Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsMH63_02G0149700 OGI:02026600 | 16/16 Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU Chr02:9338710-9346406
Gene Symbol -
DNA seq

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CDS seq

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Function Protein SNOWY COTYLEDON 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8GXD9]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_02G0149700 OsMH63_02T0149700-mRNA-1 Chr02 9338710 9346406 + maker
CDS seq

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.00341 0.0234315 0.0116095

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g16460 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0011480 RBH 0.083350 0.000000 1.681662
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0011610 RBH 0.032613 0.000000 1.263740
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0011460 RBH 0.383558 0.0 1.801838
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0011320 RBH 0.000000 0.019535 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0011290 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0011130 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0158500 RBH 0.204809 0.039704 1.234667
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0011630 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0011230 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0011610 RBH 0.0 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0011550 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0011230 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G011610 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0011410 RBH 0.0 0.0 0.0
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