Basic Info
Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLima_02g0004600 OGI:02009420 | 16/16 LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:3195626-3204490
Gene Symbol -
DNA seq

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Function -

Transcripts

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLima_02g0004600 OsLima_02g0004600.05 Chr02 3200529 3200982 + NAM
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLima_02g0004600 OsLima_02g0004600.01 Chr02 3195626 3204490 + NAM
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr02 3201453 3202121 + OsLima_02g0004600.04 OsLima_02g0004600.03,OsLima_02g0004600.04 All
A5 Chr02 3199032 3202114 + OsLima_02g0004600.04 OsLima_02g0004600.02,OsLima_02g0004600.01,OsLima_02g0004600.04 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.162084 0.020367 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0153450 SBH 0.067110 0.0 0.346779
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0153450 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0004370 RBH 0.206708 0.439847 0.211199
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0004570 SBH 0.096933 0.000000 0.403800
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0004400 RBH 0.061376 0.000000 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0004300 RBH 0.046390 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0004340 SBH 1.665661 0.000000 0.055152
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0053000 SBH 1.2185155 0.6556885 0.2696535
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0004330 RBH 0.009666 0.0 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0055400 SBH 0.7668005 0.463171 2.2909955
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0004460 RBH 0.150397 0.020339 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0004270 SBH 0.000000 0.000000 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0004600 SBH 0.000000 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0004530 RBH 0.181858 0.000000 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0004100 SBH 0.000000 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G004370 SBH 0.000000 1.603043 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0004310 SBH 0.000000 0.000000 0.000000
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