLPKSADPKEITLERALKLLTGKNVIRFGRPKGIKNPEPLEYHS

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 5.7920345 14.592307 9.33479

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0474300 RBH 1.082174 0.865003 1.207198
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g27440 RBH 1.059450 0.869180 0.369274
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0474300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0016870 RBH 0.753879 3.154313 6.166597
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0016980 RBH 0.210271 1.541392 2.145167
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0016880 RBH 2.301311 4.801648 8.063092
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0016750 RBH 0.134622 0.128122 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0016670 RBH 6.635843 4.293010 11.896700
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_06G0162300 RBH 7.827021 6.1530555 2.2574145
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0016440 RBH 0.480810 0.180615 1.702510
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0291300 RBH 4.677036 11.4153395 12.30746
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0016990 RBH 0.445664 0.034376 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0016540 RBH 0.528981 1.573711 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0017090 RBH 6.612318 4.752600 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0016860 RBH 0.817162 0.482238 0.664049
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0016610 RBH 0.232524 0.311583 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G017040 RBH 0.155466 1.640175 1.178720
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0016750 RBH 2.314850 14.475444 8.840847
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