Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLima_02g0016990 OGI:02047370 | 16/16 LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:17376028-17390629
Gene Symbol -
DNA seq

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Function DNA topoisomerase 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q1RIM1]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
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Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.445664 0.034376 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0474300 RBH 1.082174 0.865003 1.207198
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g27440 RBH 1.059450 0.869180 0.369274
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0474300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0016870 RBH 0.753879 3.154313 6.166597
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0016980 RBH 0.210271 1.541392 2.145167
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0016880 RBH 2.301311 4.801648 8.063092
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PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0016670 RBH 6.635843 4.293010 11.896700
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0270500 RBH 5.7920345 14.592307 9.33479
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Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0291300 RBH 4.677036 11.4153395 12.30746
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KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0016540 RBH 0.528981 1.573711 None
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LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0016610 RBH 0.232524 0.311583 None
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NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0016750 RBH 2.314850 14.475444 8.840847
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